Basic Information

Gene Symbol
BAZ2B
Assembly
GCA_963978525.1
Location
OZ021694.1:6820496-6834799[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
MBD
Domain
MBD domain
PFAM
PF01429
TF Group
Unclassified Structure
Description
The Methyl-CpG binding domain (MBD) binds to DNA that contains one or more symmetrically methylated CpGs [2]. DNA methylation in animals is associated with alterations in chromatin structure and silencing of gene expression. MBD has negligible non-specific affinity for DNA. In vitro foot-printing with MeCP2 showed the MBD can protect a 12 nucleotide region surrounding a methyl CpG pair [2]. MBDs are found in several Methyl-CpG binding proteins and also DNA demethylase [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 3.5e-12 1.3e-08 34.4 0.0 5 75 1001 1071 999 1073 0.88

Sequence Information

Coding Sequence
ATGAAGAACATGGATAAAAATGCGGGTGAGGGTAATACAGCACAAGGAGGAGGAGATGGCAAAGGTTCTGGTGGCGGTggcggcggtggtggtggtgggaaAACGTCTGGCTCTAATTCGGGGGCGGGAAGTGTTCATGATCCTGCCTCTCTATTAGATGCAGCCTCATTATTTGCATATTGGGGCCGTGATCCAACTGCCGCTGCCACTAATCCTTTATTTAACGCACAATTCAATGCAGCAGCGGCTGCTGGCTTGGGCCTGTTGCCAAATCCAGGAGCAGCAGCAGCCGCGGTTGCTAATGATCGATATTCTATGGCTGCTGCCGCTGCCGCCGCTGCAGCTGGTCATCATCATCAGAACACAATGGCGGTGGCAGCCTCTCAGGCAGCTAGTCTAGCAGGTCTGCATCCAGCAAgcTGGTGGTCTATGGCACAACTGGCTGCTCAGGACTATTTCTCAAGACTGCAAGCTTCAGGCTTATCACCCTTCCCTCATCCCGATTTGGCGGCAGCATTTGGACCGGCGGCCTTAGGTTTAGGTGGTGCAAGCAGCACCAGTTCGGCTGGCAGTGGTAACAGTGTTGGCTCGGGTTCGGCCGGACAAAATCCAAATTGTGGCAATACGGTGGGGTCAGGTGGTGGGGGTAGTGGGGGCGGTAATGTTGGTGGCAACAGCAATAATACGTCAAGTGGCAAATCGAGTAGTAAATCGCGTAAGGAGAAGCAGcgccaacagcagcagcaacagcaattgcaacaacaacagcaacaacagttgcaacaacagcaacagcaacaacaatcattaGCTAATAGTTTAAATGCAGCAGCCGCTGCCGCGGCCGTAGCTGCTGCTACCAGTCCAGTGGGCACTTTGGCGGGTATGCATGGTTTGGTGGGTGCGGGCACTACTATAACGCCCACCTCTAATTTGGGGGGAAATAGTAATTCCACTAATAATAGTGGTGGTGGCGGCAACAACTGCTCAAGTAATTCCTACAAGAATAACTCTTCCGGTTATGGTAAATCCAATTCGATGTCGGTGTCTCAGTCAATGCCGTCTGTGGTTCCGGGTTCGCCTTATGATCCGGTTGTATTACACAAAGAATTAATGGCTATGCAGGCAGCAGCAGCTGCTGTCTCATCCTCATCGTCGTCCAAGAAATCTTCAGCATCATCATCTGGAAGTGGTTCGCAACACAATTCAGCAAAAAATGCATCAAGCGGTATTCTCTCTTCACATCatggcaacaacagcaacagcagcggTGGTGGTGGATGCATGGGTCTCGGTACCAGTATGAACTCTAATAATTCCACATCTCATGCTGTGGCAGCCCTAATGTCACCACACGGCTCGATCGGCAGTTCGAATTTATCATCGTCGGCGAACAAAGAACGCGACAAAAACAATGCGTCCTTGAATGCGTTGAATTCGTTGACACAATTCGGAGCGTTGGGCATGACGCCACAGCAGAGCATGCAGGCGGCCATGAATGCATTTGCGGCCAGTACATCTGCGGCGGCAGCAGCTGTTGCCAACAATGCGTCCAATGCTCAGAACTCCTCTGTTCAATCAGTGTCACCTCTGACCGGCAGtggaaataataaatcatcGAGTAAGGATTACTTGTCCTCGGGCGGTTTAAGTGATCATCCTTCTTTGTTGGGTGTACGTTTGCCACCGGACACGGAAATTATTAAGTACACGTCCAGCATTGTGGGCCCTAAAATGTCGGGTAATACAACCAATACTGCGCGTGGTcgcaaaaaaacaatttcagatgaacaacaacaacagcaacaacagcagcagcagcaacaacaacagcaacagcaactacATCACAAGTCAGATATGGACACTACAACAAATGCTCTGTCTTCTCTGTTATCATTTCCGGGACTTAGTCCGGCCAAACGGGCCCGACTGGAAATGGAGTATGCAGCTATAGCGGCTGCAGCTAATGCTGCTCAACAAAGCGGTGTCATTACGGGGCTTCCCGGCAATTTAACAGCCTCACAGATGGCCGCCTTAAGTAGTAGTTTGGGCGTTGGCGGTATTGGCCTAACGACGGGTCAGCATTCATCTTCACCAGCCTCGTTGTCGCTGAATTCACAACAGAATCCCCcacaaatcgatttaaccacatCAAGCAGCAGTAGTGGCAATGGCGGCATGTGTGGAGGGCGCAGCAGTAGTCGGGATTCATCATCGGATCGTGTTGAAGTAATAAAACTGCCACCAACCATAACTTCTAATGGTGCGTACAATTTatcgaataaaaataaagacatACACGACTTAACTGGCGGTAGCAGCACTGACATGAATTCCGGTGTCAATCTAAGTTTAAAGCCGGCTGCCATGGCAAGCAATGCTGCCAACCTAAGCAATGCAAGCCTCAGTGCCCCCATTACCATTGAAGACTTTGATACGCCATTAAATTTGTCTATGAAACCAGACAAATCAACTTCAGCCAGCCATAATAATGATTTATCGTCATCCAGTGGTGGTGGCGGAGGTAACAGCATAAATTCGGCTGCAGGCATAAATAGTTTGCAAAGCTTAAGTTCCATAACAGCAGCTTTGGGTGGCGGTAACAGCAACAGTAGCGGCAGCAATAACAGTAATTGTGGTTcgttgaataataataacgggAGTGGCAATGGAAATGGCAATGTGGGAATAAATAACAGCAACGAACGTCCCAATCAGGGCACCTTCAAGGAGGGAAGGCCACGAAACTTGGGCAGAGGTGTTTCCAAGCCGAAAAAGAATACAGTGGCATCCTTGTTGGCACAATCACGAGCAGTCGGCCTCAAGCCCATGTTGGCCACAACACAACTGCTGCAACAAGGCGCAGATATAGAGAAGATACGACAGGCTTTGAGTGAAGCCAACTCTCAGTTGGACGTTTCTACAGATTCGGAAAGTATGGCTGCGGAAAGTGGCCTGTCCGAGTCAGAGAGTGAAGAAGCCAATCTACTGAATGTGGCCGAATTAAGAGTACCCTTGGATTTGGGTTGGAAACGTGAAACGGTTATACGGGGCTTAACTAAGGCCGGTCAGATACGCGGCGAAGTGGTATATTATGCGCCCGGTAGTTTGGTGCCTATGAGGAGTATAGGCCAAATTTTCGCTCATTTGAATAACAATCCATCAAAGTTGACGCGGGAGAATTTCAGTTTTTCTGCCCGAGCTATTGTGGGATCATTTTTACAACCAGCTCCGCCGCCCTACGCCAATGATGGCGACTATTTGCGCATGAGCGATGAGGATGTGGCCAAACGTTTGGAagatttgaaaatgtttacgCGACAGACGCTAAACGTGGAGCAACGCATCGAGATTGCCAAACAACAGCAGGCGTTGAGAGATGCTAAGAAGCAGCAAAAAGAAGAGATGGCTCGCAACAAGGAGAAGGCACGCCAAGAAAAATCGGAAAAACTGGAACAGCAGCGTAGAGagaaagaattgaaaaatcaaCAGGCCATTGAGGCGCGCAAGAAGCGTCAAGAAGAACTGGAACGCATTAAACAGGAGGAGTTATTGAAAAAGCAACAGgaaaaggaaaagaaacgCCAAGAGGCTATTATAGCAAAAGAACAGGAATTGAATCGTCAAAAAGAATTGTTGCTACAAGCTGAAATGGAACGAGAACGCCGACGTCAACATATGACTTTAATACGACAGCTAGACTTTAGACGGAAATTCGAGGAGCGTGAAAAGAAGAAACATCAAATGGTTTTGGACAGATTAATACAGAGAGAGAAACGTTTGGCTACACGTAAGCGTGATGTTGAAATATTGGCTCAAATAAGAAAACCTCAAGAAGATTCCGAGTTGTATCAAACTACTCTAATACCCGAATTAGAGCGTATTGTGGGCAATCGATTGCCTGGCCAAGCTATGGCCGATTTGTTAATGGTGTTTGAATTCTTGCACAATTTCGGTGAAACTTTGGGTTTTGATATGGACTCTCTACCCAGTTTGCAGAATTTGCATGACGCGTTGGCCAGCGATAGTAATGTGGAGGTGGAAGAGGAGCTGCTATCTGTGATGACACATTTGTTGGTTTGTGCCATAGAGGATCCGGGTATACCGAATCCGGGTCGTCACACCACTTTGTTGGGCCAGTCATTGCGCAATGCGGACATTACGAATTCGAATGTTTCGGAAATTCTGCGCATCTACTTGTACGCTACGGCAACCGGTGAGATACGGCAAATGTTTGGCGTGCTTATGGATCGTGAACGGGAACGTCGCATACCCGACCACCATCAGATCGGTGCTGATTCCGTAACACATTCAGGCAAAAATGCTGAATATTATCGATTGTTGCATGAAAATGAAACGTGGAAGTTGTCACAGTCGTTGAAGGATCGTCCGTTTGTGGCCTTGAATCCGACCCGAAAGGCTCACATACTCGCCCACCTCTGCAATGATCTGCTCACGAATAAGGCCGTGTTGAAGCAGATCGACAACAGTTTGGAGACTTGTGCTCAAATGCGCAAAGAGAAGTACATGACCGACATGAAGGTGCGCAAGTATAAAGCGTTGCATATGCGCAAATCGCGTATAGAAGCGTACGAGAAAATGCAAGCAGAACGCGAGGCGGCTATGCAAGCGGCAGCGGTGGCTCAGCAAAAACTGGATGCTGAACGTTTGGAAAAGGAATGCGTGGAAATGATTGATATATCGTCCAGCAATATGTCGGATATGATGATGCAGGGAGGTGGTGATGCAACAACAATGAGTATAACAACGCCACGGCCCGGCGGTAATGTGGCCATGTTTACTTCTTTACCCATGGACTCTAATGCTGAACCGAATAATAATAGTAGCCCGAAACATGGAGAACCGATGCAAGTGGATAATATTGGTGAtgcaacacaacaacaaaaactagcCGATAAAGTCACAGATTTAACCACGACTCTGGCAATGGATGACAACAACAAGTTATCTTCCAGCCTAATGCCCATGGAGAGTAC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Protein Sequence
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Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

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