Pcon009717.1
Basic Information
- Insect
- Ptychoptera contaminata
- Gene Symbol
- CAMTA1
- Assembly
- GCA_963942525.1
- Location
- OZ012638.1:12685191-12700363[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- CG-1
- Domain
- CG-1 domain
- PFAM
- PF03859
- TF Group
- Unclassified Structure
- Description
- CG-1 domains are highly conserved domains of about 130 amino-acid residues containing a predicted bipartite NLS and named after a partial cDNA clone isolated from parsley encoding a sequence-specific DNA-binding protein [2]. CG-1 domains are associated with CAMTA proteins (for CAlModulin -binding Transcription Activator) that are transcription factors containing a calmodulin -binding domain and ankyrins (ANK) motifs [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 3 7e-49 1.2e-44 150.7 2.4 2 116 208 320 207 320 0.98 2 3 0.82 1.4e+04 -4.3 0.8 20 55 607 642 600 646 0.55 3 3 0.37 6.3e+03 -3.2 0.1 16 74 1205 1264 1200 1271 0.66
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGCTGGTTATCATCCATTATCTTTACAATCAGTAACAAATCAATCTCCTATTAATATAAACCATTCAACAATAACGACACGTAATAATCGAAGGTGTGATGATATATATACTATGCATACAACCGCAACAGTAATACCATCAACAACAACTACAATACATCATAATTATGGTATTCATATGCAATCAAGAAATAATCATGATATTTATACTTCACAACATTTACTTCAACAACAAcaccagcaacaacagcagcagcaacaacatcaacagcagcaTCGTTTAATGCTTTCGCAGCACCATCATAATATGATTAATATGAATAgaaatagtaatttaattaatggtgGTCCAACACCACCACCAACATTAAATACAAGTAATAATCATATAGATATGTTATCAAGAAATGGTAATAGTACAAATGGACGTCATCAAAATAATCATCAcaatcatcataataataatagcaataataacaataatagcaataataataatgtagttAATATTGGTACAACTTTGTTAGGAAATAATGTTTTACCATTGAATGCtaaTGGTGAACCAATTAAGTTACCAGATAATTTAGAAAGTTTACCACGAGCCGACCACTTTCCAACACAGCGTCATCGATGGAAtacaaatgaggaaATTGCTGcaattttaataagttttgATAAACATTCTGAATGGCAATCAAAAGAAGTTAAAACACggccAAAAAGTGGTTCAATGTTATTGTATTCACGTAAAAAAGTACGTTATAGACGTGACGGTTATTGTTGGAAAAAACGTAAAGATGGTAAAACAACAAGAGAGGATCATATGAAATTGAAAGTACAGGGGAcagaatgtATTTATGGATGTTATGTACATTCGGCAATTCTACCAACATTTCATCGTCGTTGTTATTGGTTATTgcagAATCCAGATATAGTGCTTgtacattatttaaatgtaccATATCcagatgataataaaatggcAGTTATAACACCTAGTTTAGCATTATTTAGCGATAAAAAAGAATGGACTAAAGAGGAATTAGTGAACCAATTAAAACCAATGTTTTTCAGTGAGGATGAGCCAGATGCCAGCAATGAAATTGAAATATCGACAACCGAAACTGTAGAGGCAATTGTTAgtcaattaattgaaaaacaaagatTAGCACGACAAGCAGCTTTAGTTAAACAATTAGAGTGTGGTTGTCCAGATTCAACATGTGTTGATGGTAAATCTTGTTCACATCCAATGCGTCGTATAAGTGCTGCTAAAAGTAATGTAGATAAACGTCAAGATAATAATCAAGTATCTAGTACAACACCAAATCTAGTTGGGCCTAggttGTATCATCGTTGGACCGAGCAAAATCGCGTTGAAAGAGATCAACGTAATAATAcagcaaataatttttcaaatgcAACACTTgcaacaaatcaaataaagcaaaatgaaataattcaaTATCAAAACATTCCTtcaacaaataatacaaatattattaatcaagTTATACGTACATCTAATGATATTACAAATGTAcatgataatataatatatagtaATTCTAATCAATATTCACAACAAACacaattatcaaataataacaataattcaacggcaagtaataataataataataataaaactaataataatagtcataGTCATATAACATTAACAAGACGCAATGGAAATAGTCTCATGACAATAACTTCAactaatcataatcataataatgTTGATTTAACATCAACAGCTTCAccagcaataaataatatagagaataataataataatattgaaaatcagcaacaacagcaacaacaacaacaacagcagcagcaacagcagcaacaacaacaacatacAATAACATTATCAAATGAAAACCATCAACAAGAACATGCTAATATTGGTCATCATCAACAGCCAATTACTACAACCAATTTAATCAGTAATATAAATCgtattacaataaatacaaCTGCCAATAATACTCAAATTGTTGCATCAACACCACCgttattattaagtttatcacaattgCAAGGAAACGGCaatagtttattaatattaaatggaCAACAACAACCATATGTGTGCCACACAAcacaacaaagaaaattaaatgcagATAATAACCATCAAATGATTCAGTATGCACAGAATATGGTAGCGAAACGTGAAAATGATGGGGCTAATGTTAATTGTGCAGATGGCCTGTTAACATTACCGTCTACATTAACATCAGACAAACAGGAATTAAAATCAGAACTAATTGAAACATCATCAAACTATATGTTAGGGCaggaaacaagtaataaaagtgAGAATGATTTAAGGGAAATTGAATCAAACGAATTGCATgattctttacattttttcaaTGAAACATTGGATTTGTCACAAGAGGAtatacaaaaaacattaaGCGCTAATATGCCAATAGGTGTCAATCGTGCAAAAACGACAAATATCATTGAAGAAATAAATCCAATGGACTTTATTGATAACTGTGAAATGGgtCACTCGGcacatgatgatgatgttttagttaatttagaTGCATTTGACATGCTCGTTGAATTTCCTGATTTAGAATTGGATACAAAGACATCATTTACATCAAATGAAATTGTTGAAAACAATGAGAAtgagataaataatattaaacttaTACGTGATATATCAACAACTCCAGCTTCTGAatcaataaatgatataaacaatgaaatatttaatataactgaTTACAGTCCAGAGTGGGCTTATTCCGATGGGGGTATAAAAGTTTTAGTAACTGGTCCATGGaatgaaaatacaatatatacaatattatttgattCTTTTCCGGTGCCAACAACTTTTGTACAATCCGGTGTGCTTCGCTGTTATTGCCcagcacacGAAGCTGGCTTAGTAACGTTGCAAGTTGCCTGTGCTGGATATGTTATATCGAATTCTgtaatttttgaatataaaacataTCCACAAACAGAACAATCACgcgatataaaaacaaatgatttgctacataaatttaatttgattaatcgATTAGAGGAAATCAATGAGAGACTACACATTAAGACCGAACCTAAGGATTtgcaggaagataatttattaatgagcCAGTCAAATTTTGAAGATCGTCTAGTATCGTTttgtcaacaaaaaataaataataactggCATACAAATACACAAGTGACTTGGGCAACAGGATATCGCAATATGACATTATTACATTTGGCATCAGCATTAGGTTATACAAAATTGATTGATGTTATGTTTTCTTGGCGTTCAGAAAATTCaagtttaataattgaaacaGAAGTTGATGCACTTAGTCAAGATATAGATGGTTTTACTCCATTaATGTGGGCCTGTGCTAAAGGACACAAAGAAACTGTAAACATATTGTATAGATGGAATAGCAATGCAATTAGCGtgacaaattatttacaacaaaTGCCTATTGATATAGCGAGAAATTATGGTTTCACtgatattgttaataatttagaaaaattcaatgaatATAACTTGCACAAAAAGCAACTTACAACATTTAGCGGTCAATCAGaatatttaatagataatCAATTAGATACATATAAATtgaacagtaataatattaataataaagtcaataataatttacaaaaaacgtcattattttcaataatggACAAAATGTCATCGGCAACAAATTgtgatgaaaatcataattatgaaACATTGgataaaattctaaatttaaataataacaatgcaaatttaaataataacaatgtggTCGTTAATAAATCACAGAATAGTTTAACAACCACATCCATATCTGACTCTCCATTATCATCGCCAATCAATGTTAATAATAGTCGTAGTCACGATGGTGTATTTCTAAGACCAGATGCTGTACTAAGTAGCACTTTAAATAACGGCAGTATTCAAAGTCCTCCCAATACTAGATCGAGTAAACGTTCATCAGTTGATAGTGGTATATGCCTAGATGCAAGATCTAATGCATCTTCAAGATTATCATTTGGAAAAATTATGAAAGATTCTCAAAAGTCAAAacTTGACCGTAGTATGTCACTGCCAATATCATCATCGTCAAGtacatcatcatcaccatctAGTACTGGTGTTGATGTATTtggtaatttttcaatttcaattgATGCATCATTTATTGGTAGTGGTCATTCGCCATCCTCATCtggaacaacaaataatagtttaaatcaatattttactaacacaaacaacaatacaaataattcgATATCACCaagtaataattctttattatcacCATTGAGGAAAATTGATTTTGCATTATGCGAAGTGTCAGCACCAGCATCGAGTAtggaacaacagcaacaacatttACAACAAGATGACGATGTTGGTGTTATTAAACAAGATGTTGATGGGTGTATCACAGAGGGTGGGGTTGTagGGGACTCGGATGTTAAAGTTTTAACATTAGCTGAACAAATAATTGCTGCAATGCCGGAGCgtattaaaaatgaATCTGATGAGATTATGTCATTAGGAAGTCCACCAATTCCAGAACCAAATGATGGATCAGCAATAAGTGTTTTAAATGATACATTTATGGAACCTTTGATGGATTCCTTATCAAGTTCTCAGTTTGATCAAgagtttaattttgaatttagtGATCATAATTATCGTTACCATGATGTTGGAACACCTTGCTCTAGTTTAAGTCCAGCTAGCTCTGGACCACTTCAGAGCCCGGCTAGTTATTCTGTTCAACCTGAACCGCATATGGGTTCGCCGAGTCCACCACCAACAACACAAGATTTTACGGAATTTTTACATGCTTCAAGTGTAACTAGACCTTTTGAAGCTGATTTTTCAAACTTAACATTAACTGaTCGTGAACAACGTGAATTATACGAGGCTGCAAAATGCATTCAAAAGGCATATCGTTCGTATAAAGGCAGAAAGAAGCTTGaaga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- Protein Sequence
- MAGYHPLSLQSVTNQSPININHSTITTRNNRRCDDIYTMHTTATVIPSTTTTIHHNYGIHMQSRNNHDIYTSQHLLQQQHQQQQQQQQHQQQHRLMLSQHHHNMINMNRNSNLINGGPTPPPTLNTSNNHIDMLSRNGNSTNGRHQNNHHNHHNNNSNNNNNSNNNNVVNIGTTLLGNNVLPLNANGEPIKLPDNLESLPRADHFPTQRHRWNTNEEIAAILISFDKHSEWQSKEVKTRPKSGSMLLYSRKKVRYRRDGYCWKKRKDGKTTREDHMKLKVQGTECIYGCYVHSAILPTFHRRCYWLLQNPDIVLVHYLNVPYPDDNKMAVITPSLALFSDKKEWTKEELVNQLKPMFFSEDEPDASNEIEISTTETVEAIVSQLIEKQRLARQAALVKQLECGCPDSTCVDGKSCSHPMRRISAAKSNVDKRQDNNQVSSTTPNLVGPRLYHRWTEQNRVERDQRNNTANNFSNATLATNQIKQNEIIQYQNIPSTNNTNIINQVIRTSNDITNVHDNIIYSNSNQYSQQTQLSNNNNNSTASNNNNNNKTNNNSHSHITLTRRNGNSLMTITSTNHNHNNVDLTSTASPAINNIENNNNNIENQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHTITLSNENHQQEHANIGHHQQPITTTNLISNINRITINTTANNTQIVASTPPLLLSLSQLQGNGNSLLILNGQQQPYVCHTTQQRKLNADNNHQMIQYAQNMVAKRENDGANVNCADGLLTLPSTLTSDKQELKSELIETSSNYMLGQETSNKSENDLREIESNELHDSLHFFNETLDLSQEDIQKTLSANMPIGVNRAKTTNIIEEINPMDFIDNCEMGHSAHDDDVLVNLDAFDMLVEFPDLELDTKTSFTSNEIVENNENEINNIKLIRDISTTPASESINDINNEIFNITDYSPEWAYSDGGIKVLVTGPWNENTIYTILFDSFPVPTTFVQSGVLRCYCPAHEAGLVTLQVACAGYVISNSVIFEYKTYPQTEQSRDIKTNDLLHKFNLINRLEEINERLHIKTEPKDLQEDNLLMSQSNFEDRLVSFCQQKINNNWHTNTQVTWATGYRNMTLLHLASALGYTKLIDVMFSWRSENSSLIIETEVDALSQDIDGFTPLMWACAKGHKETVNILYRWNSNAISVTNYLQQMPIDIARNYGFTDIVNNLEKFNEYNLHKKQLTTFSGQSEYLIDNQLDTYKLNSNNINNKVNNNLQKTSLFSIMDKMSSATNCDENHNYETLDKILNLNNNNANLNNNNVVVNKSQNSLTTTSISDSPLSSPINVNNSRSHDGVFLRPDAVLSSTLNNGSIQSPPNTRSSKRSSVDSGICLDARSNASSRLSFGKIMKDSQKSKLDRSMSLPISSSSSTSSSPSSTGVDVFGNFSISIDASFIGSGHSPSSSGTTNNSLNQYFTNTNNNTNNSISPSNNSLLSPLRKIDFALCEVSAPASSMEQQQQHLQQDDDVGVIKQDVDGCITEGGVVGDSDVKVLTLAEQIIAAMPERIKNESDEIMSLGSPPIPEPNDGSAISVLNDTFMEPLMDSLSSSQFDQEFNFEFSDHNYRYHDVGTPCSSLSPASSGPLQSPASYSVQPEPHMGSPSPPPTTQDFTEFLHASSVTRPFEADFSNLTLTDREQRELYEAAKCIQKAYRSYKGRKKLEEQEKERTAATVIQNYYRRYKQYAYYRQMTHAALVIQNGYRSYCEHKRFKKSTQSSSKNLNDLMPSINSVCQDKSSQCLQNYYKNYHSDQQQQNSCLINLNNNVTTLKEPNPSGPLKRTYSQRTQNQAARKIQQFMRQSKLKLQRERAEKEKLAHQRREEYLQSLQQHDSKDHLYKELK
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_01276255;
- 90% Identity
- iTF_01276255;
- 80% Identity
- -