Basic Information

Gene Symbol
snpc-4
Assembly
GCA_030347275.1
Location
JAQQBS010001422.1:1025965-1028691[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 4 1.2e-08 8.4e-06 25.7 0.6 1 45 275 321 275 322 0.96
2 4 1.4e-09 9.6e-07 28.8 0.2 3 45 334 380 334 381 0.96
3 4 8.1e-10 5.5e-07 29.5 0.0 1 43 387 430 387 433 0.93
4 4 7.7e-08 5.2e-05 23.2 0.1 3 34 442 474 441 479 0.91

Sequence Information

Coding Sequence
atgtgcgATGAGGAAGATGATTTGGATATTCTTGATGATATCAAAGCACTTGAGCAAGCACTGGCTCAAGAATCATTAACAATAGCATTAgacaatgaagaaaatgatggTGATGAAGAGGATGAAGCCAATGACGAGGATGTAGAAGATAATAATGAAGCATTGGTCCTTATTAATCCTtcattcgaaaaaataaattcatcaaaagtaaAATGTACTAAACAGAAACCAAAATTAGATATTAAATGTGATGACCTTTATGATACTATTGATTCTGCTATCGAAGCCAATGCAAATCTACTTGCAGCTTATAAATCAGCTCTGACTGCAGTTAATGCTCGATTAGATCAATGTGAAAAACTTTGGCAAGAAGCAGATTAtcaagttaatttaattttacgtgGTGGTAGAGCCAATTGGCGTGTACCATATTTTAAAGCTGGACAACCGTACTTTAAAGATGAAAATCATTTTCCTGCAACGCCAAATGAAGATCagttaataaaacaaaaaagagaTGAATTTCCAATTGTTTATGCACGTTTACCAGGAAAATGGTCAGCAAAAGGACGAACAAATTTATGGAATGCAGCACGTGCCAATGCTTCATTGAAATatcttgaaaaaatgaaatcaatgaatagaaataatgATCATGCATcggtaaattataaaattccttCTGATTTTTTACATGTACTCCAAACTTTGGGTGATACTGAACTTGATTGGATGAGAATATCTGTAaaagatatgaaaaatcgataTTCTTGGCAAGCATGCAAAGCAATGTGGGATCTTCATATGAAACCAACTAATAATCGAGAAAAATGGCGAAATAGCGAGGATAATATGTTAAAATCATTGGCTGaatgttataattatcaaaattggaatttaattgCAGAAAAATTGGGAACTAGAAGAACGTGTTATCAATGTTTTGTAAGGTATAATACATTAAATCCACCATCAACATCAAGTATCAATACAGATATTCCGTGGTCACAAATGGAGGATGAACTTTTAAATGAATTAGTTGAAAAATTACGAATTGGTGATATAATACCATGGACATTAGTGACATTTTATTTAGGTAATAGaactaaaaatcaaatttattgtcattggaaatataatttggaTCCGACATTAAAAAAAGGTAGATTTACAATTGAAGAGGATCAAATGTTATTAAATGCTGCTAATAAATAtggtaaaaattttccacGAATTGCTGCAGAATATTTTCCACACAGAACAAGTGTACAATTAAAtactcattttcatttattaatgttaaaaaCTGATGAATCATATAATTCATGGACACATGCTGAAGATAAACAGTTGCTTGGGTTGTACGATGAATTTGGTAATAATTGGCGTGTTATtggaaatattatgaataaagatCGAACGTATGTTCGACATCATCATGCAGCGCTCACTCGTCATTTATCAAAGGGGATTGGTCTTGCTGATGtgccgagaaaaaaaaatacaacgaccgctaatgataatgatgaaatggATGATAGTGATATTGAAGACAgaataaatgagaatattGATGCACAATTAATACGTTATTTCCAAAATATACCTAATCCAGTTCCAGCTGCAggcagaaaaagaaaatatcacACAGCTCaacaattagaaaataaaacaaaacaacttcgtgatgtatttaaaaaattaaatgttaattttaaaataccaGATAATTTAGATGACTATGAAGAACTCACAATTAtggataaacaattattaatatcattgaaaCAATCTGGTGGTATAAATTCATCGAATTATACACCCGATCAAATTGAACAATATcgtttaaaaatgttttgtaCAAATAAATTGGATGATAATACAGAAAAGTTTATTCCACCTGCGCCATTTGGTTTATTTCAAAATGTACGTAAACGTGGGAgatctaaaaaaattaatgctgATACTGTATGTGATAATTGTAATGTTGAATTAGTAATGGAATTTGAAACtccagaaaatattaataaaatgttgagTGTTAATGAATTGgaattgtttgataaatttaaaaagataATTTCACAAGAATGTAAAATAACACAACATCCTGGAAGGTTTGAAGAGAAATATATGAAGTCTCTTAAATTAATTCGACAAAAATCATTGGATGATTCGAATCCACAAGAAGGAACTTCAACTTTTATTCCAACGAATGAagaatcaatgaaaaaaatgaatgaaaccTTTATTGAACCGTGCTATTCAACATTACGTGGATATCAATGTCtattaaatatgcaaaaattattaaacaagcctgtttcagatatttttttgccagaggaaatatttaatagtgaaGAAAGTAAAcacgcattttatttattaaaaaatcgctttcgtgttttatttaaatatccgATTGGTATGACACGAATACCAGTGAGCtatcaagaaataaatgacaatgataATGAGGTGGAAAAGGAAGAAGAGATGGTGGTGGAGGAGGAGGATGGCGCTGAGGAGATGACATTTAATGTGCCTGCGTTAGAAGAAGATTCATTTGAAATGTCGCCAGTATCTCCTAATAGAGAACCAGTTGAATCATCAGCAGGAGACGTTGAAGTGTCAACGCCATCGCGACTAAGTTTAAATATGGTTAAAACGCTGcgtaggaaaaataaaaataaaaataataaattaaatattccaaataattaa
Protein Sequence
MCDEEDDLDILDDIKALEQALAQESLTIALDNEENDGDEEDEANDEDVEDNNEALVLINPSFEKINSSKVKCTKQKPKLDIKCDDLYDTIDSAIEANANLLAAYKSALTAVNARLDQCEKLWQEADYQVNLILRGGRANWRVPYFKAGQPYFKDENHFPATPNEDQLIKQKRDEFPIVYARLPGKWSAKGRTNLWNAARANASLKYLEKMKSMNRNNDHASVNYKIPSDFLHVLQTLGDTELDWMRISVKDMKNRYSWQACKAMWDLHMKPTNNREKWRNSEDNMLKSLAECYNYQNWNLIAEKLGTRRTCYQCFVRYNTLNPPSTSSINTDIPWSQMEDELLNELVEKLRIGDIIPWTLVTFYLGNRTKNQIYCHWKYNLDPTLKKGRFTIEEDQMLLNAANKYGKNFPRIAAEYFPHRTSVQLNTHFHLLMLKTDESYNSWTHAEDKQLLGLYDEFGNNWRVIGNIMNKDRTYVRHHHAALTRHLSKGIGLADVPRKKNTTTANDNDEMDDSDIEDRINENIDAQLIRYFQNIPNPVPAAGRKRKYHTAQQLENKTKQLRDVFKKLNVNFKIPDNLDDYEELTIMDKQLLISLKQSGGINSSNYTPDQIEQYRLKMFCTNKLDDNTEKFIPPAPFGLFQNVRKRGRSKKINADTVCDNCNVELVMEFETPENINKMLSVNELELFDKFKKIISQECKITQHPGRFEEKYMKSLKLIRQKSLDDSNPQEGTSTFIPTNEESMKKMNETFIEPCYSTLRGYQCLLNMQKLLNKPVSDIFLPEEIFNSEESKHAFYLLKNRFRVLFKYPIGMTRIPVSYQEINDNDNEVEKEEEMVVEEEDGAEEMTFNVPALEEDSFEMSPVSPNREPVESSAGDVEVSTPSRLSLNMVKTLRRKNKNKNNKLNIPNN

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_01002012;
90% Identity
iTF_01001189;
80% Identity
-