Basic Information

Gene Symbol
TRERF1
Assembly
GCA_961205885.1
Location
OY540805.1:7535529-7545240[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 1.4e-09 9.6e-07 28.5 0.1 2 45 1396 1439 1395 1440 0.94

Sequence Information

Coding Sequence
ATGAGTACATTAAATATCgttCAAGGAGGTCTTCGTCTACCTTTAACCGGATTAACAACAAACAGAGTTCTAATGTGCAGTGCTTCAATGGGCGCCGAGGGTTCTGTTACCCTACAGCTACGTGAAGCTGTACAAGCACCTGATCCTGGCCAACCTATTGATGGTGCTCTAACTATAGGCTATCCAGATCCAGAAATATTAGCCGATATGCTGGGCAGTTTACAAGCAGCagGCAATGATGATGGGACATCATTAGTTAGAACAGAAAATAATGAGCCTGGTTTGACTGGTTTTTTACTTCCTAAAACAATATCAAAATGTAGACTTCCACACCCAATAGCAGcATCtagcagtaataataataataataataatatagttaATACAATAAGTACGAATAGTGTAAATAACAGTACTGTTAGTGAAGTTATAACCCGGAATGCTATACCATCAACAACAGTGACAACAACCAATACTTCtactaatactaataataataataatataataaatggaaataataataataatggaaatattataaatagtgttaataatagtaaaaatactataaataataataataataataataataaaaataataataataataataataataataataataataataataataacaataataattgtaataataatggaaataatataattaatggaaataataatataagtagtagcagtagtaataataactctaataatcataataaaaataataataataacaataccaCGAGTAGTAGTAACAATAATGCAAGTACAGTAACAGCGATTAAAAAACCACGAACTAAAACTGCCTCACCAACACGACATGGTCCCCAACAATGTCAGGtgtgcaataaaatatttggaaATGCGTCTGCCTTAGCAAAACATAAACTGACGCACAgtgatgaaagaaaatatgtaTGTAGTATGTGCTCAAAAGCTTTTAAACGACAGGATCACCTaaaTGGTCATATGCTAACACAtcgtaataaaaaaccatatgAGTGCAAGGCTGAAGGTTGTGGAAAGTCATACTGTGATGCACGTTCATTAAGACGGCATACAGAGAACCATCACAGTGGGCTGGCCATGACACCAACAACACCAAATCTGTCTATGTCATCATCAACAGGACCACCGACTGGGCTCAGCTTGTCACCAGCAACAGCTAGTGgTGATGCCAGCTCGCCGCATGGTGCGACGTGTATTCAATACAATAGTAACAGCGGTAGTAATAGTGGTGATGGTTCGAGTCCAAAACCATTATCACCTAGTTCACCAGCGGGAGCCGGTAATGAAGGACTAACACGACAGCAACTTGATTTAATCACACAAATAATGCAGCAAACGAAGCAAGCAAATGCTGGTATTGCCGCGGCAGTAGCTGCTGCAGCAGCAGCCGCTGGAAGTTCTAATAACGGTGGGAGTGGCGGTACAAGTTCATCCTCATCAGCTAATAATTCTTCACAACGTCATGCACAAAGGCCACGCACATGGAATATGCAGACTCAACTGcaacaaacacaaacaaagATAACGCCAAATTCTGATAATCAAACGTCTGGTACAATAATAACATCGCTGACAACTATAAATGGCGCAAAAGTTGAACAAAAACCTGTCGAATGTAATTTATGCCatcgaaaatttaaaaatatacccGCTTTGAACGGACACATGCGATTGCACGGTGGCTACTTTAAGAAAGATTCCGAAACgaaaaaatgtgataaaaaagaaacaccaGGTCCTCCATTGCAGACAGCCAGTGTTGGTGTTCGTGcattaattgaagaaaaaattattaataagcgTAGTAAGGATCTAAAGGGACCTTTTGTTGTTCCTGCACCACCATTGGCTGGGCGCCGATTATTAGAtgttgaaaattatatttctccTAAAATTTCATCTGCATCTGGTGGAGCTGTACAAGCTACTATTATTACCGCTAATGCACcaccaaaaaataatcataataatggcACAATACAACTGGCAACGTCACAAAATGGGAGCACAAACCAAAAAACTTTGATAACGTCATCGACAGCATCAATTGTGTCATCAATAGGAACAAATGCAATCATTGAAAATAGTAAAGACGCAACtcttattgaattattaaagcgTGGTACAAAAGTTGCTGTAAAACGAGCCTGTTCCGATCCTGGGCAGATAACATATAGTTCATTATCAAAATCCCAATCGACAACCACAACCATGGTAATTCCTACAACAACGACAGCTACCATATCATCATTAGCAAACACAACTTCGGCACCTCCATTGGCATTATCTCTATCAGGTTGTGGAGACAATACACCTCTAGCACTAACAATATCTCAATCACCGTCCGGATCAGGCGATGTTTACACTCTGGCATATTCTACAGATTCGACCACTGCATTTTTTACAGAGAACGATGTTTATAATGTTCCCGATGCAGCAATGCTTTTACAAGCAGTTGATTCTATTCAGCTTTTACACGACTCATCCACATCTGACCATATGGAAGAAATTGCTTCTTTAAGTGAATATACGTTAAATGGAAGTAATGGTAATTTATCTGAAAGTATGCCACAAAGTTTTACTCCATCACGACAACTTCAAGCAGTTCTTGACTCACCACTTCCAGAAAGTCTAGCTGAATTCAGTGCACTCCATTCCAAGGATTACGTTTTGTATGGCTGTTCGAGTACCGATTCTCCAACAACACAATCGTCAACATCGCCGTTACCATCACCGTTAGCATATCCAACTCCCCCAGCAAGCCATGAAGCTGTTGCACAGGCGTCACCATTCTTAGATGACTCACATCATTTTTCAGATCCAGGATCACTGTTCGATGATAAAAAATCTCATTGTTTTTTCGATGATAGTAGTCGATCTTTTTTCAAGGATTCTAAAGAGCAGTTGTCAGAATCTCAACGAAtactaaaattgaaaaatgaattatttaacgaAACAAAATCAGTTATGGATGATTCGAATGGATATttcaaagatgaaaaaaatttattttgtgtagatAATACTGTAAATTTGCTTGAAGAGAGTTCGGTAAGGATTGGAGGTCTAAACGTGAACCGTCGAATGCAAGAGTTCAATCATCAAAATTTGTCTTTTCTTGACGAGCCACAAAATTTTCTTGATGATGCTCGCAATACATCGTCACCTTTATCTGCTGCCTTTTTCTCAGCTACTATGTCAAGTGCTGAAGAGGTGAAAGAAGCACTTGAAGAAGTTCTTCCCAATGAGAATATACATGCTGAAGATGCAACCGATAATGACATCGATTTATATTATCTACCAGGCTTGTCACTTCAATCGCAAATGATGCCCAATTCTGACGATCCTCTTTTGTCATCCTCACCAAAAGATTTTCCTCAAAAAACTGCACTaaacaaatttgattttaGTGTATTCTGCCCGCCAAGCTCCAAGAAATCAAAAACATTTAGCACAGATTCTGAATTATCAAATCCCACCGTTAATTCGTCAGACGGTAACAAATTTCCACTCACTATACAAACGGTCGACCAAATATCAAAAGACAGTGAAGTTTTCCTCAGCCCAAACAGTTTATCATCGACTTCATCCACATTGGCAACGTCAACACCATCACCGAAAACATTAAGCGCCAGTGTTTTATTACGAAAACGCCCTCACAGCGAGATTAATCGAAATTATCAGCAATATAAATCACGTCTTCGTAAATCCACGTCAACACAACATTATATTCCACCACCGCTTTTAAATCCCGAACGCATGGCATCCGGACTCTTCGCAAccgtaataaaatttgaagaaAATGATATAATAGATTATGTCAATGACATAGAGTCATCCAATACCATGTTTTTTAGTcgtccaaaaataaatattggatCAGATTACCAAGCAGTTATCCCTCCGGCACTATCATCAGCGGATGATCCCTTTGATTGCGATCTTTTACCGCATGATAGTCTGCAATGGGATCCATCTGTTATAAACGACAATAAACAATTGCAAAGATTCGTGGAATTATCAAAATCGTCTGCAGTACCACTGGGGTGTCATTCCGAagaaattgcattaaaaacgCTGATGGAATCACAAGGCGAAATACATGTTGCAGTACTAAAACTTTTACAGGCACCTCCGTCGACAGCGCTTCATAAACGTTGGTCCTCCAATGAAatggaaacatttttaaaagggCTTGAAAGTTGTGGCAAAGACTTTTTCCGGATAGCAAAATTGATTCCTAGTAAAACAACGGGTGATTGcattcaattatattatttttggaaaaaaatatgTGTGGATTATAAAACAACTCATTTACGGCCCGAAATAGATCATGCATTAGCTAATTTTGATGTAACAAATACAAGTCCAAGTGTTCAACCACAAACGCAATTACCTATTCATCATAACCTTAATCATCATCCTGAACCAAGACCGCATGTCTGTGAAATGCCTGATTGTTCGGCAAGCTTTACATCAAAAGCAGCCTTGCATGGACACACGAGAATTCACTGTATTGGACGCAGTTTGAACCTCTCTAACCACACCAACAGCCATgctatattaataaatgatagcAAATCACCCaccagaattattattaacaataataataataatcaaaatattgttattagtaataataataacaataacagtaataatagtaatagtagtaataataattcattatgtGGACCTGATGGAAACATAGCATTTAAAGATGATTTTCCCTGCAAGGTGTGCGGCAAaattttcaacaaaattcgAAGTCGAAGCGCTCATATGAAATCACATCGTCCACAAGACGCTGAAGCATCAGTTAATTTGACataa
Protein Sequence
MSTLNIVQGGLRLPLTGLTTNRVLMCSASMGAEGSVTLQLREAVQAPDPGQPIDGALTIGYPDPEILADMLGSLQAAGNDDGTSLVRTENNEPGLTGFLLPKTISKCRLPHPIAASSSNNNNNNNIVNTISTNSVNNSTVSEVITRNAIPSTTVTTTNTSTNTNNNNNIINGNNNNNGNIINSVNNSKNTINNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNGNNIINGNNNISSSSSNNNSNNHNKNNNNNNTTSSSNNNASTVTAIKKPRTKTASPTRHGPQQCQVCNKIFGNASALAKHKLTHSDERKYVCSMCSKAFKRQDHLNGHMLTHRNKKPYECKAEGCGKSYCDARSLRRHTENHHSGLAMTPTTPNLSMSSSTGPPTGLSLSPATASGDASSPHGATCIQYNSNSGSNSGDGSSPKPLSPSSPAGAGNEGLTRQQLDLITQIMQQTKQANAGIAAAVAAAAAAAGSSNNGGSGGTSSSSSANNSSQRHAQRPRTWNMQTQLQQTQTKITPNSDNQTSGTIITSLTTINGAKVEQKPVECNLCHRKFKNIPALNGHMRLHGGYFKKDSETKKCDKKETPGPPLQTASVGVRALIEEKIINKRSKDLKGPFVVPAPPLAGRRLLDVENYISPKISSASGGAVQATIITANAPPKNNHNNGTIQLATSQNGSTNQKTLITSSTASIVSSIGTNAIIENSKDATLIELLKRGTKVAVKRACSDPGQITYSSLSKSQSTTTTMVIPTTTTATISSLANTTSAPPLALSLSGCGDNTPLALTISQSPSGSGDVYTLAYSTDSTTAFFTENDVYNVPDAAMLLQAVDSIQLLHDSSTSDHMEEIASLSEYTLNGSNGNLSESMPQSFTPSRQLQAVLDSPLPESLAEFSALHSKDYVLYGCSSTDSPTTQSSTSPLPSPLAYPTPPASHEAVAQASPFLDDSHHFSDPGSLFDDKKSHCFFDDSSRSFFKDSKEQLSESQRILKLKNELFNETKSVMDDSNGYFKDEKNLFCVDNTVNLLEESSVRIGGLNVNRRMQEFNHQNLSFLDEPQNFLDDARNTSSPLSAAFFSATMSSAEEVKEALEEVLPNENIHAEDATDNDIDLYYLPGLSLQSQMMPNSDDPLLSSSPKDFPQKTALNKFDFSVFCPPSSKKSKTFSTDSELSNPTVNSSDGNKFPLTIQTVDQISKDSEVFLSPNSLSSTSSTLATSTPSPKTLSASVLLRKRPHSEINRNYQQYKSRLRKSTSTQHYIPPPLLNPERMASGLFATVIKFEENDIIDYVNDIESSNTMFFSRPKINIGSDYQAVIPPALSSADDPFDCDLLPHDSLQWDPSVINDNKQLQRFVELSKSSAVPLGCHSEEIALKTLMESQGEIHVAVLKLLQAPPSTALHKRWSSNEMETFLKGLESCGKDFFRIAKLIPSKTTGDCIQLYYFWKKICVDYKTTHLRPEIDHALANFDVTNTSPSVQPQTQLPIHHNLNHHPEPRPHVCEMPDCSASFTSKAALHGHTRIHCIGRSLNLSNHTNSHAILINDSKSPTRIIINNNNNNQNIVISNNNNNNSNNSNSSNNNSLCGPDGNIAFKDDFPCKVCGKIFNKIRSRSAHMKSHRPQDAEASVNLT

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_01276899;
90% Identity
iTF_01276537;
80% Identity
iTF_01276537;