Mvar001298.1
Basic Information
- Insect
- Mylabris variabilis
- Gene Symbol
- Kdm5
- Assembly
- GCA_037464815.1
- Location
- JAZBGW010000261.1:4194-12991[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- ARID
- Domain
- ARID domain
- PFAM
- PF01388
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 4 2.9e-25 5.6e-22 77.9 0.0 2 89 108 192 107 192 0.95 2 4 8.8 1.7e+04 -3.8 0.0 48 71 796 819 794 829 0.67 3 4 4.8 9.1e+03 -2.9 0.0 8 57 1017 1065 1011 1081 0.59 4 4 0.05 96 3.4 0.1 33 79 1231 1276 1228 1303 0.76
Sequence Information
- Coding Sequence
- atgaCATCAAAAATGGATAAATTGGCATGTCCGGCCAAATCAAAAATAGGACCattaacaaaacaagaaaCATATTGTTACAAAGATGAGGCCTTTGAATTTGAACCACCACCAGAAGCACCTGTATTTTATCCAACTGAAGAAGAATTTAATGATCCATTAGaatatattaacaaaattcgtAAATATGCCGAAGATTCCGgcatttgtaaaataaaaccaCCACCAAATTGGCAACCACCGTTTGCTGTTGACGTGGATAAATTAAGGTTTACACCAAGAATTCAAAGACTTAATGAATTAGAGGCAAAGACACgtgttaaattgaattttcttgaTCAAATCGCTAAATTTTGGGAATTACAAGGTTCCACATTGAAAATACCAATGGTGGAGAAACGCTGTATAGATCTCTATACATTACACagtattgttcaaaatttaggTGGCTTTGAGCAAGTAACCAAAGATAGAAAATGGTCCAAAGTAGCTTTGAATATGGGATATTCACCTGGTAAAAGTAGTATAGGAGCAATACTCAAATCACATTATGAACGATTAATATATccatttgatttatttaaaatgggtaaaactttaaatattaaaatggCAGCAGCAACTCCATCAACGAATGAAGAGATTGAAAAAACTGACAAAGATTATAAACCACATGGAATTGTAGGAAGAATGCAAATAAAACCACCACCAGAGAAACATGCCCGACGCTCTAAAAGATTTGAAGCTGAAGTTAAATCCGAGGATGACATTAAAACAGAATGTAAAGAAGATAACAAAGAATTGAAACGCCTTCAATTCTATGGTGCCGGACCCAAAATGGGCCTTAAAGTGAAGAATGAAGATAAGAAGactaaaaattctaaatacgAATTTGATCCGttAGCTAAATATGTATGTCATAATTGTAATCGTGGTGATTCAGAAGAATACATGTTATTATGTGATGGTTGTGATGATAGTTATCATACATTCTGTTTAATGCCACCATTAAGTGAAATACCAAAAGGTGATTGGCGTTGTCCAAAATGTGTAGCTGAAGAAGTATCAAAACCAGTAGAAGCATTCGGTTTTGAACAAGCACAACGTGAATATACTTTACAACAGTTTGGTGATATGGCTGATCAATTTAAATCTGAATATTTCAACATGCCTGTTCATttgGTACCAACTAGTGTTGTGGAGAAAGAATTTTGGCGTATAGTATCATCAATTGATGAAGATGTAACTGTTGAATATGGTGCTGATCTTCATACAATGGATCATGGTTCAGGTTTTCCAACAAAAAcatcattaaatttattaccaggcGATAAAGAATATGCTGATTCAGgatggaatttaaataatttacctgTATTAGAGAATTCTGTATTAGGTTATATTAATGCTGATATATCAGGTATGAAGGTGCCTTGGATGTATGTTGGTATGTGTTTTGCAACATTTTGTTGGCATAATGAAGATCATTGGagttattcaataaattatttacattggGGTGAAGCTAAAACATGGTATGGTGTACCTGGTAAAATGGCTGAAGCATTTGAAGAAACAATGAAATCTGCAGCACCAGAATTATTTCATTCACAACCAGATTTATTACATCAATTAGTAACAATTATGAATCCAAATATATTAATGAAAGCCGGCGTACCTGTATATAGAACAGATCAAAATGCTGGTGAATTTGTTGTAACATTTCCACGTGCTTATCATGCTGGTTTTAATCAAGGCTATAATTTTGCCGAAGCTGTTAATTTTGCACCAGCTGATTGGTTGAGAATGGGCCGAGAATGTGTTTtacattattcaaatttaagaaggttttgtgttttttcacATGACGAATTAGTTTGTAAAATGGCTTTAGATGCAGATCGACTTGGATTAACAATTGCTGCAGCAACTTATCAGGACATGTTACAAATGGTTGAAACGGAAAAACAACTccgaaaaacaattttagatGCGgGTGTATCCAATGCTGAACGTGAAGCATTCGAATTATTACCAGATGATGAACGACAATGCGATACGTGTAAAACTACATGTTTCCTGTCTGCAGTTACATGTAAGTGTTCTCCAGATTTATTGGTTTGTCTTCGTCATTATGAGAATCTTTGTAAATGCAAACCAGAAAGTTATACATTAAGATATCGTTATACATTAGATGAATTACCAGTTATGTTAAAATCACTTAAATTAAAAGCAGAATCATTCGATGATTGGGTGATTAAAGTAAAAGACGTTTTGGATCCGAAAAAACCAAAAACGTTAACATTATCCGAATTAAAAGCGTTAGTAACTGAAgctgaagaaaaaaaatttccaaaatgtgAATTATTACTGACGTTAACTGATGCTGTTGAAGATGCTGAGAAATGTGCACGTGTTATACAACaattagatttaaataaaatgagaaCTAGAACAAGAAATGCATCCgatacaaaatataaattaacattgaaggaactttgtttatttaatgaagAGTTGGATAGTTTAGCTTGTGTACTTGAAGAAGCGAAAAGTATTAAAGACTTACTTgatgaaacgaaaaaattcgaaaatactAGTAAAGCATTACTCGATTTAAAATTAAGCGAATGTTCCATATctgatttagaaaattgtatCAGTCAAGGTAATAATTTATGTATAGAATTACCAAATTTACGTAGTATTAAAATAAGATTAAGACAAGTATTATGGCTTAATGATGTTCTATCATATAAAAAACGTACTGAAGTTCTTGGTTTAGAATCAATACGTAACATTATTAAATCGGGTACTCTGTTACCACCAAATgctgaaattgaaaaagaattaactgatttacaaatattattaacaagAAGTGAAGAATGGGAAGAAAAAGTTAAAGCTAtattaaaaagtaaaagttGTGAAGTTATGATTGAAGTTGATAAATTGTTAAAGGAGGCAAGTCAAATTAATTCATATCTTCCATCTGAAGAATTCCTATTTGATGCTGTGGATAAAGCACGTGATTGGTTACGGCAATTAGAAGAAATGAATTCAGCCGAATTTTATCCTTATTTTGATGATATGcaactattaattaaaaaaggtCATCAATTAGATTTACATTTAGTTGAAGTTACTAAATTAGAATCATATTTAGAATTTGCTAATAGTTGGAAAGAAAAGACAAGTCGTTCATTtcttagaaaaaatacaacttaTTCATTAATGGAAGCTCTCTCACCAAGAGTACATCATAATCCTGCACAAAGATTTAGGAAAAAGAGTCCAGATGAAGAATACggtatatttaatttaacaagcGATATGGATCCGGCAACTGTTGTTTCATTATTCCGTGATGCTGAACAAAAAGAAATGGAAATGATACGTAATTTACGTCAAACTAATTCAGGGAAAAGCTTAGATCCTAATGATACCGCTACATTTTGTATTTGTCAAAAGAATGCATACGGCTTAATGATGCAATGTGAATTATGTAAAGATTGGTATCATTCTGATTGCGTTCAATTACCAAAAGTGGCATCATCAAAGTACAAAGGCAATTTTACTAGTGCTGCATTACATTTAGGTTTTAAAGACTGTAAATTTTTGTGTACAATTTGTTATAGAACTAGACGACCACGTCTGGACGCTATTTTGCTACTTTTGATGGCGTTACAAAAACTTTATGTACGCGTACCGGAAGGTGAGGCGTTACAAAGTTTAACGGAACGCGCAATGAATTGGCAAGATAGGGCTAGACAATTAATGCAAACACCTGAATTAGAAACTgctaaaaacaaattgaattcatttacacaaaaatataCAGAAGCAGCAACTAGACAAAGAACGGAAAAAATTATATCGAATGAATTGAAACGGGCTTATAAAAATCCTGAATTACATCAAAGAGTACAAGAAATTGCACCATTCAGTGGTGTTGTTAGTCAAGATGAAACGAAATGTGACAGTATTGATTTATCAGACGATTCAAAAGATTATTGTTCTACAGATGATAGAATGGGTGAACATGCATATTCTTTACATTTACCAAAATTCGATTCTGTTGAATATCGTATTAATCTAAcatcagaaatgaaaaaacatATTGAAGAATTGTTAATGGAAGGTGATTTACTAGAAGTGTATTTAGATGAAACTTTCCAATTGTGGAAATTGTTACAAGCGGCTAGAGATCCAGAAAAAGAGGCGacattaattgattttgatgCAAATACAAAGACTGGTACAGTCAAACGTGGACGTAAACGTCGTTCAGATGGTGATTCAGCTGgtgatattataaaaattaaaccaaaaccaaataaaactggtgaaaatgataaaaaaccaagaacaacaagaacaaagGAACAAACTAAaaaaggtaataataatagaagaaaGGGTCGTCGACGTCAATTAGTTGGTTCAGAAGAcgatgatgacgatgacgatgatgttgatgaaatttgtgCAGCAAATGGTTGTTTAAAGCCATCAGGTGAAAATGTTGATTGGGTACAATGTGATGGTGGTTGCGATAAATGGTTTCATATGGCATGCGTTGGTTTATCAGCACAAGATATTAATGAAGATGAGGATTATATTTGTATGACATGTTCACAAAATGCAACATATGAGACTTATGAACATGTTGAATATAAATTGCCTGATCAACGGGATGTTCTCACTTTGTCCCTGCCTTCCACATCTAAAGACTCCAATTAG
- Protein Sequence
- MTSKMDKLACPAKSKIGPLTKQETYCYKDEAFEFEPPPEAPVFYPTEEEFNDPLEYINKIRKYAEDSGICKIKPPPNWQPPFAVDVDKLRFTPRIQRLNELEAKTRVKLNFLDQIAKFWELQGSTLKIPMVEKRCIDLYTLHSIVQNLGGFEQVTKDRKWSKVALNMGYSPGKSSIGAILKSHYERLIYPFDLFKMGKTLNIKMAAATPSTNEEIEKTDKDYKPHGIVGRMQIKPPPEKHARRSKRFEAEVKSEDDIKTECKEDNKELKRLQFYGAGPKMGLKVKNEDKKTKNSKYEFDPLAKYVCHNCNRGDSEEYMLLCDGCDDSYHTFCLMPPLSEIPKGDWRCPKCVAEEVSKPVEAFGFEQAQREYTLQQFGDMADQFKSEYFNMPVHLVPTSVVEKEFWRIVSSIDEDVTVEYGADLHTMDHGSGFPTKTSLNLLPGDKEYADSGWNLNNLPVLENSVLGYINADISGMKVPWMYVGMCFATFCWHNEDHWSYSINYLHWGEAKTWYGVPGKMAEAFEETMKSAAPELFHSQPDLLHQLVTIMNPNILMKAGVPVYRTDQNAGEFVVTFPRAYHAGFNQGYNFAEAVNFAPADWLRMGRECVLHYSNLRRFCVFSHDELVCKMALDADRLGLTIAAATYQDMLQMVETEKQLRKTILDAGVSNAEREAFELLPDDERQCDTCKTTCFLSAVTCKCSPDLLVCLRHYENLCKCKPESYTLRYRYTLDELPVMLKSLKLKAESFDDWVIKVKDVLDPKKPKTLTLSELKALVTEAEEKKFPKCELLLTLTDAVEDAEKCARVIQQLDLNKMRTRTRNASDTKYKLTLKELCLFNEELDSLACVLEEAKSIKDLLDETKKFENTSKALLDLKLSECSISDLENCISQGNNLCIELPNLRSIKIRLRQVLWLNDVLSYKKRTEVLGLESIRNIIKSGTLLPPNAEIEKELTDLQILLTRSEEWEEKVKAILKSKSCEVMIEVDKLLKEASQINSYLPSEEFLFDAVDKARDWLRQLEEMNSAEFYPYFDDMQLLIKKGHQLDLHLVEVTKLESYLEFANSWKEKTSRSFLRKNTTYSLMEALSPRVHHNPAQRFRKKSPDEEYGIFNLTSDMDPATVVSLFRDAEQKEMEMIRNLRQTNSGKSLDPNDTATFCICQKNAYGLMMQCELCKDWYHSDCVQLPKVASSKYKGNFTSAALHLGFKDCKFLCTICYRTRRPRLDAILLLLMALQKLYVRVPEGEALQSLTERAMNWQDRARQLMQTPELETAKNKLNSFTQKYTEAATRQRTEKIISNELKRAYKNPELHQRVQEIAPFSGVVSQDETKCDSIDLSDDSKDYCSTDDRMGEHAYSLHLPKFDSVEYRINLTSEMKKHIEELLMEGDLLEVYLDETFQLWKLLQAARDPEKEATLIDFDANTKTGTVKRGRKRRSDGDSAGDIIKIKPKPNKTGENDKKPRTTRTKEQTKKGNNNRRKGRRRQLVGSEDDDDDDDDVDEICAANGCLKPSGENVDWVQCDGGCDKWFHMACVGLSAQDINEDEDYICMTCSQNATYETYEHVEYKLPDQRDVLTLSLPSTSKDSN
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_01480636;
- 90% Identity
- iTF_00986915; iTF_00813497; iTF_00814180;
- 80% Identity
- -