Basic Information

Insect: Ptychoptera contaminata
Gene Symbol: Trerf1
Assembly: GCA_963942525.1
Location: OZ012637.1:36858845-36867293[-]

Transcription Factor Domain

TF Family: MYB
Domain: Myb_DNA-binding domain
PFAM: PF00249
TF Group: Helix-turn-helix
Description: This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 1 6.5e-10 6.1e-07 29.4 0.1 2 45 1384 1427 1383 1428 0.94

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	1	6.5e-10	6.1e-07	29.4	0.1	2	45	1384	1427	1383	1428	0.94

Sequence Information

Coding Sequence: ATGTATTGCgtTCAAGGCGGACTCCGTCTACCTTTAACCGGATTAACACCAAACAGAGTACTAATGTGCAGCGCTTCAATGGGCGCCGAGGGTTCTGTTACCCTACAGCTACGTGAAGCTGTACAAGCACCAGATGCTGGCCAACCAATTGATGGTGCACTTACAATTGGTTATCCAGATCCAGAAATATTAGCAGATATGCTGGGCAGTCTGCAAGCAGCAGGCACTGATGATGGGACATCATTAGTTAGAACGGAAAATAATGAGTCTGATTTAGctggttttttatttgctaaaacAACATCAAAATGTTCAAGCGTACAGCCAACAGCAGcatccagcagtaataataataataataacaataataacagtaacaataataataataataatatagcaaATGCAATAAGTACGAATAGTACTGTTAGTGAAGTTATAACGCGAACTGTTGTACCATCAACAACACAGACAACAACAAATACTTCTgctaatactaataataatagtagtagtagtaataataataataataataatactataatcaatggaaatataataaatagtgttaataatagtaaaaataatagtaataataataaaaataataataatggaaataataatataattaatggaaataataataatataaatagtgttaataataataatataagtaataataataatattaaaaacagtaataatacCACGAGTagtagtaataacaataatgcaaGTACGGTAACAGCAATTAAAAAGCCACGTACTAAAACTGCGTCACCAACAAGGCATGGTCCCCAACAATGTCaggtttgcaataaaatattcgGAAATGCGTCTGCCTTAGCGAAACATAAATTGACGCACAGTgatgaaagaaaatatgtaTGTAGTATGTGCTCAAAAGCTTTTAAACGACAGGATCACTTAAATGGTCATATGCTAACACATcgtaataaaaaaccatatgAATGTAAGGCGGAAGGTTGTGGAAAATCATACTGTGATGCACGTTCATTAAGGCGACATACAGAGAATCATCATAGTGGGCTGGCAATGACACCAACAACACCAAATCAGTCTATGTCATCATCAACAGGACCACCGACAGGGCTCAGCTTGTCACCAGCAACAGCTAGTGGTGATGCTAGTTCGCCGCATGGTGCGACATGTATTCAATATAATAGTAACAGCGGTAGTAATAGCGGTGATGGTTCGAGTCCAAAACCATTATCACCTAGTTCGCCAGCGGGCGCCGGTAATGAAGGTCTAACACGACAACAACTTGATTTAATCACACAAATAATGCAACAAACAAAGCAAGCGAATGCTGGTATTGCTGCGGCTGTAGCAGCGGCAGCAGCTGCTGCAGGAAATACAAATAATGGTGGTACTGGCGGCAGTGGTTCATCCTCCTcagctaataataatacttcacAACGTCATGTACAAAGACCACGCACATGGAATATGCAGACTCAACTGCAACAAACACAAACAAAGATATCACCAAATTCTGATAATCAAACTGCTGGCACAATATTAACATCGTTGACAACTATAAATGGGGCTAAAGTTGAACAGAAACCTGTCGAATGTAATTTATGTCATCggaaattcaaaaatataccAGCATTGAATGGACATATGCGATTGCATGGTGGCTATTTTAAGAAAGATtccgaaacaaaaaaatgtgacaaaaaagaaacaccgGGTCCACCATTGCAGACAGCTAGTGTGGGTGTTCGTGCACTAattgaagagaaaataattaacaaacgtAGTAAGGAtttaaagggAGCATTTGTTGTTCCTGCACCACCATTGGCAGCACGTCGATTATTAGAtgcagaaaattatatttctccaAAAATATCAACAGCATCAAATGGCACAGTACAGGCAACAATTATTACCTCAAATTCAATAACGGCGCCCAAAACAAATCAGCATAATGGCACAATACAGTTAGCTACATCGCAAAATGGGAGCACAaatcaaaaaacattaataacatCCTCAACAGCATCAATTGTCTCTTCAATAGGAACGAGCACAATGATTGAAAACAGTAAAGATGCGACACTGATTGAGTTACTGAAGCGTGGTACCAAAGTTGCTGTAAAACGTGCTTGTTCCGATCCTGGACAAGTTACGTACAGTTCCTTATCAAAATCACAATCAACAACCACAACTATGGTTAttccaacaacaacaacagctacTATATCAACATTAGCAAACACAACATCAGCACCCCCATTGGCATTATCTTTATCAAGTGGAGGAGAAAATACACCTCTTGCACTTACTATATCTCAGTCACCGTCCGGATCAGGAGATGTTTACACGCTGGCCTACTCAACAGATTCAACTACTGCATTTTTTACAGAGAACGATGTTTATAATGTTCCCGATGCAGCAATGCTTTTACAAGCTGTTGACTCTATTCagCTTCTTCACGATTCATCTACATCAGATCATATGGAAGAGATCGCCTCGTTAAGTGATTACACGCTAAATGGAAGTAATGGCAATTTAACTGAAAATATATCACAAAGTTTTACTCCATCACGACAACTTCAAGCAGTTCTTGACTCTCCACTTCCAGAAAGCTTAGCAGAGTTCAGTGCACTTCATTCCAAGGATTACGTTTTGTATGGCTGCTCGAGTACCGATTCGCCAACAACACAATCATCTGCATCACCTTTACCATCACCGTTAGCATATCCAACTCCTCCAGCCAGCCATGAAACTGTTGCTCAGGCATCTCCGTTTTTAGATGACTCGCATCATTTCTCAGACCCAGGATCCCTGTTTGATGACAAGAAATCTCATTGTTTTTTCGATGATAGTAGTCGATCGTTTTTCAAAGATTCTAAAGAGCATCTTTCGGAAAGTCAACGAAttttaaagcttaaaaatGAACTATTCAACGAAACCAAATCAGTCATGGATGATTCTAATGGATTTTTCAAAgatgaaaagaatttattctGCGTCGAGAATCCAGTTAGTTTGCTTGAAGAAAATTCTGTCAGAATTGGAGGTCTAAACGTAAATCGCCGAATGCAAGAATTTAATCATCAGAATTTATCATTTCTCGACGAACCCCAAAATTTTCTTGAAGATGCTCGAAACACATCGTCCCCATTATCTGCTGCCTTTTTCTCAGCCACTATGTCAAGTGCGGAAGAGGTAAAAGAAGCACTTGAAGAAGTTTTACCTAATGAAAATATGCATGCTGAAGATGCAGCCGATAATGacattgatttatattatctGCCTGGATTATCACTCCAATCACAAATGATGCCAAATTCAGATGATCCACTTTTGTCATCCTCACCGAAAGATTTTCCACAAAAAACCGcacttaataaatttgatttcagTGTATTCTGTCCGCCAAGCTCCAAAAAATCGAAAACATTTAGCACAGATTCTGAATTATCAAATCCCACCGCTAATTCAACAGACAGCAACAAATTTCCACTAACTATTCAAACGGTAGACCAAATATCAAAAAACAGTGAAGTGTTTCTTAGTCCGAATAGTTTATCATCGACTTCATCCACACTGGCGACGTCAACACCATCACCGAAAACATTAAGCGCCAGTGTTTTATTACGAAAACGCCCACACAACGAGATTAATCGAAATTATCAACAATATAAATCACGTCTTCGTAAATCAACAACAGCACAACATTATGTTCCGCCACCACTTTTAAATCCTGAACGAATGGCATCCGGGCTTTATGCGACCGTAATAAAGTTCGAGGAAAATGATATTATAGATTATGTGAATGACATCGATACGACAAGCACAATGTTTTTTAATcgtccaaaaataaatattggatCAGATTATCAAGCTGTTATCCCTCCGGCACTATCGTCAGCGGATGATCCCTTTGATTGCGATCTTTTGCCGCATGACAGTTTACAATGGGATCCATCTGTTATAAACGACAATAAACAATTGCAAAGATTTGTTGAGCTATCAAAATCATCTGCCGTTCCACTAGGATGTCATTCAGAAGAAATAGCATTAAAAACTCTGATGGAATCACAAGGCGAAGTTCATGTTGCGGTACTCAAACTATTGCAGGCGCCTCCATCAACAGCACTTCATAAACGTTGGTCGTCTAACGAAAtggaaacatttttaaaaggtCTTGAGAACTGTGGCAAAGACTTTTTCCGAATAGCAAAATTGATTCCCAGCAAAACTACTGGTGACTgtattcaattatattatttttggaaaaaaatCTGCGTGGACTATAAAACAACACATTTACGTTCCGAAATTGATCACGCATTATCATCATTAACAAATTTTGATGTTACAAATACTAGTCCAAGTGTTCAACCACAAACACAGTTACCTATTCAACATAATCATCATTCTGAACCAAGACCGCATGTCTGTGAAATGCCCGATTGTTCGGCaAGCTTTACATCAAAAGCAGCCTTGCATGGACACACGAGAATTCACTGTATTGGACGCAGTTTGAACCTCTCTAATCACAACAACAACCAtgctatattaataaataatagcaaaTCACCCACcagaattattatcaataataagaaCAATCATAATATTGCTATTAGtagtaatactaataataataataatataaataacaatagcaatagtagtagtaataataataataataattcattaagtGGACCCGATGGAAATGTAACATTTAAAGATGATTTTCCCTGCAAGGTGTGCGGCAAaattttcaacaaaattcgAAGTCGAAGCGCACATATGAAATCGCATCGTCCACAAGACGTTGAAGTATCATCTAGTTTAACATAA
Protein Sequence: MYCVQGGLRLPLTGLTPNRVLMCSASMGAEGSVTLQLREAVQAPDAGQPIDGALTIGYPDPEILADMLGSLQAAGTDDGTSLVRTENNESDLAGFLFAKTTSKCSSVQPTAASSSNNNNNNNNNSNNNNNNNIANAISTNSTVSEVITRTVVPSTTQTTTNTSANTNNNSSSSNNNNNNNTIINGNIINSVNNSKNNSNNNKNNNNGNNNIINGNNNNINSVNNNNISNNNNIKNSNNTTSSSNNNNASTVTAIKKPRTKTASPTRHGPQQCQVCNKIFGNASALAKHKLTHSDERKYVCSMCSKAFKRQDHLNGHMLTHRNKKPYECKAEGCGKSYCDARSLRRHTENHHSGLAMTPTTPNQSMSSSTGPPTGLSLSPATASGDASSPHGATCIQYNSNSGSNSGDGSSPKPLSPSSPAGAGNEGLTRQQLDLITQIMQQTKQANAGIAAAVAAAAAAAGNTNNGGTGGSGSSSSANNNTSQRHVQRPRTWNMQTQLQQTQTKISPNSDNQTAGTILTSLTTINGAKVEQKPVECNLCHRKFKNIPALNGHMRLHGGYFKKDSETKKCDKKETPGPPLQTASVGVRALIEEKIINKRSKDLKGAFVVPAPPLAARRLLDAENYISPKISTASNGTVQATIITSNSITAPKTNQHNGTIQLATSQNGSTNQKTLITSSTASIVSSIGTSTMIENSKDATLIELLKRGTKVAVKRACSDPGQVTYSSLSKSQSTTTTMVIPTTTTATISTLANTTSAPPLALSLSSGGENTPLALTISQSPSGSGDVYTLAYSTDSTTAFFTENDVYNVPDAAMLLQAVDSIQLLHDSSTSDHMEEIASLSDYTLNGSNGNLTENISQSFTPSRQLQAVLDSPLPESLAEFSALHSKDYVLYGCSSTDSPTTQSSASPLPSPLAYPTPPASHETVAQASPFLDDSHHFSDPGSLFDDKKSHCFFDDSSRSFFKDSKEHLSESQRILKLKNELFNETKSVMDDSNGFFKDEKNLFCVENPVSLLEENSVRIGGLNVNRRMQEFNHQNLSFLDEPQNFLEDARNTSSPLSAAFFSATMSSAEEVKEALEEVLPNENMHAEDAADNDIDLYYLPGLSLQSQMMPNSDDPLLSSSPKDFPQKTALNKFDFSVFCPPSSKKSKTFSTDSELSNPTANSTDSNKFPLTIQTVDQISKNSEVFLSPNSLSSTSSTLATSTPSPKTLSASVLLRKRPHNEINRNYQQYKSRLRKSTTAQHYVPPPLLNPERMASGLYATVIKFEENDIIDYVNDIDTTSTMFFNRPKINIGSDYQAVIPPALSSADDPFDCDLLPHDSLQWDPSVINDNKQLQRFVELSKSSAVPLGCHSEEIALKTLMESQGEVHVAVLKLLQAPPSTALHKRWSSNEMETFLKGLENCGKDFFRIAKLIPSKTTGDCIQLYYFWKKICVDYKTTHLRSEIDHALSSLTNFDVTNTSPSVQPQTQLPIQHNHHSEPRPHVCEMPDCSASFTSKAALHGHTRIHCIGRSLNLSNHNNNHAILINNSKSPTRIIINNKNNHNIAISSNTNNNNNINNNSNSSSNNNNNNSLSGPDGNVTFKDDFPCKVCGKIFNKIRSRSAHMKSHRPQDVEVSSSLT

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity: iTF_01277230; iTF_01276206; iTF_01276537;
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