Pter008561.1


Basic Information
Transcription Factor Domain
Sequence Information
Similer Transcription Factors

Basic Information

Insect
Protophormia terraenovae
Gene Symbol
-
Assembly
GCA_951394005.1
Location
OX596074.1:10097220-10130378[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
THAP
Domain
THAP domain
PFAM
PF05485
TF Group
Zinc-Coordinating Group
Description
The THAP domain is a putative DNA-binding domain (DBD) and probably also binds a zinc ion. It features the conserved C2CH architecture (consensus sequence: Cys - 2-4 residues - Cys - 35-50 residues - Cys - 2 residues - His). Other universal features include the location of the domain at the N-termini of proteins, its size of about 90 residues, a C-terminal AVPTIF box and several other conserved residues. Orthologues of the human THAP domain have been identified in other vertebrates and probably worms and flies, but not in other eukaryotes or any prokaryotes [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 33 2e-15 4.1e-12 47.8 0.6 1 86 856 928 856 929 0.83
2 33 4.3e-15 8.8e-12 46.7 4.7 1 87 956 1025 956 1025 0.80
3 33 2.4e-15 5.1e-12 47.5 0.3 1 87 1046 1118 1046 1118 0.83
4 33 3.6e-14 7.4e-11 43.8 3.1 1 86 1199 1267 1199 1268 0.78
5 33 4.4e-15 9.1e-12 46.7 5.4 1 87 1292 1364 1292 1364 0.81
6 33 3.6e-12 7.4e-09 37.3 0.9 1 87 1399 1467 1399 1467 0.80
7 33 3.7e-11 7.7e-08 34.1 3.1 1 86 1508 1577 1508 1580 0.74
8 33 2.8e-14 5.7e-11 44.1 0.1 1 87 1605 1675 1605 1675 0.80
9 33 5e-15 1e-11 46.5 1.5 1 86 1697 1766 1697 1767 0.81
10 33 4.6e-13 9.6e-10 40.2 2.7 1 87 1795 1867 1795 1867 0.86
11 33 2.1e-06 0.0043 18.9 0.6 1 80 1935 2009 1935 2011 0.75
12 33 1.9e-11 4e-08 35.0 0.6 1 87 2032 2104 2032 2104 0.79
13 33 2.8e-14 5.8e-11 44.1 2.6 1 87 2136 2207 2136 2207 0.80
14 33 1.3e-14 2.7e-11 45.2 5.2 1 87 2252 2325 2252 2325 0.84
15 33 2.4e-13 5.1e-10 41.1 0.6 1 87 2347 2415 2347 2415 0.80
16 33 3.7e-15 7.6e-12 46.9 0.2 1 87 2708 2777 2708 2777 0.80
17 33 1.7e-14 3.5e-11 44.8 1.8 1 86 2835 2917 2835 2918 0.81
18 33 1.3e-10 2.7e-07 32.4 1.8 1 87 2948 3021 2948 3021 0.79
19 33 1.1e-12 2.2e-09 39.0 0.9 1 87 3049 3118 3049 3118 0.82
20 33 1.1e-13 2.4e-10 42.1 1.3 1 87 3138 3208 3138 3208 0.81
21 33 1.7e-13 3.5e-10 41.6 2.7 1 87 3231 3302 3231 3302 0.80
22 33 2.4e-05 0.05 15.5 0.3 1 59 3318 3365 3318 3392 0.77
23 33 1.2e-11 2.6e-08 35.6 4.6 1 87 3406 3476 3406 3476 0.81
24 33 6e-12 1.2e-08 36.6 3.2 1 86 3501 3572 3501 3573 0.76
25 33 3.3e-14 6.8e-11 43.9 2.9 1 86 3593 3665 3593 3666 0.78
26 33 3.1e-11 6.3e-08 34.4 8.6 1 86 3686 3755 3686 3756 0.79
27 33 4.8e-11 1e-07 33.7 0.3 1 86 4253 4329 4253 4330 0.80
28 33 9.6e-07 0.002 19.9 2.4 1 86 4350 4419 4350 4420 0.72
29 33 2e-13 4.1e-10 41.4 3.8 1 86 4439 4509 4439 4510 0.80
30 33 4.1e-12 8.6e-09 37.1 1.6 1 87 4612 4686 4612 4686 0.83
31 33 1.1e-14 2.2e-11 45.4 0.5 1 85 4709 4780 4709 4782 0.82
32 33 6.5e-13 1.4e-09 39.7 5.0 1 86 4955 5027 4955 5028 0.79
33 33 1.1e-12 2.3e-09 39.0 1.6 1 86 5053 5122 5053 5123 0.80

