Basic Information

Gene Symbol
Kdm5
Assembly
GCA_013841185.1
Location
JACDRP010000006.1:312010-319740[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 4 1.7e-25 3e-22 78.3 0.0 2 89 108 192 107 192 0.95
2 4 6.2 1.1e+04 -3.6 0.0 47 71 795 819 794 829 0.67
3 4 2.7 4.9e+03 -2.5 0.0 5 57 1014 1065 1011 1080 0.64
4 4 0.021 37 4.3 0.1 33 81 1231 1281 1228 1286 0.74

Sequence Information

Coding Sequence
ATGACATCAAAAATGGATAAATTGGCATGTCCGGCCAAATCAAAAACAGGACCATTAACAAAACAAGAAACATATTGTTACAAAGAAGAGGCCTTTGAATTTGAACCACCACCAGAAGCACCTGTATTTTATCCAAGTGAAGAAGAATTTAATGATCCATTAGAATATATCAATAAAATACGTAAATACGCTGAAGATTCTGGTATATGTAAAATAAAACCACCACCAAATTGGCAACCACCGTTTGCTGTTGACGTGGATAAATTAAGGTTTACACCAAGAATTCAAAGACTTAATGAATTAGAGGCAAAGACACGTGTTAAATTGAATTTTCTTGATCAAATCGCTAAATTTTGGGAATTACAAGGTTCCACATTGAAAATACCGATGGTCGAGAAACGCTGTATAGATCTCTACACATTACACAGTATTGTTCAAAGTTTAGGTGGTTTTGAACAAGTAACCAAAGATAGAAAATGGTCCAAAGTCGCTTTAAATATGGGATATTCACCTGGTAAAAGTAGCATAGGTGCAATACTAAAATCACATTATGAACGATTAATATATCCATTTGATTTATTTAAAATGGGTAAAACATTAAATATTAAAATGGCAGCATCATCTCCATCAACGAATGAAGAAGTTGAAAAAACTGATAAAGATTATAAACCGCATGGAATTGCAGGAAGGATGCAAATAAAACCACCACCAGAGAAACATGCTCGACGTTCTAAACGATTTGAAACCGAAGTTAAATCCGAGGATGACATTAAATCAGAATGTAAAGAAGATAACAAGGAGTTGAAACGGCTCCAATTCTATGGTGCCGGACCGAAAATGGCTCTCAAAATGAAGAATGAAGACAAGAAGGGGAAAAATGTCAATTACGAATTTGATCCATTGGCTAAATATGTATGTCATAATTGTAATCGTGGTGATTCAGAGGAGTATATGTTATTATGTGATGGTTGTGATGATAGTTATCATACATTCTGTTTAATGCCACCATTAAGTGAAATACCAAAAGGTGATTGGCGTTGTCCAAAATGTGTAGCCGAAGAAGTATCAAAACCAGTAGAAGCATTTGGTTTTGAACAAGCACAACGTGAATATACACTACAACAATTCGGTGATATGGCTGATCAATTTAAATCTGAATATTTTAATATGCCAGTTCATTTGGTACCAACAAGTGTTGTAGAAAAAGAATTTTGGCGTATTGTATCATCGATTGATGAAGATGTTACTGTTGAATATGGCGCTGATCTTCATACAATGGATCACGGTTCTGGTTTCCCAACAAAAACATCATTAAATCTACTACCAGGCGATAAAGAATATGCCGATTCAGGATGGAATTTAAATAATTTACCTGTATTAGAGAATTCTGTATTAGGTTATATTAATGCTGATATATCAGGTATGAAGGTGCCTTGGATGTATGTTGGTATGTGTTTTGCAACATTTTGTTGGCATAATGAAGATCATTGGAGTTATTCTATAAATTATTTACATTGGGGTGAAGCTAAAACATGGTATGGTGTACCTGGTAAAATGGCTGAAGCATTTGAAGAAACAATGAAGTCAGCAGCACCAGAATTATTTCAATCACAACCAGATTTATTACATCAATTAGTAACAATAATGAATCCAAATATATTAATGAAAGCAGGTGTACCTGTTTATAGAACAGATCAAAATGCTGGTGAATTTGTTGTTACATTTCCACGTGCTTATCATGCTGGTTTTAATCAAGGTTACAATTTTGCTGAAGCTGTTAATTTTGCACCAGCCGATTGGTTAAGAATGGGTCGTGAATGTGTTTTACATTATTCAAATTTACGAAGATTTTGTGTATTCTCTCATGATGAATTAGTTTGTAAAATGGCTTTAGATGCTGATCGACTTGGTTTAACAATTGCTGCTGCAACTTATCAAGATATGTTACAAATGGTTGAAACTGAAAAACAACTTCGAAAAACTCTTCTAGATGCGGGTGTATCGAATGCTGAACGTGAAGCATTCGAATTATTACCAGATGATGAACGTCAATGCGATACATGTAAAACTACATGCTTTTTATCAGCTGTTACATGTAAGTGTTCTCCTGATTTATTAGTGTGTCTTCGACATTACGAGAATCTTTGTAAATGTAATCCGGAAAATTATACATTAAGATATCGTTATACATTAGATGAATTACCGGTAATGTTAAAATCACTTAAATTAAAAGCAGAATCATTCGATCATTGGGTAATTAAAGTTAAAGATGTTTTGGATCAGAAAAAACCAAAAACATTAACATTATCTGAATTAAAGGAATTATTAATAGAAGCTGAAGAGAAGAAATTTCCAAAATGTGAATTATTACAAACTTTAATTGATGCTGTTGAAGATGCTGAGAAATGTGCACGAGTTATACAACAATTAGATTTAAATAAAATGAGAACAAGAACAAGAAATGCCTCCGATACAAAATACAAATTAACATTAAAAGAACTTTGTTTATTTAATGAAGAATTAGATAGTTTAGCTTGTGTACTTGATGAGGCGAAAAGTATTAAAGATTTACTTGAAGAAACGAAAAAATTCGAAAATACAAGTAAAGCATTACTCGATTTAAAATTAACCGAATGTTCTATATCTGATTTAGAAAATTGTATAAGTCAAGGTAATAATTTATGCATAGAATTACCAAATTTACGTAGTATTAAAGTAAGATTAAGACAAGTATTATGGCTTAATGAAGTTCTATCGTATAAAAAACGTACTGAAGTACTTGGATTAGAGTCAATACGAAATATTATTAAATCGGGTACTATATTACCACCGAATGCAGAAATTGAAAAAGAATTAACTGATTTACAAATTTTATTAACAAGAAGTGAAGAATGGGAAGAGAAAGTTAAAGCTATTTTAAAAAGTAAAAGTTGTGAAGTTATGATTGAAGTTGATAAATTATTAAAGGAGGCAAGTCAAATTAATTCATATCTTCCATCTGAAGAATTCCTATTTGATGCTGTAGATAAAGCACGTGATTGGTTGCGACAATTAGAAGAAATGAATTCAGCTGAATATTACCCTTACTTTGATGATATGCAACTTTTAATAAAAAAAGGTCATCAATTAGATTTACATTTAGTTGAAGTTACTAAATTAGAATCATATTTAGAATTTGCTAATAGTTGGAAAGAAAAAACAAGTCGTTCATTTCTTAGAAAAAATACACCGTATTCATTAATGGAAGCTCTCTCACCAAGAATACATCATAATCCAGCACAACGATGTAAGAAAAAGAATCCAGATGAAGAATGTGGTATATTTAATCTAACAAGTGATATGGATCCAGCAACTGTTGTTTCATTATTTCGTGATGCTGAACAAAAAGAAATGGAAATGATACGGAATTTACGTCAAATTAATTCAGATAAAAATTTAGATCCTAATGATAACTCAACTTTTTGTATATGCCAAAAGAATGCATATGGTTTAATGATGCAATGTGAATTATGCAAAGATTGGTACCATTCTGATTGTGTACAATTACCGAAAGTTGCATCATCAAAGTACAAAGGCAATTTTACAAGTGCTGCATTACATTTAGGTTTTAAAGACTGTAAATTTTTGTGTACAATTTGTTATAGAACTAGACGGCCACGTCTAGACGCTATCTTGCTACTTTTAATGGCGTTACAAAAACTTTATGTACGCGTACCAGAAGGTGAAGCGTTACAAAGTTTAACGGAACGTGCAATGAATTGGCAAGATAGGGCTAGACAATTAATGCAAACACCTGAATTAGAAACGGCTAAAAATAAATTGAATTCACTTACACAAAAATATACAGAAGCAGCAACCAGACAAAGAACAGAAAAAATTATATCGAATGAATTGAAACGTGCTTATAAAAATCCAGAATTACATCAAAGAGTACAAGAGATTGCACCATTCAGTGGTGTTAATCAAGATGATCCGAAATGTGACAGTACAGATTTATCTGATGATTCAAAAGATTGTTCTACTGATGATAGAATGGGCGAACATGCTTATTCTCTACATTTACCAAAATTCGATTCGGGTGAATATCGAATAAATTTAACAATAGAAATGAAGAAACACATTGAAGAACTTCTAATGGAAGGTGATTTATTAGAAGTATATTTAGATGAAACTTTTCAATTGTGGAAGTTATTACAAGCGGCTAGGGACCCCGAAAAAGAGGCAATTTTAGTCGATTTTGATATAAATATGAAGACTAGTACGGTTAAACGTGGACGTAAACGTCGTTCGGATGATGGTGATTTAGTAAAAATTAAACCAAAAACGAATAAAACAGGTGAAATCGATAAAAAAACACGATCAAGAACTAAGGAACAAACGAAAAAAGATAATAATCGAAGAAAAGGTCGTCGACGTCAATCAATTGGTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGCAGCAAATGGTTGTTTAAAACCATCAGGTGAAAATGTTGATTGGGTACAATGTGATGGTGGTTGCGATAAATGGTTTCATATGGCATGTGTTGGTTTATCAGCACAAGATATTAATGAAGATGAAGATTATATTTGTATGACATGTTCACAAAACACAACATATGAGACTTATGAACATGTTGAATATAAATTGCCTGATAAACGAGATGTTCCCAGTTTGTCCCTGCCTTCCACATCTAAAGACTCCAATTAG
Protein Sequence
MTSKMDKLACPAKSKTGPLTKQETYCYKEEAFEFEPPPEAPVFYPSEEEFNDPLEYINKIRKYAEDSGICKIKPPPNWQPPFAVDVDKLRFTPRIQRLNELEAKTRVKLNFLDQIAKFWELQGSTLKIPMVEKRCIDLYTLHSIVQSLGGFEQVTKDRKWSKVALNMGYSPGKSSIGAILKSHYERLIYPFDLFKMGKTLNIKMAASSPSTNEEVEKTDKDYKPHGIAGRMQIKPPPEKHARRSKRFETEVKSEDDIKSECKEDNKELKRLQFYGAGPKMALKMKNEDKKGKNVNYEFDPLAKYVCHNCNRGDSEEYMLLCDGCDDSYHTFCLMPPLSEIPKGDWRCPKCVAEEVSKPVEAFGFEQAQREYTLQQFGDMADQFKSEYFNMPVHLVPTSVVEKEFWRIVSSIDEDVTVEYGADLHTMDHGSGFPTKTSLNLLPGDKEYADSGWNLNNLPVLENSVLGYINADISGMKVPWMYVGMCFATFCWHNEDHWSYSINYLHWGEAKTWYGVPGKMAEAFEETMKSAAPELFQSQPDLLHQLVTIMNPNILMKAGVPVYRTDQNAGEFVVTFPRAYHAGFNQGYNFAEAVNFAPADWLRMGRECVLHYSNLRRFCVFSHDELVCKMALDADRLGLTIAAATYQDMLQMVETEKQLRKTLLDAGVSNAEREAFELLPDDERQCDTCKTTCFLSAVTCKCSPDLLVCLRHYENLCKCNPENYTLRYRYTLDELPVMLKSLKLKAESFDHWVIKVKDVLDQKKPKTLTLSELKELLIEAEEKKFPKCELLQTLIDAVEDAEKCARVIQQLDLNKMRTRTRNASDTKYKLTLKELCLFNEELDSLACVLDEAKSIKDLLEETKKFENTSKALLDLKLTECSISDLENCISQGNNLCIELPNLRSIKVRLRQVLWLNEVLSYKKRTEVLGLESIRNIIKSGTILPPNAEIEKELTDLQILLTRSEEWEEKVKAILKSKSCEVMIEVDKLLKEASQINSYLPSEEFLFDAVDKARDWLRQLEEMNSAEYYPYFDDMQLLIKKGHQLDLHLVEVTKLESYLEFANSWKEKTSRSFLRKNTPYSLMEALSPRIHHNPAQRCKKKNPDEECGIFNLTSDMDPATVVSLFRDAEQKEMEMIRNLRQINSDKNLDPNDNSTFCICQKNAYGLMMQCELCKDWYHSDCVQLPKVASSKYKGNFTSAALHLGFKDCKFLCTICYRTRRPRLDAILLLLMALQKLYVRVPEGEALQSLTERAMNWQDRARQLMQTPELETAKNKLNSLTQKYTEAATRQRTEKIISNELKRAYKNPELHQRVQEIAPFSGVNQDDPKCDSTDLSDDSKDCSTDDRMGEHAYSLHLPKFDSGEYRINLTIEMKKHIEELLMEGDLLEVYLDETFQLWKLLQAARDPEKEAILVDFDINMKTSTVKRGRKRRSDDGDLVKIKPKTNKTGEIDKKTRSRTKEQTKKDNNRRKGRRRQSIGSXXXXXXXXXXXXXXXXXAANGCLKPSGENVDWVQCDGGCDKWFHMACVGLSAQDINEDEDYICMTCSQNTTYETYEHVEYKLPDKRDVPSLSLPSTSKDSN

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_01480636;
90% Identity
iTF_01022004;
80% Identity
-