Basic Information

Gene Symbol
-
Assembly
GCA_949318255.1
Location
OX439141.1:31088361-31101888[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
THAP
Domain
THAP domain
PFAM
PF05485
TF Group
Zinc-Coordinating Group
Description
The THAP domain is a putative DNA-binding domain (DBD) and probably also binds a zinc ion. It features the conserved C2CH architecture (consensus sequence: Cys - 2-4 residues - Cys - 35-50 residues - Cys - 2 residues - His). Other universal features include the location of the domain at the N-termini of proteins, its size of about 90 residues, a C-terminal AVPTIF box and several other conserved residues. Orthologues of the human THAP domain have been identified in other vertebrates and probably worms and flies, but not in other eukaryotes or any prokaryotes [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 34 3.8e-14 4.7e-11 44.8 2.2 1 86 174 246 174 247 0.83
2 34 6e-15 7.4e-12 47.4 4.7 1 87 274 343 274 343 0.80
3 34 4.6e-15 5.6e-12 47.7 0.3 1 87 364 436 364 436 0.83
4 34 4.1e-13 5e-10 41.5 2.6 1 86 516 584 516 585 0.78
5 34 1.6e-15 2e-12 49.2 5.6 1 87 609 681 609 681 0.81
6 34 9.1e-12 1.1e-08 37.2 1.2 1 87 716 784 716 784 0.80
7 34 9e-11 1.1e-07 34.0 3.4 1 86 825 894 825 895 0.72
8 34 1.6e-14 1.9e-11 46.0 0.3 1 86 922 991 922 992 0.81
9 34 1.4e-13 1.7e-10 43.0 1.7 1 86 1014 1083 1014 1084 0.80
10 34 2.1e-13 2.5e-10 42.4 2.4 1 87 1112 1184 1112 1184 0.86
11 34 3.1e-06 0.0038 19.4 0.1 1 59 1251 1303 1251 1331 0.76
12 34 1.6e-10 1.9e-07 33.2 0.7 1 87 1348 1420 1348 1420 0.80
13 34 7.6e-13 9.3e-10 40.6 2.2 1 87 1451 1522 1451 1522 0.79
14 34 3e-13 3.6e-10 41.9 3.7 1 87 1567 1640 1567 1640 0.84
15 34 4.9e-14 5.9e-11 44.5 0.4 1 87 1661 1729 1661 1729 0.79
16 34 1.3e-13 1.6e-10 43.1 0.1 1 87 2047 2116 2047 2116 0.81
17 34 2.8e-11 3.3e-08 35.6 4.8 1 86 2174 2263 2174 2264 0.78
18 34 1.4e-11 1.7e-08 36.6 1.7 1 87 2296 2368 2296 2368 0.79
19 34 3.2e-12 3.9e-09 38.6 2.1 1 87 2395 2461 2395 2461 0.81
20 34 3.3e-13 4e-10 41.8 1.3 1 87 2481 2551 2481 2551 0.81
21 34 3.5e-13 4.3e-10 41.7 1.7 1 87 2574 2645 2574 2645 0.81
22 34 2.1e-05 0.025 16.8 0.2 1 60 2661 2709 2661 2739 0.77
23 34 9.9e-11 1.2e-07 33.9 6.0 1 86 2749 2818 2749 2819 0.81
24 34 3.7e-11 4.5e-08 35.2 3.3 1 86 2844 2914 2844 2915 0.82
25 34 3.3e-13 4e-10 41.8 7.7 1 86 2935 3007 2935 3008 0.81
26 34 3.3e-10 4e-07 32.2 4.4 1 86 3028 3097 3028 3098 0.80
27 34 2.4e-13 2.9e-10 42.3 3.2 1 86 3452 3528 3452 3529 0.81
28 34 7.3e-08 8.8e-05 24.7 1.4 1 84 3548 3616 3548 3619 0.72
29 34 1e-11 1.3e-08 37.0 1.3 1 86 3642 3711 3642 3712 0.80
30 34 0.37 4.5e+02 3.2 0.2 27 73 3768 3817 3728 3830 0.53
31 34 1.2e-13 1.4e-10 43.2 0.8 1 86 3844 3918 3844 3919 0.86