Sequence Information

Coding Sequence
atgtCACAAAATAATCAACGTAAACATTATCACATACATGCTCCCTATCAACACCCCCAACAGCAGCAGCATCAACAACAGCAGgctcaacatcatcatcatcacttAACGTCCTCATCGCAGCAGCTCCAtcatcagcaacaacaacaacagcagcaacaccAGCAATGGTACTCACAGCAGCAACATTATCAACATGGTCTTCATTTAAGAGAATCCCGCCATATGCAACATGCTCAACATGCTCATCATGCTGCTGCTCATCACCATCAGACGCAACACCAGCAACCACATCATAATCATGCTATGTCGGCACCACATATGTTTACAAGTGGTTATGTGGGTATGACAGCATCCTCCTCTGGTGGTGCAGGAGGAGGTGTGGGGGGTGTAAGTAATCCAGGTAGTGGGGTGGCACACTCGGCCACAGCAACAATGGGTTCAACACACAATATACCGGCTTCTTCATCATCATCCTCGTCGTCTTCGGTTCATCATCATTATTCTGCTACTGCTTTGGCAGCTTCGAGTGCAAATAATACAGCAAGTGCTGCTACTGGTGGTGCTGGTGGTAGTACAGCCTATGCTGCTGGTCGTAATCGTATGTTTGACCTTGAAATGTTAACaccacaacaacagcaacaacattcACATCAAAGTACAGCATCAGCTACACATGCACACTCTATGCTACCGACTGCTAGTACAAGTGGACGTTCTGGTTTTGATGCCTACTCTCATAGCTCTTTGTATGCTCAACAAAATCAGCGACATCATACAACTCCCAGCTCTTCGCATCATCATCATTTGGCAGCTACACACCATTCCTTGCATTCTCATCACTCGCAACATCATCCCCAATCAGCAGCAGTAGCGCCACCACCCCCACATCATCATCCACACCAACAACATCCGCAAACTTCGTCtcttcatcatcatcagcagcaGCATCCCCATCACcaccaccaacaacaacaacattattATCATCATGCTCAACAAACTTCCCTCCACCGACCACATACTCAAGTTATGGGTCCTATGTTGCAACATATTAAATCTGAACCAGTAGAGCAAATAACCGTAACACCATCGATACAAACCGAGGAAGTTATCATAAAATccGAACCTGTGGATGATAGTGGTTATCATAAAAGTGCGCCACAAATTGAAAACAATTCTTTTCACATGGAAGAAAAACGTAAACAACATGAGTTCcatcaacaacagcaacaacaacaattacaacaaaaacaacagcagGAGCAACAACGTgttcaacaacaacaattacatGAACAGCGACAACAACAACTACTTCAACaccagcagcagcaacaacagatACAAATAAAAGAAGAACCACATGATTATCCTGAACATCAACATCATCATGAGCATCAACAAAGTGAACATACTCATAATGAAGATATTTCCCAACAAACACAAAAACGTACAAATTCCGAGAATTCTACTACGATACAACCAGCAGTAGTAGTAGAGCAAAAAACTGaaaagcagcaacaacaacaaccagaacaacaacaacagcagcagcaaatATCCTTGACAAATATAAAAACAGAGGCAAagCCCCTTAACTTTCCTCGTCGCAAATTACAAACAGAACGTTCCTCTACGCTGCCCATATGCCAACGATGTAAACAAGTTTTTTTGAAACGTCAAAACTATACACAACATGTTGCTCTATCCAGTTGTAATATTGTTGAATACGACTTTAAGTGTTCCGTATGTCCCATGTCCTTTATGTCCAATGAGGAATTACAAACGCACGAACAACTACATCGTTCACATCGATATTTTTGTCAGAAATATTGTGGCAAATTCTATGAAACCATCGATGAGTGTGAACAACATGAATATGGACAGCATGAATATGAAATGTATAAATGTAATATTTGTTGTATAAGTGTAACCCAACGTGATCAATTATTTACACATCTACATGAACATAAATATCAGCCACGTTTTGATTGTTGTATATGTCGTTTATGTTTTCAAACTTCTTTGGAATTGCATGATCATTATTTGGCCAATGAAGatttttgtggaaaattttatgataaagaagCCTTTAAAAAACCAATTACCTCCTTAACAACAACACCTTATTTGGGTAAACCGGAAAGTTCGAATTTGGAAATTTCTCATACTTTCTCGTTAAAAGATATACCTCCTGCTAATAGTCAACATTTGGAACCTTTATATACAAAACCCAACACCTCAAAAACCTCCATGGAGCCACCTAATACACCAACCAACACACCCTTATCTTCGGCATTTAGCTTAGAACCTCATGAGTTTACCTTGGAACCACAGGTAGAGgtaaaaactgaaattaaagTAGAACCTGATTTTTATCCACCCATGGATCAAACAGATTATTCGAATTATGATCAAGATTATAATGCAACAGATTACAATTCGGGCTCCAATCAAAGTTTAGCTTTTTTACAAGATTATCAAGATAATGCTTCCAGTTCGACAAATTCATCATTTTCATTTAGCAATAATAACGATGCCATACAAGATGAAGATGCTATGTGTTGTGTACCCAAATGTGGTGTTAGCAAATACACTTCACCTTCCCTACAATTCTTTGGCTTCCCGCGTGATGAAAAGTATTTAGCCCAATGgctacataatttaaaaatgatttatgaTCCTAATGTTAATTATTCAGCGTATCGTATTTGTAGTTTACATTTTCCTAAACGTTGTATAGCTAAGTATTCTTTAAGTTATTGGGCTGTGCCCACTTTTAATTTGGGCCACGATGATGTGGGTAATTTATATCAGAATAGAGAAAGTTCAGGGGGGTTTCCAGCTGGTGAAATGGCTAAATGTAGTATGCCTGGCTGTCCATCACAGCGAGGTGAAACtaatgtaaaatttcatgtatTTCCTAGAGATTTAAAGACATTAATAAAATGGTGCCAGAATTCTCGTTTGCCAGTACATAGTAAAGATAATAGATTTTTCTGTTCTAGACATTTCGAAGAGAAATGTTTTGGTAAATTTAGACTAAAACCCTGGGCCATACCTACGCTTAACTTGGGTACTGTTTATGGTAAAATACACGATAATCCTAATATCTATCAAGAggagaaaaaatgttttttaccTTTTTGTCGACGTAGTCGTTCATATGATTGTAATTTATCTTTATATAGATTTCCAAGAGATGAAACTTTATTAAGACGTTGGTGTTATAATTTAAGATTAGATCCTAATATGTATAGAGGTAAGAAccataaaatttgttcttcACATTTCATTAAAGAAGCCTTGGGCTTAAGAAAACTAAATCCAGGGGCCGTGCCCACTTTAAATTTAGGTCATAATGATAGAtttaatatatatgaaaatgaATTATATACACCACCGCCACCACCTCCTCCACCTCAGCCTTCCACATCATCTAAGGCTCATAAGTTTGAAAGAATGTTTAAACAAGAAATGGGAGGTACGGGGTCTCATATATACGACAATGTTTTTATGAATTCCATGGTGCAAAAATACTCTTCCTCGTCATCTTCTAACAGTGGCAATAATTTAGATTTGGGTGATGTTTGTTTGGTGCCCTCGTGCAAGAGAACCCGCCACTCCGCTGACATAACTTTGCACACGGTACCCAAACGTCCCGAGCAGTTAAAGAAATGGTGCCATAATTTGAAAATGGATTTAGAAAAGCTGCATAAaagtgttagaatttgtagtgCCCATTTCGAAAAGTATTGCATAGGTGGTTGTATGCGTCCCTTTGCCGTACCCACTTTGGAACTGGGTCATGATGATCCCAATATCTATCGTAATCCTGATGTTATTAAGAAACTGAATATAAGAGAAACTTGTTGCATACAATCTTGTAAAAGAAATCGCGATCGTGATCATGCCAATCTGCATAGATTCCCTACCCATCCAGAATTGTTGCAAAAATGGTGTGAGAATCTGCAAAAACCCATACCCGATGGTACTAAACTTTTCAATGATGCTGTTTGTGAAATACACTTTGAGGACAGATGTTTGCGCAATAAACGTTTAGAAAAATGGGCCATACCCACTTTAAATTTGGGTTGGGATGAGGCCCCTCACAGTTTGCCTTCGGAAGaggaaataaatgaaaattggGTTAAACCTTTTGCTCCCAATAATGGTGATGAACAAGGTGAATGTTGTGTGGCCTCCTGTAAACGTAATCCACAAATTGATGATGTTAAATTGTATAGACCACCCGAAGATGCTGAGCAGTTAGTTAAATGGGCCCATAATCTGCAAGTGGATGTTACTGAATTACcaaatcttaaaatttgtaATCTACACTTCGAGCAGCATTGTATAGGCAAAAGGTTGCTGAATTGGGCCATGCCTACTCTAAATTTGGGCGCTAAAGTGGAACATCTATTCGAAAATCCTCCTCCCATGCCGACtgtttacaaaaagaaaattaaacctGAAAGACTTTTATCTAATCAAGAAGCCATTAAATGGTCACCCAGATGTTGTCTGCCTCATTGTCGTAAAATGCGTTCTTTGGACAAGGTGCATCTGTTTCGTTTTCCCTATAATAATCGCCAAACTTTGGCCAAATGGTGTCACAATTTACAGCTACCTTTAGTGGGTTCCTCACATCGTCGTATATGTTCTTCACACTTTGAATCTTCGGTCTTAACTAAACGTTGTCCCATGTCTTTGGCAGTACCCACCTTGGATTTGAATTCTCCTCCGGGCTATAAAATCTATCAGAATCCCGCTCgcttaaaacaaataaaaccaGGTGCTCAAAGGCAATGTATTATAGAATCTTGCCGTAAAACTAAACTAGATGGTGTAACTCTCTACCGCTTCCCTAATAATCgttctattttatataaatggcgtcataatattaaaaattggcCTAAAGGTAAATTAAGCTCACAACTGAGAATTTGCGGCGAACACTTTGAGCCACATTCGGTGGGTGAGAAAAAACTATC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Protein Sequence
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