Ypad021714.1
Basic Information
- Insect
- Yponomeuta padella
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_947311075.1
- Location
- OX371251.1:11917673-11918782[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- TSC22
- Domain
- TSC22 domain
- PFAM
- PF01166
- TF Group
- Basic Domians group
- Description
- These proteins are highly similar in a region of about 50 residues that include a conserved leucine-zipper domain most probably involved in homo- or hetero-dimerisation. Drosophila protein bunched [1] (gene bun) (also known as shortsighted), a probable transcription factor required for peripheral nervous system morphogenesis, eye development and oogenesis.
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 13 0.0049 62 4.3 0.0 15 45 54 84 50 87 0.90 2 13 0.025 3.1e+02 2.1 0.0 18 45 78 105 75 107 0.84 3 13 0.025 3.1e+02 2.1 0.0 18 45 99 126 96 128 0.84 4 13 0.023 2.9e+02 2.2 0.0 18 45 120 147 116 149 0.83 5 13 0.023 2.8e+02 2.2 0.0 18 45 141 168 137 171 0.83 6 13 0.024 3.1e+02 2.1 0.0 18 45 162 189 159 192 0.84 7 13 0.021 2.6e+02 2.3 0.0 18 44 183 209 176 212 0.81 8 13 0.023 2.9e+02 2.2 0.0 18 45 204 231 200 233 0.83 9 13 0.024 3e+02 2.1 0.0 18 44 225 251 221 253 0.82 10 13 0.025 3.1e+02 2.1 0.0 18 45 246 273 243 275 0.84 11 13 0.021 2.6e+02 2.3 0.0 18 44 267 293 260 296 0.81 12 13 0.023 2.9e+02 2.2 0.0 18 45 288 315 284 317 0.83 13 13 0.2 2.5e+03 -0.8 0.0 18 44 309 335 305 339 0.66
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGCTCAGTTACGACTGTACTACGCTCGGCTACGGCTATGTTGGGCTTGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAACGTGCTATGCTTAGATACAACTATGCTACGCTCGGCTACGGCTGTGCTATGTTTGGCTGTGATAGTGCTACTCTCTACCATGAAATTGCTACGCTTAAATACGACTTTACTACGCTTGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCGGCTATGAACATGCTACGCTTAGATATGACTGTGCTACGCAGAACTACAACAGCAATGCTACAACCGGCTACGGTTGTGCTACGCTCAATGCGACGACTATATTAGGCTTAACAACGACTATGTTACGCCCGGAATAG
- Protein Sequence
- MLSYDCTTLGYGYVGLGYGCATLCYERAMLRYNYATLGYGCAMFGCDSATLYHEIATLKYDFTTLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLGYEHATLRYDCATQNYNSNATTGYGCATLNATTILGLTTTMLRPE
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- -
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
- -