32 34 1.3e-12 1.6e-09 39.9 0.1 1 76 3944 4016 3944 4023 0.78
33 34 5.4e-12 6.6e-09 37.9 6.2 1 87 4142 4215 4142 4215 0.81
34 34 1.8e-12 2.2e-09 39.4 0.1 1 86 4240 4309 4240 4310 0.81

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGAACTACATGATCATTATATGGCAAATGAagatttttgtggaaaattttacgataaaaaagccTTTAAAAAACCAATTACCTCGTCGTCATCACCTTATTTGGGAAAACCGGAAAGCTCGAATTTGGAAATCGCTCATACATTTTCGTTGAAAGaTATACCTCCTGCCAATAGCCATCACTTGGATACATTATATGCAAAACCCTCCACCTCAAAATCTTCTATGGAACCACCTACAACACCTTCGTCCTCAGCATTCAATTCGGTAAATGAATTTTCTGCTTTAGAGCCACATATAGAGGTAAAAACTGAAATTAAAGTAGAACCAGATTTTTATCCACCCATGGATCAAACTGATTATGCTAGCTATGACAATGATTATGGGACACCCGATTATACCTCCGGTTCTAATcaaagtttatcttttcttcaTGAGTATCAAGATAATGCTTCCAGCTCTACCAATTCATCGTATTCCTTCAACAATAACGAGGCCGTTCAAGATGAAGATGCCATTTGTTGTGTGCCCAAATGTGGTGTACGCAAATGTTCTTCTCCTTCCTTACAATTTTTTGGCTTTCCTAGGGAGGAGAAGTATTTGTCGCAGTGGcttcataatttgaaaatggTTTATGATCCCAATGTTAATTATTCTGTGTATAGGATTTGCAGTTTACATTTTCCTAAACGTTGTATAGCAAAGTATTCTCTAAGTTATTGGGCTGTGCCTACTTTTAATTTGGGCCACGATGATGTGGGTAATTTGTATCAGAATAGGGAAAGCTCTGGGGGGTTTCCTGGTGGTGAAATGGCTAAATGCAGTATGCCGGGTTGTTCTTCTCAACGAGGAGAGACTAATGTAAAATTTCACGTATTTCCCCGGGACTTGAAGACCTTAATAAAGTGGTGCCAGAATTCCCGTTTGCCGGTTCACAGTAAAGATAATAGATTTTTCTGTTCTAgacattttgaagaaaaatgttttggtaAATTCCGTTTAAAGCCCTGGGCAATACCAACTCTAAATTTGGGCACAGTTTATGGTAAGATCCATGATAACCCAAATATATATCAAGAAGAAAAGAAGTGCTTTTTGCCCTTTTGCCGGCGCAGCAGATCTTATGATTGTAATCTGTCTTTGTACCGATTTCCACGAGATGAAACTTTATTACGCCGCTGGTGTTATAACTTGAGGTTAGATCCGAATATGTATAGaggtaaaaatcataaaatttgctCTTCCCATTTTATTAAAGAAGCCTTAGGCTTAAGAAAACTTAATCCAGGGGCAGTGCCTACTTTAAATTTAGGTCATAACGATAGATTTAATATATACGAAAATGAACTGTACACACCACCGCCTCCGCCACCACCACCTCAACCCTCCAGCTCGTCTAAGGCTCACAAATATGCCCAGTTATTTAAACAAGAAATGGAAGGTTCATCACACATCTATGATGGTGTTTTCATGAATTCCATGGTGCAAAAGTTCTCTTCCTCGGCATCGTCAAACAGTTCAAATAATTTGGATTTAGGTGATGTTTGTTTGGTGCCTTCCTGCAAAAGAACCCGTCATTCTGATAACATTACTCTACACACCATACCCAAGCGAGCCGAGCAACTTAAAAAATGgtgtcataatttaaaaatggttttaggGAAAATGCACAAAAGTGTTAGAATTTGTAGTGCCCATTTTGAAAAGTACTGCATAGGCGGGTGTATGAGACCTTTTGCTGTGCCCACTTTGGAATTGGGTCACGATGATACCAATATTTACCGCAATCCAGAcgttataaagaaattaaatattaggGAGACCTGTTGCGTGCAATCCTGTAAAAGAAATCGGGATCGAGATCATGCCAATTTGCATAGATTTCCTACTCATCCGGAATTGCTGCAAAAATGGTGTGAGAACTTGCAAAAGCCCATACCAGATGGTACTAAACTTTTCAATGATGCCGTATGTgaaatgcattttgaagatAGATGCTTGCGTAATAAACGTTTAGAGAAGTGGGCTATACCCACCTTAAATTTAGGTTGGGATGAAATTCATCATAGTTTGCCATCGGAGGAGGAAATAAATGAGAACTGGGTTAAACCTTTTGCTCCCAATAATGGTGATGAACAGGGCGAGTGTTGTGTGGCAAGCTGCAAACGTAATCCCCAAATAGATGATGTGAAACTATACCGGCCACCGGAAGATGCAGAACAATTGGTTAAATGGGCGCATAACCTACAAGTGGATGTTACCGAGCTACCAAATCTTAAAATCTGTAACTTACATTTCAAGCAACATTGCATAggtaaacgtttattaaattggGCGATGCCCACTTTAAATTTAGGCGGCAAGGTGGAGCATCTTTTCGAAAATCCTCCTCCCATGGCAGccatttacaaaaagaaaatcaaacctgatagaattttaaatagcCATGAAGCCATTAAATGGTCCCCAAGATGTTGCCTGCCACATTGCCGTAAAATGCGTTCTGTAGACAAAGTACATCTGTTCCGATTCCCCTATAATAATCGCCAGACTTTAGCCAAATGGTGTCACAATTTACAGCTTCCTCTGGTTGGTAGTTCGCACAGACGCATTTGTTCCAGCCACTTTGAGGCATCAGTTCTAACTAAACGTTGTCCCATGACCTTGGCGGTTCCAACTATAGATCTAAATGCTCCGCAAGGctataaaatatatcaaaatcCTGCCcgcttaaaacaaataaaaattggtgcCCAAAGGCATTGCGTTATAGAATCTTGTCGCAAGACCAAACTTGATGGTGTAACTCTATTCAGATTCCCCAATAATAgatctattttatataaatggcgccataatattaaaaactggcCTAAAGGGAAACTGAGTTCCCAAATGAGAATATGTGCAGAACACTTCGAACCTCATTCGGTGGGTGTTAGGAAATTATCCCCCGGTGCTATACCTACACTTAAGTTGGGTCATGAGGCCCAGGATTTGTATCCCAATGAAACCAGATCATTTTTCGATTTAGAAAAATGTGTAGTGAGTGGCTGTGATTCTCGCAAGGAAATGGAGGATATTAGGCTTTACCGTTTCCCCCGAGATGATGAAGAATTACTTAAGAAATGGTGTAATAATCTTAAAATGAATCCCAACGATTGTGTGGGCATTAAAATATGCAGCAAGCATTTCGAGGCGGAATGTTTGGGACCCAGGCAGCTGTACAAATGGTGTATACCTACATTAAAGTTAGGCCATAAGGAAGATGAGGACCTAAACATAATACCCAATCCTCCGCCTGAGCAAAGAACCGGGGAATTCCTTTTCAAATGTTGTGTCCCCACCTGTGGTAAGACACGCAAATACGATGACGCTCAAATGAATAGTTTTCCCAAAAATTTGAAACTGTTCCGCAAATGGaaccacaatttaaaattagaattcctaaatttcaaagaaagagaaaaatataaaatttgcaatGATCATTTCGAATCAATATGTGTTGGAAAGACTAGGCTTAATTTTGGCGCTTTGCCCACTTTAAATTTGGGTCATGATGACATAGATGATTTGTATCAAATTAATCCCGATAGAATCAgaccaaatttatttattaaacaaaaagatgTGGAAAGAATGGAAAGGAGACGGTTATTAAGAGAAGAAAATCCAGGACAATATGAGTGCGAGGAACCCGAGGACGATAATGGTGATCCTTTGAGTTTGGAAGCCAGCGATATTAAATGTTGGGTTAGTGATTGTTCAGCTCCCAAGTCTATAATGAGAGAACCATATGATTTACCAGAATCTAAAGAATTAAGAGAAATGTGGTTGAAAGAATTAAGAAAAAGTGAGAAAGAAGATTTGACACCAGAAGCTAAAATATGTGGTTTACATTTTCAGTTGGTATTCAAAAACCTTAAGGACTTAATGCCTACACTATTAGAAGATAAAGAGGATTTAAAatccgattttaataaattgcaatACAATTATCAAAAGTCGAACATATCTTTAGTAATAAACAGCTACCAATGTAGGGTTCAGGATTGTTCTacgaatttattaaattcctctATAAGATTATACTTCTTTCCCTATGGTAAACATTTAATTAGCAAATGGTCTCACAACACCGGCATAATACCTGATGAGCATCGTCGTTATATGAATAAGGTGTGTGCTTTACATTTTGAGTCCTTTTGTATAACAGAAAATCAAAGATTGAGATCTTGGGCCATACCCACCCTGAATTTACCTAAATCCGAAGAGGATAAACGCATATATAAAAATCCTGATCTTACAAAAATCGATAAAAGAATGCTGGGTCCCCAGATCCTGAAATGTGCCGTGGCAAAttgtaattatattaaaatagcaGATGATGAGTCcttaaagctttttaatttcCCCAGCGATgataagttattaaagaaatggtgtgataatttaaaaatgtctcaCCACTTTACCCCTTTACTTAAAATATGttctttgcattttgaaaaaatatgctttGGTAGTTGCCGCATCCGTTCATGGGCCATACCCACCCTTAATTTAGGTTATGATGAAGCGCCagaacacttaaataaaaccaCCATAAGGCAAGAGGTGTTTGATGCTCCCGAAGACGTTTCCgaaatacaattaaaacaagtaaaaatcaaaaagtcaCTGGATAGTACTAAATGTTTTATAACCAGCTGCCGCAAAAGTAGACTGAAACATGGTGTACGTTTTTATAGTCTGCCctcaagtttaaaaattaaacgcaAATGGCTgcataatttacaaataagGCATCTAAAATCCAGCCATAagcttcaaaatattaaaatctgtaatcttcattttcaaaaaaggtGTTTAGaaggaaaagttttaaaacccTGGGCAGTGCCCACCATGCATTTGGGTCATAGTGAAGCCATTTTTGATAATCCTCGGGTACGAGGTTTCCCAATGCCAAAATGTGCCCTAACACACTGTAA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Protein Sequence
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