Basic Information

Gene Symbol
TRERF1
Assembly
None
Location
scf7180000640591:10774-52521[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 3 2.3e+03 -1.7 0.0 6 22 1735 1751 1734 1762 0.83
2 2 1.2e-11 9.1e-09 34.8 0.2 2 45 1768 1811 1767 1812 0.93

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGCAACCATAAACTCGGTACCGAAAAGTATACACCTGCCGTTAGCTGGTCTCCCTGCGACGCCGCGTGTGCTCATGTGCAGTGCTTCAGTGGGCACGGAAGGTTCGGTTACTTTAAAATTACGCGATGCCAATTCATCGTCCTCGCCTTCGTCCGATTCCAATCAATCAGTGTCGACAGTCGCATCAAACGCTTCAAATGCAGTCAGCAGTTTGGATAATGCGTTAACCATTGGCTATCCGGATCCGGAAATGTTGGCTGATGTATTGGGCACTTTGCAAACGGCTTCCCTAAATAATAATAATCATTATCGTAGTAATGGTAATGAATGCAATAGCAAAGTGCAAATAAATAAATTAaacacaatcgtaacaacaggagcggcaacaccaacaacaacagcagcaacagcaacagcaacgacaattaacagtgataacaatcccaataatatcaataccaatcatggtaataatcaaaataacaatgttgcgaatactaataattgcattaacaacattaaaaacTGTGCGAATAATTTAAAAAGTCGTGTAACCATTAGTCGTCGTACCTCAAACGTAGCGCACAGTTCACAAACCCAAAAAGATTCCCCTAAATGTACGATAGCGGCCGCTGTTCAAACTGTATCcatctcaacaaataccaccaacaagactaacagttatattaaaaattgcttgatacgcagtagcagttgcaataataccaccaatattacatcattggctcaaataatgagcaatagcagttcgagtaacagcaacagcaacagcaacatcaacagcaacagcaacagtaacagcaacaacaataacaataacaacaacaataacaacaacaacagcaacagcagcagcaacaacaataataacgctagcagtacctttcaacaatttcaaagcagtagcaacagtaatttgtcatgcagcaatagcaacagcaattgcagcagtaacagtaactacagttcaaacagtaacgatagttgttttagtataactagtagcagcaatagcagcagtggcaacaTAAGTGTACGTTGTGCCCCCATTCCCTGTAATCGCAAAGTTCCTGTTTCATTAACAAATCCACCGAAAATACTGaaaaaaaaCCGTTCAAAACTATCTTCGCCTAGCCGTCACGGTCCACAACAGTGTCAGatttGCAATAAAATATTTGGAAATGCATCAGCACTGGCTAAACATAAATTGACGCACAGTGACGAACGGAAATACGTGTGTGTTATGTGCTCAAAAGCATTTAAACGGCAGGATCATTTAAACGGTCACATGATGACGCATAGAAATAAAAAACCATACGAATGTAAAGCTGAGGGCTGCGGTAAATCTTATTGTGATGCACGTTCCCTTCGTAGACATACCGAAAATCATCATGCTGGCGTTATAACCCCGCAAAATCAAAACTTATCATCTATTAACGTCAATTGTTCATCAGCAAATCTAAGTTTATCACCAGCTACCGCAAACGGGGATGCAAGCTCACCAGATGGTGCAACATGTTTGGGTACGTATCTTTCGAATGGCGGTACAGTGGTTGACGCTTCAACTGGTTTAGCTTTAACTGAAGACGAGGTGAAGGCTTTAAAGACCAATGTTACATTGCTATCACCCACCTCTACTCTTTCTTCTTCTTCGTCGTCGGCTAGTAGTATCGCCTCGACATCGACTGCAGCCACTATAACTTTAACAGATAGCGGTGGCAATATGGAGGGCGAAGGTCTAACCCCCGAACAGTTAGACTTGATTAGTAAAATTATGCGTCAGACTAAGCAAACAACAGCACAGGTAACCGTGTCCTCACACTCCAGTTCACAATCCTATAAAATCGACACATCACCGGCCCAGACGCAAACTCAGAATCCAAGACCACGAACCTGGAATATGCAATTGCTAAACACCACTCAGAACTTGGCCATTACCGTGGATGAGGTGTCCAATGATGCTATACCTCGCAATATAGATTCACCACTATTGGCCATGGACGCTAAAGAAGAGGAAGTCAAGATAGATTTGACTTCCGGCCTGAACTCCTCTTCGTTATTAAATGTAGTTAAAATTGATCAAAAGCCAGTGGAATGTAATTTATGCCATCGCAAATTTAAGAACACGCCGGCCTTAAACGGTCACATGCGTTTGCATGGCGGTTATTTTAAAAAAGATCCCGAGACTaaaaaaaGCGAGAAAAAGGAGAATAATGGTCCGCCCTTGCAAACAGCTAGCATTGGTGTTCGAGCCCTAATCGAAGAGAAAATTATTAACAAGCGAAGTAGAGATATAAATAAGGGTTCTTTTGCCGTACCTGCTCCGCCTACCAATAATTTAGCCAATAATCCGATCTTGCGGAGATCAATTAGCGATTTGGAAAATTTCCTAAGTTCTAAAAATCAGACAAGTTCTGGTAGTTGCATATCATCGAATCTGAACACGATGTCTACCCCTTCAGTCGCTTTTAAAAATAATAATAGAACTATGCTTAATGCCCAGGATATGGGTTTACCTCAGAGTATTGAAATCTTCAGTACCAAACAACAAAAACCAATGAATAATGTGAGCGTGGGAGTGGGCACGAATCTCACTCAGCTGAATAGCGGTGAATGCAGTTCAGTGACAACGACAGAAAAACCAGTAACAACGACGTTGAACACAACGACTTCTACAGGAACAACAACCCGCAGCACATCAACTGATCCAAAAGATTCCACTTTAATAGAATTACTAAAGAGAGGAACACGTATCGCTGTCACGTCCAAGCAAGCATCAAACGCGCCATTGGGTGGCGTGACGCGCCAAATCGTTAATACCACCACCACAACAAATTCTCCTTCAAGGGCAGTACTTATACCCTCCGATGTACAAGTTATTAATAACAAGGTAAAGCTGGCAACCACAACCCAAGAAATCGAGAATTCATTAAACAATTGCCCAGAATCCACTGGTATATCGCTAGCGCAAAGTTCCCCGTTGTCCTTGACATTATCGCAGAATGGAGATGTCAACGCAGAAGTGTACACTGTCACTTATGCCAGTGACAATTCTAATTTGTTTGAAGAAACTGAGGTTTACAATGTCAGTGAGGCCGAAATGCTATTGCAAACAGTAGACACAATGCAATTGTTGAATGATTCCAATCATGAAAACCTGCTCAAATCTTCTGAACATTCCGAACAATATGAAATTATAGATAATAATGGTCAAGTATTGCAGCCCTCTTGTCCAACGGATATTAATAATGGCTCAGAATGTAAGCAACAACAAATTTTGCCGAATTTTCAACATTTCCATTCCAAAGAACTACTAATGAATCCTTTAACTCAATCCAATGGAAGTTTAAACTCCTTGTCCATGCCATTAGTTGAAAGGAAACAACTTTATGGGAGGCTGAATTCTCCTTTGCATTCTCCATTAGCCTATCCGACTCCTCCCTCCAGCCACGAAAATGTTACTCAAACTTCTCCTTACGTAGACGATAATCAACAGTATGGCGAAACATCGAATGTCTTTTTTAGCGAATCGTTAATAAGTAACGCTTCAACAAGTGCAACTGGAGAAATGGAGAATGAAAAACTAACAAAGCTAGGAAATATTATGGGAGATAACAATTTCGATAATAATAATATTAAGATGGAGGATTTACTTAGTGATACCAATACGGATGCGGAACGTGATTTAAGGGAATTCGCCGAAGCCAATCTTTCATTTCTAGATGAGGAACAGGAGTTTCTAAATGATTCGGGCAACGCTGCGTCTCCGTTATCGGAGTCTTTCTTTAGCGGGGGCATAGGTTCAGTAGAAGAGGTGAAAGAAGTATTACGTGAGGTCTTAACCGAAGATCAAATACAAATCAATTGCGAAAGTCAATCAGAGAACATAATCGATTTGTATTACTTGCCTTGCTTAAGTTTGCAGTCACAAATGATGCCAAATTCGGAAGATCCGTTGCTGTCATCTTCACCTCGTGATTTTGGTCAGCAGAAATTGACTCAAACAGCAAATAATACAAGCCAACACATTCCTCACCAACAACAACCAAACCTAAATCCAAATGCCTCGACCAATACAAGCCAGAATCCATACCTGCAGAGTAATAAtgctgcgatttcagtacaactacaacaacagcagcagcagcatcagcatcagcagcagcagcaaccaccacaacagcagcaAGGCGTATTAAAGATGCAGCCACTGCAAACGCAACAAATGCCTTCAGAGATTAATCAGGTTATTGTAACAGTACCGGCCAATGGTTGTGGCAATACGGCCTCTATCATGCAGTACAATTTTCAAAACACACCGCAAGTACAAATTCCAACAAATACCCAGCAATATATTGACTCCGCCAATCAATCACATACACAAGCTAGCAATAGCACCAGTAGCAATAGAACAATAACAGCGCAGTTAAATGAGGCCTTAACGCAGCCCCTTGTTTACACAGGAACCACCGAAAGATCAGAAATGAAATTAATGCCAACACAAAATCACAACCGCCTTAATTTAAATATTGAGCAAAGGCAACAAGAGACCCAACAACGGTTGCAAATTACTGATGTCTTAAATAATTCTAATATTTATTATGGACAAATCGCGTCCAATGAGCAACAGCAAACGCCTCAGTATTGTCAGACGTCAAATGCGATGAATAGCACATCAGTGTTGACTACCATTCTACAGCCATTATCCAATCAAACTAATTCCATATTAAAAAGACGTCTAAGAGGGTATAATTCCTCGGATTCGGGCTCTTCTGGTTATCAGTTAAAGTTCCAAACTTTATCTCCGTACCGTTCTAAATTAAGGAAACCCTCAAGGACTCATTACACACCTGCTCCAATTTTAAACCCCGCCCGCAAAGGCCACGGTTTGTATTGCAACATTCTTAAGGAATCGAATGGTAATCTTTCAGCATTTGATGCCTTCGACGATGATTTCGAGGACTCAGTGGGCTTAGTGGATTTCTCAGATGTGTCTAAAGTTAATTTAGGATCAGCATATCAAGCTGCCATACCAATTTTTAAAGAGCGATCCGCATTAACAGCAATTGACGAGCCCGTAAAAGCGGAACTCATGTGGAATCCGGACATTCAAAGGGATGAAAATATATTGATGCGTTTTATAGATCTTAGCAAATCATCGGCGACGCCTTCGGGAAGTCATACAGAAGAAATAGCATTAAAGACACTGCTTAAATCCCATGGTAACACCGCTTCAGCAGTTTTAACTCTACTACAAACCCAGTCAAATCCATTCCAAATGAAATGGTCCGCTCAAGAATTGGAAACTTTCCTGAAGGGATTGGAGAAATATGGCAAGGAATTTAGCAAAATTTCCAAAGAGCTTGGTTCTAAAACAACTGGAGAATGTATACAAATCTATTACTTTTGGAAGAAGCTGTGTGTAGATTACAAGGTCACCCACCTAAAAACTGAAACACCGCCGGTCAACCACAGCAATGAAGTGAAACCATACGTATGTGAACAACCTGATTGCTCAGCGAGCTTCTCTTCAAAAGCTGCTCTGCATGGCCATACTCGCATACATACCTATGGTCGCAATAGCCACAATAATAATCACAGTGCCACTAATCCAAACGCTAACAACTCCTTACCCGGCTCGATCAGTTCAACTAGTGCATGTACCGCCTCATCTCAGGCACTTAGTCACTCAGTAAATTTAGTAAATAAAGATAACACCACTGCAACCAATACCAAAGATATCAACAACGATTTCCCCTGCAAGGTGTGCGGCAAAGTATTTAATAAAATCAAAAGTCGTAGCGCTCATATGAAGACCCATCGTGTACCGGAGAATGaaacaactgtacaaaatgctaatcaaaatcaaacacatcaacaacaacaacaacaacaaGCTAATAACCACTAA
Protein Sequence
MATINSVPKSIHLPLAGLPATPRVLMCSASVGTEGSVTLKLRDANSSSSPSSDSNQSVSTVASNASNAVSSLDNALTIGYPDPEMLADVLGTLQTASLNNNNHYRSNGNECNSKVQINKLNTIVTTGAATPTTTAATATATTINSDNNPNNINTNHGNNQNNNVANTNNCINNIKNCANNLKSRVTISRRTSNVAHSSQTQKDSPKCTIAAAVQTVSISTNTTNKTNSYIKNCLIRSSSCNNTTNITSLAQIMSNSSSSNSNSNSNINSNSNSNSNNNNNNNNNNNNNSNSSSNNNNNASSTFQQFQSSSNSNLSCSNSNSNCSSNSNYSSNSNDSCFSITSSSNSSSGNISVRCAPIPCNRKVPVSLTNPPKILKKNRSKLSSPSRHGPQQCQICNKIFGNASALAKHKLTHSDERKYVCVMCSKAFKRQDHLNGHMMTHRNKKPYECKAEGCGKSYCDARSLRRHTENHHAGVITPQNQNLSSINVNCSSANLSLSPATANGDASSPDGATCLGTYLSNGGTVVDASTGLALTEDEVKALKTNVTLLSPTSTLSSSSSSASSIASTSTAATITLTDSGGNMEGEGLTPEQLDLISKIMRQTKQTTAQVTVSSHSSSQSYKIDTSPAQTQTQNPRPRTWNMQLLNTTQNLAITVDEVSNDAIPRNIDSPLLAMDAKEEEVKIDLTSGLNSSSLLNVVKIDQKPVECNLCHRKFKNTPALNGHMRLHGGYFKKDPETKKSEKKENNGPPLQTASIGVRALIEEKIINKRSRDINKGSFAVPAPPTNNLANNPILRRSISDLENFLSSKNQTSSGSCISSNLNTMSTPSVAFKNNNRTMLNAQDMGLPQSIEIFSTKQQKPMNNVSVGVGTNLTQLNSGECSSVTTTEKPVTTTLNTTTSTGTTTRSTSTDPKDSTLIELLKRGTRIAVTSKQASNAPLGGVTRQIVNTTTTTNSPSRAVLIPSDVQVINNKVKLATTTQEIENSLNNCPESTGISLAQSSPLSLTLSQNGDVNAEVYTVTYASDNSNLFEETEVYNVSEAEMLLQTVDTMQLLNDSNHENLLKSSEHSEQYEIIDNNGQVLQPSCPTDINNGSECKQQQILPNFQHFHSKELLMNPLTQSNGSLNSLSMPLVERKQLYGRLNSPLHSPLAYPTPPSSHENVTQTSPYVDDNQQYGETSNVFFSESLISNASTSATGEMENEKLTKLGNIMGDNNFDNNNIKMEDLLSDTNTDAERDLREFAEANLSFLDEEQEFLNDSGNAASPLSESFFSGGIGSVEEVKEVLREVLTEDQIQINCESQSENIIDLYYLPCLSLQSQMMPNSEDPLLSSSPRDFGQQKLTQTANNTSQHIPHQQQPNLNPNASTNTSQNPYLQSNNAAISVQLQQQQQQHQHQQQQQPPQQQQGVLKMQPLQTQQMPSEINQVIVTVPANGCGNTASIMQYNFQNTPQVQIPTNTQQYIDSANQSHTQASNSTSSNRTITAQLNEALTQPLVYTGTTERSEMKLMPTQNHNRLNLNIEQRQQETQQRLQITDVLNNSNIYYGQIASNEQQQTPQYCQTSNAMNSTSVLTTILQPLSNQTNSILKRRLRGYNSSDSGSSGYQLKFQTLSPYRSKLRKPSRTHYTPAPILNPARKGHGLYCNILKESNGNLSAFDAFDDDFEDSVGLVDFSDVSKVNLGSAYQAAIPIFKERSALTAIDEPVKAELMWNPDIQRDENILMRFIDLSKSSATPSGSHTEEIALKTLLKSHGNTASAVLTLLQTQSNPFQMKWSAQELETFLKGLEKYGKEFSKISKELGSKTTGECIQIYYFWKKLCVDYKVTHLKTETPPVNHSNEVKPYVCEQPDCSASFSSKAALHGHTRIHTYGRNSHNNNHSATNPNANNSLPGSISSTSACTASSQALSHSVNLVNKDNTTATNTKDINNDFPCKVCGKVFNKIKSRSAHMKTHRVPENETTVQNANQNQTHQQQQQQQANNH

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_00750397;
90% Identity
iTF_00749955;
80% Identity
iTF_00749216;