Palb008875.1


Basic Information
Transcription Factor Domain
Sequence Information
Similer Transcription Factors

Basic Information

Insect
Ptychoptera albimana
Gene Symbol
CAMTA1
Assembly
GCA_961205885.1
Location
OY540804.1:15754913-15780756[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
CG-1
Domain
CG-1 domain
PFAM
PF03859
TF Group
Unclassified Structure
Description
CG-1 domains are highly conserved domains of about 130 amino-acid residues containing a predicted bipartite NLS and named after a partial cDNA clone isolated from parsley encoding a sequence-specific DNA-binding protein [2]. CG-1 domains are associated with CAMTA proteins (for CAlModulin -binding Transcription Activator) that are transcription factors containing a calmodulin -binding domain and ankyrins (ANK) motifs [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 8.4e-49 1.2e-44 150.4 2.4 2 116 514 626 513 626 0.98
2 2 0.9 1.3e+04 -4.4 2.6 42 47 926 931 895 974 0.48

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTCGTCACAACCACTTTACTGCTTAAGCCTACAAATTCgGCCAAATTCTGAAGAAAGtagtaataatattgaattaaatgacAATTTTGAACAACATTTAAGAGTCGAGAAAATAAAAGgtgaaaaattacataaaaatgataatggtTGTAAAATTAGAACACATGATGAACAACAAATTGTTGTGCCATCAACAATACAACACCAACAATCACATCAgaacaataatataatattattgcgTGGGGCACGTTCAGAAAATGGCcaaattatattacaaaacGGTCATGaactattaaatttatttaatggtagtaataataacaacaataacactAATAATAACATTGATGATGAACATAATCATCATGTCAAACCAATTCTGTTGCAAAATCAACagattaaaacaacaaaaaaattacaagaaactagtgcaatattattacaatcgtcgtcatcatcatcatcatcatcatcgggAACGCATGgtacaaagaaaaattcccGTTCTGTTAATAGTATAATATGTGATGGTAATTCACCAATTATTGTACAACAGGcacgttttaataataaagtatgtAATGATGGAccaatattattacaaacattaaaacGTTTTGATAAATCACAGTCGATATTTGTTTTACGTAATGCACATAATATTGGTACcggaagtaataataataatggcaaaaataataatggaaataattCAGCAGCAGGATCCACATTTTTATCATCTGTGTCtggaacaaataaacaaaattgtagtaatattaaagttaaaagtagTATTtcatcaataacaacaactaCTGTCTctgttaaacaagaaaatggtCAAGATACATCAAAGcaccagcagcagcaacaaaaacaaacgttAATACCTATTGGGACTGGTAAGTTttgttatTGTTCTCGTATGATAATAATGGCTGGTTATCATCCATTATCTTTACAATCAGTAACAAATCCTTCTCCTATTAATATAAACCATTCAACAATAACGACACGTAATAATCGAAGGTGTGACGATATATATACAATGCATACAACCGCTACTATAGtaccatcaacaacaaccacagtaCATCATAATTATGGTATTCATATGCAATCAAGAAATAATCATGATATTTATACTTCACACAATTTACACCAacaccagcaacaacaacaacaacaacaacagcatcgtTTAATGCTCTCGCAACACCATCATAATATGATTAATATGAATAGAggtagtaatttaattaatggtgGTCCAACGCCACCGCCAACATTAAATACTAGTAATAATCATATAGATATATTATCAAGAAATGGTAATAGTACAAATGGACGTCATCAAAAtaatcaccatcatcatcatcatcatcatcagaataataataataataacaataatatagtAAATATTGGTACAACTTCGTTaggaaataatgttttaccaTTGAATGCTAATGGTGAACCAATTAAGTTACCAGATAATTTAGAAAGTTTACCACGAGCCGACCACTTTCCAACACAGCGACACCGATGGAATACAAatgagGAAATTGCTGCAATTTTAATAAGTTTTGATAAACATTCTGAATGGCAATCAAAAGAAGTTAAAACACggcCAAAAAGCGGTTCAATGTTACTTTATTCACGTAAAAAAGTACGATATAGACGTGACGGTTATTGTTGGAAAAAACGTAAAGATGGCAAAACAACAAGAGAGGATCATATGAAATTGAAAGTACAGGGGAcagaatgTATTTATGGATGCTATGTACATTCGGCAATTCTTCCTACATTTCATCGCCGTTGCTATTGGTTATTgcagaATCCCGATATAGTGCTTGTCCATTATTTAAACGTACCATATCcagatgataataaaatggcAGTTATAACACCAAGTTTAGCATTATTTAGTGATAAAAAAGAATGGACTAAAGAGGAATTAGTAAACCAATTAAAACCAATGTttttcagtGAAGATGAACCAGATGCCAGCAATGAAATAGAAATAtccACAACCGAAACAGTGGAGGCAATTGTTAGTCAATTAATTGAAAAGCAAAGATTAGCACGTCAAGCAGCTTTGGTCAAACAATTAGAGTGTGGCTGTCCTGATTCAACATGTGTCGATGGTAAATCTTGTTCACATCCAATGCGTCGAATAAGTGCTGCTAAAAGTAATGTAGAAAAACGGCAAGATAATAATCAAGTATCGAGTACAACACCAAATTTAGTTGGACCAAGgttgTATCATCGTTGGACCGAACAAAATCGAGTTGAAAGAGATCAGCGTAATAATACAAGCAGTAACTTTTCTAATACAGCTCTAACAAATAACCAAATAAagcaaaacgaaataattcaATATCAAAACATTCCTtcaacaaataatacaaatattattaatcaagTTATACGTACATCTAATGATATTACAAATGTAAATGATAATATGatatataataattctaatCAATATTCACAACAAACAcaattatcaaataataacaataattcaactgcaaataataataaaactaataataataatcatagtcATATAACATTAACAAGACGCAATGGAAATAGTCTCATGACAATAACTTCAactaatcataatcataataatgttgatttaacaTCAACAGCTTTACcagcaataaataatgtagaaaCTAATAATATCGAAAAtcagcatcagcagcagcaacatcaacaacaacagcagcaacaacaacagcagcagcaacagcaacaccagcaacaacaacagcagcagcatcaacaacaacatcagcagcaacaacaacaacatactATTACTTTATCAAATGAAAATCGTCAACAAGAACATGTTAATGTCAGTCATCATCAGCAACCAATTACAACGGCTAACTTAATTAGTAATATTAATCGTATAACTATAAATACAACTGCTAATAATACTCAGATTGTTGCTTCAACTCCACCACTATTATTAAGTTTATCACAActaCAAGGTAATGGtaatagtttattaattttgaatggACAACAACAACCATATGTATGCCATACAACacagcaaagaaaattaaatacggataataataatcatcaaatgATACAATATTCACAAAATATGGTAGCAAAACGTGAAAATGATGGGTCTACTGTTAATTGTGCAGATGGCCTATTAACAATTCCATCTTCTGATAAACAAGAATTAAAATCAGAATTAATTGAAACACCATCAACATATATGTTGGGGCAGGAACCAAGTAATAAAAGTGAGAATGATTTAAGGGAAATTGAATCAAatGAATTACAAGactctttacatttttttaatgaaacattGGATTTGTCACAAGAAGAtatacaaaaaacattaagcgCTAATATGCCAATAGGTGTAAATAGAGCAAAAGCGACAAATATTATTGAAGAAATAAATCCTATGGACTTTATTGATAACTGTGAAATCGgtCATTCCGcacatgatgatgatgttttaGTGAATTTGGATGCATTTGACATGCTAGTTGAATTCCCTGATTTAGAGTTAGACACAAAGACTACATTTACATCAAATGAAATTGTTGAAACCCACGATAATGATATAAACAATATGAAACTTATACGTGATATATCAACTACGCCAACTGCAGAATCAATAACTgatataaacaatgaaatatttaatattactgATTATAGTCCAGAATGGGCATACTCTGATGGCGGTATAAAAGTTTTGGTGACTGGACCATGGAATGAAAATACAACATATACAATATTATTTGACTCTTTTCCAGTACCAACGACGTTTGTACAATCTGGTGTGCTTCGCTGTTATTGTCCAGcgcACGAAGCTGGTTTGGTAACACTGCAAGTTGCTTGTTCTGGATATGTTATATCGAATTCTGtaatatttgaatataaaacaTATCCACAAACAGAACAGTCACgcgatataaaaacaaatgatttgctacataaatttaatttgattaatcgaTTAGAAGAAATTAATGAACGACTACATATTAAGACCGAACCTAAAGATTtgCAGGAAGATAGTTTATTGATGAGCTTGTCTAACTTTGAAGATCGTTTAGTAACATTttgtcaacaaaaaataaataataaatggcaTACAAATACACAAGTTACTTGGGCAACAGGATACCGTAATATGACATTATTACATTTGGCATCAGCATTAGGTTATACaaaattgattgatgttatgCTTTCTTGGCGTTCTGAAAATTCaagtttaattattgaaacagAAGTAGATGCACTTAGTCAAGATGTAGATGGCTTTACTCCATtaATGTGGGCCTGTGCTAAAGGACATAAAGAAACTGTAAACATATTGTATAGATGGAATTGTAATGCAATAAGTGTGACAAATTATTTGCAACAAATGCCTATTGATATAGCGAGAAATAATGGtttCACCGATATTGTTAATGATTtagaaaaattcaatgaatataatctacacaaaaaacaactaaCAACGTTTAGTGGCCAGtcagaaaatttaatagataATCAATTAGATacgtataaattaaataatattaataaaaacaataataatttacaaaagacATCATTATTTTCAATGATGGATAAAATGTCACCTACCAATTGTGatgataatcataattatgaaacattagataaaattttaaatttgaatcataacaattcacatttaaataataaaaattcagttgTTAATAAATCACAGAATAGTTCAACTACAACATCCATCTCAAACTCACCCCTATCTTCACCAAGCAATGTAAACATTAATCGCAGTCATGATGGTGTATTTCTTAGACCAGATGCTGTAATAAGTATCCAAAGTCCTCCTAATACCAGATCAACTAAACGTTCATCAGTTGATAGTGGTATATGTTTAGATGCCAGATCAAATGCATCATCTAGATTATCTTTTGGGAAATTTTTGAAAGATTCTCAAAAGTCAAAgcTTGACCGTAGTATGTCACTGCCAATATCAACATCTTCAAGTACGTCCTCATCGCCATCAAATGCTGGTGTCGATGTATTtggtaatttttcaatttcaattgatGCATCATTTATTGGTAGTGGTCATTCATCATCCTCCTCTGGAGCAActagtaataatttaaatcaatattttactAACGCaaacaacaatacaaataattcGATATCACCAagtaataattctttattatcaCCATTGAGGAAAATTGATTTTGCATTATGCGAAGTATCTGCACCAGCATCAAGTAtggaacaacagcaacaacatttGCAACAAGATGACGATGTTGGTGTTATAAAACAAGATGCTGATGGGTGTATGACAGAGGGTGGGGTTGTagGGGACTCAGATGTTAAAGTTTTAACACTAGCTGAACAAATAATTGCTGCAATGCCGGAGCGTATTAaaaatgaaTCTGATGAGATTATGTCATTGGGGAGTCCACCAATATCGGAAGCAAACGATGCGGGAATAAGTGTTTTAAATGATACTTTTATGGAACCTTTAATGGATTCATTGTCTAGTTCCCAATTTGATcaagagtttaattttgaattcagTGATCATAATTATCGTTATCACGATGTAGGCACTCCTTGCTCTAGTCTTAGTCCAGCTAGTTCTGGACCACTACAAAGTCCCGCCAGCTATTCTATTCAGCCGGAACCGCATATGGGTTCTCCTAGTCCACCACCTACTACGCAAgattttacagaatttttgcATGCTTCAAGCATAACAAGACCCTTTGAAGCTGATTTTTCCAACTTAACATTAACtgatCGCGAACAACGTGAACTATACGAAGCTGCTAAGTGTATTCAAAAGGCTTATCGTTCATATAAAGGCAGAAAGAAGCTAgaagaacaagaaaaagagCGCTCCGCAGCTACGGTTATACAAAATTACTATCGTCGTTATAAACAGtatGCTTATTATCGTCAAATGACACATGCAGCACTTGTTATACAAAATGGTTATCGTTCATATTGTGAGCATAAacggtttaaaaaatcaacacaaacatcatcaaaaaatcttAATGATTTAATACCATCAATGAACGGTGTGTGTCAAGATAAATCCTCACAATgcttacaaaattattataaaaattatcatagtggtcaacaacaacaaaatagttgtttaattaatttaaataataatctaacaTCATTAAAAGAGCCTAATCCATCTGGACCTCTAAAACGTACATACTCACAAAGAACTCAAAATCAAGCTGCTAGAAAAATACAACAGTTTATGCgtcaatcaaaattaaaACTTCAGAGAGAACGAGCCGAAAAAGAGAAGCTTGCGCATCAACGCAGGGAGGAATACCTACAAAGCTTGCTACATCTCGACTCCAAAGAGCATCTAcacaaagaattaaaatag
