Basic Information

Gene Symbol
CAMTA1
Assembly
GCA_963942525.1
Location
OZ012638.1:12685191-12700363[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
CG-1
Domain
CG-1 domain
PFAM
PF03859
TF Group
Unclassified Structure
Description
CG-1 domains are highly conserved domains of about 130 amino-acid residues containing a predicted bipartite NLS and named after a partial cDNA clone isolated from parsley encoding a sequence-specific DNA-binding protein [2]. CG-1 domains are associated with CAMTA proteins (for CAlModulin -binding Transcription Activator) that are transcription factors containing a calmodulin -binding domain and ankyrins (ANK) motifs [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 3 7e-49 1.2e-44 150.7 2.4 2 116 208 320 207 320 0.98
2 3 0.82 1.4e+04 -4.3 0.8 20 55 607 642 600 646 0.55
3 3 0.37 6.3e+03 -3.2 0.1 16 74 1205 1264 1200 1271 0.66

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGCTGGTTATCATCCATTATCTTTACAATCAGTAACAAATCAATCTCCTATTAATATAAACCATTCAACAATAACGACACGTAATAATCGAAGGTGTGATGATATATATACTATGCATACAACCGCAACAGTAATACCATCAACAACAACTACAATACATCATAATTATGGTATTCATATGCAATCAAGAAATAATCATGATATTTATACTTCACAACATTTACTTCAACAACAAcaccagcaacaacagcagcagcaacaacatcaacagcagcaTCGTTTAATGCTTTCGCAGCACCATCATAATATGATTAATATGAATAgaaatagtaatttaattaatggtgGTCCAACACCACCACCAACATTAAATACAAGTAATAATCATATAGATATGTTATCAAGAAATGGTAATAGTACAAATGGACGTCATCAAAATAATCATCAcaatcatcataataataatagcaataataacaataatagcaataataataatgtagttAATATTGGTACAACTTTGTTAGGAAATAATGTTTTACCATTGAATGCtaaTGGTGAACCAATTAAGTTACCAGATAATTTAGAAAGTTTACCACGAGCCGACCACTTTCCAACACAGCGTCATCGATGGAAtacaaatgaggaaATTGCTGcaattttaataagttttgATAAACATTCTGAATGGCAATCAAAAGAAGTTAAAACACggccAAAAAGTGGTTCAATGTTATTGTATTCACGTAAAAAAGTACGTTATAGACGTGACGGTTATTGTTGGAAAAAACGTAAAGATGGTAAAACAACAAGAGAGGATCATATGAAATTGAAAGTACAGGGGAcagaatgtATTTATGGATGTTATGTACATTCGGCAATTCTACCAACATTTCATCGTCGTTGTTATTGGTTATTgcagAATCCAGATATAGTGCTTgtacattatttaaatgtaccATATCcagatgataataaaatggcAGTTATAACACCTAGTTTAGCATTATTTAGCGATAAAAAAGAATGGACTAAAGAGGAATTAGTGAACCAATTAAAACCAATGTTTTTCAGTGAGGATGAGCCAGATGCCAGCAATGAAATTGAAATATCGACAACCGAAACTGTAGAGGCAATTGTTAgtcaattaattgaaaaacaaagatTAGCACGACAAGCAGCTTTAGTTAAACAATTAGAGTGTGGTTGTCCAGATTCAACATGTGTTGATGGTAAATCTTGTTCACATCCAATGCGTCGTATAAGTGCTGCTAAAAGTAATGTAGATAAACGTCAAGATAATAATCAAGTATCTAGTACAACACCAAATCTAGTTGGGCCTAggttGTATCATCGTTGGACCGAGCAAAATCGCGTTGAAAGAGATCAACGTAATAATAcagcaaataatttttcaaatgcAACACTTgcaacaaatcaaataaagcaaaatgaaataattcaaTATCAAAACATTCCTtcaacaaataatacaaatattattaatcaagTTATACGTACATCTAATGATATTACAAATGTAcatgataatataatatatagtaATTCTAATCAATATTCACAACAAACacaattatcaaataataacaataattcaacggcaagtaataataataataataataaaactaataataatagtcataGTCATATAACATTAACAAGACGCAATGGAAATAGTCTCATGACAATAACTTCAactaatcataatcataataatgTTGATTTAACATCAACAGCTTCAccagcaataaataatatagagaataataataataatattgaaaatcagcaacaacagcaacaacaacaacaacagcagcagcaacagcagcaacaacaacaacatacAATAACATTATCAAATGAAAACCATCAACAAGAACATGCTAATATTGGTCATCATCAACAGCCAATTACTACAACCAATTTAATCAGTAATATAAATCgtattacaataaatacaaCTGCCAATAATACTCAAATTGTTGCATCAACACCACCgttattattaagtttatcacaattgCAAGGAAACGGCaatagtttattaatattaaatggaCAACAACAACCATATGTGTGCCACACAAcacaacaaagaaaattaaatgcagATAATAACCATCAAATGATTCAGTATGCACAGAATATGGTAGCGAAACGTGAAAATGATGGGGCTAATGTTAATTGTGCAGATGGCCTGTTAACATTACCGTCTACATTAACATCAGACAAACAGGAATTAAAATCAGAACTAATTGAAACATCATCAAACTATATGTTAGGGCaggaaacaagtaataaaagtgAGAATGATTTAAGGGAAATTGAATCAAACGAATTGCATgattctttacattttttcaaTGAAACATTGGATTTGTCACAAGAGGAtatacaaaaaacattaaGCGCTAATATGCCAATAGGTGTCAATCGTGCAAAAACGACAAATATCATTGAAGAAATAAATCCAATGGACTTTATTGATAACTGTGAAATGGgtCACTCGGcacatgatgatgatgttttagttaatttagaTGCATTTGACATGCTCGTTGAATTTCCTGATTTAGAATTGGATACAAAGACATCATTTACATCAAATGAAATTGTTGAAAACAATGAGAAtgagataaataatattaaacttaTACGTGATATATCAACAACTCCAGCTTCTGAatcaataaatgatataaacaatgaaatatttaatataactgaTTACAGTCCAGAGTGGGCTTATTCCGATGGGGGTATAAAAGTTTTAGTAACTGGTCCATGGaatgaaaatacaatatatacaatattatttgattCTTTTCCGGTGCCAACAACTTTTGTACAATCCGGTGTGCTTCGCTGTTATTGCCcagcacacGAAGCTGGCTTAGTAACGTTGCAAGTTGCCTGTGCTGGATATGTTATATCGAATTCTgtaatttttgaatataaaacataTCCACAAACAGAACAATCACgcgatataaaaacaaatgatttgctacataaatttaatttgattaatcgATTAGAGGAAATCAATGAGAGACTACACATTAAGACCGAACCTAAGGATTtgcaggaagataatttattaatgagcCAGTCAAATTTTGAAGATCGTCTAGTATCGTTttgtcaacaaaaaataaataataactggCATACAAATACACAAGTGACTTGGGCAACAGGATATCGCAATATGACATTATTACATTTGGCATCAGCATTAGGTTATACAAAATTGATTGATGTTATGTTTTCTTGGCGTTCAGAAAATTCaagtttaataattgaaacaGAAGTTGATGCACTTAGTCAAGATATAGATGGTTTTACTCCATTaATGTGGGCCTGTGCTAAAGGACACAAAGAAACTGTAAACATATTGTATAGATGGAATAGCAATGCAATTAGCGtgacaaattatttacaacaaaTGCCTATTGATATAGCGAGAAATTATGGTTTCACtgatattgttaataatttagaaaaattcaatgaatATAACTTGCACAAAAAGCAACTTACAACATTTAGCGGTCAATCAGaatatttaatagataatCAATTAGATACATATAAATtgaacagtaataatattaataataaagtcaataataatttacaaaaaacgtcattattttcaataatggACAAAATGTCATCGGCAACAAATTgtgatgaaaatcataattatgaaACATTGgataaaattctaaatttaaataataacaatgcaaatttaaataataacaatgtggTCGTTAATAAATCACAGAATAGTTTAACAACCACATCCATATCTGACTCTCCATTATCATCGCCAATCAATGTTAATAATAGTCGTAGTCACGATGGTGTATTTCTAAGACCAGATGCTGTACTAAGTAGCACTTTAAATAACGGCAGTATTCAAAGTCCTCCCAATACTAGATCGAGTAAACGTTCATCAGTTGATAGTGGTATATGCCTAGATGCAAGATCTAATGCATCTTCAAGATTATCATTTGGAAAAATTATGAAAGATTCTCAAAAGTCAAAacTTGACCGTAGTATGTCACTGCCAATATCATCATCGTCAAGtacatcatcatcaccatctAGTACTGGTGTTGATGTATTtggtaatttttcaatttcaattgATGCATCATTTATTGGTAGTGGTCATTCGCCATCCTCATCtggaacaacaaataatagtttaaatcaatattttactaacacaaacaacaatacaaataattcgATATCACCaagtaataattctttattatcacCATTGAGGAAAATTGATTTTGCATTATGCGAAGTGTCAGCACCAGCATCGAGTAtggaacaacagcaacaacatttACAACAAGATGACGATGTTGGTGTTATTAAACAAGATGTTGATGGGTGTATCACAGAGGGTGGGGTTGTagGGGACTCGGATGTTAAAGTTTTAACATTAGCTGAACAAATAATTGCTGCAATGCCGGAGCgtattaaaaatgaATCTGATGAGATTATGTCATTAGGAAGTCCACCAATTCCAGAACCAAATGATGGATCAGCAATAAGTGTTTTAAATGATACATTTATGGAACCTTTGATGGATTCCTTATCAAGTTCTCAGTTTGATCAAgagtttaattttgaatttagtGATCATAATTATCGTTACCATGATGTTGGAACACCTTGCTCTAGTTTAAGTCCAGCTAGCTCTGGACCACTTCAGAGCCCGGCTAGTTATTCTGTTCAACCTGAACCGCATATGGGTTCGCCGAGTCCACCACCAACAACACAAGATTTTACGGAATTTTTACATGCTTCAAGTGTAACTAGACCTTTTGAAGCTGATTTTTCAAACTTAACATTAACTGaTCGTGAACAACGTGAATTATACGAGGCTGCAAAATGCATTCAAAAGGCATATCGTTCGTATAAAGGCAGAAAGAAGCTTGaaga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Protein Sequence
MAGYHPLSLQSVTNQSPININHSTITTRNNRRCDDIYTMHTTATVIPSTTTTIHHNYGIHMQSRNNHDIYTSQHLLQQQHQQQQQQQQHQQQHRLMLSQHHHNMINMNRNSNLINGGPTPPPTLNTSNNHIDMLSRNGNSTNGRHQNNHHNHHNNNSNNNNNSNNNNVVNIGTTLLGNNVLPLNANGEPIKLPDNLESLPRADHFPTQRHRWNTNEEIAAILISFDKHSEWQSKEVKTRPKSGSMLLYSRKKVRYRRDGYCWKKRKDGKTTREDHMKLKVQGTECIYGCYVHSAILPTFHRRCYWLLQNPDIVLVHYLNVPYPDDNKMAVITPSLALFSDKKEWTKEELVNQLKPMFFSEDEPDASNEIEISTTETVEAIVSQLIEKQRLARQAALVKQLECGCPDSTCVDGKSCSHPMRRISAAKSNVDKRQDNNQVSSTTPNLVGPRLYHRWTEQNRVERDQRNNTANNFSNATLATNQIKQNEIIQYQNIPSTNNTNIINQVIRTSNDITNVHDNIIYSNSNQYSQQTQLSNNNNNSTASNNNNNNKTNNNSHSHITLTRRNGNSLMTITSTNHNHNNVDLTSTASPAINNIENNNNNIENQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHTITLSNENHQQEHANIGHHQQPITTTNLISNINRITINTTANNTQIVASTPPLLLSLSQLQGNGNSLLILNGQQQPYVCHTTQQRKLNADNNHQMIQYAQNMVAKRENDGANVNCADGLLTLPSTLTSDKQELKSELIETSSNYMLGQETSNKSENDLREIESNELHDSLHFFNETLDLSQEDIQKTLSANMPIGVNRAKTTNIIEEINPMDFIDNCEMGHSAHDDDVLVNLDAFDMLVEFPDLELDTKTSFTSNEIVENNENEINNIKLIRDISTTPASESINDINNEIFNITDYSPEWAYSDGGIKVLVTGPWNENTIYTILFDSFPVPTTFVQSGVLRCYCPAHEAGLVTLQVACAGYVISNSVIFEYKTYPQTEQSRDIKTNDLLHKFNLINRLEEINERLHIKTEPKDLQEDNLLMSQSNFEDRLVSFCQQKINNNWHTNTQVTWATGYRNMTLLHLASALGYTKLIDVMFSWRSENSSLIIETEVDALSQDIDGFTPLMWACAKGHKETVNILYRWNSNAISVTNYLQQMPIDIARNYGFTDIVNNLEKFNEYNLHKKQLTTFSGQSEYLIDNQLDTYKLNSNNINNKVNNNLQKTSLFSIMDKMSSATNCDENHNYETLDKILNLNNNNANLNNNNVVVNKSQNSLTTTSISDSPLSSPINVNNSRSHDGVFLRPDAVLSSTLNNGSIQSPPNTRSSKRSSVDSGICLDARSNASSRLSFGKIMKDSQKSKLDRSMSLPISSSSSTSSSPSSTGVDVFGNFSISIDASFIGSGHSPSSSGTTNNSLNQYFTNTNNNTNNSISPSNNSLLSPLRKIDFALCEVSAPASSMEQQQQHLQQDDDVGVIKQDVDGCITEGGVVGDSDVKVLTLAEQIIAAMPERIKNESDEIMSLGSPPIPEPNDGSAISVLNDTFMEPLMDSLSSSQFDQEFNFEFSDHNYRYHDVGTPCSSLSPASSGPLQSPASYSVQPEPHMGSPSPPPTTQDFTEFLHASSVTRPFEADFSNLTLTDREQRELYEAAKCIQKAYRSYKGRKKLEEQEKERTAATVIQNYYRRYKQYAYYRQMTHAALVIQNGYRSYCEHKRFKKSTQSSSKNLNDLMPSINSVCQDKSSQCLQNYYKNYHSDQQQQNSCLINLNNNVTTLKEPNPSGPLKRTYSQRTQNQAARKIQQFMRQSKLKLQRERAEKEKLAHQRREEYLQSLQQHDSKDHLYKELK

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_01276255;
90% Identity
iTF_01276255;
80% Identity
-