Preg026592.1


Basic Information
Transcription Factor Domain
Sequence Information
Similer Transcription Factors

Basic Information

Insect
Phormia regina
Gene Symbol
-
Assembly
GCA_001735585.1
Location
MINJ01004060.1:346-17403[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
THAP
Domain
THAP domain
PFAM
PF05485
TF Group
Zinc-Coordinating Group
Description
The THAP domain is a putative DNA-binding domain (DBD) and probably also binds a zinc ion. It features the conserved C2CH architecture (consensus sequence: Cys - 2-4 residues - Cys - 35-50 residues - Cys - 2 residues - His). Other universal features include the location of the domain at the N-termini of proteins, its size of about 90 residues, a C-terminal AVPTIF box and several other conserved residues. Orthologues of the human THAP domain have been identified in other vertebrates and probably worms and flies, but not in other eukaryotes or any prokaryotes [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 34 1e-15 2.6e-12 48.3 0.6 1 86 387 459 387 460 0.84
2 34 3e-15 7.5e-12 46.9 4.7 1 87 487 556 487 556 0.80
3 34 1.7e-15 4.3e-12 47.6 0.3 1 87 577 649 577 649 0.83
4 34 3.4e-14 8.2e-11 43.5 3.1 1 86 730 798 730 799 0.78
5 34 3.1e-15 7.7e-12 46.8 5.4 1 87 823 895 823 895 0.81
6 34 2.5e-12 6.2e-09 37.5 0.9 1 87 930 998 930 998 0.80
7 34 1.7e-11 4.2e-08 34.8 2.6 1 86 1039 1108 1039 1114 0.74
8 34 2e-14 4.8e-11 44.3 0.1 1 87 1136 1206 1136 1206 0.80
9 34 1e-13 2.6e-10 41.9 2.9 1 86 1228 1297 1228 1298 0.81
10 34 3.3e-13 8.1e-10 40.3 2.7 1 87 1326 1398 1326 1398 0.86
11 34 2.1e-06 0.0051 18.5 0.4 1 79 1466 1539 1466 1542 0.73
12 34 1.4e-11 3.3e-08 35.2 0.6 1 87 1563 1635 1563 1635 0.79
13 34 2e-14 4.9e-11 44.2 2.6 1 87 1667 1738 1667 1738 0.80
14 34 1.2e-14 2.9e-11 45.0 5.2 1 87 1783 1856 1783 1856 0.84
15 34 3e-13 7.3e-10 40.5 0.9 1 87 1878 1946 1878 1946 0.80
16 34 2.6e-15 6.5e-12 47.1 0.2 1 87 2246 2315 2246 2315 0.80
17 34 5.3e-14 1.3e-10 42.9 1.9 1 86 2373 2455 2373 2456 0.79
18 34 1.5e-10 3.7e-07 31.8 1.3 1 87 2488 2561 2488 2561 0.79
19 34 1.3e-12 3.1e-09 38.5 1.3 1 87 2589 2658 2589 2658 0.82
20 34 3.1e-14 7.7e-11 43.6 1.3 1 87 2678 2748 2678 2748 0.81
21 34 1.6e-13 3.9e-10 41.4 1.5 1 87 2771 2842 2771 2842 0.80
22 34 9.4e-06 0.023 16.4 0.3 1 59 2858 2905 2858 2932 0.76
23 34 4.4e-12 1.1e-08 36.7 4.2 1 87 2946 3016 2946 3016 0.81
24 34 4.4e-12 1.1e-08 36.7 3.2 1 86 3041 3112 3041 3113 0.77
25 34 4.2e-14 1e-10 43.2 3.7 1 86 3133 3205 3133 3206 0.78
26 34 1.2e-09 3.1e-06 28.9 7.9 1 86 3226 3295 3226 3296 0.78
27 34 4e-12 9.9e-09 36.8 0.9 1 86 3734 3810 3734 3811 0.80
28 34 5.2e-08 0.00013 23.7 1.9 1 86 3830 3899 3830 3900 0.76
29 34 5.4e-14 1.3e-10 42.9 4.0 1 86 3919 3989 3919 3990 0.80
30 34 0.012 31 6.4 0.2 1 58 4038 4098 4038 4122 0.76
31 34 5.2e-12 1.3e-08 36.5 1.5 1 87 4143 4217 4143 4217 0.83
32 34 2e-15 4.8e-12 47.5 3.7 1 85 4240 4311 4240 4313 0.84
33 34 4.6e-13 1.1e-09 39.9 5.0 1 87 4486 4559 4486 4559 0.80
34 34 2.7e-13 6.7e-10 40.6 0.8 1 86 4584 4653 4584 4654 0.80

