Basic Information

Insect: Plagodis dolabraria
Gene Symbol: -
Assembly: GCA_963854805.1
Location: OY978440.1:18103161-18104318[-]

Transcription Factor Domain

TF Family: PC4
Domain: PC4 domain
PFAM: PF02229
TF Group: Unclassified Structure
Description: This domain is found at the C-terminal end of Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15 from humans, YdbC from Lactococcus lactis, and other PC4 family members. p15 has a bipartite structure composed of an N-terminal regulatory domain and a carboxy-terminal cryptic DNA-binding domain [1-4]. Activity is controlled by protein kinases that target the regulatory domain.
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 32 0.012 3.9e+02 2.4 0.0 8 26 10 28 4 34 0.85

2 32 0.012 3.8e+02 2.4 0.0 8 26 21 39 14 45 0.84

3 32 0.013 4.2e+02 2.3 0.0 8 26 32 50 28 57 0.85

4 32 0.013 4.2e+02 2.3 0.0 8 26 43 61 37 66 0.85

5 32 0.012 3.9e+02 2.4 0.0 8 26 54 72 48 78 0.85

6 32 0.014 4.4e+02 2.2 0.0 8 26 65 83 60 88 0.86

7 32 0.014 4.5e+02 2.2 0.0 8 26 76 94 72 99 0.86

8 32 0.012 3.9e+02 2.4 0.0 8 26 87 105 81 111 0.85

9 32 0.013 4.3e+02 2.3 0.0 8 26 98 116 94 122 0.85

10 32 0.013 4.1e+02 2.3 0.0 8 26 109 127 104 133 0.85

11 32 0.014 4.4e+02 2.2 0.0 8 26 120 138 115 143 0.86

12 32 0.012 3.9e+02 2.4 0.0 8 26 131 149 125 155 0.85

13 32 0.012 3.8e+02 2.4 0.0 8 26 142 160 135 166 0.84

14 32 0.0061 1.9e+02 3.4 0.0 8 23 164 179 149 188 0.59

15 32 0.012 3.9e+02 2.4 0.0 8 26 175 193 169 199 0.85

16 32 0.014 4.5e+02 2.2 0.0 8 26 186 204 182 209 0.86

17 32 0.013 4.1e+02 2.3 0.0 8 26 197 215 192 221 0.85

18 32 0.013 4.1e+02 2.3 0.0 8 26 208 226 203 232 0.85

19 32 0.014 4.3e+02 2.3 0.0 8 25 219 236 212 241 0.84

20 32 0.013 4.2e+02 2.3 0.0 8 26 230 248 224 253 0.85

21 32 0.015 4.8e+02 2.1 0.0 8 26 241 259 237 263 0.86

22 32 0.012 3.9e+02 2.4 0.0 8 26 252 270 246 276 0.85

23 32 0.012 3.8e+02 2.4 0.0 8 26 263 281 256 287 0.84

24 32 0.014 4.4e+02 2.2 0.0 8 26 274 292 268 296 0.86

25 32 0.011 3.5e+02 2.6 0.0 8 26 285 303 277 309 0.79

26 32 0.014 4.4e+02 2.2 0.0 8 26 296 314 290 318 0.86

27 32 0.015 4.8e+02 2.1 0.0 8 26 307 325 303 329 0.86

28 32 0.013 4.1e+02 2.3 0.0 8 26 318 336 313 342 0.85

29 32 0.014 4.4e+02 2.2 0.0 8 26 329 347 323 351 0.86

30 32 0.015 4.8e+02 2.1 0.0 8 26 340 358 336 362 0.86

31 32 0.013 4.2e+02 2.3 0.0 8 26 351 369 347 375 0.85

32 32 0.015 4.8e+02 2.1 0.0 8 26 362 380 358 384 0.86

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	32	0.012	3.9e+02	2.4	8	26	10	28	4	34	0.85
2	32	0.012	3.8e+02	2.4	8	26	21	39	14	45	0.84
3	32	0.013	4.2e+02	2.3	8	26	32	50	28	57	0.85
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Sequence Information

Coding Sequence: ATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCAGGTCATGGTCATATCtag
Protein Sequence: MVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGQVMVRSWSGHGHI

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity: -
90% Identity: -
80% Identity: -