Osur011107.1
Basic Information
- Insect
- Oryzaephilus surinamensis
- Gene Symbol
- Kdm5
- Assembly
- GCA_004796505.1
- Location
- SSSI01009954.1:14871-22602[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- ARID
- Domain
- ARID domain
- PFAM
- PF01388
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 3.1e-25 8.2e-22 77.5 0.0 2 89 115 198 114 198 0.95 2 2 0.095 2.5e+02 2.2 0.0 32 75 1241 1283 1227 1299 0.74
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGACTACAAAGGTAGACCGACTTACAAATGGTTGCAAAAGTAATCCAGGAAGTTCGAAATCAACAACTCCTGTGAAATCGTacgaaaacaattatttatttaaagatgaTTGCTTCGAATTCGAAGTACCACCAGAGGCACCAGTGTTTTATCCCACTGATGAAGAATTTGAGGATCCTTTGGGATATATTGCTAAAATTCGACCAATTGCCGAAAATACGGgcatatgtaaaataaaaccacCATCAAATTGGCAGCCCCCCTTCGCTGTTGATGTTGATAAATTACGTTTCACACCTAGAATACAAAGATTAAACGAACTTGAAGCTAAAACACGCGTAAAACTGAATTTTCTCGATCAAATTGCTAAATTTTGGGAGTTACAAGGATCGTCACTAAAAATTCCTATGGTTGAAAAGCGTGCATTAGATTTATATACACTGCATAGAATTGTACAAGCTGAAGGTGGATTCGAATCTGTTACAAAAGATAGAAAATGGTCGAAAATTTCCATACGTATGGGTTATCCAGCTGGTAAAAGTATTGGAACAATATTAAAGACACATTACGAACGTTTACTGTATCCGTTTGATGTGTTTAAACAAgggaaaactttaaatattaaAATTGAACAACATGATGATGCCGAAAAAACAGATAAAGACTATAAACCCCATGGTATTGTTGGACGTATGGCGATAAAACCACCACCAGAAAAGAATGCAAGACGTTCAAAACGTTTCGAAAATGATGATAGCAAGACTgaaAATTTAGCTGTTAAGGTAAATGACGAGAAATTAGAAGAATGTGATGAAGTAGATAATAAGGAATTGAAacgtttacaattttatggtGCCGGTCCAAAGATGGCCGGTTTTAGTAAAAAACGTGAcgacaaaaaatcaaataattgtgAATATGATCCATTAGCAAAATATGTTTGTCACAATTGTAATCGTGGTGATGCTGAAGAATATATGTTGTTGTGCGACGGTTGTGATGACAGTTATCACACGTTCTGTTTAATGCCACCATTATCTGAAATACCAAAAGGCGATTGGAGATGTCCGAAATGTGTTGCCGAAGAAGTATCGAAGCCGACGGAGGCTTTTGGTTTTGAACAAGCACAAAGAGAATACACGTTACAACAATTTGGCGAAATGGCCGATCAATTCAAGTCCGAGTACTTTAACATGCCTGTGcatGTGGTACCGACGTCCACAGTTGAACGTGAATTTTGGCGTATTGTGTCATCGATAGACGAAGATGTGACCGTTGAATATGGCGCCGATTTACATACAATGGATCATGGATCGGGTTTTCCAACAAAAACttccataaatttatttccagGCGACAAAGAATACGCCGATTCCAGttggaatttaaataatttaccagTGTTAGAAGGATCAGTATTGGGCTACATAAATGCTGACATATCTGGTATGAAAGTACCATGGATGTATGTTGGTATGTGTTTTGCGACGTTTTGTTGGCACAACGAGGACCATTGGAGCTATTCGATAAATTATCTACATTGGGGCGAAGCGAAAACATGGTACGGTGTACCAGGTAGTAAAGCTGAAGCATTTGAAGAAACAATGAAATCAGCTGCACCGGAATTATTTCAATCGCAGCCGGATTTGTTGCATCAATTAGTTACGATTATGAATCCGAATATATTGATGGCTGCCGGTGTGCCTGTATATAGAACAGATCAACATGCTGGTGAATTTGTTGTAACATTTCCAAGAGCTTATCATGCTGGCTTTAATCAAGGCTATAATTTTGCTGAGGCCGTTAATTTTGCACCAGCAGATTGGTTGCGTATGGGACGTGAATGTATATTACATTATTCGCATTTAAGGCGTTTCTGTGTTTTCTCACATGATGAATTAGTATGTAAAATGTCATTGGATCCAGAAAAATTAGATTTAACTATTGCTGCTGCTACTTATCAAGATATGTTGCAAATGGTTGATTCGGAGAAGAAGTTACGCAAACATTTACTCGATTGGGGCGTCACAAATGCGGAGCGAGAAGCTTTTGAATTGTTGCCAGATGATGAGCGACAATGCGAAGTATGTAAAACAACATGCTTTTTATCAGCAGTTACTTGTAGTTGTACAAGTGATGTATTAGTATGTTTAAGACATTATAAAAATCTATGCGATTGTCCGCCAAAAAGTCACACATTACGTTATCGTTACACATTAGATGAATTGCCCGTTATGTTGAAatcgttaaaattaaaagctgAATCATTTGATCATTGGGTAAATCGTGTTAAAGATGCACTAGATCCAAATACACCAAAAACAATGAACTTAGCCGAATTGAAAGCTCTATTAAATGAAGCTGATGGTAAAAAGTTTCCAAAATCCGATTTATTGCAAACATTAACAACAGCTGTCGAGGATGCTGAGAAATGTTCAAGTGTTATACAACaattagatttaaataaaataagaacaAGAACTAGAAATTCATCTGATACTAAATACAAACTAACTGTTGAAGAATTAACATTGTTTTGCGAAGAAATCGACAGTTTAGCTTGTACTTTAGATGAATCTAAAAGTATACGTGATTTATTGGAACAAACAAAGAAATTTGAAAACGAAAGTGAACGTTTATTGGCGTTGCCATTGGCAGATTGTTCTTTACAAGAGATTAAAAGTTGTATGGCACATGGTAATGGTTTGTGTATTGAATTACcgaatttaaaaagaatatcaTCGAGAGAAAAACAAGTTGAATGGTATCGTGAAGTTTTGgcatataaaaagaaaaccgATTATCTCAGTTTAGAGTccatcaaaaatttaatacaagttGGAATTTCTTTAGTACCACACGTTGAAATCGAAGTTGAATTAAGCGAATTGCAATATATATTGGAACAAAGCGAAGAATGGGAAACAAAAGTAACTGCTGTGCTTAATTCAGTTGATAGTGCAGTATTAATACAAGTTGATAAATTGCTTAAAGAAGCATCTaagataaaatgttatttgcCATCAGAAGGACATTTATACGATGCCATGAAGAAAGCAAGAGATTGGTTGAGATTATTAGAAGAAATGAATTCAGCTGAATATTATCCATATTTCAATGCAATggaagatttaattaaaaaaggaCGTTCATTGGCGTTACATTTAGTGGAAGTTGATAGAATGAATGATTATTTAGTATTAGCAACAAATTGGAAAGATAAAACATGTAAAGTATTTTTACGGAAAAATTcaccaattaatttaatggaaGCTTTATCGCCACGAATACAATTtccaaataatacaacaaaaatgaaaCTTAAGAAAACCGATGAAGAgcaaaagaattttatatgtttgacAAATACAATGGATCCAGCTACAGTTGTGCAATTATTCAAAGATGCTGAAGATACAGAAATGgatatgataaaaaaattacgtagtattaatatagaaaaaagtttAGATCCAAATGATGGTCATACATTTTGTATATGCAATCAAAATGCATATGGTATTATGATGCAATGTGAATTATGCAAAGATTGGTATCATTCAAATTGTGTACAATTACCAAAAATATCTACAACCAAGTACAAAGGGAATTTAACCAGTGTTTCATTACATTTAGGCTTTAaagattgtaaatatttatgtcCAAATTGTTTAAGAACTAAACGTCCACGTTTAGATGTAatattaagtttattaatgtctttacaaaaattatatgttcGCGTACCAGAAGGTGAAGCATTACAATGTTTAACAGAACGTGCAATGAATTGGCAAGACCGTGCCAGACAATTGTTGCAACAACCAGAATTGGAAGctgctaaaaataaattaaatttatttacacaaaaatatatgcaaGTTGCTTCTAAAcatcaacatcaacaacaacaacagcataTGCAACAACGTCTTTTGGAAAAAGTTCGACACAAAGAAGATGATGTTGAAATTATGCAAGTTGATGGTGCAAATGAGATTATGGTTAACAAAGATGTTAAAAACGATGACATTACTATTGAAAGTACACAATTAGCTACTGCAGCAAACACATCATCATCAGTAGATGATTCAAATGCAAACAGTAGTAGTGATGAACAAATGATGGGAGAACATGCATATTCCTTACATTTACCAAAAGTTGATACaaaagattttatattaaaacttaaGCCCGATTTACGTGAACAAATTGaagatttattaattgaagGTGATTTATTGGAAGTACATTTAGatgaaacattttgtttatggAAACTGTTTCATGCTACAAGAGATCCAGAAAAAGAACCAATTCTTGTTGATTTTGATacCCGTTCGAAGAATCCACCGAAAAAACGTGGAAGAAAACGTGTTTCCGAAGACGGTGATCCAAATAAAAAATCTGTAAAAAGTATTAAGCCAACTGATGGTGGTGTTGCTGAGAAAAAGATACGTAGAAAAATCCGTACCAAAGATAATAATGGAATAAAACGTCGTACAAAACGGCGTGGCCGCCATCGTCAGCCGATCAACGAAAGTGACGGTACAGAAAATGATGCAGACGACGACGAAGaggacgatgatgatgatgaagatgaAGAGGAAAGTTGTGCAACAAGCGGTTGTTTGAAACCAACTGGGCAAAATGTTGATTGGGTACAATGTGATGGTGGTTGTGAACAATGGTTCCATATGGCGTGTGTTGGATTGTCTGCTGAAGATATAAATGAAGATGAagattatatatgtatgcagTGTTCGAAAAATACAACATTTGAAAGTTTAAATACGAATGACACAATTACATGTAGTCCACAGTCACCTGATTCTACACAGCCTTCCACATCAAAAgaaaatctataa
- Protein Sequence
- MTTKVDRLTNGCKSNPGSSKSTTPVKSYENNYLFKDDCFEFEVPPEAPVFYPTDEEFEDPLGYIAKIRPIAENTGICKIKPPSNWQPPFAVDVDKLRFTPRIQRLNELEAKTRVKLNFLDQIAKFWELQGSSLKIPMVEKRALDLYTLHRIVQAEGGFESVTKDRKWSKISIRMGYPAGKSIGTILKTHYERLLYPFDVFKQGKTLNIKIEQHDDAEKTDKDYKPHGIVGRMAIKPPPEKNARRSKRFENDDSKTENLAVKVNDEKLEECDEVDNKELKRLQFYGAGPKMAGFSKKRDDKKSNNCEYDPLAKYVCHNCNRGDAEEYMLLCDGCDDSYHTFCLMPPLSEIPKGDWRCPKCVAEEVSKPTEAFGFEQAQREYTLQQFGEMADQFKSEYFNMPVHVVPTSTVEREFWRIVSSIDEDVTVEYGADLHTMDHGSGFPTKTSINLFPGDKEYADSSWNLNNLPVLEGSVLGYINADISGMKVPWMYVGMCFATFCWHNEDHWSYSINYLHWGEAKTWYGVPGSKAEAFEETMKSAAPELFQSQPDLLHQLVTIMNPNILMAAGVPVYRTDQHAGEFVVTFPRAYHAGFNQGYNFAEAVNFAPADWLRMGRECILHYSHLRRFCVFSHDELVCKMSLDPEKLDLTIAAATYQDMLQMVDSEKKLRKHLLDWGVTNAEREAFELLPDDERQCEVCKTTCFLSAVTCSCTSDVLVCLRHYKNLCDCPPKSHTLRYRYTLDELPVMLKSLKLKAESFDHWVNRVKDALDPNTPKTMNLAELKALLNEADGKKFPKSDLLQTLTTAVEDAEKCSSVIQQLDLNKIRTRTRNSSDTKYKLTVEELTLFCEEIDSLACTLDESKSIRDLLEQTKKFENESERLLALPLADCSLQEIKSCMAHGNGLCIELPNLKRISSREKQVEWYREVLAYKKKTDYLSLESIKNLIQVGISLVPHVEIEVELSELQYILEQSEEWETKVTAVLNSVDSAVLIQVDKLLKEASKIKCYLPSEGHLYDAMKKARDWLRLLEEMNSAEYYPYFNAMEDLIKKGRSLALHLVEVDRMNDYLVLATNWKDKTCKVFLRKNSPINLMEALSPRIQFPNNTTKMKLKKTDEEQKNFICLTNTMDPATVVQLFKDAEDTEMDMIKKLRSINIEKSLDPNDGHTFCICNQNAYGIMMQCELCKDWYHSNCVQLPKISTTKYKGNLTSVSLHLGFKDCKYLCPNCLRTKRPRLDVILSLLMSLQKLYVRVPEGEALQCLTERAMNWQDRARQLLQQPELEAAKNKLNLFTQKYMQVASKHQHQQQQQHMQQRLLEKVRHKEDDVEIMQVDGANEIMVNKDVKNDDITIESTQLATAANTSSSVDDSNANSSSDEQMMGEHAYSLHLPKVDTKDFILKLKPDLREQIEDLLIEGDLLEVHLDETFCLWKLFHATRDPEKEPILVDFDTRSKNPPKKRGRKRVSEDGDPNKKSVKSIKPTDGGVAEKKIRRKIRTKDNNGIKRRTKRRGRHRQPINESDGTENDADDDEEDDDDDEDEEESCATSGCLKPTGQNVDWVQCDGGCEQWFHMACVGLSAEDINEDEDYICMQCSKNTTFESLNTNDTITCSPQSPDSTQPSTSKENL
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_01344695;
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
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