Basic Information

Gene Symbol
-
Assembly
GCA_947311075.1
Location
OX371251.1:11917673-11918782[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
TSC22
Domain
TSC22 domain
PFAM
PF01166
TF Group
Basic Domians group
Description
These proteins are highly similar in a region of about 50 residues that include a conserved leucine-zipper domain most probably involved in homo- or hetero-dimerisation. Drosophila protein bunched [1] (gene bun) (also known as shortsighted), a probable transcription factor required for peripheral nervous system morphogenesis, eye development and oogenesis.
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 13 0.0049 62 4.3 0.0 15 45 54 84 50 87 0.90
2 13 0.025 3.1e+02 2.1 0.0 18 45 78 105 75 107 0.84
3 13 0.025 3.1e+02 2.1 0.0 18 45 99 126 96 128 0.84
4 13 0.023 2.9e+02 2.2 0.0 18 45 120 147 116 149 0.83
5 13 0.023 2.8e+02 2.2 0.0 18 45 141 168 137 171 0.83
6 13 0.024 3.1e+02 2.1 0.0 18 45 162 189 159 192 0.84
7 13 0.021 2.6e+02 2.3 0.0 18 44 183 209 176 212 0.81
8 13 0.023 2.9e+02 2.2 0.0 18 45 204 231 200 233 0.83
9 13 0.024 3e+02 2.1 0.0 18 44 225 251 221 253 0.82
10 13 0.025 3.1e+02 2.1 0.0 18 45 246 273 243 275 0.84
11 13 0.021 2.6e+02 2.3 0.0 18 44 267 293 260 296 0.81
12 13 0.023 2.9e+02 2.2 0.0 18 45 288 315 284 317 0.83
13 13 0.2 2.5e+03 -0.8 0.0 18 44 309 335 305 339 0.66

Sequence Information

Coding Sequence
ATGCTCAGTTACGACTGTACTACGCTCGGCTACGGCTATGTTGGGCTTGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAACGTGCTATGCTTAGATACAACTATGCTACGCTCGGCTACGGCTGTGCTATGTTTGGCTGTGATAGTGCTACTCTCTACCATGAAATTGCTACGCTTAAATACGACTTTACTACGCTTGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCTGCTATGAATGTGCTACGCTTAGATACGACTGTGCTACGCTCGGCTACGGTTGTGCTACTCTCGGCTATGAACATGCTACGCTTAGATATGACTGTGCTACGCAGAACTACAACAGCAATGCTACAACCGGCTACGGTTGTGCTACGCTCAATGCGACGACTATATTAGGCTTAACAACGACTATGTTACGCCCGGAATAG
Protein Sequence
MLSYDCTTLGYGYVGLGYGCATLCYERAMLRYNYATLGYGCAMFGCDSATLYHEIATLKYDFTTLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLCYECATLRYDCATLGYGCATLGYEHATLRYDCATQNYNSNATTGYGCATLNATTILGLTTTMLRPE

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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