Ltri004721.1
Basic Information
- Insect
- Lydus trimaculatus
- Gene Symbol
- Arid2
- Assembly
- GCA_037414755.1
- Location
- JAZBGY010000622.1:20787-34042[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- ARID
- Domain
- ARID domain
- PFAM
- PF01388
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 1 7.6e-26 1.2e-22 79.8 0.0 1 89 15 101 15 101 0.94
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGCCACTATACTCGGCAAGGATCCGTCCACGTACCCCAAGGAACGCGACGGCTTCCTACGGGACTTGCAACATTTCCACGAGACGCGCGGgACGCCGTTTAGAAGACCACCTATTATTGGTGGTAAAGAAGTTGATCTATATTTACTTTATAATTTGGTGATCAGTCAAGGTGGCTGGATTAAGGTAAATTCGAAGAATGGATGGTCGGAGcttttagaacaattaaatttgCCACAAGAATGTGTTAATGGTAGTGTTGCACTCAAACAAATCTATCTGAGgTATTTAGATAGATGGGAAAAGGTTCATTTTCTTGGTGAAGAAGCTGATAGAggtagtgatgatgatgaggagaGTAGACATAAAAGATGGTCGGCTAGGGCTTTACATTCAGTACCATTAACTTACAACTACATACAACATGCTATTGCTGATGCCAATCGTGAATACAATCATTTGTCAGCCGATTTATATAAACCATCAGATTATGATAAATTAGCATTATCACTTTTATCACCTTTACCAAATGAACaagattttgcaataaatgtatgtacattattatcaaatgatggTAAACATACATTAAAACTTGAAAAACATCCACGATTAATTGATTATCTACTTGGTCATGCTGGTGTATTTTGTCATGgCTCTCTACGAAAATTATTTGTACATTGTTATCGAAACATTCGTAAACATTCTATACTTACATTTTGGAATGATGTACTCGaatcaaatgaatttttgGATCTTACAAATGAAgataaattcaatcaacataataattctaaaaaagTTAGTGGTGATGATGGTATCGGTAGTGTTGTTatagttgatgatgatggaggtggtggtggtgatgaaaaatcaaaaagtgatatggaaattgatgatgatatttgtGACATTTATAGTGTATTAGATAAAGATagtgatttaaaaaattttaaggatcgtttacgttttaaattaaaattagaaaccAGTGATAgagaattattttgtttaggACGTCAACTTGGTACACAAGATTATATTGGTCAACGTGTTctacaaataacaacaatattaagaaatttaaGTTTTACAGAAGAGAATGTACCagtattgataaaaaatcgtacatttcttagatttttattattatgtgcTTCCTCACGTTGgggttatttaaaaaatctcgGTATGGATATGTTAGGTAATGTAGCTggtgaaatattaattaaagattatcCAAATGATCGTTTAgctaaagttttattaaaaattataacgaATGGTTTGAAAAGTGAAGATCGTGCTGCTTGTATTACATCATTAGAAGTATTAAATAAACTTAGTCAAAATGAATCGAATGAAGAGACATTATTGAAATGTCTTGAAGTGGAAGTGTTTGAAAAAGTGTGTTCATTTTTGACTATTCACGATGttatgttattaatttatacatTAGAATGTTTATATTCATTATCGTCACTAGGTGAACGatcttgtaatttaattataagcAATCATGGTGTAGTGGATACATTAGTGTCACTTGTTACTGTTGAAGGCAAAAGTTATGGTCCTAAAGCGTGTATTGGTATGAAATTAGTTGAAACTGTACCAGGTGGTATTAGtaatacaacatcaacatcaacacaaTCTGTTACGGTTTCTTCTacatcagcaacaacaactacaacaacaacaactgcatCATTagcaacaacgacaacaacaacaacaacactaacaACAAGTTCAAATCTTACAAATACATTATCATCTACAATTGTTGCATCAAatacatcaacatcattaacatcatgtgtaacaacaaaactttCTACAAATATAACAGCAACTCCTGTACGAACTGTACATGTAACACCTCaacgtttattaaatatttcaccatCACctacaacatcatcatcatcagcaactggtgtatcaacaacaacaactcagTCACAATCAATGACACcacaacaattaatacaacaacaacatgccCATCAACAAGCTATCcatgaaaatgaacaattcGCTTTAGCTTGGTTACGTGCCAATTATGAACCATGCATAAATAGTAAAGTTGATCATCAAGAACTTTATAAACAGTATTTGAATTCGTGTTCAAAAATCGGTAGGCGGGGAGTGATTTCTCCTTTACATTTTCCAAGATGTGTTCGGTCAGTATTTGGCGGCACAGTGGGTCCAAATCCAATGAAGACATCTAATTCAAGTGAATCACAGTATTATGAAGGCATTAAGGTGCGATCTCAACCACTCATAATTAATATCCAACCAAATTCCAATCCTATTGTCACACAGCCTATTTCGAAAGGAGCAAATAATCGacgaaaatcatcaacaacaacaacaacaacaattttatctacaccaacaacaacagcaacagcaacatCCCCTTGTTTATCGATTGTTGctgctgataataataatttaatcaatgaCCAATCACAAATGTCTCCTGCCTCACCTATCCTGAAGGCGCAGCTAAGTGCTCCTCCAAAACAGAGGGACACCACTGCACCACCTACCACTAGTAAAGGCGATATTAAAAGTcagGTTATGGCTCATCCACATCTTAGTCAAGCTTTATTaggaaataacaataatacaacatcaAATTCTAATACATGTAGTAAAGAGAATCAACAGGCAGGTCAAAGTAATACATCGCTGATTAAAAGTTTATTAGCTACAAAGGTAAACGATTGCATGACAACAGTGAGCATGAGGACTGCAACAGACTGCCAAAATGTAGCTCAGgtTGCAgcacgacaacaacaacaaagactTCTAGCCCAACAAGTGACAACACCGTCCATTtcaattgatacaaataaGAATCTTACAAAATTGGACACATCAAAAGCATCATCTCGTATCAATGGTGTTAGGCAGTTATTTGCTGATAGTGATGTAGGTGATTCATCTGTAACATCAACAAGTCAATTCACATATTTGTTAAAGGGTAAAAAGGaaccaccacaaccaccacctcCTCCTTTGACACCATTAAgttcaacattatcatcaacatctctatcatcatcatcaactacaacaacaacaacaacaccaccagcACTATTGACAAAAGTTAAAACAAATCGTCTTGAAAATGAAGATAGTGATTCGActggtaataattcaatagCTTCTAGTTCTGGAATAGGTACAGTTGGTATTGGTGGTGTTTCATCAACTGAGGATGGTGATAATTCATTAACTAGTTTTGAAGGTTTATTAAATGGTGTACCGAATATTGATAATCCATTGAATGAAGATAGTAATTCCAAAGATTCTGTTAAAGTTGTTGTTAgtaatgaaataacaaaaaatagacCTTTGCGATTGGCTGATTTATTAgagaagaaaattgaaaaaccaccaccattattgaATGGTAATTTAGGTAAAGAATTACGTTTAGGTGATCGAACTCTTGATTTAGTTGAAAATCATATTGAGAAGGCTCTTAGtcgtgataataataatgatcataataatattgaaaagagAAATGATATGATGATTGTgtcaaataatgaaaataataaaacgaatttaaaACGATCAGCATCagatgatattgttgaatcTGATGCAAAAAAACCAATGTTAAATTCGAATATTAATGGTTCAACAAGTGCTGCTGATTCACCAGCACCTGGTTCTGTGTCTAGTTCAAATGGTGATGAAGCTAATACAACTGTATCAACGGCAGCTGCAAAATTGTTTGCTGATATTGCAGCTGATATATtagaagatgaagatgaagaacaattattacaagaagCTCAACCACAAACACAGACTGAAATTACAGTTCCTCCAGTATCTGGTGCATCATCCGCACCTGTACAACAAatcattgttgataataatcaacaagtATTATTAACACAACCTAgacaaattattgttacacAATcacaaattcaatcaaatgCCACAACAGCTGTATTATCAACTGGTACaccaataaaaacacaaagtGGACAAACtgtaattgtacaaaattcaaatcaacaaagAACACCAGTTGTTTTACAACCAAATACTGgtcaaatattattatcacaagGTATACAAGGACAAGTACAATTAGTAGCTAGTACAACACAACCTGGACAATATGTTTTACAAACAAGTGGTACACAAAATACGTATGTCGTAGCACAACCACAAACTGCTGTTGTTCATGGACAACCACAAACAGTTTTAGTTGCACAAACAGCACAACAACAAGGTAGTGGTAcgaaaactataattatattacaacaacaagcaCCACAAACTACTGCTACACATCATCAAAAAGTAATGGTTACACCACAAGGACAACAAGTTGTTGTTACACAAGTACATCGACctgttttacaacaatcaactgtaacaaataatataataccAGCAACATCagttataaaaacaacaccagTCACAGCAGCAATTACAACACAAACTACAACAATCAATGGTGTTGGTAATAGTGAGAAGAAAAATGAAGAAACTAAACCGAAATTGGTTAGAGATTTAACAACACCGTTTGTCTGTGAATGGGGTGATTGTAATATAGATACTAAATTTAAATCAGCAAATCAGGTATATTTGCATGTTTGCGAAGCACATTGTCCTAAAGGTACTGAAGAAATTGTTTGTCAATGGGAACGTTGTGATaatatgaaaagaaaaagattCTCATTGATGACACATCTACATGATAAACATTGCAATACTGAAgCTATGAAACAAAGTTTGGttagaagaaaacaaatatcaCAAGGTGCTAAAGTtgatccaccaccaccaacaccaactACCCCACATCCTGGTTATGCCCCAGATGCTGCATTGCATGCAATCAAAAGGCATGCATTAGAATTTGTTAATCCAAAAGAATTACAACAAAAAGCAGCACCAAAACAAGGGGCACAAACTGTGCCTGTTACTCCGCCCAGACCTGGGCCTGC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- Protein Sequence
- MATILGKDPSTYPKERDGFLRDLQHFHETRGTPFRRPPIIGGKEVDLYLLYNLVISQGGWIKVNSKNGWSELLEQLNLPQECVNGSVALKQIYLRYLDRWEKVHFLGEEADRGSDDDEESRHKRWSARALHSVPLTYNYIQHAIADANREYNHLSADLYKPSDYDKLALSLLSPLPNEQDFAINVCTLLSNDGKHTLKLEKHPRLIDYLLGHAGVFCHGSLRKLFVHCYRNIRKHSILTFWNDVLESNEFLDLTNEDKFNQHNNSKKVSGDDGIGSVVIVDDDGGGGGDEKSKSDMEIDDDICDIYSVLDKDSDLKNFKDRLRFKLKLETSDRELFCLGRQLGTQDYIGQRVLQITTILRNLSFTEENVPVLIKNRTFLRFLLLCASSRWGYLKNLGMDMLGNVAGEILIKDYPNDRLAKVLLKIITNGLKSEDRAACITSLEVLNKLSQNESNEETLLKCLEVEVFEKVCSFLTIHDVMLLIYTLECLYSLSSLGERSCNLIISNHGVVDTLVSLVTVEGKSYGPKACIGMKLVETVPGGISNTTSTSTQSVTVSSTSATTTTTTTTASLATTTTTTTTLTTSSNLTNTLSSTIVASNTSTSLTSCVTTKLSTNITATPVRTVHVTPQRLLNISPSPTTSSSSATGVSTTTTQSQSMTPQQLIQQQHAHQQAIHENEQFALAWLRANYEPCINSKVDHQELYKQYLNSCSKIGRRGVISPLHFPRCVRSVFGGTVGPNPMKTSNSSESQYYEGIKVRSQPLIINIQPNSNPIVTQPISKGANNRRKSSTTTTTTILSTPTTTATATSPCLSIVAADNNNLINDQSQMSPASPILKAQLSAPPKQRDTTAPPTTSKGDIKSQVMAHPHLSQALLGNNNNTTSNSNTCSKENQQAGQSNTSLIKSLLATKVNDCMTTVSMRTATDCQNVAQVAARQQQQRLLAQQVTTPSISIDTNKNLTKLDTSKASSRINGVRQLFADSDVGDSSVTSTSQFTYLLKGKKEPPQPPPPPLTPLSSTLSSTSLSSSSTTTTTTTPPALLTKVKTNRLENEDSDSTGNNSIASSSGIGTVGIGGVSSTEDGDNSLTSFEGLLNGVPNIDNPLNEDSNSKDSVKVVVSNEITKNRPLRLADLLEKKIEKPPPLLNGNLGKELRLGDRTLDLVENHIEKALSRDNNNDHNNIEKRNDMMIVSNNENNKTNLKRSASDDIVESDAKKPMLNSNINGSTSAADSPAPGSVSSSNGDEANTTVSTAAAKLFADIAADILEDEDEEQLLQEAQPQTQTEITVPPVSGASSAPVQQIIVDNNQQVLLTQPRQIIVTQSQIQSNATTAVLSTGTPIKTQSGQTVIVQNSNQQRTPVVLQPNTGQILLSQGIQGQVQLVASTTQPGQYVLQTSGTQNTYVVAQPQTAVVHGQPQTVLVAQTAQQQGSGTKTIIILQQQAPQTTATHHQKVMVTPQGQQVVVTQVHRPVLQQSTVTNNIIPATSVIKTTPVTAAITTQTTTINGVGNSEKKNEETKPKLVRDLTTPFVCEWGDCNIDTKFKSANQVYLHVCEAHCPKGTEEIVCQWERCDNMKRKRFSLMTHLHDKHCNTEAMKQSLVRRKQISQGAKVDPPPPTPTTPHPGYAPDAALHAIKRHALEFVNPKELQQKAAPKQGAQTVPVTPPRPGPASTDQDDNEGPVTKSIRLTASLILRNLVIYSTNCRRYLKHYEPHLANVALSNVESSRTIAQVLYDMNEGTNR
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_01022006;
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
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