Basic Information

Gene Symbol
ALDH1A2
Assembly
GCA_028455855.1
Location
JAPTHL010000008.1:5961519-5970714[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
RHD
Domain
RHD domain
PFAM
PF00554
TF Group
Beta-Scaffold Factors
Description
Proteins containing the Rel homology domain (RHD) are eukaryotic transcription factors. The RHD is composed of two structural domains. This is the N-terminal DNA-binding domain that is similar to that found in P53. The C-terminal domain has an immunoglobulin-like fold (See PF16179) that functions as a dimerisation domain [1-2].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 9.3e-41 4.1e-37 127.3 0.4 1 167 75 264 75 266 0.92

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTTGCTTGAAACACAGCAAAACTCATTCAATTCTGATATGAGTAATAATTATGTGAATATATTAACACCACCATCAAGTAATGAAGATTCACCGCAATATTACAATCTTAATAATTCAAATTCACCAACATGTTATTCACAACTTGATACAAATACGAATTTTATTATAACAGCAGCCCCATTACAAAGTGATCCATTAATGTTGCCTGATAAGCCGTATTTGAAGATTCTAGAACAGCCAGTTGGTAAATTTCGATTTCGTTATAAATCCGAAATGACTGGCACACATGGCAGTTTATGTGGTGAGAATTCTGATAGACATCGTAAACAAACAGCACCAACAATTGAATTGTGCAAATTTAATCAACCAGCAATACTACGTTGTTCAATTTATCAATTTAATGTTAATGATGATAATAGACCGCATGCACATAGATTGATGCGTAAAGAAGGCAAAGATGAAGTTGATGATCCACATGATGTTGAAATAACACCACAACAAGGGATGAAATATTCATTTCATAATATGGGTATTATCCATACAGCCAAAAAGAATATCGTATTGGAATTAGAACGGAAGAAAATGAAATTGAAAAAGGAAGAAATTGCTAGAATTGAAGGGAAATTTAGGGATTTAAATTTAAAAGAAATGGCAGAGATTAAAAGATTGGCTGAAGATGAAAGCAAATCAATTAATCTGAATGTTGTACGTTTACGGTTTGATGCATTTTATAAAGATAATGGAATATTACGTCCAATATGTTCCCCAGTTTATTCACATGGTATTAAAAATTTAAAAAGTGCATTAACGGGTGAATTGAAAATTGTACGTATGGATCATTGTAGTAGTCCATCAAAAGGGGGACGTGAGATTTTTATATTAGTTGAAAGAGTTACAAAAAAAAATATTAAAATTAAATTCTTTGAAGTTGATGATGATGAAAATGAGATTTGGCAAGATTACGGTAGATTTACTGATCTTGATGTGCATCATCAATATGCCATTGTTTTTAGAACGCCCGCATATAAAAATTTGGAATTAACAAAACCAGTGACTGTTTTTATACAATTGGTACGTCCATCGGATGGGGCGACAAGTGAACCAAAAGAATTCCGTTATATACCATCATCTGATTCATATAAACCAGGTGTTAAACGTTCTAGATCAAGTTATAGTAGTAGTTATGATAGTAGTTCATTATCAATGAATAGTGATGAATTACCTGTAACTGTTACGAATTTATTTACAACAGCATCATCATCATCAACATCACCACCACAATCACAATCATTCGAAAATCATGATCAACAAATTAATGAAACAAATATGAATATTGATTATCAAATAACAAGTGCTGAATTACAATTAGCAATGACAAATATTAATTCGGATGAATTTAATCAATTATTTAATGATTTCGGCGATGAATATTTATCATGTAATACACCTGGTTTAAGACAAACAGATATATTAGGTAATAATTGTGGTGGTACATCATCGGTTGCTGTTGATGCTGCTACAGTTTTTGGCAAGAAAACATATGAGAAACGACAACGACAATTTCTGGGAAGACCTGATCCAAAAAGACCAACAACATTGGATGAAATTAAACATGCAAAAGATGTCATTGAAGATTTACGTAGTTTAATAAAAACAAAACCACCAAATGAACGTGTCATACAAATGCTACAACATTATTTAAATACACCAAATAAAAACAATGCTTTACATACAATAATAAAACGCAATGATACAGATAATGGGATGTTTCTATTACATTTAATTTATGTATGGAAACAATACGATTTATTAAATATAAAAAATAATGATAGTGAAACACCATTACATATAGCAACATATTGTAAAAATAAAACAATCATTGATGGTTTAATTAAAAATAAAGCTGATCTATCAATCGGTGATCAACAATTAAATACAGCATTACATATAGCTGTTGAAATAAATGCACCAATTGATGTATTAGAAACATTATTGATGGCTGATAAAGTTTTGGAATTTATTAATTGTGAAAATTCCGATGGTAATACACCGTTAAATGTAGCTATTGAAAATAATAATTTGAGAGCTGTTAAAATGTTGTTGATTCGCGGTGCTGATGTGAATAAAACCCATAAAAAGAGTGGTTATACACCGTTACGTTTCGCTATAGAAAAACAACATATCGATATTATTAAATATATCTTGGATTTCCCTGGTACAAATCCTTTAATTGAAGATTTCCAAGGTAAAAGTGCTCTATATGCTGCAATGAAGAAGGAGAATGATGAATTATCAGCGTCTATTGCTGAATTTATGAAAACTCATAATTATTCTGATATAATTAAAAGTGAAATTGAAGAGACAATAGAAGATGAAGAATTGGAAGAGAAATATCCGATAAAATTAGAACAAGTATCAGCAGAAGATTTACGTGATATGTATAGTAATATAACAACATTTACAACAGAATGTCTATGTGAAATTGCAACAATTTTGGATAATTCTGGTGCATGGGAGAGTTTAGCTGATTTATTAGATTTAGGACATTTGATACGTTCAGGAATGTGTGATGCATCTGATAGTCCGACAAAAGTCTTATTAAAATTTGCTACAGAGAATAATGGTGATACGATACTGCAAATTCGGGACTTTTTGGAAAATCTCGATGAATTGCGCGCTGTTGAAATGATTGATGATATGTTGTTCATCGATAATGAATTTATTGATGCTGTAAATGGTGAAAAATTGCCCGTAATAAATCCAACAACCGGTACGAAAATCATTGATGTTTTTGAAGCCGGTCAAGATGATGTTGAGAAAGCTGTGAAAGCAGCAAAACAAGCATTTTCACGACAATCTGAATGGCGACAAATGGATGCTTCCAAACGTGGATTACTTATTAATAAACTTGCCGATTTATTTGAGCGCGACATTGATGAGCTTGCACATTTAGAAACATTAAATAATGGAAAAACATTATCTAATTCATTGCTTGATATGAAATGTTCAATTGACGTATTCCGTTATTATGCGGGAATTTGTGATAAAGTTCATGGTAAAACTATACCTTCCGATGGTGATTATTTCGCTTTGACACctttagctgctggttgtacaatagttttgaaaccatccgaacaaacaccATTAACCGCTCTAATAGCGGCTGCTTTAGCAAAAGAAGCCGGTTTCCCAAAAGGTGTTATCAATGTTTTGACTGGATATGGACCTACCGTTGGGGCAGCTTTAGCTCTACATTCGGATGTTGATAAAATTGCTTTCACTGGTTCTGTTGATGTTGGTAGAAAAATTATGGAGTATTCAGCGAAATCAAATTTGAAAAAAGTCGGCCTTGAATTAGGCGGTAAAAGTCCATTAATTATCTTCAGTGATGTTGATTTGGATGAAGCTGTGCAAATTGCTCATAATGCAGTTTTTGTGAATCACGGTCAAAATTGCTGTGCTGGTTCTCGCACATTTGTTCAAGCACCAATTTATGAAGCATTCGTTGAGAAAGCGGCAATTTTAGCGAGAAATCTTAAAGTCGGTGATCCTTTCGATCCAAACACTGAACAAGGCCCGCAAACTAATCAGTTAGTTTTCGATAAAGTTTTAAAGATGATCGAATCCGGTCGAAAAGACGGTGCCACATTGGTTGTTGGTGGTGACAGAATTGGTACACAGGGTTTTTTCATACAACCAACTGTATTTGCTGATGTTGACGATCATATGACAATTGCAAAAGAGGAGATTTTCGGTCCCGTCCAAAGTATTTTAAAATTCAATAATTTAGATGAGGCTATCGAAAGAGCTAATAATTCACCGTATGGTTTAGCTGCTGGTGTTTTAACAAATGATATAAATAAGGCTCTAGTTTGTGCTCAAGCTATTAGGGCAGGATCTGTTTGGGTTAATTGTTATGAAGCGACAACATCACAGACACCGTTTGGTGGATACAAAATGTCAGGATTTGGGCGAGATTTGGGTGAAGATTCAGTGGACGACTATCTGGAAATCAAAACAATCTCAATAAAAGTACCAACAAAAGTGTAG
Protein Sequence
MLLETQQNSFNSDMSNNYVNILTPPSSNEDSPQYYNLNNSNSPTCYSQLDTNTNFIITAAPLQSDPLMLPDKPYLKILEQPVGKFRFRYKSEMTGTHGSLCGENSDRHRKQTAPTIELCKFNQPAILRCSIYQFNVNDDNRPHAHRLMRKEGKDEVDDPHDVEITPQQGMKYSFHNMGIIHTAKKNIVLELERKKMKLKKEEIARIEGKFRDLNLKEMAEIKRLAEDESKSINLNVVRLRFDAFYKDNGILRPICSPVYSHGIKNLKSALTGELKIVRMDHCSSPSKGGREIFILVERVTKKNIKIKFFEVDDDENEIWQDYGRFTDLDVHHQYAIVFRTPAYKNLELTKPVTVFIQLVRPSDGATSEPKEFRYIPSSDSYKPGVKRSRSSYSSSYDSSSLSMNSDELPVTVTNLFTTASSSSTSPPQSQSFENHDQQINETNMNIDYQITSAELQLAMTNINSDEFNQLFNDFGDEYLSCNTPGLRQTDILGNNCGGTSSVAVDAATVFGKKTYEKRQRQFLGRPDPKRPTTLDEIKHAKDVIEDLRSLIKTKPPNERVIQMLQHYLNTPNKNNALHTIIKRNDTDNGMFLLHLIYVWKQYDLLNIKNNDSETPLHIATYCKNKTIIDGLIKNKADLSIGDQQLNTALHIAVEINAPIDVLETLLMADKVLEFINCENSDGNTPLNVAIENNNLRAVKMLLIRGADVNKTHKKSGYTPLRFAIEKQHIDIIKYILDFPGTNPLIEDFQGKSALYAAMKKENDELSASIAEFMKTHNYSDIIKSEIEETIEDEELEEKYPIKLEQVSAEDLRDMYSNITTFTTECLCEIATILDNSGAWESLADLLDLGHLIRSGMCDASDSPTKVLLKFATENNGDTILQIRDFLENLDELRAVEMIDDMLFIDNEFIDAVNGEKLPVINPTTGTKIIDVFEAGQDDVEKAVKAAKQAFSRQSEWRQMDASKRGLLINKLADLFERDIDELAHLETLNNGKTLSNSLLDMKCSIDVFRYYAGICDKVHGKTIPSDGDYFALTPLAAGCTIVLKPSEQTPLTALIAAALAKEAGFPKGVINVLTGYGPTVGAALALHSDVDKIAFTGSVDVGRKIMEYSAKSNLKKVGLELGGKSPLIIFSDVDLDEAVQIAHNAVFVNHGQNCCAGSRTFVQAPIYEAFVEKAAILARNLKVGDPFDPNTEQGPQTNQLVFDKVLKMIESGRKDGATLVVGGDRIGTQGFFIQPTVFADVDDHMTIAKEEIFGPVQSILKFNNLDEAIERANNSPYGLAAGVLTNDINKALVCAQAIRAGSVWVNCYEATTSQTPFGGYKMSGFGRDLGEDSVDDYLEIKTISIKVPTKV

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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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