Xate027472.1
Basic Information
- Insect
- Xylophagus ater
- Gene Symbol
- Rel
- Assembly
- GCA_963422695.1
- Location
- OY730485.1:10990263-11026550[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- RHD
- Domain
- RHD domain
- PFAM
- PF00554
- TF Group
- Beta-Scaffold Factors
- Description
- Proteins containing the Rel homology domain (RHD) are eukaryotic transcription factors. The RHD is composed of two structural domains. This is the N-terminal DNA-binding domain that is similar to that found in P53. The C-terminal domain has an immunoglobulin-like fold (See PF16179) that functions as a dimerisation domain [1-2].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 1.1e-47 8.8e-44 150.3 0.3 1 168 354 537 354 538 0.93 2 2 1.4e-44 1.2e-40 140.1 0.2 1 168 1244 1427 1244 1428 0.93
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGATGAATAGCAAGAATGTTGTGTTTCATCATGATGACGACGCTAGGCCACAGACAACTTTGATGACTCGTCAAAAATTTCTACCCCGAAAACATAGAAGTTCTACAGTGACGGCGGATAATCGTCATGCCCAGGAAAAACGCAAAAAGaTTGAAGAAAATGATAATCTACCAAATTTACTATGCGATTTATGTATTGTTCAATTAAATGTTGCCTATAATTTTAAACGGCTTGCAATTGAAAACGatacaaaattaaatcaatatatTATTGAAAAAGGGATTGTAAAAAATCCAACAATATCTTCACATacagaaaattcaataaataatacagcagcaacaacaaatcgtcataattttccaataataCCAATAATTGTTAAAACTGAACCGGTTGATGTCGATACACTTTCTGATGATACAAATATAACAAATTCAACAGTGACTAATAATAATGATGGTCAACAATCGATAATACCAATTCATTCATTCGATGAACAAAATCTAACAAATGATAATAATCGTTTATTTAATATGACACCACAAACTAACAATTCAATGGTGCTTGTTAATAGTTACATTTATAGTCGTCTAACACCATCCAGTGATAttgagtttacacaaaatttcaatttatcaaGAAATCACAATTCAAATGATACAACAATCGATAAGAATCTAACAAATGAAGATGAAAATCATATGGAAATCGAAACTATTAATGATTCAAAagaagcaattaaaaaaaatattaatatgaatataaggaaattaaataaaaagccAAGAAGTCATCGTGAACTAAAAGGACTGTCAATTAGCATGCAATTGCCAATTGATAGTGGTTATTCAACGACACCTTCACCTGGATCATCATCAACAAGTTCCAGAATGATGGCTTCACCAATGTCGCAAATAAGTGACACACAAACAagtttacaatttttaaatttacttacCACTGaaGAATCATTTTCCAATAATGTCTTTGATACACCTCTAAGAATGACAGCGATGCGTGATccaaATCCAGCACCAACTTTAAATGGTCCGCAATTAGTTATATTAGAACAACCTGTAGATAAATTTCGATTTCGTTATAAATCAGAAATGCATGGAACTCATGGTTCCTTAATGGGTGCCCGtaatgaaaaatcaaagaaaactttTCCAACAGTTGAATTACGAGGTTATAATGGCAAAGCAGTTATCCGATGCAGTTTATATCAAACAGATGGTCTATATCCAACACCACATTCTCATAAATTAGTAGTTCGTCACGGTGATATGGATATAAGTGATCCACATGATGTTTTCGTGTCAAAGGAAGAAGGATTTAGAGCAATcTTTCAAGGTATGGGAATAATTCATACTGCTAAAAAACATATTGTTGAAGAACTGATTGctaaaaaacgaaaagaaaaaaaatttgagcTGAATCGTCAATTGACAACACGAGAAGAAACTCAGataaaACTAACTGCCGAGAGTGAAGCTAAATCGATGAAtttaaatcaagtttgtttaggTTTTCAAGCATTTGCTGTTGATAATGATGACTCGTGgaggaaaatttgtgaaccagtATTCTCAAAGCAAATCAATAATATGAAAAGTGCATTAACTGGAGAATTAAAAATATCACGTTTAAGTGCCGCCGTTAGTAGTGCAGCCGGTGGTGAAGATTTATTCTTATTTGTAGAGAAAGTTGGAAAAAaaaatattaaagttcGATTTTTTGAAGTTGATGAAAATGACGATACCGTTTGGGAAGGTTGGGGTAATTTCTCAGAAGCAGATGTACATCATCAATATGCTATTGCCTTAAGAACACCACCgtatcaaaatattaatatcgATCGTAATgtTGATGTATATATACAATTGATACGTCCTAGTGATAGTGATACTAGTGAACCGATGCCGTTCAAATATAAACCAAGAGATGTGGTAACATCAAGAAAACGTGCACGAACATCATCGAGTTTTAGTTCATCAGAATTACCTGAACCAATTGTTAAAGGTGTTCGTAGTAATTTTCAAGATATCCAACAGAATCCGATAACAATTAGTAAAGAATTTAATGGATCACAAATTATCGATGATCTAATGCAATCCGGAATAACAGATCCGAATTCAAAAGATACATTTTTACAACAAGTTCAAATGGATTCAGACGaACTTCTTAATATCATGGATTCCAGTTTGATGGATTCAAGTTTAATGGATTTTGGTAAATTTGAAACAGATGGAGTTTCTGTTCAATCTAAAAATCTTCATAAACAATCAACATCAATACCGGCTTTATCAATGCCACGTAATGAACCACAAATAACATTTAATACTGTACCGGATTCTGAATTATATGTTAatgattttaaaacaattttaagcATATATCGAACGAAATGGCAAACTGAACCAGAAAAAgctaaatcaaaaatattggaaatattttatgaagcaaattcaaataatgaagataTTTTACATAATGCGATAGCATGTGGTAATACAAAAGCAATGATCAATATATTACCTTTAATTGATAAATTACAAATCTATCAAGTTctacaaattcaaaatgaacGAAAGGAAACATGTCTACATATTGCGTGTCTTTTTGATAAACCAGAATATTTAAGGCCCCTAATTAATTTAGgCGCAAATCCAAACATACCAAATGATCGTGGTAACACAGCATTACATATTGCtgttgaagaaaatttaattatgtgCGCTAGTAAAATACTTGATAAAaagaattatacaaaaaaaagtcatAATTTACAAATCGATTTAGTAAATGATGAAGGTTTAACGCCACTTCATTTAGCAGTCAAgaAAAGGAACTTACCAATGATACAGAAACTATTAGAAATTGGCGGTGCCTCAACAAAATTATGTATATCGAAAAATGGAAATAATCTTCTTCATATAGCAATCGAACAAaatGATGAAAGTATTGTTAAGTATTTATTGGAAAGTACACCAGTTAAAGTTAATGAACTAAATAGTTCTGGATTTACACCATTACGTTTAGCCCAATCAATGGAAAAAGTATCGAATGGAATTATTCGATTACTAATTAAACATGGTGCTgctaatgaaaaaaataaaatgGATTGTGATTGGATTGAACTACGAAAAGAtgagatgagttcaaatgatggagacgatgatgatgatgatgataaacaATTGACAATCgatgaaaatcaaagaaaatcaacGGATAATGATGATGCTGATAGCGATaaaattgacCAATCAATTGTATTAGATGAAGAATGTATGAAGAAATTATCGGCGATatttaataatgataaaaaatgggaaaaactAGCTCTACATTTAAATTTGGTAGATTATGTTCGATTTTGGAGAACGCTAGGGAATCCGACTAAATATATGCTAAATTTTATTAGATTACAATCGTCGGATGGTTTCAATATGAAAATACTTTTGGATgcattaaaaacattaaatgaaACTGAAGCGATTCaatATAGTGGTTATTTAACGGCACCTTCACCTGGATCATCATCAACAAGTTCCAGAATGATGGCTTCACCAATGTCGCAAATAAGTGACACACAAActagtttaaaatttgtaaatttactTACCACTGaaGAATCATTTTCCAATAATGTCTTTGATACACCTCTAAGAATGACAGCGATGCATGATCcaaATCCACCACCAACTTTAAATGGTCCGCAATTAGTTATATTAGAACAACCTGTAGATAAATTTCGATTTCGTTATAAATCACAAATGCATGGAATTCATGGTTCCTTAATGGGTGCCCGtaatgaaaaatcaaagaaaactttTCCAACAGTTGAATTACGAGGTTATAATGGCAAAGCAGTTATCCGATGCAGTTTATATCAAACAGATGGTCTATATCCAACACCACATTCTCATAAATTAGTTGTTCGTCACGGTGATATGGATATAAGTGATCCACATGATGTTTTCGTGTCAAAGGAAGAAGGATTTAAAGCAATgTTTCAAGGTATGGGAATAATTTATACTGCTAAAAAACATATTGTTGAAGAACTGATTGctaaaaaacgaaaagaaaaaaaatttgagcTGAATCGTCAATTGACAACACGAGAAGAATCTCAGataaaACTAACTGCCGAGAGTGAAGCTAAATCGATGAAtttaaatcaagtttgtttaggTTTTCAAGCATTTGCTGTTGATAATGATGACTCGTGgaggaaaatttgtgaaccagtATTCTCAAAGCAAATCAATAATATGAAAAGTGCATTAACTGGAGAATTAAAAATATCACGTTTAAGTGCCGCCGTTAGTAGTGCAGCCGGTGGTGAAGATTTATTCTTATTTGTAGAGAAAGTTGGAAAAAaaaatattaaagttcGATTTTTCGAAGTTGATGAAAATGATGATGCCGTTTGGGAAGGTTGGGGTAATTTCTCAGAAGCAGATGTACATCATCAATATGCTATTGCCTTAAGAACACCACCgtatcaaaatattaatatcgATCGTAATgtTGATGTATATATACAATTGATACGTCCTAGTGATAGTATTACTAGTAAAGCGATGCCGTTCAAATATAAACCAAGAGATGTGGTAACATCAAGAAAACGTGCACGAACATCATCGAGTTTTAGTTCATCAGAATTACCTGAACCAATTGTTAAAGGTGTTCGTAGTAATTTTCAAGATATCCAACAGAATCCGATAACAATCAGTAAAGAATTTAATGGATCACAAATTATCGATGATCTAATGCAATCCGGAATAACAGATCCGAATTCAAAAGATACATTTTTACAACAAGTTCAAATGGATTCAGACGaaCTTCTTAATATCATGGATTCCAGTTTAATGGATTCAAGTTTAATGGATTTTGGTAAATTTGAAACAGATGGAGTTTCTGTTCAATCTAAAAATCTTCATAAACAATCAACATCAATACCGGCTTTATCAATGCCACGTAATGAACC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- Protein Sequence
