Basic Information

Gene Symbol
ZNF541
Assembly
GCA_949748255.1
Location
OX456523.1:18462152-18478503[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 4e-10 1e-06 30.2 0.2 2 45 1726 1769 1725 1770 0.94

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTGCAGTGCATCAGTGGGTACTGAAGCATCGGTGACACTACAATTGCGTGATGTTAATTCCAATGATTCCTCAAATCAATCATCATCGGCAACAACAGTGGTTACATCAGCAACAGCAAATACccatcataatcatcatcataCAACAActggaacaacaacaacaacattggATAATGCATTAACCATCGGTTATCCAGATCCAGAAATGTTGGCAGATGTTTTAGGTACATTACAAACAGCATctttaaaaaatacaaatcccAGTGGTGAGAGTACAAAACAAAATTCCTCCAAATTAACAAATACCAGCGATATTTCCAATGTCAATTTAAATGGTTCGATTAAAAATCGTATAACAATTAGTAAACGCTCCtcgaatattataaataattcccAAAATACCAGTAACATTATtagcagcaacagcaacagcatCAACCAGAACAACAATACATCCCCTAGAGATTTAGGAAGAGGCACTACAACTTCGGCTGTACAAACTGTATCGACATCAACGAATACTACCACCGCTGTTAATAAAACCAATAGTTATATTAAGAATTGTTTGATACGTAGCAGTAGTTGCAGCAACACTACCAATATAACATCATTGGCTCAGATAATGAGCAATAGTAGTACAACAATTAATAATAACGGCAACAATAGCAGCAGTGGcggcagcaacaacaacagtgTATCTTCCTTAACCCTTAATAGCAATAACAACAGCATCAGTAgtagcagcaacaacagcaacaatttaacccaaattagcaacaacaacaacaacacaactaacaacaacaatagttgTAATAGTAATTTCAGTTCTAGCAGCAACGACAGTTGTTTCAGTTATAGCAGTAATAGTAGTAGTGGAAATTCTGTTGCACGTAGCATTACATCGTTGAGTCACGGTAGCCGAAAAGTTCCTGGTCCATTAACAACAAATCCACCGAAAATCTTAAAGAAAAGCCGTTCAAAAATATCATCGCCCAGTCGTCACGGTCCACAACAGTGTCAGatatgtaataaaatttttggaaatgcaTCAGCTTTGGCCAAACATAAACTGACACATAGTGACGAACGGAAATACGTGTGTGTTATGTGCTCAAAGGCATTTAAGCGACAAGATCATTTaaatggaCATATGATGACACATAGAAATAAGAAACCATATGAATGTAAAGCTGAAGGTTGTGGCAAATCATATTGTGATGCTCGTTCATTACGAAGACACACTGAAAATCATCACGCTGGCATAATAACACCACAAAATCAACAACTCTCAATAATCAATAATAATTCCAattcaaatttaagtttatCCCCTGCTACAGCAAATGGAGATGCCAGTTCACCAGATGGTGCCACTTGTTTAGGTACTTATTTATCAAATGGTGGTACAGTAGTCGATGCTGCTACTGGTTTAGCGCTAACCGAAGAAgaattaaaagctttaaatgtTCCCCTTAAAACTGGTGTAACTTTATTGTCACCCACGTCCACAACTTCTTCAATGTCATCCTCGAGTAGTATTTCTTCAGCCCCCGGGGCAACTATAACACTTACCGATAATAGTGGTAACTTAGAGGGAGAAGGTTTGACCAGAGAACAATTGGatttaataagtaaaataatgcgacaaacaaaacaaacaacagCTCAAGTGACCGTGTCATCACCTACTAGTTCACAATCGTATAAAATAGATACAAATCCCCAACCCACGGCTCAAACACAAACTCAAAACCCTAGGCCTAGAACCTGGAATATGCAATTGCTTAATTCCTCTCAAAATGTTGCCATAACTGTAGATGAAATATCCACGGATAATACAAATGATTCCTCTTCTATGCCATCGACCACCACTACTCAAgccaaaataaaagaagaagaaattgaaattgatttatCCAATGCTATTAattccaatttatttaatttagtaaaaattgatCAGAAACCTGTCGAATGTAATTTATGTCATCGAAAATTCAAGAATGTACCCGCCTTAAATGGTCATATGCGTTTACATGGTGGTTATTTCAAAAAGGATCCTGAAACTAAGAAAAGtgagaaaaaagaaaacagtgGTCCTCCCTTGCAGACGGCTAGTATTGGTGTCAGAGCTTTGATTGAGGAGAAAATTATAAGCAAACGAAGTAAAGATTTAAATAAGGGAGCCTTTGTAGTTCCAGCACCACCATCAAATAGTACTCAAAATAATGCAGCTGCCATACGACGCTCCATTAGTGATTTGGATAGTTTCCTTAATCCCAAGACACAACCAAACAGTACAACaacacaacagcaacaacaaaattccACACAACAACTACCAGCAGCTTCTACCATTAAAAATGGTTCTAAAACCAATATAAATGTACAAGATATTAATTTGCCACAAAGTATAGAAATCTATAATACgaagcagcaacaacaacaaatgcagcagcagcaacaaaagACAATGAATAATATAGGAGTTGGAACCACTACCAACTCTCTTAATTCGGAACGTAATAATTCAACGAAAACATCCCTTACAAATACCACAAATACAACAGCAGCAACGATTAATACAACGACAACACGTAGTACATCAACCGATCCAAAAGATTCTACTTTGATAGAATTACTTAAACGGGGAACACGCATAGCAGTTACCCCAAAACAACCAAATAATAATACTCCCCTGGGTGGAGTTACCCGCCAGATTAtaaccaataaaaataattgcagTGTCATTATACCCTCAGAAGTACAAGTAGTCTCTACCAAGGGGAAAATGAAAAAGGAAGAACAATTACAAATGTCTAATTCGACAAATGTCACACTACCAGATGGTACTCCTCTATCATTGACTATAGCCCAAGGAGCCGATAGTAATAGTGAGGTATATACCGTTACCTACACCAGTGATGGTACGGCTTTATTTGGAGAATCTGAAGTTTATAATGTAAGTGAGGCTGAAATGTTACTACAAACTGTAGATACCATGCAATTGCTAAATGAGGCTGGAGATCAATTAAAATCCGAACATTCCGAACAATTTGAGGTTAtggacaataaaattaaattggaaattgaACAACAACAAACTTGTGTAgatcaacagcagcagcagcatcatCAGCAACATCAACAAACCAACAATAATTGTCAAACTACACAAACTTTGCCAAATTTCCAACATTTCCATTCCAAAgaattaataatacaaaatccAGCTATGCTGCAGCATCAGCAATTAAGATCAAATTCCTTGACCTTGCCACAGGatatgaaaaatcaatttaattctaatttaaattctCCAATACATTCACCTTTGGCATATCCCACACCACCCTCTAGCCATGAAAATGTTACCCAAACTTCACCCTATATAGAAGAGAATCATCATTACAatgatacacaaaatatattctttagTGAATCGTTAATATctaccaataataataataataatcaaaattcCGATAATGATAAGATCTTGAAATTGAAAAGTGTTTTAGAAGATAATTCCTTTGATTCAAATATAAAAGTCGAGGATTTATTAAATGGCACTGGTCCAGATACTGAATGCGATTTAAGAGAATTTGCCGAAGCAAATCTATCATTTCTCGATGAAGatcaagaatttttaaatgattctcGTAATGCTACCTCACCATTATCGGAATCATTTTTCACTAGTGGTATAGGATCGGCCGAAGAAGTTAAGGAAGTATTAAGGGAGGTATTAACAGAggatcagataaatttaaattgtgaaaatcAAGGAGAAAATATTAtagatttatattatttaccCGGCTTAAGTTTACAATCACAAATGATGCCCAATTCCGAAGATCCTTTATTATCTTCATCACCCCGAGATTTTGGTCAACAAAAGATACCACAAAATCCtatgcaacaacaacagcagcaacaacaaatccAACACATTCCTCACcaccagcagcagcagcagcagctacAACAGCAAatccaacaacaaaatatacaatatcataATTCCCAAACCCTTAATAATAACCAACAGCAACAACCTGGTCAAACAGTTAAAATTGCATTGGATTCAAACTCACAGTCGGCAGACATGAATcagttgattttaaatttacccGCTAATGCTTTACAAAACACCTCCAATTCTAATTCCTCTACAACAACAACTACTTTACActataatgtacaaaatttaccaCAAgtacaaaatcaattaaataatactaataatcttcagcagcaacaacaacaacagcaacaacaatttatGGCTTCCTCAACCATAAATGCCCATAATATAAATTCACTTAACGAGGCCTTAATGCAGCCTATAATATACACTAGTGGTACCACCGATAAAATGGAAATAAAGTTAGATAACCACACAAATTCCCCACAAAatggacaaattttaaataatctaaataAAACCCTAGATATGGTGAAACACACTTCCTCTCACATAATCTTCTCACAGCAAACATCCCACAGCAATGTGACTAATACATCAACTTCCAATACTAGTAATAATAATTCCTTTTCTTCAATAAATTCCTCTACCCTCCAACCTTTATCCAATCAAACTAACTCTATATTAAAACGTCGTTTGAAGGGTCACTCCTCATTGGATTCTTCTTCCTCACATTCTTCTTATTCCAAATATCAAGCTTTATCACCCTATAAATCAAAACTACGTAAACCTTCACGTACCCACTACACACCAGCTCCAATTTTGAATCCTGAACGTAAAGGTCATGGTTTATATTGTtgtgttttaaaacaattagGCTGCTCTTTATTAACTTTCGATAACTTTGATGATGATTTTGATGATCCCGTGGGTTTGGTAGATTTCTCCGATGAATCCAAAGTTAATTTGGGTTCGGCTTATCAAGCATCTATACCTGCATTTATAGAATCCTCTACATGTGTAATGGAAGATTCCATCGGTAGTGATCTTATGTGGAATCC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Protein Sequence
MCSASVGTEASVTLQLRDVNSNDSSNQSSSATTVVTSATANTHHNHHHTTTGTTTTTLDNALTIGYPDPEMLADVLGTLQTASLKNTNPSGESTKQNSSKLTNTSDISNVNLNGSIKNRITISKRSSNIINNSQNTSNIISSNSNSINQNNNTSPRDLGRGTTTSAVQTVSTSTNTTTAVNKTNSYIKNCLIRSSSCSNTTNITSLAQIMSNSSTTINNNGNNSSSGGSNNNSVSSLTLNSNNNSISSSSNNSNNLTQISNNNNNTTNNNNSCNSNFSSSSNDSCFSYSSNSSSGNSVARSITSLSHGSRKVPGPLTTNPPKILKKSRSKISSPSRHGPQQCQICNKIFGNASALAKHKLTHSDERKYVCVMCSKAFKRQDHLNGHMMTHRNKKPYECKAEGCGKSYCDARSLRRHTENHHAGIITPQNQQLSIINNNSNSNLSLSPATANGDASSPDGATCLGTYLSNGGTVVDAATGLALTEEELKALNVPLKTGVTLLSPTSTTSSMSSSSSISSAPGATITLTDNSGNLEGEGLTREQLDLISKIMRQTKQTTAQVTVSSPTSSQSYKIDTNPQPTAQTQTQNPRPRTWNMQLLNSSQNVAITVDEISTDNTNDSSSMPSTTTTQAKIKEEEIEIDLSNAINSNLFNLVKIDQKPVECNLCHRKFKNVPALNGHMRLHGGYFKKDPETKKSEKKENSGPPLQTASIGVRALIEEKIISKRSKDLNKGAFVVPAPPSNSTQNNAAAIRRSISDLDSFLNPKTQPNSTTTQQQQQNSTQQLPAASTIKNGSKTNINVQDINLPQSIEIYNTKQQQQQMQQQQQKTMNNIGVGTTTNSLNSERNNSTKTSLTNTTNTTAATINTTTTRSTSTDPKDSTLIELLKRGTRIAVTPKQPNNNTPLGGVTRQIITNKNNCSVIIPSEVQVVSTKGKMKKEEQLQMSNSTNVTLPDGTPLSLTIAQGADSNSEVYTVTYTSDGTALFGESEVYNVSEAEMLLQTVDTMQLLNEAGDQLKSEHSEQFEVMDNKIKLEIEQQQTCVDQQQQQHHQQHQQTNNNCQTTQTLPNFQHFHSKELIIQNPAMLQHQQLRSNSLTLPQDMKNQFNSNLNSPIHSPLAYPTPPSSHENVTQTSPYIEENHHYNDTQNIFFSESLISTNNNNNNQNSDNDKILKLKSVLEDNSFDSNIKVEDLLNGTGPDTECDLREFAEANLSFLDEDQEFLNDSRNATSPLSESFFTSGIGSAEEVKEVLREVLTEDQINLNCENQGENIIDLYYLPGLSLQSQMMPNSEDPLLSSSPRDFGQQKIPQNPMQQQQQQQQIQHIPHHQQQQQQLQQQIQQQNIQYHNSQTLNNNQQQQPGQTVKIALDSNSQSADMNQLILNLPANALQNTSNSNSSTTTTTLHYNVQNLPQVQNQLNNTNNLQQQQQQQQQQFMASSTINAHNINSLNEALMQPIIYTSGTTDKMEIKLDNHTNSPQNGQILNNLNKTLDMVKHTSSHIIFSQQTSHSNVTNTSTSNTSNNNSFSSINSSTLQPLSNQTNSILKRRLKGHSSLDSSSSHSSYSKYQALSPYKSKLRKPSRTHYTPAPILNPERKGHGLYCCVLKQLGCSLLTFDNFDDDFDDPVGLVDFSDESKVNLGSAYQASIPAFIESSTCVMEDSIGSDLMWNPEVQRDDKILMRFIDLSKSSAVPLGSHSEEVALQTLLNAQGNTATAVLSLLQTQSNSFQMKWSSYELEIFLKGLEKHGKEFSKISKELGTKSTGECVQMYYFWKKLCVDYKVTHLKTETPPQNHANDPKPYVCEIPDCSASFSSKAALHGHTRIHTYGRNTHNNNQHNNNNNNNANATTATNTNASSSQGSSATNPMQNNTPATTASNPKDANANKDNTEFPCKVCGK

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_00893324;
90% Identity
iTF_00892673;
80% Identity
iTF_00717195;