Pcon011666.1
Basic Information
- Insect
- Ptychoptera contaminata
- Gene Symbol
- Zmiz1
- Assembly
- GCA_963942525.1
- Location
- OZ012638.1:36109832-36114518[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- zf-MIZ
- Domain
- zf-MIZ domain
- PFAM
- PF02891
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- This domain has SUMO (small ubiquitin-like modifier) ligase activity and is involved in DNA repair and chromosome organisation [1][2].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 3 0.12 6.6e+02 0.1 1.6 3 24 690 711 688 716 0.90 2 3 4.8e-25 2.7e-21 75.0 2.5 1 49 837 885 837 886 0.98 3 3 0.25 1.4e+03 -0.9 0.0 7 37 1119 1149 1115 1153 0.86
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGAGTGCCCAGGGGGGCTCCTCAGGGGCTTTAGCCTTAGGGGGCCGTGCAACTCCAAATAGGGGCTATCCGGAGCCCCACAATCAACAAAACTCTTCTACCGGCGAGAAAATAACAACGGGTAGATCGAGACGTCGTAAAGTTGTACAAGATGATGTTCAACAGATAACCCAAGTTCTTAATCCAAATGTACAGCAAAATTCTTAtccaaacaatttattaaataataataataataatacaaatattaataataataatagtaatagtggtaatttaaacaataataataataatacgtcaGTTAATCAACAATTTGTGACaagtcaacaacaacaacagcagcaacaattacagcagcagcagcagcaacatctCGGTTATGgtggaaataatttaaattattctgtaaataatcaaaatattggTAATGGACATTTAAATCCAAATCATCATCAATATATTGGACACGGCGGTTATaatcagcaacagcagcagcaacaacatcataatagtttaaatagtcatcatcaccatcagcagcaacagcatcttcaacatcatcaacaacagcagcaacatcatttgcaacagcaacaacagcaacagcagcagcaacatttaagtgttaacaataataataataacaataataacaatagtgCAGTGAGTggtaataatacatttaatacaaataatagttCGTCGCCAAACATGGTAGCTGCAACGGGTAACCAACAAGCCATGGATGTCGGTTTTAATGCTCAGATGCAGATGGGTGGCGGAATGGGCATGCATACACAATCCCATCAACAATATATGAACGGGATGAATAATATGGGTGGTGGCGGTGGTACCGGTGCTAGTGTCGGAGGTGGTGGCGGTGTAGGCGTAGGTGTTGGTGGCAATAGTGTTGCCGGCAGCATGAGCAACATGAATAATATGACAAGcataaatagtttaaatgGTATgagtaatttaaatacaatgaaCGGTATGAATTCAATGCAAATGAATTCAATGAATCCAATGAATAATATGAATTATAATACATCAAGACATCATCATatGAATCCAATGGCACAAATGCAAGGGATGAATATGGGTGGTATGCAGCAAATGCATAGTATGAATCCAATGAATCAAATGGCAAATATGTCGCAACATATGAATGGTGGTGGAATgagtcatcatcatcaaatgAACCCTATGGCTAAAATGCAGGGTATGGCTAATGGTGGTTATCCACCACGACGAATGTCACCATATCCATCACCACAAATGTTATCGGCACAAAAACGAGCTGCTATGTATCCAGGCATGGTAAATCCAAATTCACAGAGTATGCCATCGGGGCCAATGCaatatcaacaacagcaacagcatgtacaacagcagcagcaacaacaacagcagcaacagcagttaTCACAACACCAGCAACATCCGCATCACCCACAGCAAACAAATGTGCCGCCAGTTCCTATACAAACGAATAATTATGGTCGTGGCCCAGTTGTTAATACAGCGGCATATAATCGTGGTGGCCCTGTTATACCACAGCAGAGGCAAAACACTCCACCTTATTCTAacacacacaatcaacaatttTACGGTGGAAATACCTATCAAAATGTACCAAGTTATCAACAAGAAGTACGATTAAATTACCAACATAGTCCAGTACCTGGTAATCCGACACCACCGTTAACGCCGGCTACGTCTATGACACCATATATCAGTCCTAATCCCGATATTAAACCGGCTCCTATGCACaaagATGATGAATTACGATTGACATTTCCTGTTCGTGACGGTGTAATATTGACACCATTCCGCTTGGAACATAATTTAGCAGTTAGTAATCATGTGTTTCAATTAAAACCAAATGTTTTCAATACATTAATGTGTCgACCTGATCTCGAATTACAATTAAAGTGTTTCCATCATGacgataaattaatgaatacaaattGGCCGGCTAGTGTACAAGTATCTGCAAATGCAACACCATTGATAATTGATCgtggtgaaaataaaaactctcaTCGACCACTTTATTTGAAGCAAGTATGCCAGCAGGGACGAAACACAATACAAATAACCGTCAGTACGTGTTGTTGCTcacatttgtttgttttacaaATGGTTCATCGACCATCTGTACGTCATGTTTTACAAGGTTTAGTAAGGAGAAATCTTTTACCAGCTGAATTTTGTGTAGCGAAAATAAAACGCAATTTTAATGCTGGCGGTTATGCAATAatgcaacagcaacagcaacaacagcagcagcaacaacaaatacCGTCAACAGCATCAACAACAGTAACAGGACTAGAtcgtgataataataatagtagtagtagcagtagtattaataataataataataatagtaatagtaataatatgagtagtaataataacaacagcaacaataataacactaatagtaataataataataataataacaacaacagtattgaacaaacaacaataagaGTATCATTAAAATGTCCTGTTACATATAAAAGGATAACGTTACCAGCTCGTGGCATTGACTGTAAACACACACAATGTTTTGATTTAGAATCATATTTGCAATTGAATTGTGATCGTGGCAGTTGGCGTTGTCCTGTATGCAATAAGGGAATATTAACTGAAGCACTAGAAATTGATCAATATATGTGGGCTATTTTAAGTGCATTAAGTACAACAGATACTGAAGAAGTGTCTATTGATTCTGGTGCAAATTGGAAAGCAATTAAAATGGTGACCGGTATTAAAATGGAAGAGGACATCGATACAAAACGATTAAATAAAGTCAATTCACCTGGTTCAACAACACTACCTACCTGGGATAATTCGCAAGCGATGAGTCCTTACATGTTTCCGGATATGAATACAATAGCCAGTGGAAGCATGATGGGACAAAATTATAACAATAGGAACGCCTATGATTATAATCAACAGAATACTGATGGAGGTGGCAATAATCAGCTTGTAAATGAATTTAGTGCAAGTGTTACTAGTCCATTAACACATTTAAGTGAATCAGTTAATTCATTAGAATTAAATCCGTTAAATGCTATGGAAAAATCACTGAATGATCAGATGCCTCACACACCTCATACACCACATACACCTGGTGGTGCATCCACAGGACATCCATTAACACCTGGTGGACCACCAAGTGTAACATCAGTTCATGGTGAAACTAGTTCAACACAAATCAATTCAAATTcagGTGGAACAACAGGTAGCAACTCGTCACCACAACATAATTTGATATCAAATCAGAATGCAACCTCAGGTACAACAACGACCGGTTCAACAGCAAATGgcacaataaataatcaacaaatgaATAATCCAATGCAAAATTCAATGATGAATCATCAACAGCAGCATCTTATGAATTCATTTATGAGTGCACAAAATGacattagtttaattaatttaaccgaTGCCGACTTAAATGCTGACTTAAATTTTGATCCAGCTGCAGTTATTGATGGTGACGGAACAGCGGATGCATTAAatttattGTCCGACAACGTTGTTGATCCTATGGAATTATTATCGTACTTGGATCCGCCAGACTTGAATACACCACCATCAAGTGGTTCCAGTAACAATCCTAACAATGATGATATATTAGCTGCATTTTTAGATTAG
- Protein Sequence
- MSAQGGSSGALALGGRATPNRGYPEPHNQQNSSTGEKITTGRSRRRKVVQDDVQQITQVLNPNVQQNSYPNNLLNNNNNNTNINNNNSNSGNLNNNNNNTSVNQQFVTSQQQQQQQQLQQQQQQHLGYGGNNLNYSVNNQNIGNGHLNPNHHQYIGHGGYNQQQQQQQHHNSLNSHHHHQQQQHLQHHQQQQQHHLQQQQQQQQQQHLSVNNNNNNNNNNSAVSGNNTFNTNNSSSPNMVAATGNQQAMDVGFNAQMQMGGGMGMHTQSHQQYMNGMNNMGGGGGTGASVGGGGGVGVGVGGNSVAGSMSNMNNMTSINSLNGMSNLNTMNGMNSMQMNSMNPMNNMNYNTSRHHHMNPMAQMQGMNMGGMQQMHSMNPMNQMANMSQHMNGGGMSHHHQMNPMAKMQGMANGGYPPRRMSPYPSPQMLSAQKRAAMYPGMVNPNSQSMPSGPMQYQQQQQHVQQQQQQQQQQQQLSQHQQHPHHPQQTNVPPVPIQTNNYGRGPVVNTAAYNRGGPVIPQQRQNTPPYSNTHNQQFYGGNTYQNVPSYQQEVRLNYQHSPVPGNPTPPLTPATSMTPYISPNPDIKPAPMHKDDELRLTFPVRDGVILTPFRLEHNLAVSNHVFQLKPNVFNTLMCRPDLELQLKCFHHDDKLMNTNWPASVQVSANATPLIIDRGENKNSHRPLYLKQVCQQGRNTIQITVSTCCCSHLFVLQMVHRPSVRHVLQGLVRRNLLPAEFCVAKIKRNFNAGGYAIMQQQQQQQQQQQQIPSTASTTVTGLDRDNNNSSSSSSINNNNNNSNSNNMSSNNNNSNNNNTNSNNNNNNNNNSIEQTTIRVSLKCPVTYKRITLPARGIDCKHTQCFDLESYLQLNCDRGSWRCPVCNKGILTEALEIDQYMWAILSALSTTDTEEVSIDSGANWKAIKMVTGIKMEEDIDTKRLNKVNSPGSTTLPTWDNSQAMSPYMFPDMNTIASGSMMGQNYNNRNAYDYNQQNTDGGGNNQLVNEFSASVTSPLTHLSESVNSLELNPLNAMEKSLNDQMPHTPHTPHTPGGASTGHPLTPGGPPSVTSVHGETSSTQINSNSGGTTGSNSSPQHNLISNQNATSGTTTTGSTANGTINNQQMNNPMQNSMMNHQQQHLMNSFMSAQNDISLINLTDADLNADLNFDPAAVIDGDGTADALNLLSDNVVDPMELLSYLDPPDLNTPPSSGSSNNPNNDDILAAFLD
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_01276643;
- 90% Identity
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- 80% Identity
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