Basic Information

Gene Symbol
Kdm5
Assembly
GCA_028455855.1
Location
JAPTHL010000045.1:4923180-4930775[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 4 1.1e-25 1.6e-22 79.3 0.0 2 89 108 192 107 192 0.95
2 4 8.2 1.2e+04 -3.7 0.0 48 70 797 820 795 831 0.67
3 4 3 4.5e+03 -2.3 0.0 5 57 1015 1066 1012 1083 0.64
4 4 0.2 3e+02 1.5 0.0 33 76 1232 1274 1229 1304 0.76

Sequence Information

Coding Sequence
ATGACATCAAAATTAGATAAATTGGCGTGTCCGGCCAAATTAAAAACAGGACCATCAACAAATAAAGAAACATATTGTTACAAAGAAGAGGCCTTCGAATTTGAACCACCATCAGAAGCACCAGTATTTTATCCAACTGAAGATGAATTTAATGATCCATTAGAATATATTAATAAAATACGTAAATATGCTGAAGATTCTGGTATATGTAAAATAAAACCACCACCAAATTGGCAACCACCGTTTGCTGTTGACGTGGATAAATTAAGATTTACACCAAGAATTCAGAGACTTAATGAATTAGAGGCAAAGACACGTGTTAAACTGAATTTTCTCGATCAAATTGCTAAATTCTGGGAATTACAAGGTTCCACATTAAAAATTCCAATGGTTGAGAAACGTTGTATAGATCTCTACACATTACACAGTATTGTCCAAAGTTTAGGTGGTTTTGAACAAGTAACCAAAGACAGAAAGTGGTCCAAAGTCGCTTTAAATATGGGATATTCACCTGGTAAAAGTAGTATAGGAACGATACTTAAATCACATTATGAACGATTAATATATCCATTCGATTTATTTAAATTGGGTAAAACTTTAAATATTAAAATGGCAGTATCATCACCTTCAACGAATGAAGACGCTGAAAAAACGGACAAAGATTATAAACCTCATGGTATTGTAGGAAGAATGCAAATAAAACCACCACCTGAAAAACATGCTAGACGTTCTAAAAGATTTGAAGGCGAAGTTAAAAACGAAAACGATATTAAACAAGAATGTAAAGAAGACAACAAAGAATTGAAACGTCTTCAATTTTATGGTGCTGGACCGAAAATGGCTCTTAATAAAGTAAAAAGTGAAGATAAAAAGAATAAAAATTCGCATTACGAATTTGATCCGTTGGCAAAATATGTATGTCATAATTGTAATCGTGGTGATTCAGAAGAATATATGTTATTATGTGATGGTTGTGATGATAGTTATCATACATTTTGTTTAATGCCACCATTAAGTGAAATACCAAAAGGTGATTGGCGTTGTCCAAAATGTGTAGCTGAAGAAGTATCAAAACCAGTAGAAGCATTTGGTTTTGAACAAGCACAACGTGAATATACATTACAACAATTTGGTGATATGGCTGATCAATTTAAGTCTGAATATTTCAACATGCCTGTTCATTTGGTACCTACCAGTGTTGTAGAAAAAGAATTTTGGCGTATTGTATCATCGATTGATGAAGATGTAACAGTTGAATATGGTGCTGATCTTCATACAATGGATCATGGTTCAGGTTTTCCAACAAAAACATCATTAAACTTATTACCTGGTGATAAAGAATATGCTGATTCAGGATGGAATTTAAATAATTTACCTGTATTAGAAAATTCCGTCTTAGGTTATATTAATGCTGATATATCAGGTATGAAAGTGCCTTGGATGTATGTTGGTATGTGTTTTGCAACATTTTGTTGGCACAATGAAGATCATTGGAGTTATTCAATAAATTATTTACATTGGGGTGAAGCTAAAACATGGTATGGTGTACCTGGTAAAATGGCTGAAGCATTTGAAGAAACAATGAAATCAGCAGCACCAGAACTATTTCAATCACAACCAGATTTATTACATCAATTAGTAACAATAATGAATCCAAATATATTAATGAAAGCTGGTGTACCTGTATATAGAACAGATCAAAATGCTGGTGAATTTGTTGTTACATTTCCTCGTGCCTATCATGCTGGTTTTAATCAAGGTTATAATTTTGCTGAAGCTGTTAATTTTGCACCAGCTGATTGGTTAAGAATGGGTAGAGAATGTGTTTTACATTATTCAAATTTAAGAAGATTTTGTGTTTTCTCACATGATGAATTAGTTTGTAAAATGGCACTCGATGCAGATACACTTGGATTAACTATTGCTGCAGCTACATATCAAGATATGCTACAAATGGTAGAAACTGAAAAACAACTTCGAAAAACTCTTTTAGATGCGGGTGTTTCAAATGCTGAACGTGAAGCATTTGAATTATTACCAGATGATGAACGTCAATGCGATACTTGTAAAACTACATGCTTCCTTTCTGCAGTTACATGTAAATGTTCTCCTGATATATTGGTTTGTCTTCGTCATTACGAAAATCTTTGTAAATGTCATCCAGAACATTATACATTAAGATATCGTTATACATTAGATGAATTACCCGTTATGTTAAAATCACTTAAATTAAAAGCAGAATCATTTGATCATTGGGTAAATAAAGTAAAAGATGCATTAGATCCGAAAAAACCAAAAACATTAACATTATGTGAATTAAAAGCATTATTAAGTGAAGCTGATGGAAAGAAATTTCCAAAATGTGAATTATTACAAACATTAACTGATGCTGTTGAAGATGCTGAAAAATGTGCACGTGTTATACAACAATTAGATTTAAATAAAATGAGAACTAGAACAAGAAATGCATCAGATACAAAATATAAACTTACATTAAAGGAACTTTGTTTATTTAATGAAGAATTAGATAGTTTAGCTTGTGTACTTGAAGAATCAAAAAGTATTAAAGATTTACTTGAAGAAACTAAAAAATTTGAAACAACTAGTAAATCATTACTTGATTTACAATTAAGTGAATGTTCTGTATCTGATTTAGAAAATTGTATCAGTCAAGGTAATAATTTATGTATAGAATTACCTAATTTACGTAGTATTAAAGTACGATTACGACAAGTATTATGGCTTAATGATGTTTTATCATATAAAAAACGAACTGAAGTACTTGGTTTAGAATCAATTCGAAATATTATTAAATCTGGTACTATGTTACCACCAAATCCAGAAATTGAAAAAGAATTAACTGAATTACAAATTTTACTTACAAGAAGTGAAGAATGGGAAGATAAAGTTAAAGCGATATTAAAAAATAAAAGTTGCGAAGTTATGATCGAAGTTGATAAATTATTAAAAGAAGCAAGTCAAATTAATTCATATCTTCCATCTGAAGAATTTTTATTTGATGCTATGGATAAAGCACGTGATTGGTTAAGACAATTAGAAGAAATGAATTCAGCTGAATATTATCCATATTTTGATGATATGCAACTATTAATTAAAAAAGGTCATCAATTAGATTTACATTTAGTAGAAGTTACTAAATTAGAATCCTATTTAGAATTTGCTAATAGTTGGAAAGAAAAAACAAGTCGTGCATTTCTTAGAAAAAATACACCTTATACATTAATGGAAGCTCTCTCTCCAAGAATCCAACATAGTCCCACACAAAAATGTAGAAAAAAGAATCAAGATGATGAATATGGCATATTTAATTTAACAAGTGATATGGATCCAGCAACTGTTGTTGCATTATTTCGTGATGCTGAACAAAAAGAAATGGAAATGATACGTAATTTACGTCAGACAAATTTTGAAAAAAGTTTAGATTCAAATGATAACGCTTTATTTTGTATATGTCAAAAGAATGCATACGGTTTAATGATGCAATGTGAATTATGTAAAGATTGGTTTCATTCTGATTGTGTTCAACTTCCAAAAGTTGCATCATCAAAGTACAAAGGCAATTTTACAAGTGCTGCATTACATTTAGGTTTTAAAGACTGCAAATTTTTGTGTACAATTTGTTATAGAACTAGACGACCTCGTTTAGATGCTATTTTGTTACTTTTAATGGCGTTACAGAAGCTTTTTGTACGCGTCCCAGAAGGTGAAGCGTTACAAAGCTTAACTGAACGTGCAATGAATTGGCAAGATAGAGCTAGACAATTAATGCAAACACCTGAATTAGAAGCTGCTAAAAATAAATTACATTCACTTACACTAAAATATACAGAAGCAGCAGCTAGACAAAGAACAGAAAAAATTATATCAAATGAATTGAAACGTGCTTATAAAAATCCTGAATTACATCAAAGGGTTCAAGAAATTGCACCATTTAGTGGTGTTAATCAAGATGAATCTAAATGTGACAGTAATGATTTATCGGATGATTCGAAAGATTGTTCTACAGATGATAGAATGGGTGAACATGCGTATTCTTTACATTTACCAAAATTTGATTGTGGTGAATATCGAATAAATCTTAGTCAAGAAATGAAAAAACATATTCAAGAACTTTTAATGGAAGGTGATTTATTAGAAGTGTATCTTGATGAAACTTTCCAATTATGGAAATTGTTGCAAGCGTCACGAGATCCTGAAAAAGAGGCAATTCTAATTGATTTTGATACAAATTTAAAAAATGGTACTGTTAAACGTGGACGTAAACGTCGATCAGATGATGGTGATATAATAAAAATTAAACCCAAAACAAATAAAAGTGTTGAAAATGAAAAGAAAACAACAAGAACAACTCGTACAAAAGAACAAATGAAAAAAGATAATAATGGTAGACGAAAAGGACGTCGACGTCAATCAACTGGTTCAGAAGATGATGATGATGATGATGTTGATGAAATTTGTGCAGCCAGTGGTTGTTTAAAACCATCAGGTGAAAATGTTGATTGGGTACAATGTGATGGTGGTTGCGATAAATGGTTTCATATGGCATGTGTTGGTTTATCAGCTCAAGATATTAATGAAGATGAAGATTATATTTGTATGACATGTTCACAGAATACAACATATGAAACTTATGATCATGTTGAATATAAATTGCCTATTAAACGAGATGTTTCCAGTTTGCCCCTGCCTTCCACATCTAAAGACTCCAATTAG
Protein Sequence
MTSKLDKLACPAKLKTGPSTNKETYCYKEEAFEFEPPSEAPVFYPTEDEFNDPLEYINKIRKYAEDSGICKIKPPPNWQPPFAVDVDKLRFTPRIQRLNELEAKTRVKLNFLDQIAKFWELQGSTLKIPMVEKRCIDLYTLHSIVQSLGGFEQVTKDRKWSKVALNMGYSPGKSSIGTILKSHYERLIYPFDLFKLGKTLNIKMAVSSPSTNEDAEKTDKDYKPHGIVGRMQIKPPPEKHARRSKRFEGEVKNENDIKQECKEDNKELKRLQFYGAGPKMALNKVKSEDKKNKNSHYEFDPLAKYVCHNCNRGDSEEYMLLCDGCDDSYHTFCLMPPLSEIPKGDWRCPKCVAEEVSKPVEAFGFEQAQREYTLQQFGDMADQFKSEYFNMPVHLVPTSVVEKEFWRIVSSIDEDVTVEYGADLHTMDHGSGFPTKTSLNLLPGDKEYADSGWNLNNLPVLENSVLGYINADISGMKVPWMYVGMCFATFCWHNEDHWSYSINYLHWGEAKTWYGVPGKMAEAFEETMKSAAPELFQSQPDLLHQLVTIMNPNILMKAGVPVYRTDQNAGEFVVTFPRAYHAGFNQGYNFAEAVNFAPADWLRMGRECVLHYSNLRRFCVFSHDELVCKMALDADTLGLTIAAATYQDMLQMVETEKQLRKTLLDAGVSNAEREAFELLPDDERQCDTCKTTCFLSAVTCKCSPDILVCLRHYENLCKCHPEHYTLRYRYTLDELPVMLKSLKLKAESFDHWVNKVKDALDPKKPKTLTLCELKALLSEADGKKFPKCELLQTLTDAVEDAEKCARVIQQLDLNKMRTRTRNASDTKYKLTLKELCLFNEELDSLACVLEESKSIKDLLEETKKFETTSKSLLDLQLSECSVSDLENCISQGNNLCIELPNLRSIKVRLRQVLWLNDVLSYKKRTEVLGLESIRNIIKSGTMLPPNPEIEKELTELQILLTRSEEWEDKVKAILKNKSCEVMIEVDKLLKEASQINSYLPSEEFLFDAMDKARDWLRQLEEMNSAEYYPYFDDMQLLIKKGHQLDLHLVEVTKLESYLEFANSWKEKTSRAFLRKNTPYTLMEALSPRIQHSPTQKCRKKNQDDEYGIFNLTSDMDPATVVALFRDAEQKEMEMIRNLRQTNFEKSLDSNDNALFCICQKNAYGLMMQCELCKDWFHSDCVQLPKVASSKYKGNFTSAALHLGFKDCKFLCTICYRTRRPRLDAILLLLMALQKLFVRVPEGEALQSLTERAMNWQDRARQLMQTPELEAAKNKLHSLTLKYTEAAARQRTEKIISNELKRAYKNPELHQRVQEIAPFSGVNQDESKCDSNDLSDDSKDCSTDDRMGEHAYSLHLPKFDCGEYRINLSQEMKKHIQELLMEGDLLEVYLDETFQLWKLLQASRDPEKEAILIDFDTNLKNGTVKRGRKRRSDDGDIIKIKPKTNKSVENEKKTTRTTRTKEQMKKDNNGRRKGRRRQSTGSEDDDDDDVDEICAASGCLKPSGENVDWVQCDGGCDKWFHMACVGLSAQDINEDEDYICMTCSQNTTYETYDHVEYKLPIKRDVSSLPLPSTSKDSN

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_01480636;
90% Identity
iTF_01022004;
80% Identity
-