Protein Sequence
MSSQPLYCLSLQIRPNSEESSNNIELNDNFEQHLRVEKIKGEKLHKNDNGCKIRTHDEQQIVVPSTIQHQQSHQNNNIILLRGARSENGQIILQNGHELLNLFNGSNNNNNNTNNNIDDEHNHHVKPILLQNQQIKTTKKLQETSAILLQSSSSSSSSSSGTHGTKKNSRSVNSIICDGNSPIIVQQARFNNKVCNDGPILLQTLKRFDKSQSIFVLRNAHNIGTGSNNNNGKNNNGNNSAAGSTFLSSVSGTNKQNCSNIKVKSSISSITTTTVSVKQENGQDTSKHQQQQQKQTLIPIGTGKFCYCSRMIIMAGYHPLSLQSVTNPSPININHSTITTRNNRRCDDIYTMHTTATIVPSTTTTVHHNYGIHMQSRNNHDIYTSHNLHQHQQQQQQQQQHRLMLSQHHHNMINMNRGSNLINGGPTPPPTLNTSNNHIDILSRNGNSTNGRHQNNHHHHHHHHQNNNNNNNNIVNIGTTSLGNNVLPLNANGEPIKLPDNLESLPRADHFPTQRHRWNTNEEIAAILISFDKHSEWQSKEVKTRPKSGSMLLYSRKKVRYRRDGYCWKKRKDGKTTREDHMKLKVQGTECIYGCYVHSAILPTFHRRCYWLLQNPDIVLVHYLNVPYPDDNKMAVITPSLALFSDKKEWTKEELVNQLKPMFFSEDEPDASNEIEISTTETVEAIVSQLIEKQRLARQAALVKQLECGCPDSTCVDGKSCSHPMRRISAAKSNVEKRQDNNQVSSTTPNLVGPRLYHRWTEQNRVERDQRNNTSSNFSNTALTNNQIKQNEIIQYQNIPSTNNTNIINQVIRTSNDITNVNDNMIYNNSNQYSQQTQLSNNNNNSTANNNKTNNNNHSHITLTRRNGNSLMTITSTNHNHNNVDLTSTALPAINNVETNNIENQHQQQQHQQQQQQQQQQQQQQHQQQQQQQHQQQHQQQQQQHTITLSNENRQQEHVNVSHHQQPITTANLISNINRITINTTANNTQIVASTPPLLLSLSQLQGNGNSLLILNGQQQPYVCHTTQQRKLNTDNNNHQMIQYSQNMVAKRENDGSTVNCADGLLTIPSSDKQELKSELIETPSTYMLGQEPSNKSENDLREIESNELQDSLHFFNETLDLSQEDIQKTLSANMPIGVNRAKATNIIEEINPMDFIDNCEIGHSAHDDDVLVNLDAFDMLVEFPDLELDTKTTFTSNEIVETHDNDINNMKLIRDISTTPTAESITDINNEIFNITDYSPEWAYSDGGIKVLVTGPWNENTTYTILFDSFPVPTTFVQSGVLRCYCPAHEAGLVTLQVACSGYVISNSVIFEYKTYPQTEQSRDIKTNDLLHKFNLINRLEEINERLHIKTEPKDLQEDSLLMSLSNFEDRLVTFCQQKINNKWHTNTQVTWATGYRNMTLLHLASALGYTKLIDVMLSWRSENSSLIIETEVDALSQDVDGFTPLMWACAKGHKETVNILYRWNCNAISVTNYLQQMPIDIARNNGFTDIVNDLEKFNEYNLHKKQLTTFSGQSENLIDNQLDTYKLNNINKNNNNLQKTSLFSMMDKMSPTNCDDNHNYETLDKILNLNHNNSHLNNKNSVVNKSQNSSTTTSISNSPLSSPSNVNINRSHDGVFLRPDAVISIQSPPNTRSTKRSSVDSGICLDARSNASSRLSFGKFLKDSQKSKLDRSMSLPISTSSSTSSSPSNAGVDVFGNFSISIDASFIGSGHSSSSSGATSNNLNQYFTNANNNTNNSISPSNNSLLSPLRKIDFALCEVSAPASSMEQQQQHLQQDDDVGVIKQDADGCMTEGGVVGDSDVKVLTLAEQIIAAMPERIKNESDEIMSLGSPPISEANDAGISVLNDTFMEPLMDSLSSSQFDQEFNFEFSDHNYRYHDVGTPCSSLSPASSGPLQSPASYSIQPEPHMGSPSPPPTTQDFTEFLHASSITRPFEADFSNLTLTDREQRELYEAAKCIQKAYRSYKGRKKLEEQEKERSAATVIQNYYRRYKQYAYYRQMTHAALVIQNGYRSYCEHKRFKKSTQTSSKNLNDLIPSMNGVCQDKSSQCLQNYYKNYHSGQQQQNSCLINLNNNLTSLKEPNPSGPLKRTYSQRTQNQAARKIQQFMRQSKLKLQRERAEKEKLAHQRREEYLQSLLHLDSKEHLHKELK

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_01276945;
90% Identity
iTF_01276945;
80% Identity
-