Pame024131.1
Basic Information
- Insect
- Pollenia amentaria
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_943735935.1
- Location
- CALSEV010000405.1:2202537-2226997[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- THAP
- Domain
- THAP domain
- PFAM
- PF05485
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- The THAP domain is a putative DNA-binding domain (DBD) and probably also binds a zinc ion. It features the conserved C2CH architecture (consensus sequence: Cys - 2-4 residues - Cys - 35-50 residues - Cys - 2 residues - His). Other universal features include the location of the domain at the N-termini of proteins, its size of about 90 residues, a C-terminal AVPTIF box and several other conserved residues. Orthologues of the human THAP domain have been identified in other vertebrates and probably worms and flies, but not in other eukaryotes or any prokaryotes [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 34 4e-14 4.2e-11 44.7 2.2 1 86 453 525 453 526 0.83 2 34 2e-14 2.1e-11 45.7 3.7 1 87 553 622 553 622 0.80 3 34 4.8e-15 5e-12 47.7 0.3 1 87 643 715 643 715 0.83 4 34 4.3e-13 4.5e-10 41.4 2.6 1 86 795 863 795 864 0.78 5 34 4.1e-15 4.3e-12 47.9 5.5 1 87 888 960 888 960 0.81 6 34 9.5e-12 9.9e-09 37.1 1.2 1 87 995 1063 995 1063 0.80 7 34 4.9e-11 5.1e-08 34.8 2.9 1 85 1104 1172 1104 1176 0.72 8 34 1.7e-14 1.7e-11 45.9 0.3 1 86 1201 1270 1201 1271 0.81 9 34 7.6e-14 7.9e-11 43.8 2.0 1 86 1293 1362 1293 1363 0.80 10 34 3e-13 3.2e-10 41.9 2.4 1 87 1391 1463 1391 1463 0.86 11 34 4.9e-06 0.0051 18.8 0.0 1 59 1530 1582 1530 1608 0.78 12 34 2.1e-10 2.2e-07 32.8 0.6 1 87 1627 1699 1627 1699 0.79 13 34 5.4e-13 5.6e-10 41.1 2.4 1 87 1730 1801 1730 1801 0.79 14 34 1.9e-13 2e-10 42.5 3.7 1 87 1846 1919 1846 1919 0.84 15 34 8e-14 8.4e-11 43.7 0.4 1 87 1940 2008 1940 2008 0.80 16 34 6.4e-14 6.7e-11 44.0 0.2 1 87 2322 2391 2322 2391 0.81 17 34 1.7e-11 1.8e-08 36.3 4.1 1 86 2449 2537 2449 2538 0.79 18 34 1.2e-11 1.2e-08 36.8 1.8 1 87 2570 2642 2570 2642 0.81 19 34 8e-12 8.3e-09 37.3 0.9 1 87 2669 2735 2669 2735 0.82 20 34 4.6e-13 4.8e-10 41.3 2.2 1 87 2755 2825 2755 2825 0.81 21 34 2e-13 2.1e-10 42.5 1.8 1 87 2848 2919 2848 2919 0.82 22 34 4.3e-06 0.0045 18.9 0.3 1 60 2935 2983 2935 3013 0.77 23 34 6.7e-11 7e-08 34.4 5.5 1 86 3023 3092 3023 3093 0.81 24 34 4e-12 4.2e-09 38.3 3.8 1 86 3118 3188 3118 3189 0.82 25 34 1.9e-12 2e-09 39.3 6.3 1 86 3209 3281 3209 3282 0.81 26 34 6.7e-10 7e-07 31.2 3.6 1 86 3302 3371 3302 3372 0.79 27 34 2e-13 2.1e-10 42.5 5.1 1 87 3718 3795 3718 3795 0.81 28 34 1.5e-07 0.00015 23.7 1.2 1 85 3814 3883 3814 3885 0.73 29 34 3.6e-12 3.8e-09 38.4 0.7 1 86 3908 3977 3908 3978 0.82 30 34 0.76 8e+02 2.1 0.1 49 62 4054 4074 3994 4097 0.54 31 34 1.9e-13 2e-10 42.5 0.7 1 86 4112 4186 4112 4187 0.86 32 34 6.6e-12 6.9e-09 37.6 0.1 1 79 4212 4287 4212 4291 0.76 33 34 5.7e-12 6e-09 37.8 6.5 1 87 4411 4484 4411 4484 0.80 34 34 8e-12 8.4e-09 37.3 0.1 1 86 4509 4578 4509 4579 0.81
