Tlon009085.1
Basic Information
- Insect
- Temnothorax longispinosus
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_004794745.1
- Location
- QBLH01002088.1:33325-175157[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- BTB
- Domain
- zf-C2H2|ZBTB
- PFAM
- PF00651
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- The BTB (for BR-C, ttk and bab) [6] or POZ (for Pox virus and Zinc finger) [1] domain is present near the N-terminus of a fraction of zinc finger (Pfam:PF00096) proteins and in proteins that contain the Pfam:PF01344 motif such as Kelch and a family of pox virus proteins. The BTB/POZ domain mediates homomeric dimerisation and in some instances heteromeric dimerisation [1]. The structure of the dimerised PLZF BTB/POZ domain has been solved and consists of a tightly intertwined homodimer. The central scaffolding of the protein is made up of a cluster of alpha-helices flanked by short beta-sheets at both the top and bottom of the molecule [2]. POZ domains from several zinc finger proteins have been shown to mediate transcriptional repression and to interact with components of histone deacetylase co-repressor complexes including N-CoR and SMRT [5, 3, 4]. The POZ or BTB domain is also known as BR-C/Ttk or ZiN.
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 7 8.3e-06 0.0016 18.1 0.4 13 89 13 97 10 117 0.73 2 7 6.9e-06 0.0013 18.4 0.2 13 98 483 567 473 577 0.82 3 7 3.2e-07 6.1e-05 22.7 0.1 12 93 583 666 578 689 0.83 4 7 2.1e-05 0.0039 16.9 0.3 12 98 1080 1174 1076 1185 0.76 5 7 0.00049 0.092 12.5 0.1 12 98 1594 1687 1589 1698 0.64 6 7 0.00031 0.058 13.1 0.1 12 106 2082 2183 2077 2186 0.71 7 7 8.1e-05 0.015 15.0 0.2 12 107 2637 2741 2626 2744 0.75
Sequence Information
- Coding Sequence
- 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- Protein Sequence
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
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