Palb010149.1
Basic Information
- Insect
- Ptychoptera albimana
- Gene Symbol
- Zmiz1
- Assembly
- GCA_961205885.1
- Location
- OY540804.1:31364236-31368953[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- zf-MIZ
- Domain
- zf-MIZ domain
- PFAM
- PF02891
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- This domain has SUMO (small ubiquitin-like modifier) ligase activity and is involved in DNA repair and chromosome organisation [1][2].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 0.12 5.7e+02 0.1 1.7 2 24 705 727 704 732 0.91 2 2 2.4e-24 1.1e-20 72.8 2.6 1 49 854 902 854 903 0.97
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGAGTGCCCAGGGGGGCTCCTCAGGGGCTTTAGCCTTAGGGGGCCGTGCAACTCCAAATAGGGGCTACCCGGAGCCCCACAACCAACAAAACTCATCTACCGGTGAGAAAGTGACTACGGGTAGATCGAGACGTCGTAAAGTTGTACAAGAGGATGTCCAACAGATAACACAAGTTCTTAATCCAAATGTACAACAAAACTCTTatccaaataatttattaaacaataacaataataactcAAGTAgtagtattaataataataataataataatattagtggTAATACAAGTAATAATTCATCGgttaatcaacaacaatttgTGGCAAGTCAGCAACaccaacagcaacatcaacagcaactTGGTTATGgtggtaataatttaaattattctgttaataatcaaaatattggTAATGGTAATGgacatttaaatcaaaatcatcaCCAATATATTGGACACGGttataatcaacaacaacaacaacagcagcagcagcaacaacatcagcaacagcaactaCAACCTCATCATAGTAGTTTAGCACATTCGAGTAGTTTAAATAGTCATCATCTtcatcagcagcaacagcaacatcttcagcatcatcaacagcagcagcatcaacagcaacagcatcatttgcaacagcaacaacaacaacaacagcaacaacatttaggtgttaataataatagtgcaGTGAGTGGcaataatacatttaatacaaataatagttCATCGCCAAATATGGTAGCGGCAACGGGTAACCAACAAGCCATGGATGTCGGTTTTAATGCACAGATGCAGATGGGTGGCGGTAGCATGGGTGGCATGCATGCACAATCTCATCAACAATATATGAACGGAATGAATAATATGGGTGGCAGTGGCGGTGGCAGTGTCGGTGGTGTTGGTGGCGTTGGCGGCGGTGGCGTAGGTGTTGGTGTTGGCGTAGGTGGCAGTAGTGTTGGCGGTGGTATGAGCAGCATGAATAATATGACAGGCATAAATAGTTTAAATGGGATgagtaatttaaatacaatgaaCGGCATGAATTCAATGCAAATGAATTCAATGAATCCAATGAATAACATGAATTATAATACATCAAGACATCATCATATGAATCCAATGGCACAAATGCAGGGTATGAATATGGGTGGTATGCAGCAAATGAATGGGATGAATCCAATGAATCAAATGGCAAATATGTCGCAACATATGAATGGTGGCGGTATGAGTCACCATCACCAAATGAATCCTATGGCGAAAATGCAGGGTATGGCTAATGGTGGTTATGCGCCACGTCGGATGTCACCGTATCCATCGCCACAAATGATATCGGCACAAAAACGAGCTGCTATGTATCCAAACATGGTAAATCCTAATTCACAGAGTATACCATCTGGAGCGATGCAAtatcaacagcagcaacagcatgcacaacaacaacagcaacagcagcaggtACCACAACACCAGCAACATCCGCATCACccacaacaaacaaatgttCCGCCAGTTCCtttgcaacaaaataattatggtCGTGGCCCAGTTGTCAATACAACGCCATATAATCGTGGTGGCCCGGTCATACCACAGCAAAGGCAAAACACTCCACCATATTCAAACTCACACAATCAACAATTTTACGGAGGAAATACTTATCAAAATGTACCCAGTTATCAACAAGAGGTGCGTTTGAATTTCCAACATAGTCCAGTCCCTGGTAATCCGACACCACCATTAACACCAGCTACGTCTATGACACCGTACATTAGTCCTAATCCAGATATTAAACCAGCCCCCATGCACAacgaTGATGAAATACGATTGACGTTTCCAGTTCGTGACGGTGTACTCTTGCCACCATTCCGTTTGGAACACAATTTAGCTGTTAGTAATCATGTGTTTCAATTAAAACCAAAcgtttttaatacattaatgTGTCGACCTGATCtagaattacaattaaaatgtttccATCATGACGATAAGTTAATGAACACAAATTGGCCGACTAGTGTACAAGTGTCTGCAAATGCAACACCATTGATGATTGATCGAGGCGAAAGTAAAAACTCTCATCGAccactttatttaaaaactgtttGCCAGCCGGGACGGAACACTATACAAATAACCGTCAGTACGTGTTGTTGCtcgcatttgtttgttttacaaaTGGTACATCGACCATCTGTACGTCACGTTTTACAAGGTTTATTAAAAAGGAACCTTTTGCCAGCCGAATTTTGTATAGCGAAAATAAAACGCAATTTTAATGCTGGTGGCCATGCAATaatgcagcagcaacaacaacagcaacaacaacaagtacCGTCAGTggcatcaacaacaataacaggaCTAGatcgtgataataataatagtagtagcagtagtattaataataataataataataatagtaatagtaataataataatatgagtagtaataataacaacaacaacaacaatagtaataatattaacaacaataacaataataacaacaacaacagtattgaacaaacaacaataagaGTATCATTTAAATGtccaatttcatttaaaaggaTTATGTTACCAGCTCGTGGCAATGATTGTAAACACACACAATGCTTTGATTTAGaatcatatttaaaattgaattgtgATCGTGGAAGTTGGCGTTGTCCAATATGCAATAAAGGAATATTAACCGAAGCACTAGAGGTTGACCAGTATATGTGGGCTATATTAAATACAACAAGTACAACCGATACCGAAGAAGTGTCTATCGATTCTGGTGGTAATTGGAAATCAATTAAACCAGTAACTGGTATTAAAATGGAGGAGGATATCGATACGAAACGTTTAAATAAAGTCAATTCACCTGGATCAACAACATTACCTACCTGGGATAATTCGCAAGCGATGAGTCCATACATGTGCCCCGATATGAATACAATTGCTAGTGGAAGCATGATGGGACAAAATTATAATAGGGGCGCCTATGATTATAATCAACTGAATCCGGATGGAAGTGGCGGGAATCAACtagcaaatgaatttaatgcGAGTGTTACGAGTCCTTTAACACATTTAAGTGAATCTGTTAACTCATTGGAGTTGAATCCATTGAATGCCATGGAGAAATCATTGAATGATCAGATGCCGCACACACCTCATACACCACATACACCTGGTGGTGGATCCACGGGACATCCATTAACACCTGGTGGACCACCAAGTGTAACATCAGTACACGGTGAAACTAGTTCAACACAGTTAAATTCagGTGGAACATCTGGTAGCAACTCGTCACcacaacataatttaataacaaatcagAATGCAACATCAGGTGGAACAACCGGTTTAACATCAAACagcacaacaaataatttacaaatgaaTAATCAGATGCAAAATTCAATGATGAATCATCAGCAACAGCATTTGATGAATTCATTTATGAATGCACAAAATGACATAAGTTTGATTAACCTAACCGACGCCGATCTGAATGCTGACTTAAATTTTGATCCAGCGGCAGTTATTGATGGTGACGGAACCGCGGATGCATTGAATttaCTTTCCGATAACGTTGTTGATCCTATGGAGTTGTTATCGTATTTAGATCCACCAGACTTGAATACACCACCGTCAAGTGGTTCCAGCAACAATCCCAACAATGATGATATTTTAGCTGCATTTTTAGATTAA
- Protein Sequence
- MSAQGGSSGALALGGRATPNRGYPEPHNQQNSSTGEKVTTGRSRRRKVVQEDVQQITQVLNPNVQQNSYPNNLLNNNNNNSSSSINNNNNNNISGNTSNNSSVNQQQFVASQQHQQQHQQQLGYGGNNLNYSVNNQNIGNGNGHLNQNHHQYIGHGYNQQQQQQQQQQQHQQQQLQPHHSSLAHSSSLNSHHLHQQQQQHLQHHQQQQHQQQQHHLQQQQQQQQQQHLGVNNNSAVSGNNTFNTNNSSSPNMVAATGNQQAMDVGFNAQMQMGGGSMGGMHAQSHQQYMNGMNNMGGSGGGSVGGVGGVGGGGVGVGVGVGGSSVGGGMSSMNNMTGINSLNGMSNLNTMNGMNSMQMNSMNPMNNMNYNTSRHHHMNPMAQMQGMNMGGMQQMNGMNPMNQMANMSQHMNGGGMSHHHQMNPMAKMQGMANGGYAPRRMSPYPSPQMISAQKRAAMYPNMVNPNSQSIPSGAMQYQQQQQHAQQQQQQQQVPQHQQHPHHPQQTNVPPVPLQQNNYGRGPVVNTTPYNRGGPVIPQQRQNTPPYSNSHNQQFYGGNTYQNVPSYQQEVRLNFQHSPVPGNPTPPLTPATSMTPYISPNPDIKPAPMHNDDEIRLTFPVRDGVLLPPFRLEHNLAVSNHVFQLKPNVFNTLMCRPDLELQLKCFHHDDKLMNTNWPTSVQVSANATPLMIDRGESKNSHRPLYLKTVCQPGRNTIQITVSTCCCSHLFVLQMVHRPSVRHVLQGLLKRNLLPAEFCIAKIKRNFNAGGHAIMQQQQQQQQQQVPSVASTTITGLDRDNNNSSSSSINNNNNNNSNSNNNNMSSNNNNNNNNSNNINNNNNNNNNNSIEQTTIRVSFKCPISFKRIMLPARGNDCKHTQCFDLESYLKLNCDRGSWRCPICNKGILTEALEVDQYMWAILNTTSTTDTEEVSIDSGGNWKSIKPVTGIKMEEDIDTKRLNKVNSPGSTTLPTWDNSQAMSPYMCPDMNTIASGSMMGQNYNRGAYDYNQLNPDGSGGNQLANEFNASVTSPLTHLSESVNSLELNPLNAMEKSLNDQMPHTPHTPHTPGGGSTGHPLTPGGPPSVTSVHGETSSTQLNSGGTSGSNSSPQHNLITNQNATSGGTTGLTSNSTTNNLQMNNQMQNSMMNHQQQHLMNSFMNAQNDISLINLTDADLNADLNFDPAAVIDGDGTADALNLLSDNVVDPMELLSYLDPPDLNTPPSSGSSNNPNNDDILAAFLD
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_01277360;
- 90% Identity
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- 80% Identity
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