Hcom008724.1
Basic Information
- Insect
- Hesperia comma
- Gene Symbol
- STAT5A
- Assembly
- GCA_905404135.1
- Location
- FR990039.1:1525341-1547504[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- STAT
- Domain
- STAT_bind domain
- PFAM
- PF02864
- TF Group
- Beta-Scaffold Factors
- Description
- STAT proteins (Signal Transducers and Activators of Transcription) are a family of transcription factors that are specifically activated to regulate gene transcription when cells encounter cytokines and growth factors. This family represents the DNA binding domain of STAT, which has an ig-like fold. STAT proteins also include an SH2 domain Pfam:PF00017.
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 47 3.2e-23 4.9e-19 70.0 0.0 1 81 838 924 838 928 0.92 2 47 0.00091 14 7.0 0.0 56 82 947 973 939 977 0.90 3 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 1001 1026 993 1030 0.91 4 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 1049 1074 1041 1078 0.91 5 47 0.0011 17 6.7 0.0 56 83 1097 1124 1089 1128 0.90 6 47 0.0011 16 6.8 0.0 56 83 1143 1170 1134 1174 0.90 7 47 0.0011 16 6.8 0.0 56 83 1189 1216 1180 1220 0.90 8 47 0.0016 24 6.2 0.0 56 81 1235 1260 1226 1264 0.91 9 47 0.00084 13 7.1 0.0 56 84 1283 1311 1275 1318 0.89 10 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 1396 1421 1388 1425 0.91 11 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 1444 1469 1436 1473 0.91 12 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 1492 1517 1484 1521 0.91 13 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 1540 1565 1532 1569 0.91 14 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 1588 1613 1580 1617 0.91 15 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 1636 1661 1628 1665 0.91 16 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 1684 1709 1676 1713 0.91 17 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 1732 1757 1724 1761 0.91 18 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 1780 1805 1772 1809 0.91 19 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 1828 1853 1820 1857 0.91 20 47 0.0011 17 6.7 0.0 56 83 1876 1903 1868 1907 0.90 21 47 0.0011 16 6.8 0.0 56 83 1922 1949 1913 1953 0.90 22 47 0.0016 24 6.2 0.0 56 81 1968 1993 1959 1997 0.91 23 