Hcic008722.1


Basic Information
Transcription Factor Domain
Sequence Information
Similer Transcription Factors

Basic Information

Insect
Hycleus cichorii
Gene Symbol
Arid2
Assembly
GCA_013841215.1
Location
JACDRQ010000025.1:143969-156503[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 9.3e-26 1.7e-22 79.1 0.0 1 89 15 101 15 101 0.94

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGCCACGATTCTCGGCAAGGACCCAGCCGTATACCCCAAGGAGCGAGACGGTTTCCTTCGGGATCTACAGCATTTCCACGAGACGCGCGGAACGCCGTTTCGAAGACCACCTATCATCGGTGGTAAAGAAGTCGATCTATATTTACTCTATAATTTGGTAATCAGTCAAGGTGGTTGGATCAAGGTAAATTCGAAAAATGGTTGGGTTGATGTTTTAGAAGAGTTAAACTTGCCGAAAGAATGTGTAAATGGTAGTGTTGCCTTAAAACAAATCTATTTAAGGTATTTAGATCGATGGGAGAAGGTGCATTTTCTTGGTGAAGAAGCTGATAGAGGTAGTGATGATGATGAAGAGAGTAGACATAAAAGATGGTCGGCTAGAGCTTTACATTCAGTACCCCTAACTTATAACTATACACAACATGCTATAGCCGATGTCAATAGAGAGTACAATCACTTATCCGCCGATTTGTATAAACCATCCGATTATGATAAACTAGCTTTATCACTTTTATCACCATTACCAAATGAACAAGATTTTGCTATAAATGTGTGTACATTATTATCAAATGATGGTAAACATACGTTAAAATTGGAAAAACATCCGCGATTAATTGATTATCTACTCGGTCATGCTGGTGTCTTTTGTCATAGCTCTCTTCGAAAGTTGTTTGTATATTGTTATCGGAATATCCGTAAACATTCAATTCATAGTTTTTGGAATGATGTACTCGAATCAAATGAATTTTTAGATCTCACAAATGAAGATAAATTTATTCGAACGAATAATTCTAAAATAGGTGAAATTAGTAAAGTTGATAATAATAATGTTGATGATGGTGGTGTGGAGGAAGAAACATCAAAAAGTGATATGGAAGTTGACGATGATGATGATGATGTTTGTGACATTTATAGTGTATTAGAGAAAGACAGTGATTTAAAAAATTTTAAAGATCGTTTACGTTTTAAAATAAAATTAAGTACAAGTGATAAAGAATTATTTTGTTTAGGCAGACAATTAGGTACACAAGATTATATTGGTCAACGTGTTTTACAAATAACAACAATTTTACGAAATCTTAGTTTTACAGAAGAGAATATACCAGTATTGTTGAAAAATCGAACATTTCTTAGGTTTTTATTATTATGTGCTTCCTCGCGTTGGGGTTATTTAAAAAATCTCGCCATGGACATGTTAGGTAATGTGGCTGGTGAAATTTTAATTAAAAATTATCCACACGACCGATTAGCTGTAGTTTTATTAAAAATTATAACAAATGGCCTAAAAAGTGAGGATAGAGCTGCTTGTATTACGTCACTTGAAGTATTAAATAAACTTAGTCAAAATGAATCGAATGAAGAAATATTATTAAAATATCTTGAAGTGGAAGTGTTTGAGAAAGTGTGTTCTTTTTTAACGATTCACGATGTTATGTTATTAATTTATACATTAGAATGTTTATATTCATTATCGTCTCTAGGTGAACGTTCTTGTAATTTAATTATAAGCAATCATGGTGTAGTGGATACTTTAGTGTCACTAGTTACTGTTGAAGGAAAAAGTTATGGTCCTAAAGCATGTATTGGTATGAAATTGGTTGAAACTGTACCAGGTGGGATTAGTACAACGACATCGACGACAACAGCAGCAACAACAACAACAACAACACAATCTAATTCAACTATTAGTAATACAACAATAACAACAACGGCGACAACAACAACAACAACATTAACAACAAATTCCAATTTCACAAATACATTATCATCTGCAATAATTACATCAAACAATTCAACATTATCAACTCCATCTGTTGCAATAAAAGTTTCGACAAATGTAACAACACCTGTACGAACTGTACAAGTAACACCACAACGTTTATTAAATATTTCACCATCACCAGCGGCATCATCTACAACTACAGCTAATATAACTCAATCACAATCAATGACACCACAACAATTAATACAACAACAACATGCCCATCAACAAGCTATTCATGAAAATGAACAATTCGCCTTAGCTTGGTTACGTGCCAATTATGAACCATGTACAAATAGTAAAGTTGATCATCAAGAATTATATAAGCAGTATTTAAATTCGTGTTCAAAAATTGGTAGAAGGGGTGTTATCTCCCCTTTGCATTTCCCAAGATGTGTACGGTCAGTATTTGGAGGTACAGTGGGTCCAAATCCGATGAAGTTGTCCAATTCGAATGAATCACAGTATTATGAAGGCATAAAGGTGCGATCTCAACCTCTCATAATTAATATCCAACCAAATTCCAATCCTAGTGTCACGCAGCCCATTTCAAAAGGACCAAATAATCGACGAAAATCATCGTCAACAACATCGACAACAACTACTACGACTACAACAACAACATCCACATCCTTATCAGTTGTTGCTGATAATAATAATACAATCAATGACCAATCACAATTGTCTCCTGCCTCACCTATCCTGAAGGCGCAGCTAAGTGCTCCTCCAAAACAGAGGGACACCACTGCACCTATCGGTAGTAAAGGCGATATCAAAAGCCAGGTGATGGCACATCCACATCTGAGTCAAGCTTTATTAGGAAATAATAATAGTACATCAAATTCTAATTTAAGTAAAGAGAATCAAACAGGTCAAAGCAATACGTCGTTGATCAAAAGTTTATTAGCAACAAAGGTAAACGATTGCATGACAACAGTGAGCATGAGGACTGCAACAGACTGCCAAAATGTAGCTCAGGTTGCAGCACGACAACAACAACAAAGACTTTTAGCTCAACAAGTGACAACACCGTCCATTTCAGTTGATACAAATAAAAATCTAACAAAATTAGATGCATGTAAAGCATCTCGAATAAATGGTGTTCGACAATTATTCGCCGACAGTGATAGTAAAAAGGAACCACCACAACCGCCACCCCCTCCTTTAGCACCGTTAAGTTCAACAACTCTATCATCAACATCAGCAACAACAACAACACCAACTATAGTAACAAAAGTGAAAACGAATCGTGTTGAAAATGAAGATAGTGATTCAACTGGTAATAATTCATTAGCATCTAGTTCAGGAATTGGTACAGTTGGTATTGGTGGTGTTTCATCAACTGAAGATGGTGATAATTCATTAACTAGTTTTGAAGGTTTATTAAATGGTGTACCAAATATTGACAATCCATTAAATGAAGATAGTAATTCCAAAGATTCTGTTAAAGTTGTTTGTAATGAAATAACGAAAAATCGTCCGTTACGATTGGCTGATTTATTAGAGAAGAAAATTGAAAAACCACCACCTTTATTGAATGGTAGTTTAGGTAAAGAATTGCGTTTAGGTGAGAAAACTTTGGATTTAGTTGAAAATCATATTGAGAAAGCCCTTAGTCGTGATAATGATAATAATTCGCATGATAATCACAATATTGATAAGAAAACAGAAACAACAAATAATAATGAAAATAAATTGAATTTAAAACGGCCAGCCTCGGATGATATTGTTGAATCGGAAGCAAAGAAACCAATGTTGAATGTTAACGGTTCTTCAAGTGCTGCAGATTCACCAGCTCCGGATTCTGTATCTAGTTCAAATGGTGATGAAGCTAATACGACTGTATCAACAGCAGCTGCGAAATTATTTGCTGATATTGCTGCTGATATTTTGGAAGATGAAGATGAAGAACAGTTGTTACAAGAAGCTCAACCACAACAACAACATCAACAGCAACAACAACAACAACAACAGACTGAAATTGCAGTTCCTCCTCCAGTATCCGGGACATCAGCGCCTGTTCAACAAATTATTGTCGATAATAATCAACAAGTATTATTAACACAACCTAGACAAATTATTGTAACACAATCACAAATCCAATCGAATGCTACAACAGCAGTTTTATCGACTGGTACGCCAATAAAAACACAAACTGGACAAACTGTAATTGTACAAAATTCCAATCAACAAAGAACACCAGTCGTCCTACAACCGAATACTGGTCAAATTCTATTATCACAAGGTATACAAGGGCAAGTACAATTAGTAGCTAGTACAACACAACCTGGCCAATATGTATTACAAACAAGTGGTACACAAAATGCTTATGTTGTGGCACAACCACAAACTGCAGTTGTACATGGACAACCGCAAACCGTTCTTGTTGCACAAACAGCCCAACAACAAGGTAGCGGTACAAAAACTATAATTATTTTACAACAACAAGCACCATCAACAACGGCTACACATCATCAAAAAGTTATGGTTACACCACAAGGTCAACAAGTTGTTGTAACACAAGTCCATCGACCGGTATTGCAAACATCAACTGTAACAAATAATATTATACCGGCTACATCTGTAATAAAAACAACACCAATTACAACTATTACAACACAAAATAATACAACAACAGTGAATGGTGTTGGTGGTAATAACGATAAGAAAATTGATGAAACTAAACCGAAAATTGTTCGAGATTTAACAACACCGTTTGTTTGCGAATGGGGTGATTGTAATATAGATACTAAATTTAAGTCAGCAAATCAGGTGTATTTGCATGTTTGTGAAGCACATTGTCCTAAAGGTACTGAAGAAATTGTTTGTCAATGGGAGCGCTGTGATAATATGAAAAGAAAAAGATTCTCATTGATGACACATCTACACGATAAACACTGCAATACAGAGGCTATGAAACAGAGTTTGACTAGAAGAAAACAAATCTCCCAAGGCGCTAAAGTTGACCCACCACCACCGACACCAACGACCCCCCATCCTGGTTATGCACCGGATGCTGCACTACATGCAATTAAACGGCATGCATTAGAATTTGTAAATCCGAAAGAATTGCAAGATGATAATGAAGGTCCAGTAACGAAAAGTATAAGGTTGACTGCATCTCTAATACTTAGGAATCTCGTTATTTACAGCAGTAACTGTAGAAGGTACTTAAAACATTATGAGCCCCATCTGGCGAATGTAGCCCTTAGTAATGTTGAATCGTCCCGGACGATAGCCCAAGTTCTTTATGATATGAATGAAGGGACGAATAGGTGA
Protein Sequence
MATILGKDPAVYPKERDGFLRDLQHFHETRGTPFRRPPIIGGKEVDLYLLYNLVISQGGWIKVNSKNGWVDVLEELNLPKECVNGSVALKQIYLRYLDRWEKVHFLGEEADRGSDDDEESRHKRWSARALHSVPLTYNYTQHAIADVNREYNHLSADLYKPSDYDKLALSLLSPLPNEQDFAINVCTLLSNDGKHTLKLEKHPRLIDYLLGHAGVFCHSSLRKLFVYCYRNIRKHSIHSFWNDVLESNEFLDLTNEDKFIRTNNSKIGEISKVDNNNVDDGGVEEETSKSDMEVDDDDDDVCDIYSVLEKDSDLKNFKDRLRFKIKLSTSDKELFCLGRQLGTQDYIGQRVLQITTILRNLSFTEENIPVLLKNRTFLRFLLLCASSRWGYLKNLAMDMLGNVAGEILIKNYPHDRLAVVLLKIITNGLKSEDRAACITSLEVLNKLSQNESNEEILLKYLEVEVFEKVCSFLTIHDVMLLIYTLECLYSLSSLGERSCNLIISNHGVVDTLVSLVTVEGKSYGPKACIGMKLVETVPGGISTTTSTTTAATTTTTTQSNSTISNTTITTTATTTTTTLTTNSNFTNTLSSAIITSNNSTLSTPSVAIKVSTNVTTPVRTVQVTPQRLLNISPSPAASSTTTANITQSQSMTPQQLIQQQHAHQQAIHENEQFALAWLRANYEPCTNSKVDHQELYKQYLNSCSKIGRRGVISPLHFPRCVRSVFGGTVGPNPMKLSNSNESQYYEGIKVRSQPLIINIQPNSNPSVTQPISKGPNNRRKSSSTTSTTTTTTTTTTSTSLSVVADNNNTINDQSQLSPASPILKAQLSAPPKQRDTTAPIGSKGDIKSQVMAHPHLSQALLGNNNSTSNSNLSKENQTGQSNTSLIKSLLATKVNDCMTTVSMRTATDCQNVAQVAARQQQQRLLAQQVTTPSISVDTNKNLTKLDACKASRINGVRQLFADSDSKKEPPQPPPPPLAPLSSTTLSSTSATTTTPTIVTKVKTNRVENEDSDSTGNNSLASSSGIGTVGIGGVSSTEDGDNSLTSFEGLLNGVPNIDNPLNEDSNSKDSVKVVCNEITKNRPLRLADLLEKKIEKPPPLLNGSLGKELRLGEKTLDLVENHIEKALSRDNDNNSHDNHNIDKKTETTNNNENKLNLKRPASDDIVESEAKKPMLNVNGSSSAADSPAPDSVSSSNGDEANTTVSTAAAKLFADIAADILEDEDEEQLLQEAQPQQQHQQQQQQQQQTEIAVPPPVSGTSAPVQQIIVDNNQQVLLTQPRQIIVTQSQIQSNATTAVLSTGTPIKTQTGQTVIVQNSNQQRTPVVLQPNTGQILLSQGIQGQVQLVASTTQPGQYVLQTSGTQNAYVVAQPQTAVVHGQPQTVLVAQTAQQQGSGTKTIIILQQQAPSTTATHHQKVMVTPQGQQVVVTQVHRPVLQTSTVTNNIIPATSVIKTTPITTITTQNNTTTVNGVGGNNDKKIDETKPKIVRDLTTPFVCEWGDCNIDTKFKSANQVYLHVCEAHCPKGTEEIVCQWERCDNMKRKRFSLMTHLHDKHCNTEAMKQSLTRRKQISQGAKVDPPPPTPTTPHPGYAPDAALHAIKRHALEFVNPKELQDDNEGPVTKSIRLTASLILRNLVIYSSNCRRYLKHYEPHLANVALSNVESSRTIAQVLYDMNEGTNR

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_01022006;
90% Identity
iTF_00813459; iTF_01021965; iTF_01022006; iTF_00814142; iTF_00814184;
80% Identity
iTF_00813459;