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGCCCGTATATCGATCTGAGCCCGTAGATGATGTTGTTGGTTATCATCACAAAAGTGCGCCACAAATTGAAAACAATTCTTTTCACATAGAAGAAAAACGTAAACAACATGAACAGCAACAACTACAACGTGCACAACAACACCAATTACATGAGCCACAACTGCATCAACACCAGATACAACAAGTAAAACAAGAACATTATCATCATCCTCAAAGTAAATATACTCATAATCAAGATGTTTCCCAACAAACACAACAACGTATAAATACCGAGAATTCTACAACTACTAACACTACTATAATACAACAAACCGCAACAGCAACAGAGAAAAAACAACAATCTGAACAACAACATCAGCAGCAGCAAATATCCTTGACTAATATAAAAGCAGAAGCAAAGCCCCTTCACTTTCCTCGTCGGAAATTACAAACAGAACGTTCCTCCACTCTGCCCATATGCCAACGTTGTAAACAAGTTTTTCTGAAACGTCAAAACTATACACAACATGTTGCTCTATCTAGTTGCAATATTGTTGAATACGACTTTAAATGTTCTGTCTGCCCCATGTCCTTTATGTCTAATGAGGAATTGCAGGCACATGAACAATTACATCGTTCAAATAGATATTTTTGTCAAAAATATTGTGGCAAATTCTATGAAACAATTGATGAGTGTGAACAACATGAATTTGGTCAGCATGAATATGAAATGTATAAATGTAATATATGTTGTATAAGTGTTACGCAACGTGATCAATTATTTACCCATCTAAATGAACATAAATATCAGCCACGTTTCGATTGCTGTATATGTCGTTTATGTTTTCACACTTCTATGGAATTACATGATCATTATATAGCAAATGAAGATTTTTGTGGAAAATTTTACGATAAAAAAGCCTTTAAAAAACCAATTACCTCGTCGTCATCACCTTATTTGGGAAAACCGGAAAGCTCGAATTTGGAAATAGCTCATACATTTTCGTTAAAAGATATACCTCCTGCCAGTAGTCATCACTTGGATAATTTATATGCAAAACCCTCCACCTCAAAACCTTGCATGGAACCACCTACAACACCTTCATCTTCAGCATTCAATTCGGTAAATGAATTTGCTGCTTTAGAGCCACATATAGAGGTAAAAACTGAAATTAAAGTAGAACCAGATTTTTATCCACCCATGGATCAAACTGATTATGCTAGCTATGACAATGATTATGGGACCCCCGATTATACCTCCGGTTCTAATCAAAGTTTATCTTTTCTCCATGAGTATCAAGATAATGCTTCCAGCTCTACCAATTCATCATATTCCTTCAACAATAACGAGGCAATTCAAGATGAAGATGCCATTTGTTGTGTGCCAAAATGTGGTGTACGCAAATGTTCTTCTCCTTCCTTACAATTTTTTGGCTTTCCTCGCGAGGAGAAGTATTTGTCACAGTGGCTTCATAATTTGAAAATGGTTTATGACCCCAATGTTAATTATTCTGTGTATAGGATTTGCAGTTTACATTTTCCTAAACGTTGTATAGCCAAGTATTCTCTAAGTTATTGGGCTGTGCCCACTTTTAATTTGGGCCACGATGATGTGGGTAATTTGTATCAGAATAGGGAAAGCTCTGGGGGGTTTCCTGGTGGTGAAATGGCTAAATGCGGTATGCCGGGCTGTTCCTCTCAACGAGGAGAGACTAATGTAAAATTTCACGTATTTCCCCGGGACTTGAAGACCTTAATAAAGTGGTGCCAGAATTCCCGTTTGCCGGTTCACAGTAAAGATAATAGATTTTTCTGTTCTAGACATTTTGAAGAGAAATGTTTTGGTAAATTCCGTTTAAAGCCCTGGGCCATACCAACTCTAAATTTGGGCACTGTTTATGGTAAGATCCATGATAATCCAAATATATATCAAGAAGAAAAGAAGTGCTTTTTGCCATTTTGCCGGCGCAGCAGATCTTATGATTGTAATCTGTCTTTGTACCGATTTCCGCGAGATGAAACGTTATTACGACGATGGTGTTATAATTTGAGGTTAGATCCGAATATGTATAGAGGTAAAAATCATAAAATTTGTTCTTCTCATTTCATTAAAGAAGCATTAGGCTTAAGAAAACTTAATCCAGGGGCAGTGCCTACTTTAAATTTAGGTCATAATGATAGATTTAATATATACGAAAATGAACTTTACACACCACCGCCTCCGCCACCACCACCTCAACCCTCCACCTCATCTAAGGCTCACAAATATGCCCAATTATTTAAACAAGAAATGGAAGGTTCGTCACACATCTATGATGGTGTTTTCATGAATTCCATGGTGCAAAAGTTCTCTTCCTCGGCATCGTCAAACAGTTCAAATAATTTGGATTTAGGTGATGTTTGTTTGGTGCCTTCCTGCAAAAGAACCCGCCATTCTGATAATATTACTCTACACACCATACCTAAGCGAGCCGAGCAACTTAAAAAATGGTGTCATAATTTAAAAATGGTTTTAGGAAAAATGCACAAAAGTGTTAGAATTTGTAGTGCCCATTTTGAAAAGTACTGCATAGGCGGGTGTATGAGACCTTTTGCTGTGCCCACTTTGGAATTGGGTCACGATGATACCAATATTTACCGCAATCCAGACGTTATAAAGAAATTAAATATTAGGGAGACATGTTGCGTACAATCTTGTAAAAGAAATCGTGACCGAGACCATGCCAATTTGCATAGATTTCCTACTCATCCGGAATTATTGCAAAAATGGTGTGAGAACTTACAAAAGCCCATACCAGATGGTACCAAACTTTTCAATGATGCCGTATGTGAAATACATTTTGAAGATAGATGTTTGCGTAATAAACGTTTAGAGAAATGGGCTATACCCACCTTAAATTTAGGTTGGGATGAAATTCATCATAGTTTGCCATCGGAGGAGGAAATAAATGAGAACTGGGTTAAACCTTTTGCTCCTAATAATGGCGATGAACAGGGCGAGTGTTGTGTAGCAAGCTGCAAACGTAATCCCCAAATAGATGATGTGAAACTATACCGTCCCCCGGAAGATGCAGAACAATTGGTTAAATGGGCGCATAACCTACAAGTGGATGTTACCGAGCTACCAAATCTTAAAATCTGTAACTTACATTTCAAGCAACATTGCATAGGTAAACGTTTATTAAATTGGGCAATGCCCACTTTAAATTTAGGCGGCAAGGTGGAGCATCTTTTTGAAAATCCTCCTCCCATGCCAGCCATTTACAAAAAGAAAATTAAACCTGATAGAATTTTAAATAGCCATGAAGCCATTAAATGGTCCCCAAGATGCTGTCTACCACATTGCCGTAAAATGCGTTCTGCAGACAAAGTACATCTGTTCCGATTCCCCTATAATAATCGCCAGACTTTAGCCAAATGGTGTCACAATTTGCAGCTACCTCTGGTGGGTAGTTCACACAGACGCATTTGTTCCAGCCACTTCGAGGCTTCAGTTCTAACTAAACGTTGTCCCATGACTTTGGCGGTTCCAACTTTAGATCTAAATGCTCCGCAAGGCTATAAAATATATCAAAATCCTGCCCGCTTAAAACAAATAAAAATTGGAACCCAAAGACATTGTGTAATAGAATCTTGTCGCAAGACCAAACTGGATGGTGTAACTCTATTCAGATTCCCCAATAATAGATCTATTTTATATAAATGGCGCCATAATATTAAAAATTGGCCTAAAGGGAAACTGAGTTCCCAAATGAGAATATGTGCAGAACACTTCGAACCTCATTCGGTGGGTGTCAGGAAATTATCCCCCGGTGCTATACCTACACTTAAGTTGGGCCATGAGGCCCAGGATTTGTATCCCAATGAAACTAGATCATTTTTCGATTTAGAAAAATGTGTGGTAAATGGCTGTGATTCTCGCAAGGAAATGGAGGATATTAGGCTTTACCGTTTCCCCCGAGATGATGAAGAATTACTTAAGAAATGGTGTAATAATCTTAAAATGAATCCCAACGATTGTGTGGGCATTAAAATATGTAGCAAACATTTCGAGGAGGAATGCTTGGGACCCAGGCAGCTGTACAAATGGTGTATACCTACATTAAAGTTAGGCCATACGGAAGATGATGAGATAAACATAATACCCAATCCTCCGCCTGAGCAAAGAACCGGAGAATTCCTTTTCAAATGTTGTGTCCCCACCTGCGGTAAGACACGCAAATACGATGACGCTCAAATGAATAGTTTTCCCAAAAATTTGAAACTATTCCGCAAATGGAAACATAATTTAAAATTAGATTTCCTTAATTTCAAAGAAAGAGAAAAATATAAAATTTGCAATGATCATTTTGAATCAATTTGTGTTGGAAAGACTAGGCTTAATTTTGGCGCTTTGCCCACTTTAAATTTGGGTCATGATGACATAGACGATTTGTATCAAATTAATCCCGATAGAATCAGACCAAATTTATTTATTAAACAAAAAGATGTGGAAAGAATGGAAAGGAGAAGGTTATTAAGAGAAGAAAATCAAGGACAATATGACTGCGAGGAACCAGATGAGGATAATGGCGATCCTTTGAGTTTGGAACCCAGCGATATTAAATGTTGGGTTAGTGATTGTTCAGCTCCCAAGTCTATAATGAGAGAACCATATGATTTACCAGAATCTAAGGAAATAAGAGAAATGTGGCTTAAAGAATTAAGAAAAACTGAAAAAGAAGATTTGACACCAGAAGCTAAAATATGTGGTTTACATTTTCAGTTGGTATTCAAAACACTTAAGGACTTAATGCCTACACTATTAGAAGAAAAAGAGGATTTAACATCCGATTTTAATAAATTGCAATACAATTATCAAAAGTCGAACATATCTTTAGTAATAAACAGTTACCAATGTAGAGTTCAGGATTGTTCCACCAATTTATTAAACTCCTCTATAAGACTATACTTTTTCCCCTATGGTAAACATTTGATTAGCAAATGGTCTCACAACACCGGAATTATACCTGATGAACA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- Protein Sequence
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