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 2016 2041 2008 2045 0.91 24 47 0.0011 17 6.7 0.0 56 83 2064 2091 2056 2095 0.90 25 47 0.0016 24 6.2 0.0 56 81 2110 2135 2101 2139 0.91 26 47 0.0011 17 6.7 0.0 56 83 2158 2185 2150 2189 0.90 27 47 0.0012 19 6.6 0.0 56 82 2204 2230 2196 2235 0.92 28 47 0.0016 24 6.2 0.0 56 81 2242 2267 2232 2271 0.91 29 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 2290 2315 2282 2319 0.91 30 47 0.0013 20 6.5 0.0 56 82 2338 2364 2330 2380 0.90 31 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 2403 2428 2395 2432 0.91 32 47 0.0013 20 6.5 0.0 56 82 2451 2477 2443 2495 0.90 33 47 0.0016 24 6.2 0.0 56 81 2514 2539 2505 2543 0.91 34 47 0.0013 20 6.5 0.0 56 82 2562 2588 2554 2606 0.90 35 47 0.0055 84 4.5 0.0 56 81 2625 2650 2617 2654 0.91 36 47 0.0037 57 5.0 0.0 56 83 2673 2700 2665 2704 0.89 37 47 0.0013 20 6.5 0.0 56 82 2719 2745 2710 2761 0.90 38 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 2784 2809 2776 2813 0.91 39 47 0.0011 17 6.7 0.0 56 83 2832 2859 2824 2863 0.90 40 47 0.0016 24 6.2 0.0 56 81 2878 2903 2869 2907 0.91 41 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 2926 2951 2918 2955 0.91 42 47 0.0011 17 6.7 0.0 56 83 2974 3001 2966 3005 0.90 43 47 0.0016 24 6.2 0.0 56 81 3020 3045 3011 3049 0.91 44 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 3068 3093 3060 3097 0.91 45 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 3116 3141 3108 3145 0.91 46 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 3164 3189 3156 3193 0.91 47 47 0.0016 25 6.2 0.0 56 81 3212 3237 3204 3241 0.91
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGTTGCCGACGCGTTGCAGCCACGCGCCGCACGAGCTGTACACGTACATGCGGCGGTGCCTCGCGCTCGAGATGGAAGTGATCCAGAGCGCCATGGGAGCGCCCTATGTAGCCCAACCGCACACCGAGCGCAAGTATAGCGAGTTGATAACGGGGCTGCAGACGGTGCGGCAGAAGGTGAGCATGGCTGGCGAGGAGATCCGCAGCCTGCAGGCCAACATCGAGTCCTTCTCGCTGCAGTACCACGAGTGTTTGAAGCATAAGGGCCACGTGAGCTACCTGCAGCAGTCGGGCGGGCTGGGCGCGCCGGCGGAGCGCCGCGAGCTGGAGGCGCGCCTGCGCGGCCAGATCGAGGACATCGAGCGCCGGCTCAACGCGCTGCTGGAGGCGCGCCTGCGCGGCCAGATCGAGGACATCGAGCGCCGGCTCAACGCGCTGGTGAGTGCGTGTGCGCTGTGTCCGCTTTCGGACGTTGCACAGTCGCCTGCATTGATCACTTACACACGCACACATAGACCACTAACACATATGAGTGATACACACACATTGACTACCGAGCTGGAGGCGCGCCTGCGCGGCCAGATCGAGGACATCGAGCGCCGGCTCAACGCGCTGGTGGCGCAGATCAACCAGTCGCAGATGGAGCTGGTGGACCACATCAAGGAGAACATCGCCAACCTGCGCCAGCTGCAGAGCCAGGTGCTCGACGAGGAGCTCATCAAATGGAAGCGCGAGCAGCAGTTGAGCGGCAACGGCGTGCCGATGCAGTCGAACCTGAACACGATCCAGGAGTGGTGCGAGCTGCTGGCCGAGCTGGTGTGGAGCACGCGGCAGCAGGTCGGCAACGTGGCGCGCATCAACGGCAAGACCGCGGTGGAGCTGCGCCAGCCGCACCTCGCCGAGATGCTCGACGACATGGGCAAGCAGGAGTGGTGCGAGCTGCTGGCCGAGCTGGTGTGGAGCACGCGGCAGCAGATCGGCAACGTGGCGCGCATCAACGGCAAGACCGCGGTGGAGCTGCGCCAGCCGCACCTCGCCGAGATGCTCGACGACATGGGCAAGCAGGGGACGAGTAGGCTGGGGCTCCCGGTGTACCTGGACACGGTCCAGGAGTGGTGCGAGCTGCTGGCCGAGCTGGTGTGGAGCACGCGGCAGCAGGTCGGCAACGTGGCGCGCATCAACGGCAAGACCGCGGTGGAGCTGCGCCAGCCGCACCTCGCCGAGATGCTCGACGACATGGGCAAGCAGGGGACGAGTAGGCTGGGGCTCCCGGTGTACCTGGACACGGTCCAGGAGTGGTGCGAGCTGCTGGCGGAGCTGGTGTGGAGCACGCGGCAGCAGGTCGGCAACGTGGCGCGCATCAACGGCAAGACCGCGGTGGAGCTGCGCCAGCCGCACCTCGCCGAGATGCTCGACGACATGGGCAAGCAGGAGTGGTGCGAGCTGCTGGCCGAGCTGGTGTGGAGCACGCGGCAGCAGGTCGGCAACGTGGCGCGCATCAACGGCAAGACCGCGGTGGAGCTGCGCCAGCCGCACCTCGCCGAGATGCTCGACGACATGGGCAAGCAGGTGCGCCGCGCTCGCGCCACACGGCTGTCGGCGCAAGATAGATCGGCTCGACCGGTTTTGGTGAAACTTTTCTGGCTCCCGGTGTACCTGAACACGATCCAGGAGTGGTGCGAGCTGCTGGCCGAGCTGGTGTGGAGCACGCGGCAGCAGGTCGGCAACGTGGCGCGCATCAACGGCAAGACCGCGGTGGAGCTGCGCCAGCCGCACCTCGCCGAGATGCTCGACGACATGGGCAAGCAGGAGTGGTGCGAGCTGCTGGCGGAGCTGGTGTGGAGCACGCGGCAGCAGGTCGGCAACGTGGCGCGCATCAACGGCAAGACCGCGGTGGAGCTGCGCCAGCCGCACCTCGCCGAGATGCTCGACGACATGGGCAAGCAGGAGTGGTGCGAGCTGCTGGCCGAGCTGGTGTGGAGCACGCGGCAGCAGGTCGGCAACGTGGCGCGCATCAACGGCAAGACCGCGGTGGAGCTGCGCCAGCCGCACCTCGCCGAGATGCTCGACGACATGGGCAAGCAGGAGTGGTGCGAGCTGCTGGCCGAGCTGGTGTGGAGCACGCGGCAGCAGGTCGGCAACGTGGCGCGCATCAACGGCAAGACCGCGGTGGAGCTGCGCCAGCCGCACCTCGCCGAGATGCTCGACGACATGGGCAAGCAGGTGCGCCGCGCCCGCGCGACACGGCTCCCGGCGCAAGATAGATCGGCTCGACCGGTTTTGATGAAACTTTTCTGGCTCCCGGTGTACCCGGACACGATCCAGGAGTGGTGCGAGCTGCTGGCCGAGCTGGTGTGGAGCACGCGGCAGCAGGTCGGCAACGTGGCGCGCATCAACGGCAAGACCGCGGTGGAGCTGCGCCAGCCGCACCTCGCCGAGATGCTCGACGACATGGGCAAGCAGGTGACGAGCCTGCTGTCCACGCTGGTGACGTCCACCTTCGTCATCGAGAAGCAGCCGCCGCAGGTCATGAAGACCAACACACGGTTCACGGCGACCGTACGCCTGTTGGTGGGCGGGCAGCTCAACGTGCACATGACGCCGCCACGAGTCACGGTGGTGATAATATCGGAGCAGCAAGCCCAGCTGCTGATGAAGTCTGACGCGGGCGGCGCGCGCGGCAAGCAGCCGACCGAATGTGGCGACATCCTGAACAACAGCGGCTGCATGGAGTACCAGCCCACGTCGCGGCAGCTCAGCGTCAGCTTCCGGTGGGTGTGGGTGTGGTTGCTAGGCAACGGTGTGTTGGCGCCGAGCTCTGGAGTGTTCTATGTGTGGATCGGTGGCGACATCCTGAACAACAGCGGCTGCATGGAGTACCAGCCCACGTCGCGGCAGCTCAGCGTCAGCTTCCGCTCAGCGTCAGCTTCCGGTGGGTGTGGTTGGTGGTTGCTAGGCAACGGTGTGTTGGCGCCGAGCTCTGGAGTGTTCTATGTGTGGATCGGTGGCGACATCCTGAACAACAGCGGCTGCATGGAGTACCAGCCCACGTCGCGGCAGCTCAGCGTCAGCTTCCGGTGGGTGTGGGTGTGGTTGCTAGGCAACGGTGTGTTGGCGCCGAGCTCTGGAGTGTTCTATGTGTGGATCGGTGGCGACATCCTGAACAACAGCGGCTGCATGGAGTACCAGCCCACGTCGCGGCAGCTCAGCGTCAGCTTCCGGTGGGTGTGGGTGTGGTTGCTAGGCAACGGTGTGTTGGCGCCGAGCTCTGGAGTGTTCTATGTGTGGATCGGTGGCGACATCCTGAACAACAGCGGCTGCATGGAGTACCAGCCCACGTCGCGGCAGCTCAGCGTCAGCTTCCGGTGGGTGTGGTTGCTAGGCAACGGTGTGTTGGCGCCGAGCTCTGGAGTGTTCTATGTGTGGATCGGTGGCGACATCCTGAACAACAGCGGCTGCATGGAGTACCAGCCCACGTCGCGGCAGCTCAGCGTCAGCTTCCGGTGGGTGTGGTTGCTAGGCAACGGTGTGTTGGCGCCGAGCTCTGGAGTGTTCTATGTGTGGATCGGTGGCGACATCCTGAACAACAGCGGCTGCATGGAGTACCAGCCCACGTCGCGGCAGCTCAGCGTCAGCTTCCGGTGGGTGTGGTTGCTAGGCAACGGTGTGTTGGCGCCGAGCTCCGGAGTGTTCTATGTGTGGATCGGTGGCGACATCCTGAACAACAGCGGCTGCATGGAGTACCAGCCCACGTCGCGGCAGCTCAGCGTCAGCTTCCGGTGGGTGTGGGTGTGGTTGCTAGGCAACGGTGTGTTGGCGCCGAGCTCTGGAGTGTTCTATGTGTGGATCGGTGGCGACATCCTGAACAACAGCGGCTGCATGGAGTACCAGCCCACGTCGCGGCAGCTCAGCGTCAGCTTCCGGTGGGTGTGGTTGGTGGTTGCTAGGCAATGGTGTGTTGGCGCCGAGCTCTGGAGTGTTCTATGTGTGGATCGGTGGCGACATCCTGAACAACAGCGGCTGCATGGAGTACCAGCCCACGTCGCGGCAGCTCAGCGTCAGCTTCCGGTGGCGGCTGCATGGAGTACCAGCCCACGTCGCGGCAGCTCAGCGTCAGCTTCCGGTGGGTGTGGTTTGCTAGGCAACGGTGTGTTGGCGCCGAGCTCTGGAGTGTTCTATGTGTGGATCGGTGGCGACATCCTGAACAACAGCGGCTGCATGGAGTACCAGCCCACGTCGCGGCAGCTCAGCGTCAGCTTCCGGTGGGTGTGGGTGTGGTTGCTAGGCAACGGTGTGTTGGCGCCGAGCTCTGGAGTGTTCTATGTGTGGATCGGTGGCGACATCCTGAACAACAGCGGCTGCATGGAGTACCAGCCCACGTCGCGGCAGCTCAGCGTCAGCTTCCGGTGGGTGTGGGTGTGGTTGCTAGGCAACGGTGTGTTGGCGCCGAGCTCTGGAGTGTTCTATGTGTGGATCGGTGGCGACATCCTGAACAACAGCGGCTGCATGGAGTACCAGCCCACGTCGCGGCAGCTCAGCGTCAGCTTCCGGTGGGTGTGGGTGTGGTTGCTAGGCAACGGTGTGTTGGCGCCGAGCTCTGGAGTGTTCTATGTGTGGATCGGTGGCGACATCCTGAACAACAGCGGCTGCATGGAGTACCAGCCCACGTCGCGGCAGCTCAGCGTCAGCTTCCGGTGGGTGTGGGTGTGGTTGCTAGGCAACGGTGTGTTGGCGCCGAGCTCTGGAGTGTTCTATGTGTGGATCGGTGGCGACATCCTGAACAACAGCGGCTGCATGGAGTACCAGCCCACGTCGCGGCAGCTCAGCGTCAGCTTCCGGTGGGTGTGGGTGTGGTTGCTAGGCAACGGTGTGTTGGCGCCGAGCTCTGGAGTGTTCTATGTGTGGATCGGTGGCGACATCCTGAACAACAGCGGCTGCATGGAGTACCAGCCCACGTCGCGGCAGCTCAGCGTCAGCTTCCGGTGGGTGTGGGTGTGGTT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- Protein Sequence
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