Sequence Information

Coding Sequence
atgagTGAACATACTCATAATGACGATATTTCCCAACAAACACAAAAACGTACAAATTCCGAGAATTCTACTACGATACAACCGACTGTAGTAGTAGAACAAAAAActgaacagcaacaacaaccagaacaacaacaacagcagcagcaaatatccttgacaaatataaaaacagaGGCAAagCCCCTTAACTTTCCTCGTCGCAAATTACAAACAGAACGTTCCTCAACGCTGCCCATATGCCAACGatgtaaacaagtttttttgaaACGTCAAAACTATACACAACATGTTGCTCTCTCCAGTTGTAATATTGTCGAATACGACTTTAAGTGTTCCGTATGCCCAATGTCCTTTATGTCCAATGAGGAATTACAAACGCACGAACAATTACATCGTTCACATCGATATTTTTGTCAGAAATATTGCGGCAAATTCTATGAAACCATCGATGAGTGTGAACAACATGAATATGGACAGCATGAATATgatatgtataaatgtaatATTTGTTGTATAAGTGTAACCCAACGTGATCAATTATTTACACATCTCCACGAACATAAATATCAGCCACGTTTTGATTGTTGTATATGTCGTTTATGTTTTCAAACTTCTTTGGAACTGCATGATCATTATATAGCCAATGAagatttttgtggaaaattttatgataaagaagCCTTTAAAAAACCAATTACCTCCTTGACAACAACAACACCCTATTTGGGTAAACCGGAAAGTTCGAATTTGGAAATTTCTCATACTTTCTCGTTAAAAGATATACCTCCGGCTAATAGTCAACATTTGGAACCTTTATATACAAAACCCAACACCTCAAAAACCTCCATGGAGCCACCTAATACACCAACCACCACACCTTTATCATCGGCATTCAGCTTAGAAGCTCATGAGTTTCCCTTGGAACCCCAGGTAGAGgtaaaaactgaaattaaagtAGAACCTGATTTTTATCCACCCATGGATCAAACAGATTATTCAAATTATGATCAAGATTATAATGCAACAGATTACAATTCGGGCTCTAATCAAAGTTTAGCTTTTTTACAAGATTATCAAGATAATGCTTCCAGTTCGACAAATTCATCATTTTCATTTagcaataataatgatgccaTACAAGATGAAGATGCTATGTGCTGTGTACCCAAATGTGGTGTTAGCAAATACTCCTCACCTTCTTTGCAATTCTTTGGTTTTCCGCGTGATGAAAAGTATTTAGCCCAATGgctacataatttaaaaatgatttatgatCCTAACGTTAATTATTCAGCGTATCGTATTTGTAGTTTACATTTTCCTAAACGTTGTATAGCTAAGTATTCATTAAGTTATTGGGCTGTGCCCACTTTTAATTTGGGACACGATGATGTGGGTAATTTATACCAGAATAGAGAAAGTTCAGGGGGGTTTCCAGCTGGTGAAATGGCTAAATGTAGTATGCCTGGCTGCCCATCACAGCGGGGTGAAactaatgtaaaatttcatgtatttcCTAGAGATTTAAAGACCTTGATCAAATGGTGCCAGAATTCTCGTTTGCCGGTACATAGTAAAGATAATAGATTCTTCTGTTCCAGACATTTTGAAGAGAAATGTTTTGGTAAATTTAGATTAAAACCCTGGGCTATTCCAACGCTTAACTTGGGTACTGTTTATGGTAAAATACACGACAATCCTAATATCTATCAAGaggagaaaaaatgttttttacctTTTTGTCGACGTAGTCGTTCATATGATTGTAATTTATCTTTGTATAGATTTCCCAGAGATGAAACTTTATTAAGAcgttggtgttataatttaagaCTAGATCCTAATATGTATAGaggtaaaaatcataaaatttgttcttcGCATTTCATTAAGGAAGCCTTGGGCTTGAGAAAACTTAATCCAGGGGCTGTGCCCACTTTAAATTTAGGTCATAATGAtagatttaatatatatgaaaatgaatTATATACCCCACCGCCGCCACCTCCTCCACCTCAGCCTTCAACATCGTCAAAGGCTCAGAAGTTTGAAAGAATGTTTAAACAAGAAATGGGAGGTACGGGGTCTCATATATACGACAATGTTTTTATGAATTCTATGGCGCAAAAATACTCTTCCTCGTCATCATCTAACAGTGGTAATAATTTAGATTTAGGTGATGTTTGTTTGGTGCCGACGTGCAAGAGAACACGTCATTCTGCAGACATAACTTTGCACACGGTACCAAAACGTCCCGAACAGTTAAAGAAATGgtgtcataatttaaaaatggatCTAGAAAAACTGCACAAAAGTGTTAGAATTTGCAGTGCCCATTTCGAAAAGTATTGCATAGGTGGCTGTATGCGTCCCTTTGCCGTACCCACTTTGGAACTGGGTCATGATGATCCCAATATCTATCGAAATCCTGATGTTATTAAGAAACTCAATATAAGAGAAACTTGTTGCATACAATCTTGTAAAAGAAATCGCGATCGTGATCATGCCAATCTGCATAGATTCCCTACCCATCCAGAATTGTTGCAAAAATGGtgtgaaaatttgcaaaaacccATACCTGATGGTACTAAACTTTTCAATGATGCTGTCTGTGAAATACACTTCGAAGACAGATGTTTGCGCAATAAACGTTTAGAGAAATGGGCCATACCCACTTTAAATTTGGGTTGGGATGATGCCCCTCACAGTTTGCCTTCCGAAgaggaaataaatgaaaattgggTTAAACCTTTTGCTCCAAATAATGGTGATGAACAAGGTGAATGTTGCGTAGCCTCTTGCAAACGTAACCCTCAAATTGATGATGTGAAATTATATAGACCTCCCGAAGATGCTGAGCAGTTAGTTAAATGGGCCCATAACCTACAAGTAGATGTTACCGAATTACcaaatcttaaaatttgtaatctACACTTCGAGCAGCATTGTATAGGCAAAAGATTGTTGAATTGGGCCATGCCAACATTAAATTTGGGTGCTAAAGTAGAACATCTATTTGAAAATCCTCCTCCCATGCCGACtgtttacaaaaagaaaattaaacctGAAAGAGTTTTATCCAATCAAGAAGCCATTAAATGGTCACCCAGATGTTGTCTGCCTCATTGTCGTAAAATGCGTTCTTTGGACAAAGTACATCTATTCCGTTTTCCTTACAACAATCGGCAAACTTTGGCCAAATGGTGTCACAATTTACAACTACCTTTAGTGGGTTCTTCACATCGCCGTATATGTTCCTCGCACTTTGAATCTTCGGTTTTAACTAAACGTTGTCCCATGTCTTTGGCAGTACCCACTTTGGATCTGAATGCTCCTCCGGGCTATAAAATCTATCAGAATCCCGCTcgcttaaaacaaataaaaccagGTGCTCAAAGACAATGTATAATAGAATCTTGCCGTAAGACAAAACTAGATGGTGTAACCCTCTACCGTTTCCCTAATAATCGTTCTATTTTATACAAATGGcgtcataatattaaaaattggcCTAAAGGTAAATTGAGCTCTCAACTGAGAATTTGTGGCGAACACTTTGAGCCACATTCGGTAGGTGAGAAAAAACTATCACCAGGTGCCATACCTACCTTAAATCTGGGCCATGACTCCAAAGATTTGTATCCCAATGAAACAAGATCATTTTTCGATTTAGAAAAATGTGTAGTAAATGGCTGTGATTCACGCAAAGAAATGGAGGATGTAAGACTTTTCCGTTTCCCCCGTGATGATGAGGAATTGCTAAAGAAATGGTGCCataatttacaaatgaataccaaCGATTGTGTGGGaattaaaatatgttgtaaACATTTTGAACCGGAATGTTTAGGTCCCAGGCAGCTATACAAATGGTCTATACCCACTTTGAAATTAGGACACAAAGAAGATGAATTAGTGGATATAATACCTAATCCACCACCCGAACAAAGGACTGGAGAATTCCTATTCAAATGTTGTGTACCCACTTGTGGCAAAACACGTAAATATGATGATGCCCAAATGAATAGTTTCCCCAAACATTTGAAACTATTCCGTAAATGGAAACATAATCTAAAAttagattttcttaatttcaaagaaagagaaaaatataagatatgTAATGATCATTTCGAACCGATTTGCGTGGGCAAGACCCGTTTAAATTTTGGCGCCTTACCTACTTTGAATTTGGGACATGATGAAGTTGATGATTTGTACCAAATTAATCCCGATAGAATAAGACCAAATTTGTTTATCAAACAAAAAGATGTGGAAAGACTGGAGCGTAAAAGAATCTTACGTGAGGAGAATCAGGAACAATATGAATGTGAAGATCAAGAGGATCAGGATAATACAGATCCCTTAAGTTTAGAGCCTACAGATGTTAAATGTTGTGTAGTGGAGTGTACGGCTCCTAAGTCCATTATGAGAGAACCCTATGATTTGCCCGAGACAatagaatttaaacaattatggcTTAAGGAATTAGCTAACCAGGAACAAGAAGAACTGtctgtagaaaataaaatctgtgGTTTACATTTCCAAATGATTTTTAACAAACTAAAAGACAAAATGCAGGAATTGAGTGAAAATAATGAGGAATTgaaaaccgattttaataaattgttatacaaTTATCAAAAATCCCTTATCTCTCTGGTAGTCAATAGTTATCAGTGTCGTGTAGCTCAATGttcttcaaatttattaaattcttccATTAGACTGTTTTTCTTTCCATATggcaaaaatttagttaataaatggTCTCACAACACCGGTATTATACCCGATGAACATCGCCGTTATATGAATAAGGTATGTGCTTTACATTTTGAATCATATTGTATAACCGAAAATCAAAGATTAAGATCTTGGGCTATACCTACGCTTAATTTACCCTCGTCGAGCGaggaaaataaaactttgtataaaaatccAGATCTtactaaaattgataaaagaATGTTGGGTccccaaattttaaaatg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Protein Sequence
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