Basic Information

Gene Symbol
Arid2
Assembly
GCA_037464815.1
Location
JAZBGW010001258.1:3515-15778[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 1.5e-25 2.9e-22 78.8 0.0 1 89 15 101 15 101 0.94

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGCCACAATTCTCGGCAAGGACCCGGCCACATACCCCAAGGAGCGAGACGGCTTCCTTAGGGACCTGCAGCATTTCCACGAGACGCGCGGGACGCCGTTTAGAAGACCACCTATCATCGGTGGTAGAGAAGTCGATTTGTATTTACTCTATAATTTGGTAATCAGTCAAGGTGGTTGGATCAAGgtGAATTCGAAAAACGGTTGGGTCGACGTTTTAGAAGAATTAAATTTGCCGAAAGAATGTGTGAATGGTAGTGTTGCATTGAAACAAATCTATTTGAGGTATTTAGATCGATGGGAGAAGGTGCATTTCCTTGGTGAAGAAGCTGATAGAggtagtgatgatgatgaagagaGCAGACATAAAAGATGGTCGGCTAGAGCTTTACATTCGGTACCCCTAACTTATAACTATACACAACATGCTATAGCCGATGTCAATCGAGAGTACAATCATCTATCAGCCGATTTGTATAAACCATCCGATTATGATAAATTAGCCTTATCACTTCTATCACCATTACCAAATGAACAAGATTTTGCTATAAATGTTTGtacattattatcaaatgATGGTAAACATAcgttaaaattggaaaaacatCCACGATTAATTGATTATCTACTTGGTCATGCTGGTGTCTTTTGCCATAGCTCTCTTCGAAAGTTATTTGTACATTGTTATCGGAATATCCGTAAACATTCAATTCATAGTTTTTGGAATGATGTACTCGaatcaaatgaatttttagATCTCACAAATGAAGATAAATTTATTCGAACTAATAATACTAAAATAGgtgaaattaatgaatatgatgaggaagaaaaatcaaaaagtgatatggaaattgatgatgatgatgttagtGACATTTATAGTGTATTCGATAAAGACAGTgacttaaaaaattttaaagatcgtttacgttttaaattaaaattagataacagtgataaagaattattttgtttaggACGACAATTGGGTACACAAGATTATATTGGTCAACGTGTTttacaaataacaacaattttacgaaATCTTAGTTTTACAGAAGAGAATATACcagtattgttgaaaaatcgGACATTTCTtaggtttttattattatgtgcTTCCTCGCGATGgggttatttaaaaaatcttgcTATGGACATGTTAGGTAATGTGGctggtgaaattttaattaaaaattatccacACGATCGACTTGCTgtagttttattgaaaattattacaaatggTTTAAAAAGTGAGGATAGAGCTGCTTGTATTACGTCACTTGAAGTATTAAACAAACTTAGTCAAAACGAATCGAatgaagaaatattattaaaatatcttGAAGTGGAAGTGTTTGAGAAAGTGTGTTCTTTTTTAACTATTCACGATGTtatgttattaatttatacattGGAATGTTTATATTCATTATCATCACTAGGCGAACGatcttgtaatttaattataagcAATCATGGTGTAGTGGATACTTTAGTGTCACTTGTTACTGTTGAAGGAAAAAGTTATGGTCCTAAAGCGTGCATTGGTATGAAATTGGTTGAAACGGTACCAGGTGGGATTAGTACAACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCAACTAGTACTAATACAACTACAACATctgcaataacaacaacaacaatgtcaacaacatcaacaacaaattccAATCTTACAAATACATTATCATCCACAATAATCACATCAAACAATTCAACATTAACAACACCATCGGTCGCAATAAAAGTTTCCACAAGTGTAACAACACCTGTACGAACAGTACAAGTAACACCACAacgtttattaaatatttcaccATCACCAGCAACATCATCTACAACTACTACTAATATAACTCAATCACAATCAATATCACCACaacaattaatacaacaacaacatgccCATCAACAAGCTATTCATGAAAACGAACAATTTGCCTTAGCTTGGTTACGTGCCAATTATGAACCATGTACAAATAGTAAAGTTGATCATCAGGAATTATATAAACAGTATTTAAATTCGTGTTCAAAAATTGGTAGACGTGGAGTTATTTCTCCTTTGCATTTCCCAAGATGTGTACGgtCAGTATTTGGAGGTACAGTGGGTCCAAATCCGTTGAAGTTGTCCAATTCGAATGAATCACAGTATTATGAAGGCATAAAGGTGCGATCTCAACCTCTCGTAATTAATATCCAACCAATTTCCAATCCTAGTGTCACACAGCCCATTTCAAAAGGACCAAATAATCGACGAAAATCATCGTCAACATCatcgacaacaacaactacaacaacaacaacaacatccacATCCTTATCGGTTGTtgctgataataataatacaatcaaTGACCAATCACAATTGTCTCCTGCCTCACCTATCCTGAAGGCGCAGCTAAGTGCTCCTCCAAAACAGAGGGACACCACTGCACCTATCGGTATTAAAGGCGATATCAAAAGCCAGgTGATGGCACATCCACATCTCAGTCAAGCTTTATtaggaaataataataatagtacatcaaattctaatttaagtAAAGAGAATCAAACAGGTCAAAGCAATACATCGTTGATCAAAAGTTTATTGGCAACAAAGGTAAACGATTGCATGACAACAGTGAGCATGAGGACTGCAACAGACTGCCAAAATGTAGCTCAGgTTGCAGCAAGACAACAACAGCAAAGACTTCTAGCCCAACAAGTTACAACACCGTCCATTTCACTTGATACAAATAagaatgtaacaaaattagatgCATCGAAAGCATCTCGAATTAATGGTGTTCGACAATTATTTGCTGATAGTGATggTAAAAAGGAACCACCACAACCACCACCCCCTCCTTTGGCACCATTAAGTTcaacaacaccaccatcaacaacaccaataacaacaacaataataacaccaACAATAGTAACAAGAGTGAAAACAAATCGTGTTGAAAATGAAGATAGTGATTCTACTGGTAATAATTCTTTAGCATCTAGTTCAGGAATTGGTACAGTtggtattggtggtgtttCATCGACTGAAGATGGTGATAATTCATTAACTAGTTTTGAGGGTTTATTAAATGGTGTACCGAATATTGACAATCCATTAAATGAAGATAGTAATTCCAAAGATTCTGTTAAAGttgttaataatgaaataacgAAAAATCGGCCATTGAGATTGGCTGATTTATtagagaagaaaattgaaaaaccaCCACCTTTATTGAATGGTAGTTTAGGTAAAGAATTACGTTTAGGTGACAAAACTTTGGATTTAGTAGAAAATCATATTGAGAAAGCTCTTAGTcgtgataatgataacaataattcacatgataatcataatattgataagaaagcagaaaaaacaacaaataataataatgaaaataaattgaatttaaagcGGTCAGCCTCAGATGATATTGTTGAATCAGAAGCAAAGAAACCAATGTTAAATTCTAATGTCAATGGTTCATCCAGTGCTGCTGATTCACCAGCACCTGATTCTGTATCTAGTTCAAATGGTGATGAAGCTAATGCAACTGTATCAACAGCTGCTGCGAAATTATTTGCTGATATTGCTGCTGATATATTAgaagatgaagatgaagaaCAATTGTTACAAGAAGCTCAAccacaacatcaacaacagcagcagcaacaacatcaacaacaaactgAAATTGCAGTTCCTCCTTCAGTAACCGGGGCATCAGCGCCTGTCcaacaaattattgttgacAATAATCAACAAGTATTATTAACACAACCTAGACAAATTATTGTAACACAATCACAAATACAATCGAATGCAACAACAGCAGTTCTATCAACTGGTACaccaataaaaacacaaactGGACAAACAgtaattgtacaaaattcaaatcaacaaAGAACACCAGTCGTTCTACAACCAAATACTGgtcaaatattattatcacaaGGTATACAAGGGCAAGTACAATTAGTAGCTAGTACAACACAACCAGGTCAATATGTATTGCAAACAAGTGGTACACAAAATACTTATGTAGTGGCACAACCGCAAACTGCTGTTGTTCATGGTCAACCACAAACAGTTCTCGTTGCACAAACAGCACAACAACAAGGTAGTGGTacaaaaactataattatattacaacaacaagcACCATCAGCAACGGCTACACACCACCAAAAAGTTATGGTTACACCACAAGGTCAACAAGTTGTTGTTACGCAAGTCCATCGACCGGTATTACAAACATCAACTGtaacaaataatattataCCTGCTACATCGgttataaaaacaacaccaaTTACTACGATTACaacacaaaataatacaacagTGAATGGTGTTGGtggtaataatgataagaaaagTGAAGATATTAAACCGAAAATTGTTAGAGATTTGACAACACCGTTTGTTTGTGAATGGGGCGATTGTAATATagATATTAAATTTAAGTCAGCAAATCAAGTGTATTTGCACGTTTGTGAAGCACACTGCCCTAAAGGTACTGAAGAAATTGTTTGTCAATGGGAACGCTGTGATaatatgaaaagaaaaagattcTCATTGATGACACATCTACATGATAAACATTGCAATACAGaggCTATGAAACAAAATTTGACTAGGAGAAAACAAATCTCACAAGGTGGTAAAGTTGACCCACCACCACCGACACCAACTACCCCACATCCTGGTTATGCACCAGATGCTGCATTACATGCAATTAAAAGGCATGCATTGGAATTTGTCAATCCGAAGGAATTACAACAAAAAGCAGCTCCGAAACAAGGGGCACAAACAGTGCCTGTTTCTCCGCCCAGACCTGGGCCGTCTGCTACAGATCAGGATGATAATGAAGGTCCAGTAACGAAAAGTATAAGATTGACTGCATCTCTAATCCTTAGGAATCTCGTTATTTACAGCAGTAATTGCAGAagGTACTTAAAACATTATGAGCCTCATCTGGCGAATGTAGCCCTTAGTAATGTTGAATCGTCCAGGACGATAGCCCAAGTTCTTTATGATATGAATGAAGGAACGAATAGGTGA
Protein Sequence
MATILGKDPATYPKERDGFLRDLQHFHETRGTPFRRPPIIGGREVDLYLLYNLVISQGGWIKVNSKNGWVDVLEELNLPKECVNGSVALKQIYLRYLDRWEKVHFLGEEADRGSDDDEESRHKRWSARALHSVPLTYNYTQHAIADVNREYNHLSADLYKPSDYDKLALSLLSPLPNEQDFAINVCTLLSNDGKHTLKLEKHPRLIDYLLGHAGVFCHSSLRKLFVHCYRNIRKHSIHSFWNDVLESNEFLDLTNEDKFIRTNNTKIGEINEYDEEEKSKSDMEIDDDDVSDIYSVFDKDSDLKNFKDRLRFKLKLDNSDKELFCLGRQLGTQDYIGQRVLQITTILRNLSFTEENIPVLLKNRTFLRFLLLCASSRWGYLKNLAMDMLGNVAGEILIKNYPHDRLAVVLLKIITNGLKSEDRAACITSLEVLNKLSQNESNEEILLKYLEVEVFEKVCSFLTIHDVMLLIYTLECLYSLSSLGERSCNLIISNHGVVDTLVSLVTVEGKSYGPKACIGMKLVETVPGGISTTXXXXXXXXXXXXXXXXXSTSTNTTTTSAITTTTMSTTSTTNSNLTNTLSSTIITSNNSTLTTPSVAIKVSTSVTTPVRTVQVTPQRLLNISPSPATSSTTTTNITQSQSISPQQLIQQQHAHQQAIHENEQFALAWLRANYEPCTNSKVDHQELYKQYLNSCSKIGRRGVISPLHFPRCVRSVFGGTVGPNPLKLSNSNESQYYEGIKVRSQPLVINIQPISNPSVTQPISKGPNNRRKSSSTSSTTTTTTTTTTSTSLSVVADNNNTINDQSQLSPASPILKAQLSAPPKQRDTTAPIGIKGDIKSQVMAHPHLSQALLGNNNNSTSNSNLSKENQTGQSNTSLIKSLLATKVNDCMTTVSMRTATDCQNVAQVAARQQQQRLLAQQVTTPSISLDTNKNVTKLDASKASRINGVRQLFADSDGKKEPPQPPPPPLAPLSSTTPPSTTPITTTIITPTIVTRVKTNRVENEDSDSTGNNSLASSSGIGTVGIGGVSSTEDGDNSLTSFEGLLNGVPNIDNPLNEDSNSKDSVKVVNNEITKNRPLRLADLLEKKIEKPPPLLNGSLGKELRLGDKTLDLVENHIEKALSRDNDNNNSHDNHNIDKKAEKTTNNNNENKLNLKRSASDDIVESEAKKPMLNSNVNGSSSAADSPAPDSVSSSNGDEANATVSTAAAKLFADIAADILEDEDEEQLLQEAQPQHQQQQQQQHQQQTEIAVPPSVTGASAPVQQIIVDNNQQVLLTQPRQIIVTQSQIQSNATTAVLSTGTPIKTQTGQTVIVQNSNQQRTPVVLQPNTGQILLSQGIQGQVQLVASTTQPGQYVLQTSGTQNTYVVAQPQTAVVHGQPQTVLVAQTAQQQGSGTKTIIILQQQAPSATATHHQKVMVTPQGQQVVVTQVHRPVLQTSTVTNNIIPATSVIKTTPITTITTQNNTTVNGVGGNNDKKSEDIKPKIVRDLTTPFVCEWGDCNIDIKFKSANQVYLHVCEAHCPKGTEEIVCQWERCDNMKRKRFSLMTHLHDKHCNTEAMKQNLTRRKQISQGGKVDPPPPTPTTPHPGYAPDAALHAIKRHALEFVNPKELQQKAAPKQGAQTVPVSPPRPGPSATDQDDNEGPVTKSIRLTASLILRNLVIYSSNCRRYLKHYEPHLANVALSNVESSRTIAQVLYDMNEGTNR

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