Mbra016528.1
Basic Information
- Insect
- Microctonus brassicae
- Gene Symbol
- KDM5A
- Assembly
- GCA_940306215.1
- Location
- OW675811.1:4965589-4977852[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- ARID
- Domain
- ARID domain
- PFAM
- PF01388
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 5.5e-25 1.2e-21 77.0 0.0 2 89 117 200 116 200 0.94 2 2 4.5 1e+04 -2.9 0.1 49 81 827 857 824 861 0.64
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGTATCCAAAGTggattcaaataatattgatagtgGAAAATATAATCGTGGAGGAAATACACGCGACATTATGGGCGAAAAAAGTACAAATAATTGTGGTGTTAATGGTGACACGGATTTTGAGTTTGGTGTACCACCAGAGGCGCCTGTTTTTGAGCCAACTGCTGAAGAATTTTTGGATCCACTTGGTTATATTGCTAAAATACGACCAATAGCTGAAAAAGCTggaatatgtaaaataaaaccaCCGCCTAATTGGCAACCACCTTTTGCAGTTGACGttgataaattcaaatttacaccAAGGATACAGAGGTTGAATGAGCTTGAAGCAAAAACAAGaataaagttaaattttttagatCAAATTGCTAAATTTTGGGAACTTCAAGGatcatcattgaaaatacCATTGGTGGAGAGAAAAGCATTAGATCTTTATTCATTACACAAAATTGTTACTGATGAaggTGGTATTGAAACAGTGACAAGGGAACGAAGATGGGCCAAAATAGCCAACAAAATTGGCTATCCATCAGGCAGAAGTGTTGGcagtattttaaaaaatcattatgaaagaattttatatccaTTTGACGTATTTAAGCAAGGAAAAACATTGAAGGATATTAAAATTGAGCCAGAGCcagaaataaatgagaaaaaagatCGTGATTATAAGCCACATGGTATAATATCACGACAACAAATAAAGCCACCAGCAGCGAAATTTTCACGTAGGTCAAAACGTTTTGCGGGCGATGATAAACAAGACGTATCAATAAAGCAAGAAGATTGTAAAGATGAGTGTGATTCTGATAATGAAACTAAAGATGATGTTAAATCagaaattgataatgataaagacagtaaagaattgaaaaaattacaattttatggGGCTGGACCGAAAATGGCCGGTTTTAATACCAAAGACGGCaagaaatcaaataaaacacgcggaattaaatacacatatgaCTACGATCCCTTGGCTAAATACATTTGTCACAATTGTGGCAGAGGCGATATGGAAGAAAGTATGCTGCTTTGTGATGGTTGTGATGACAGTTATCACACATTTTGTCTTTTACCACCACTTACTGAAATCCCAAAAGGCGATTGGCGATGTCCTAAGTGTGTTGCTGAAGAAGTATCAAAACCCATGGAAGCATTTGGTTTTGAGCAAGCACAAAGAGAATATACACTTCAACAATTTGGTGAAATGGCAGATCAATTTAAAAGTGATTATTTCAATATGCCAGTGCATATGGTACCAACGTCATTagttgaaaaagaattttggCGAATTGTATCGTCAATTGATGAAGATGTTACCGTTGAATATGGCGCTGATCTTCATACAATGGATCATGGCTCAGGTTTTCCAACAAAAACTagcgttaatttatttacttgtgaTCAAGAATATGCCGAGTCTTCatggaatttaaataatcttcCGGTACTTGAAGGGAGTGTATTGGGTCATATTAATGCTGATATTAGCGGCATGAAAGTTCCATGGATGTATGTTGGAATGTGTTTTGCAACATTTTGTTGGCATAATGAAGATCATTGGagttattcaattaattatttacattgggGTGAGCCAAAGACTTGGTATGGTGTACCAGGATCAGAAGCTGAAAAGTTTGAGCATTCAATGAAATCTGCAGCACCAGAATTATTTCACAGTCAGCCTGATTTACTTCATCAGCTCGTAACAATTATGAATCCAACGATTTTAACAAATGAAGGTGTACCAGTATTTAGAACGGATCAACATGCAGGTGAATTTGTCGTTACATTTCCACGAGCTTATCACGCGGGTTTCAATCAAGGCTACAATTTCGCTGAAGCTGTAAATTTTGCTCCAGCTGACTGGTTAAAAATTGGCAGAGATTGTATTGCACATTATTCCAATTTACGGCGTTTTTGTGTGTTTTCTCATGACGAATTAGTATGCAAAATGTCACTTGATCCTGATGCATTAGACATTGGAATAGCCACAGCGACTTATCAAGATATGTTACAAATGgtagatgatgaaaaaaaattgagaaaaaatttactcGAATGGGGTGTTACAGAAGCTGAGCGTGAAGCATTTGAATTGTTGCCAGATGATGAACGACAGTGTGAAGCGTGTAAAACAACGTGTTTTCTTAGTGCTGTGACGTGCTCGTGTCACAGTTCTCAATTAGTGTGTTTACGACACTTTACTGATCTCTGCAGTTGTTCACCAGAGAAGCATACATTACGTTATCGTTATACGCTTGATGAATTACCAATAATGTTGcagaaattgaaattaaaagcCGAGTCGTTTGACTCATGGGTGACGAAAGTGAAGGAGGCGATGGATcctaaagatgaaaaaattgaattaagtGAGCTTaaagaattattgaatgaagctgaaagtaaaaaatttccagACAGCGAATTATTAACGGCTTTAACAACTGCCGTACAAGATGCTGAAAAGTGCGCGAGTGTCGCAcaacaattattgaataataaacaacgcACACGTACACGACAATCAGTTgatactaaatataaattaaccgTTGAAGAATTAACATTATTCtataaagaaataacaaatctTTGTTGTGAATTGAAAGAATCTGATggtgttaaatatatattagatcaAGTTGTACAATTTCAAAAGGATGCTGAGGATTTAGAGGCTAAATGTGATGATTGTGATCATGCTAAATTGGAAAAATGTATTGATTTTGGTGATTCAATTTGCATTGAATTGCCGCAATTGGTAcgtttgaaacaaaaattaaatcaaatacaaTGGTTGGATGAGGTAAAATCAATGTTGGATGAATCAAAATCCGTGACGCGTGAAGATTTGgctaaattaattgataaaggTATGTCAATACCGccgcatataaatattgaaacaatgCTATCAAAATTACAGCAggttgttattaatattgataaatggGAGGAAAAAGCCAAAGGATATTTACAATCAAAAAGTcgtcaaaatataattgttattgaagaatttattcaaGAGGCTGATGATATTGATGCTTATTTACCAAGTCTTGATAGCTTACAAGATATTTTAACAAAGGCGAAAAATTGGACAAAAACCGTTGAAGAAATTCAGGCTCGCGATAATTATCCATATTATGATACACTAGATGATCTTGTACGTAAAGGAAGAAATATTCCATTACATCTTGATGCTTTACCATTATTAGAATCAACATTGTCACAGGCTAAAGTATGGAAAGATCGAACAGCACGAACATTTTTacgaaaaaattcacattataCATTAATGGAAGCGCTATCGCCAAGAATTGGCGTTGGTGTTCAGgcattaaaaacaaaaaaaaataaaggcgATGAAAGTATTGGCGCTGTATTTGTTTGTGATACTAAATTGGATGATACAAGCGATTCAGCCCATGTTGTTGCTGCATTTAAGCTCGCTGAACAGCGTGAAATGGAGGCAATGCGAAATTTACGCGAGAGAAATATGTCAAAAGCCAACTTTGAAGAATCACGATATTGTGTATGTAGACGACCGCGTTTTGGATTAATGTTACAATGTGAATTATGTAAAGATTGGTTTCATTCAAATTGCGTTCCGCTTCCAAAAACAATGTACAAAGGTAAAGTTCAATCGTCAAGGGAAACTAAATTTTTATGCCCGTGTTGTTTAAGATCACGTAGACCAAGATTAGAAACAATATTAGCGTTATTGGTTagtttacaaaaaatttcaataagaTTACCGGAGGGTGAAGCACTTCAATGTTTAACTGAACGTGCAATGAATTGGCAAGATCGTGCTAGACAAGCATTGGCAACTGAAGAAATATCATCGGTATTGGCTAAATTATCAGCGATGTCACAGAAACTTGTTGAGGCAGCGGCACGtgaaaaaactgaaaaaataattagcagTGAATTGAAAAAAGCCGCAAATAATCCAGAATTACATCAACGTGTGCAAGCTATTGCCCCATTAAGTGGTGTACACTCTGACGACAGTGTCATCAGCACTGCAgatGACGATGACGATGTTACAATTGATGGCGAAGAGCCAACATGTAGTACTTTTAACAGCAGCGAACATGCTTATTCATATGtTTCAAAGTTTCAACGTAAATCACAATCGCAAAATTCCGAAAATTCCGTTGTATTGTCAGTAACAGCACGAACGAAATTGGAGGAATTAATGATGGAGGGCGATCTTTTAGAAGTGGCATTAGATGAAACCCAGCATATTTGGCGAATTCTCAGTCATACAAATAGTCCAACAACTGTACGTAAATATGCGGCATTTGAGGAAGTTCAAGCTAATTTTAATGCTGATATTAAGGATCCGAAAAAACGTGGACGTAAAAGAAAATCTGAGGAATTTGTTGAATTGTCAAGTAAAAATGCTGGAAGGCCTAAAGTTGATGAAAAAACTTTGGTTAAAAAAAAgggatttaataataaagataataagaaaattgttACGCCGCCAAGTCCATTGAAACGTGGACCTAGAAagatGAAACGAAAGGAAGGCGAGGAAGTGCCGAAAAAACGTGGTGGCAATCGTAAAAAAACTAAACAAGACACATCAGATGAAGAAGATGATTGTGCAGCTGACAATTGTCTACGTCCAAATGGTCGCGAAGTTGACTGGGTTCAATGTGATGGCGGTTGCAACGGTTGGTTCCACATGCATTGTGTAGGTCTTGATCGAACTGAATTGACCGAGGAGGACGATTACATTTGCAGCAATTGCAAGGACGCCGATCAAAACGCAACGGGTTATCTCAGTGACGACAACGAACCGGACATCGACGATGAAGAAGAGTCCTTCGTCAAGACCTAA
- Protein Sequence
- MVSKVDSNNIDSGKYNRGGNTRDIMGEKSTNNCGVNGDTDFEFGVPPEAPVFEPTAEEFLDPLGYIAKIRPIAEKAGICKIKPPPNWQPPFAVDVDKFKFTPRIQRLNELEAKTRIKLNFLDQIAKFWELQGSSLKIPLVERKALDLYSLHKIVTDEGGIETVTRERRWAKIANKIGYPSGRSVGSILKNHYERILYPFDVFKQGKTLKDIKIEPEPEINEKKDRDYKPHGIISRQQIKPPAAKFSRRSKRFAGDDKQDVSIKQEDCKDECDSDNETKDDVKSEIDNDKDSKELKKLQFYGAGPKMAGFNTKDGKKSNKTRGIKYTYDYDPLAKYICHNCGRGDMEESMLLCDGCDDSYHTFCLLPPLTEIPKGDWRCPKCVAEEVSKPMEAFGFEQAQREYTLQQFGEMADQFKSDYFNMPVHMVPTSLVEKEFWRIVSSIDEDVTVEYGADLHTMDHGSGFPTKTSVNLFTCDQEYAESSWNLNNLPVLEGSVLGHINADISGMKVPWMYVGMCFATFCWHNEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGSEAEKFEHSMKSAAPELFHSQPDLLHQLVTIMNPTILTNEGVPVFRTDQHAGEFVVTFPRAYHAGFNQGYNFAEAVNFAPADWLKIGRDCIAHYSNLRRFCVFSHDELVCKMSLDPDALDIGIATATYQDMLQMVDDEKKLRKNLLEWGVTEAEREAFELLPDDERQCEACKTTCFLSAVTCSCHSSQLVCLRHFTDLCSCSPEKHTLRYRYTLDELPIMLQKLKLKAESFDSWVTKVKEAMDPKDEKIELSELKELLNEAESKKFPDSELLTALTTAVQDAEKCASVAQQLLNNKQRTRTRQSVDTKYKLTVEELTLFYKEITNLCCELKESDGVKYILDQVVQFQKDAEDLEAKCDDCDHAKLEKCIDFGDSICIELPQLVRLKQKLNQIQWLDEVKSMLDESKSVTREDLAKLIDKGMSIPPHINIETMLSKLQQVVINIDKWEEKAKGYLQSKSRQNIIVIEEFIQEADDIDAYLPSLDSLQDILTKAKNWTKTVEEIQARDNYPYYDTLDDLVRKGRNIPLHLDALPLLESTLSQAKVWKDRTARTFLRKNSHYTLMEALSPRIGVGVQALKTKKNKGDESIGAVFVCDTKLDDTSDSAHVVAAFKLAEQREMEAMRNLRERNMSKANFEESRYCVCRRPRFGLMLQCELCKDWFHSNCVPLPKTMYKGKVQSSRETKFLCPCCLRSRRPRLETILALLVSLQKISIRLPEGEALQCLTERAMNWQDRARQALATEEISSVLAKLSAMSQKLVEAAAREKTEKIISSELKKAANNPELHQRVQAIAPLSGVHSDDSVISTADDDDDVTIDGEEPTCSTFNSSEHAYSYVSKFQRKSQSQNSENSVVLSVTARTKLEELMMEGDLLEVALDETQHIWRILSHTNSPTTVRKYAAFEEVQANFNADIKDPKKRGRKRKSEEFVELSSKNAGRPKVDEKTLVKKKGFNNKDNKKIVTPPSPLKRGPRKMKRKEGEEVPKKRGGNRKKTKQDTSDEEDDCAADNCLRPNGREVDWVQCDGGCNGWFHMHCVGLDRTELTEEDDYICSNCKDADQNATGYLSDDNEPDIDDEEESFVKT
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_01103329;
- 90% Identity
- iTF_00937800;
- 80% Identity
- -