Lobt001635.1
Basic Information
- Insect
- Leucophora obtusa
- Gene Symbol
- ZNF541
- Assembly
- GCA_949987735.1
- Location
- OX465295.1:29436968-29456819[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- MYB
- Domain
- Myb_DNA-binding domain
- PFAM
- PF00249
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 1 1.3e-10 4.7e-07 31.6 0.2 2 45 1711 1754 1710 1755 0.94
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGTGCAGTGCATCAGTGGGTACTGAAGCATCGGTGACGCTACAATTGCGCGATGTCAATTCCAATGATTCCTCAAATCAATCATCATCTGCGACAACAGTGGTTACATCAGCAACAGGAAATAcacatcatcatcatcatcataCAGCAACAGGAACAACAACATTGGATAATGCATTAACCATAGGTTATCCAGATCCAGAAATGTTGGCTGATGTTTTAGGTACATTACAAACAGCATCTTTAAAAAATACAAATCCCAGTGGTGAGAGTACAAAACAAAATTCCTCCAAATTACCAAATACCAGCGATATTTCCAATACCAATTTAAATGGTTCGATTAAAAATCGTATAACAATTAGTAAACGCTCCTCGAACATTATAAGTAATTCCCAAAATACCAGTAACATTATCAGCAGTagcaacagcaacaacaacaacaattcATCCCCTAGAGATATAGGAAAAGGCACTACATCTTCGGCTGTACAAACTGTATCGACATCAACTAATACTACCACCACCGCTGTTAATAAAACAAATAGTTATATTAAGAATTGTTTAATACGTAGCAGTAGTTGCAGCAATACTACCAATATAACGTCACTGGCTCAGATAATGAGCAATAGTAGTACAACAATTAATAACAACAACGGCAGCAATAACAACAGTAACAGCAACAACAGTGTAACTTCCTTAACCCTTAATAGCAGTAACAACAGCGGTAGCagcaataacaacaacaatgtaaatcaactttgcaacaacaacaacacaaataccaacaacaacaacagtTGTAATAGTAATTTCAGTTCTAGCAGCAACGACAGTTGTTTCAGTTATAGCAGTAATAGTAGTAGTGGTAATTCTGTTGCACGTAGTATTACATCGTTGAGTCACGGTAGCCGAAAAGTTCCTGGTCCATTAACAACAAATCCACCGAAAATCTTAAAGAAAAGCCGTTCAAAAATATCATCACCCAGTCGTCACGGTCCACAACAGTGTCAGatttgtaataaaatttttggaaatgCATCAGCTTTGGCCAAACATAAACTGACACACAGTGACGAGCGGAAATACGTGTGTGTTATGTGCTCAAAGGCATTTAAGCGACAAGATCATTTAAATGGACATATGATGACACATAGAAATAAAAAACCATATGAATGTAAAGCTGAAGGTTGCGGCAAATCATATTGTGATGCTCGTTCATTAAGAAGACATACAGAAAATCATCACGCTGGCATAATAACACCACAAAATCAACAACTCtcaataattaataataattcCAATTCCAATTTAAGTTTATCCCCTGCTACAGCAAATGGAGACGCTAGTTCACCAGATGGTGCCACATGTTTAGGTACTTATTTATCAAATGGTGGTACAGTAGTCGATGCTGCTACTGGTTTAGCTCTGACCGAAGAAGAATTAAAAGCTTTAAATGTTCCCCTTAAAACCGGAGTAACTTTATTGTCTCCTACATCCACGACTTCCTCAATGTCGTCCTCGAGTAGTATTTCTTCAGGCCCAGGGGCAACAATAACCCTTACCGATAATAGCGGTAATTTAGATGGAGAAGGTTTAACAAGAGAACAATTGGATTTGATAAGTAAAATAATGCGTCAAACAAAACAGACAACAGCTCAAGTGACAGTTTCATCACCTACCAGTTCACAATCGTATAAAATAGATACAAATCCCCAACCCACGGCACAAACACAAACTCAAAACCCTAGGCCTAGAACCTGGAATATGCAATTGCTTAATTCCTCTCAAAATGTTGCCATAACTGTAGATGAAATGTCCACAGATAATACAAATGATTCCTCTTCTATGTCATCAATAACCACTACTCAATCCAAAATAAAAGAAGAAGAAATTGAAATTGATTTATCAAATGCCATTAATTCCAATCTAtttaatttagttaaaattgatCAAAAGCCTGTAGAATGCAATTTATGTCATCGCAAATTTAAGAATGTACCCGCCTTAAATGGTCACATGCGTTTACATGGTGGTTATTTCAAAAAAGATCCCGAAACTAAAAGAAATGAGAAAAAAGAAAATAGTGGCCCTCCCTTGCAGACGGCTAGTATTGGTGTCAGAGCTTTGATTGAGGAGAAAATAATAAGCAAGCGAAGTAAAGATTTAAACAAGGGTGCCTTTGTAGTTCCTGCGCCACCATCAAATACTACTCAAAACAATGCATCAACCTTACGACGATCCATTAGTGATTTGGATAGTTTCCTAAATCCCAAGACGCAACCGAACAGTACAACACAACTGCAACAAAATTCCACACAACAATTACCAGCAGCTTCTACTATAAAAAATGGTTCTAAAACCAATATAAATGTACAAGATATTAACTTGCCACAAAGTATAGAAATCTATAGTACgaaacaacaacagcaacaaatgcagcagcagcaacaacaaaaGACAATGAATAATATAGGAGTTGGAACAAGTACCAACTCCCAAAATTCGGAACGCAATAATTCAACGAAAACATCCCTAACTACTACCACAAATACAACATCAGCAACGATTAATACAACGACGACACGTAGTACATCAACCGATCCAAAAGATTCTACTTTGATAGAATTACTTAAACGGGGAACACGCATAGCAGTAACCCAAAAACAACCAAATAATAATACTCCGCTTGGTGGAGTAACCCGCCAGATTAtaaccaataaaaataattgcaGTGTTATTATACCCTCAGAAGTACAAGTAGTCTCTACCAAGGGAAAAATGAAGAAGGAAGAACAACTACAAATGTCTAATTCGACAAATGTCACACTACCCGATGGTACTCCCCTATCATTGACTATAGCCCAAGGAGCCGATAGTAATAGTGAGGTGTATACGGTAACCTATACCAGTGATGGCTCGGCCTTATTTGGCGAATCTGAGGTTTATAATGTTAGTGAGGCTGAAATGTTATTACAAACTGTAGATACCATGCAATTGCTGAATGAAGCTGGAGATCAATTGAAATCTGAACATTCCGAACAATTTGAGGTTATGgataataaaattaaattggAAATTGAACAGCAAAATTGTGTAGAGCAACAGCAACATCAGCAAAATCAACAATCTAACAATAATTGTCAAACTACACAAACTTTACCAAATTTCCAACATTTCCATTCCAAAGAATTGATAATACAAAATCCCGCTATGCTACAGCATCAGCAATTAAGATCAAATACCCTAACTTTGCCACAGGATAtgaaaaatcaatttaattCCAATCTAAATTCTCCAATGCATTCACCTCTGGCATATCCCACACCACCGTCTAGTCATGAAAATGTTACCCAAACTTCACCGTATATAGAGGAGAATCATCATTTTAATGATACACAAAATATATTCTTTAATGAAGCGTTAATGTCTGCCAATAATAATGGAGATTCCGAAAATGATAAGATCTTGAAATTGAAAAGTGTCTTAGAAGATAATTCTTTTGATTCAAATATAAAAGTAGAAGATTTATTAAATGGCACTGATCCAGATACTGAATGTGATTTAAGAGAATTTGCCGAAGCAAATTTATCATTTCTGGATGAAGATCAAGAATTTCTAAATGATTCTCGTAATGCCACTTCACCACTATCGGAATCATTTTTTACTAGTGGCATAGGATCGGCCGAAGAAGTTAAGGAAGTATTGCGGGAGGTCTTAACAGAAGATCagataaatttaaattgtgaaaATCAGGGAGAAAATATTATAGATTTATATTATTTACCCGGTTTAAGTTTACAATCACAAATGATGCCCAATTCCGAAGATCCTTTATTATCTTCATCACCCCGGGATTTTGGTCAACAAAAGATACAACAAAATCCAATTCAACAgcaacaacagcagcagcagcaacaacaacagcaaatCCAACACATTCCTCAACAGcagcaacagcaacaacaaGTCCAAATCCAACAACAAAATATTCAATATCAAAATTCACAAATCCTGAATAATAATCAACAGCAATCTGGTCAAACAGTTAATATTGCACTGGATTCAAACTCACACTCCGCAGAAATGAATCAATTGATTTTGAATATACCCGCTAATGCTTTACAAAACTCATCCAATTCTAATTCCTCTACCACAACTTCAACTTTACACTATAATGTACAAAATTTACCACAAGTACAAAATCATTTAAATAATACTAATACTCTtcagcaacaacaacaacaacaacaatttatgGCTTCCTCAACCATAAATTCCAACAATATAAATTCACTTAATGAGGCCTTAATGCAGCCTATAATATATACAAGTGGTACCACCGATAAAATGGAAATAAAGTTAGATAACCACACAAATTCCCAACAAAATggacaaattttaaataatctaAATAAAACCCTAGATATGGTGAAGCACACTTCCTCTCACATAATCTTCTCACAGCATACATCCCACAATAATGCTACTAATTCATCAATTTCCAATACTAATAATAATTCCTTATCTTTAATAACTTCCTCTACCCTACAACCTTTATCTAATCAAACTAACTCCATATTAAAACGACGTTTGAAAGGTCATTCCTCATTGGATTCTGCTTCCTCACATTCTTCTTATTCCAAATATCAAGCTTTATCACCTTATAAATCTAAATTACGCAAACCTTCTCGTACCCACTATACACCCGCTCCAATTTTGAATCCTGAACGTAAAGGTTATGGTTTATATTGTAATGTTTTAAAACAATTAGGCTGCTCTTTATTAACTTTCGATAATTTCGATGATGATTTTGATGATCCCGTGGGTTTGGTAGATTTCTCCGATGAATCAAAAGTTAATCTGGGTTCTGCTTATCAAGCATCTATCCCTGCATTTATTGAATCCTCCACATGTATAGTAGAAGATCACATCGGTAGTGATCTTATGTGGAATCCTGAAGTCCAGAGGGATGATAAGATCCTAATGAGATTTATTGATTT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- Protein Sequence
- MCSASVGTEASVTLQLRDVNSNDSSNQSSSATTVVTSATGNTHHHHHHTATGTTTLDNALTIGYPDPEMLADVLGTLQTASLKNTNPSGESTKQNSSKLPNTSDISNTNLNGSIKNRITISKRSSNIISNSQNTSNIISSSNSNNNNNSSPRDIGKGTTSSAVQTVSTSTNTTTTAVNKTNSYIKNCLIRSSSCSNTTNITSLAQIMSNSSTTINNNNGSNNNSNSNNSVTSLTLNSSNNSGSSNNNNNVNQLCNNNNTNTNNNNSCNSNFSSSSNDSCFSYSSNSSSGNSVARSITSLSHGSRKVPGPLTTNPPKILKKSRSKISSPSRHGPQQCQICNKIFGNASALAKHKLTHSDERKYVCVMCSKAFKRQDHLNGHMMTHRNKKPYECKAEGCGKSYCDARSLRRHTENHHAGIITPQNQQLSIINNNSNSNLSLSPATANGDASSPDGATCLGTYLSNGGTVVDAATGLALTEEELKALNVPLKTGVTLLSPTSTTSSMSSSSSISSGPGATITLTDNSGNLDGEGLTREQLDLISKIMRQTKQTTAQVTVSSPTSSQSYKIDTNPQPTAQTQTQNPRPRTWNMQLLNSSQNVAITVDEMSTDNTNDSSSMSSITTTQSKIKEEEIEIDLSNAINSNLFNLVKIDQKPVECNLCHRKFKNVPALNGHMRLHGGYFKKDPETKRNEKKENSGPPLQTASIGVRALIEEKIISKRSKDLNKGAFVVPAPPSNTTQNNASTLRRSISDLDSFLNPKTQPNSTTQLQQNSTQQLPAASTIKNGSKTNINVQDINLPQSIEIYSTKQQQQQMQQQQQQKTMNNIGVGTSTNSQNSERNNSTKTSLTTTTNTTSATINTTTTRSTSTDPKDSTLIELLKRGTRIAVTQKQPNNNTPLGGVTRQIITNKNNCSVIIPSEVQVVSTKGKMKKEEQLQMSNSTNVTLPDGTPLSLTIAQGADSNSEVYTVTYTSDGSALFGESEVYNVSEAEMLLQTVDTMQLLNEAGDQLKSEHSEQFEVMDNKIKLEIEQQNCVEQQQHQQNQQSNNNCQTTQTLPNFQHFHSKELIIQNPAMLQHQQLRSNTLTLPQDMKNQFNSNLNSPMHSPLAYPTPPSSHENVTQTSPYIEENHHFNDTQNIFFNEALMSANNNGDSENDKILKLKSVLEDNSFDSNIKVEDLLNGTDPDTECDLREFAEANLSFLDEDQEFLNDSRNATSPLSESFFTSGIGSAEEVKEVLREVLTEDQINLNCENQGENIIDLYYLPGLSLQSQMMPNSEDPLLSSSPRDFGQQKIQQNPIQQQQQQQQQQQQQIQHIPQQQQQQQQVQIQQQNIQYQNSQILNNNQQQSGQTVNIALDSNSHSAEMNQLILNIPANALQNSSNSNSSTTTSTLHYNVQNLPQVQNHLNNTNTLQQQQQQQQFMASSTINSNNINSLNEALMQPIIYTSGTTDKMEIKLDNHTNSQQNGQILNNLNKTLDMVKHTSSHIIFSQHTSHNNATNSSISNTNNNSLSLITSSTLQPLSNQTNSILKRRLKGHSSLDSASSHSSYSKYQALSPYKSKLRKPSRTHYTPAPILNPERKGYGLYCNVLKQLGCSLLTFDNFDDDFDDPVGLVDFSDESKVNLGSAYQASIPAFIESSTCIVEDHIGSDLMWNPEVQRDDKILMRFIDLSKSSAVPLGSHSEEVALQTLLKAHGNTATAVLSLLQTQSNSFQMKWSSNELEIFLKGLEKHGKEFSKISKELGTKSTGECVQMYYFWKKLCVDYKVTHLKTETPPQNHANDPKPYVCEIPDCSASFSSKAALHGHTRIHTYGRNTHNNNQHNNNNANATSATNTNASSSQGSSAINPMQNNTQATTASNPKDANANKDNTEFPCKVCGK
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
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