- MMNSKNVVFHHDDDARPQTTLMTRQKFLPRKHRSSTVTADNRHAQEKRKKIEENDNLPNLLCDLCIVQLNVAYNFKRLAIENDTKLNQYIIEKGIVKNPTISSHTENSINNTAATTNRHNFPIIPIIVKTEPVDVDTLSDDTNITNSTVTNNNDGQQSIIPIHSFDEQNLTNDNNRLFNMTPQTNNSMVLVNSYIYSRLTPSSDIEFTQNFNLSRNHNSNDTTIDKNLTNEDENHMEIETINDSKEAIKKNINMNIRKLNKKPRSHRELKGLSISMQLPIDSGYSTTPSPGSSSTSSRMMASPMSQISDTQTSLQFLNLLTTEESFSNNVFDTPLRMTAMRDPNPAPTLNGPQLVILEQPVDKFRFRYKSEMHGTHGSLMGARNEKSKKTFPTVELRGYNGKAVIRCSLYQTDGLYPTPHSHKLVVRHGDMDISDPHDVFVSKEEGFRAIFQGMGIIHTAKKHIVEELIAKKRKEKKFELNRQLTTREETQIKLTAESEAKSMNLNQVCLGFQAFAVDNDDSWRKICEPVFSKQINNMKSALTGELKISRLSAAVSSAAGGEDLFLFVEKVGKKNIKVRFFEVDENDDTVWEGWGNFSEADVHHQYAIALRTPPYQNINIDRNVDVYIQLIRPSDSDTSEPMPFKYKPRDVVTSRKRARTSSSFSSSELPEPIVKGVRSNFQDIQQNPITISKEFNGSQIIDDLMQSGITDPNSKDTFLQQVQMDSDELLNIMDSSLMDSSLMDFGKFETDGVSVQSKNLHKQSTSIPALSMPRNEPQITFNTVPDSELYVNDFKTILSIYRTKWQTEPEKAKSKILEIFYEANSNNEDILHNAIACGNTKAMINILPLIDKLQIYQVLQIQNERKETCLHIACLFDKPEYLRPLINLGANPNIPNDRGNTALHIAVEENLIMCASKILDKKNYTKKSHNLQIDLVNDEGLTPLHLAVKKRNLPMIQKLLEIGGASTKLCISKNGNNLLHIAIEQNDESIVKYLLESTPVKVNELNSSGFTPLRLAQSMEKVSNGIIRLLIKHGAANEKNKMDCDWIELRKDEMSSNDGDDDDDDDKQLTIDENQRKSTDNDDADSDKIDQSIVLDEECMKKLSAIFNNDKKWEKLALHLNLVDYVRFWRTLGNPTKYMLNFIRLQSSDGFNMKILLDALKTLNETEAIQYSGYLTAPSPGSSSTSSRMMASPMSQISDTQTSLKFVNLLTTEESFSNNVFDTPLRMTAMHDPNPPPTLNGPQLVILEQPVDKFRFRYKSQMHGIHGSLMGARNEKSKKTFPTVELRGYNGKAVIRCSLYQTDGLYPTPHSHKLVVRHGDMDISDPHDVFVSKEEGFKAMFQGMGIIYTAKKHIVEELIAKKRKEKKFELNRQLTTREESQIKLTAESEAKSMNLNQVCLGFQAFAVDNDDSWRKICEPVFSKQINNMKSALTGELKISRLSAAVSSAAGGEDLFLFVEKVGKKNIKVRFFEVDENDDAVWEGWGNFSEADVHHQYAIALRTPPYQNINIDRNVDVYIQLIRPSDSITSKAMPFKYKPRDVVTSRKRARTSSSFSSSELPEPIVKGVRSNFQDIQQNPITISKEFNGSQIIDDLMQSGITDPNSKDTFLQQVQMDSDELLNIMDSSLMDSSLMDFGKFETDGVSVQSKNLHKQSTSIPALSMPRNEPQITFNTVPDSELYVNDFKTILSIYRTKWQTEPEKAKSKILEIFYEANSNNEDILHNAIACGNTKAMINILPLIDKLQIYQVLQIQNERKETCLHIACLFDKPEYLRPLINLGANPNIPNDRGNTALHIAVEENLIMCASKILDKKNYTKKSHNLQIDLVNDEGLTPLHLAVKKRNLPMIQKLLEIGGASTKLCISKNGNNLLHIAIEQNDESIVKYLLESTPVKVNELNSSGFTPLRLAQSMEKVSNGIIRLLIKHGAANEKNKMDCDWIELRKDEMSSNDGDDDDDDDKQLTIDENRRKSTDNDDADSDKIDQSIVLHEDIMKKLCSILENAGESD
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
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