Basic Information

Transcription Factor Domain

TF Family: CBF
Domain: CBF_beta domain
PFAM: PF02312
TF Group: Beta-Scaffold Factors
Description: Core binding factor (CBF) is a heterodimeric transcription factor essential for genetic regulation of hematopoiesis and osteogenesis. The beta subunit enhances DNA-binding ability of the alpha subunit in vitro, and has been show to have a structure related to the OB fold [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 3 0.0026 34 5.9 0.1 53 97 23 66 1 85 0.47

2 3 0.00077 10 7.6 0.1 50 104 86 139 61 144 0.71

3 3 0.00096 13 7.3 0.9 53 67 177 191 109 283 0.61

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	3	0.0026	34	5.9	0.1	53	97	23	66	1	85	0.47
2	3	0.00077	10	7.6	0.1	50	104	86	139	61	144	0.71
3	3	0.00096	13	7.3	0.9	53	67	177	191	109	283	0.61

Coding Sequence: ATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCTTACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCATACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCATACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCATACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCATACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCATACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCATACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCATACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCATACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCATACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCATACAAATATGCAATTAGCCTATGGTGCGGTGCATACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCAGACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCTTACAAATGTGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCATACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCATACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCATACAAATATTCAATTAGCCTATGATGCGGTGCATACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTACATACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCATACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCTTACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCATACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCATACAAATATGCAATTAGCCTATGATGCGGTGCAtacaaacaaatataataacttatttttagaTTATGTTAGAGATAATGGTGTTAAGTTAGAGATAATGGTGTTAAGTTAG
Protein Sequence: MQLAYDAVLTNMQLAYDAVHTNMQLAYDAVHTNMQLAYDAVHTNMQLAYDAVHTNMQLAYDAVHTNMQLAYDAVHTNMQLAYDAVHTNMQLAYDAVHTNMQLAYDAVHTNMQLAYDAVHTNMQLAYGAVHTNMQLAYDAVQTNMQLAYDAVLTNVQLAYDAVHTNMQLAYDAVHTNMQLAYDAVHTNIQLAYDAVHTNMQLAYDAVHTNMQLAYDAVHTNMQLAYDAVLTNMQLAYDAVHTNMQLAYDAVHTNMQLAYDAVHTNKYNNLFLDYVRDNGVKLEIMVLS

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2