Basic Information

Gene Symbol
Arid2
Assembly
GCA_013841185.1
Location
JACDRP010000043.1:100240-113081[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 3.3e-25 5.8e-22 77.4 0.0 1 89 15 101 15 101 0.94

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGCCACGATTCTCGGCAAGGACCCAGCCGTATACCCCAAGGAGCGAGACGGTTTCCTTCGGGATCTACAACATTTCCACGAGACGCGCGGAACGCCGTTTCGACGACCACCTATCATCGGTGGTAAAGAAGTCGATCTATATTTACTCTATAATTTGGTAATCAGTCAAGGTGGTTGGATCAAGGTAAATTCGAAAAGTGGTTGGGTTGATGTTTTAGAAGAGTTAAACTTGCCGAAAGAATGTGTAAATGGTAGTGTTGCCTTAAAACAAATCTATTTAAGGTATTTAGATCGATGGGAGAAGGTGCATTTTCTTGGTGAAGAAGCTGATAGAGGTAGTGATGATGATGAAGAGAGTAGACATAAAAGATGGTCGGCTAGAGCTTTACATTCAGTACCCCTAACTTATAACTATACACAACATGCTATAGCCGATGTCAATAGAGAGTACAATCACTTATCCGCCGATTTGTATAAACCATCCGATTATGATAAACTAGCTTTATCACTTTTATCACCATTACCAAATGAACAAGATTTTGCTATAAATGTGTGTACATTATTATCAAATGATGGTAAACATACGTTAAAATTGGAAAAACATCCGCGATTAATTGATTATCTACTCGGTCATGCTGGTGTCTTTTGTCATAGCTCTCTTCGAAAGTTGTTTGTATATTGTTATCGGAATATCCGTAAACATTCAATTCATAGTTTTTGGAATGATGTACTCGAATCAAATGAATTTTTAGATCTCACAAATGAAGATAAATTTATTCGAACGAATAATTCTAAAATAGTTGAAATTAATAAAGTTGATAATAATAATGTTGATGATGGTGGTGTGAAGGAAGAAAAATCAAAAAGTGATATGGAAGTTGACGACGATGATGATGATGATAATGTTTGTGACATTTATAGTGTATTAGAGAAAGACAGTGATTTAAAAAATTTTAAAGATCGTTTACGTTTTAAAATAAAATTAGGTACAAGTGATAAAGAATTATTTTGTTTAGGAAGACAATTAGGTACACAAGATTATATTGGTCAACGTGTTTTACAAATAACAACAATTTTACGAAATCTTAGTTTTACAGAAGAGAATATACCAGTATTGTTGAAAAATCGAACATTTCTTAGGTTTATATTATTATGTGCTTCCTCGCGTTGGGGTTATTTAAAAAATCTCGCTATGGACATGTTAGGTAATGTGGCTGGTGAAATTTTAATTAAAAATTATCCACACGACCGATTAGCTGTAGTTTTATTAAAAATTATAACAAATGGCCTAAAAAGTGAGGATAGAGCTGCTTGTATTACGTCACTTGAAGTATTAAATAAACTTAGTCAAAATGAATCGAATGAAGAAATATTATTAAAATATCTTGAAGTGGAAGTGTTTGAGAAAGTGTGTTCTTTTTTAACGATTCACGATGTTATGTTATTAATTTATACATTAGAATGTTTATATTCATTATCGTCTCTAGGTGAACGTTCTTGTAATTTAATTATAAGCAATCACGGTGTAGTGGATACTTTAGTGTCACTAGTTACTGTTGAAGGAAAAAGTTATGGCCCTAAAGCATGTATTGGTATGAAATTAGTTGAAACTGTACCAGGTGGGATTAGTACAACGACATCGACGACAACAGCAGCAGCAACAACAACAACAACAACACAATCTAATTCAACTACTAGTAATATAACAACAACAACAACGGCAACAACAACATTAACAACAAATTCCAATTTCACAAATACATTATCATCCGCAATAATCACATCTAACAATTCAACATTATCAACACCATCTGTTGCAATAAAAGTTTCGACAAATGTAACAACACCTGTACGAACTGTACAAGTAACACCACAACGTTTATTAAATATTTCACCATCACCAGCGGCATCATCTACAACTACAGCTAATATAACTCAATCACAATCAATGACACCACAACAATTAATACAACAACAACATGCCCATCAACAAGCTATTCATGAAAATGAACAATTCGCCTTAGCTTGGTTACGTGCCAATTATGAACCATGTACAAATAGTAAAGTTGATCATCAAGAATTATATAAACAGTATTTAAATTCGTGTTCAAAAATTGGTAGAAGGGGTGTTATCTCCCCTTTGCATTTCCCAAGATGTGTACGGTCAGTATTTGGAGGTACAGTGGGTCCAAATCCGATGAAGTTGTCCAATTCGAATGAATCACAGTATTATGAAGGCATAAAGGTGATGGCACATCCACATCTGAGTCAGGCTTTATTAGGAAATAATAATAGTACATCAAATTCTAATTTAAGTAAAGAGAATCAAACAGGTCAAAGCAATACGTCGTTGATCAAAAGTTTATTAGCAACAAAGGTAAACGATTGCATGACAACAGTGAGCATGAGGACTGCAACAGACTGCCAAAATGTAGCTCAGGTTGCAGCACGACAACAACAACAAAGACTTTTAGCTCAACAAGTGACAACACCGTCCATTTCAGTTGATACAAATAAAAATCTAACAAAATTAGACGCATGTAAAGCATCTCGAATAAATGGTGTTCGACAATTATTTGCTGATAGTGATAGTAAAAAGGAACCACCACAACCACCACCCCCTCCTTTAGCACCGTTAAGTTCAACAACTCTATCATCATCATCAGCAACAACTACAACAACAACAACAATAATAACACCAACTATAGTAACAAAAGTGAAAACGAATCGAGTTGAAAATGAAGATAGTGATTCAACTGGTAATAATTCATTAGCATCTAGTTCAGGAATTGGTACAGTTGGTATCGGTGGTGTTTCATCAACTGAAGATGGTGATAATTCATTAACTAGTTTTGAAGGTTTATTAAATGGTGTACCAAATATTGACAATCCATTAAATGAAGATAGTAATTCCAAAGATTCTGTTAAAGTTGTTAGTAATGAAATAACGAAAAATCGTCCGTTACGATTGGCTGATTTATTAGAGAAGAAAATTGAAAAACCACCACCTTTATTGAATGGTAGTTTAGGTAAAGAATTACGTTTAGGTGAGAAAACTTTGGATTTAGTTGAAAATCATATTGAGAAAGCCCTTAGTCGTGATAATGATAATAATTCGCATGATAATCACAATATTGATAAGAAAACAGAAACAACAAATAATAATGAAAATAAATTGAATTTAAAACGGCCAGCCTCGGATGATATTGTTGAATCGGAAGCAAAGAAACCAATGTTGAATGTTAACGGTTCTTCAAGTGCTGCAGATTCACCAGCTCCAGATTCTGTATCTAGTTCAAATGGTGATGAAGCTAATACAACTGTATCAACAGCAGCTGCGAAATTATTTGCGGATATTGCTGCTGATATTTTGGAAGATGAAGATGAAGAACAATTGTTACAAGAAGCTCAACCACAACAACAACATCATCATCAACAACAACAACAACAACAGACTGAAATTGCAGTTCCTCCTCCAGTATCCGGGACATCAGCGCCTGTTCAACAAATTATTGTCGATAATAATCAACAAGTATTATTAACACAACCTAGACAAATTATTGTAACACAATCACAAATCCAATCGAATGCAACAACAGCAGTTTTATCGACTGGTACGCCAATAAAAACACAAACTGGACAAACTGTAATTGTACAAAATTCAAATCAACAAAGAACACCAGTCGTCCTACAACCGAATACTGGTCAAATTCTATTATCACAAGGTATACAAGGGCAAGTACAATTAGTAGCTAGTACAACACAACCTGGCCAATATGTATTGCAAACAAGTGGTACACAAAATGCTTATGTTGTGGCACAACCACAAACTGCAGTTGTACATGGACAACCGCAAACTGTTCTTGTTGCACAAACAGCCCAACAACAAGGTAGCGGTACAAAAACTATAATTATTTTACAACAACAAGCACCATCAACAACGGCTACACATCATCAAAAAGTTATGGTTACACCACAAGGTCAACAAGTTGTTGTTACACAAGTCCATCGGCCGGTATTACAAACATCAACTGTAACAAATAATATTATACCGGCTACATCTGTAATAAAAACAACACCAATTACAACTATTACAACACAAAATAATACAACAACAGTGAATGGTGTTGGTGGCAATAACGATAAGAAAAATGATGAAACTAAACCGAAAATTATTCGAGATTTATCTACACCGTTTGTTTGTGAATGGGGTGATTGTAATATAGATACTAAATTTAAGTCAGCAAATCAGGTGTATTTGCATGTTTGTGAAGCACATTGTCCTAAAGGTACTGAAGAAATTGTTTGTCAATGGGAGCGCTGTGATAATATGAAAAGAAAAAGATTCTCATTGATGACACATCTACACGATAAACATTGTAATACAGAGGCTATGAAACAGAGTTTGACTAGAAGAAAACAAATCTCCCAAGGCGCTAAAGTTGATCCACCACCACCGACACCAACGACCCCCCATCCTGGTTATGCACCGGATGCTGCATTACATGCAATTAAACGGCATGCATTAGAATTTGTCAATCCGAAAGAATTGCAACAAAAAGCAGCACCGAAACAGGGGGCACAAACAGTGCCTGTTTCATCGCCCAGACCTGGGCCATCTGCTACCGATCAGGATGATAATGAAGGTCCAGTAACGAAAAGTATAAGGTTGACTGCATCTCTAATACTTAGGAATCTCGTTATTTACAGCAGTAACTGTAGAAGGTACTTAAAACATTATGAGCCTCATCTGGCGAATGTAGCCCTTAGTAATGTTGAATCGTCCCGGACGATAGCCCAAGTTCTTTATGATATGAATGAAGGGACGAATAGGTGA
Protein Sequence
MATILGKDPAVYPKERDGFLRDLQHFHETRGTPFRRPPIIGGKEVDLYLLYNLVISQGGWIKVNSKSGWVDVLEELNLPKECVNGSVALKQIYLRYLDRWEKVHFLGEEADRGSDDDEESRHKRWSARALHSVPLTYNYTQHAIADVNREYNHLSADLYKPSDYDKLALSLLSPLPNEQDFAINVCTLLSNDGKHTLKLEKHPRLIDYLLGHAGVFCHSSLRKLFVYCYRNIRKHSIHSFWNDVLESNEFLDLTNEDKFIRTNNSKIVEINKVDNNNVDDGGVKEEKSKSDMEVDDDDDDDNVCDIYSVLEKDSDLKNFKDRLRFKIKLGTSDKELFCLGRQLGTQDYIGQRVLQITTILRNLSFTEENIPVLLKNRTFLRFILLCASSRWGYLKNLAMDMLGNVAGEILIKNYPHDRLAVVLLKIITNGLKSEDRAACITSLEVLNKLSQNESNEEILLKYLEVEVFEKVCSFLTIHDVMLLIYTLECLYSLSSLGERSCNLIISNHGVVDTLVSLVTVEGKSYGPKACIGMKLVETVPGGISTTTSTTTAAATTTTTTQSNSTTSNITTTTTATTTLTTNSNFTNTLSSAIITSNNSTLSTPSVAIKVSTNVTTPVRTVQVTPQRLLNISPSPAASSTTTANITQSQSMTPQQLIQQQHAHQQAIHENEQFALAWLRANYEPCTNSKVDHQELYKQYLNSCSKIGRRGVISPLHFPRCVRSVFGGTVGPNPMKLSNSNESQYYEGIKVMAHPHLSQALLGNNNSTSNSNLSKENQTGQSNTSLIKSLLATKVNDCMTTVSMRTATDCQNVAQVAARQQQQRLLAQQVTTPSISVDTNKNLTKLDACKASRINGVRQLFADSDSKKEPPQPPPPPLAPLSSTTLSSSSATTTTTTTIITPTIVTKVKTNRVENEDSDSTGNNSLASSSGIGTVGIGGVSSTEDGDNSLTSFEGLLNGVPNIDNPLNEDSNSKDSVKVVSNEITKNRPLRLADLLEKKIEKPPPLLNGSLGKELRLGEKTLDLVENHIEKALSRDNDNNSHDNHNIDKKTETTNNNENKLNLKRPASDDIVESEAKKPMLNVNGSSSAADSPAPDSVSSSNGDEANTTVSTAAAKLFADIAADILEDEDEEQLLQEAQPQQQHHHQQQQQQQTEIAVPPPVSGTSAPVQQIIVDNNQQVLLTQPRQIIVTQSQIQSNATTAVLSTGTPIKTQTGQTVIVQNSNQQRTPVVLQPNTGQILLSQGIQGQVQLVASTTQPGQYVLQTSGTQNAYVVAQPQTAVVHGQPQTVLVAQTAQQQGSGTKTIIILQQQAPSTTATHHQKVMVTPQGQQVVVTQVHRPVLQTSTVTNNIIPATSVIKTTPITTITTQNNTTTVNGVGGNNDKKNDETKPKIIRDLSTPFVCEWGDCNIDTKFKSANQVYLHVCEAHCPKGTEEIVCQWERCDNMKRKRFSLMTHLHDKHCNTEAMKQSLTRRKQISQGAKVDPPPPTPTTPHPGYAPDAALHAIKRHALEFVNPKELQQKAAPKQGAQTVPVSSPRPGPSATDQDDNEGPVTKSIRLTASLILRNLVIYSSNCRRYLKHYEPHLANVALSNVESSRTIAQVLYDMNEGTNR

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_01022006;
90% Identity
iTF_00813501;
80% Identity
iTF_00814142;