Pgri024326.1
Basic Information
- Insect
- Pollenia griseotomentosa
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_963931875.1
- Location
- OZ007561.1:164373711-164399079[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- THAP
- Domain
- THAP domain
- PFAM
- PF05485
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- The THAP domain is a putative DNA-binding domain (DBD) and probably also binds a zinc ion. It features the conserved C2CH architecture (consensus sequence: Cys - 2-4 residues - Cys - 35-50 residues - Cys - 2 residues - His). Other universal features include the location of the domain at the N-termini of proteins, its size of about 90 residues, a C-terminal AVPTIF box and several other conserved residues. Orthologues of the human THAP domain have been identified in other vertebrates and probably worms and flies, but not in other eukaryotes or any prokaryotes [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 33 3.5e-14 3.1e-11 45.6 1.3 1 86 438 510 438 511 0.84 2 33 1e-14 9.4e-12 47.3 4.7 1 87 538 607 538 607 0.80 3 33 7.9e-15 7.2e-12 47.7 0.3 1 87 628 700 628 700 0.83 4 33 7.1e-13 6.5e-10 41.4 2.6 1 86 780 848 780 849 0.78 5 33 2.8e-15 2.5e-12 49.1 5.6 1 87 873 945 873 945 0.81 6 33 1.7e-11 1.6e-08 37.0 1.1 1 87 980 1048 980 1048 0.79 7 33 1.5e-10 1.4e-07 33.9 3.4 1 86 1089 1158 1089 1159 0.72 8 33 1.9e-14 1.8e-11 46.4 0.5 1 86 1186 1255 1186 1256 0.81 9 33 8.1e-14 7.4e-11 44.5 2.3 1 86 1278 1347 1278 1348 0.80 10 33 5e-13 4.5e-10 41.9 2.4 1 87 1376 1448 1376 1448 0.86 11 33 5.6e-06 0.0051 19.3 0.1 1 60 1515 1568 1515 1595 0.76 12 33 2.7e-10 2.5e-07 33.1 0.7 1 87 1612 1684 1612 1684 0.80 13 33 1.3e-12 1.2e-09 40.6 2.2 1 87 1715 1786 1715 1786 0.79 14 33 6.1e-13 5.5e-10 41.6 3.5 1 87 1831 1904 1831 1904 0.84 15 33 5.5e-14 5e-11 45.0 0.4 1 87 1925 1993 1925 1993 0.80 16 33 1.1e-13 9.6e-11 44.1 0.2 1 87 2312 2381 2312 2381 0.81 17 33 1.5e-11 1.4e-08 37.2 3.5 1 86 2439 2531 2439 2532 0.77 18 33 3e-11 2.7e-08 36.2 1.1 1 87 2564 2636 2564 2636 0.81 19 33 1.1e-11 9.6e-09 37.7 1.8 1 87 2663 2729 2663 2729 0.82 20 33 3.6e-13 3.2e-10 42.4 1.8 1 87 2749 2819 2749 2819 0.81 21 33 4.3e-13 3.9e-10 42.1 2.6 1 87 2842 2913 2842 2913 0.82 22 33 3.6e-05 0.032 16.8 0.2 1 60 2929 2977 2929 3007 0.77 23 33 4.7e-10 4.2e-07 32.4 6.7 1 86 3017 3086 3017 3087 0.81 24 33 7.3e-12 6.6e-09 38.2 3.7 1 86 3112 3182 3112 3183 0.82 25 33 4e-13 3.6e-10 42.2 7.3 1 86 3203 3275 3203 3276 0.81 26 33 2.5e-09 2.3e-06 30.1 4.0 1 86 3296 3365 3296 3366 0.77 27 33 4.2e-13 3.8e-10 42.2 4.0 1 87 3720 3797 3720 3797 0.80 28 33 3.7e-07 0.00033 23.1 1.0 1 84 3816 3884 3816 3887 0.72 29 33 1.1e-12 9.7e-10 40.9 2.1 1 86 3910 3979 3910 3980 0.80 30 33 9e-14 8.2e-11 44.3 1.4 1 86 4008 4082 4008 4083 0.87 31 33 3.4e-13 3.1e-10 42.5 0.4 1 78 4108 4182 4108 4187 0.78 32 33 9.4e-12 8.5e-09 37.8 6.5 1 87 4306 4379 4306 4379 0.80 33 33 5.7e-12 5.2e-09 38.5 0.2 1 86 4404 4473 4404 4474 0.81
Sequence Information
- Coding Sequence
- 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- Protein Sequence
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