Eten004195.1
Basic Information
- Insect
- Eristalis tenax
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_905231855.1
- Location
- HG993128.1:60127795-60135135[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- LRRFIP
- Domain
- LRRFIP domain
- PFAM
- PF09738
- TF Group
- Unclassified Structure
- Description
- LRRFIP1 is a transcriptional repressor which preferentially binds to the GC-rich consensus sequence (5'- AGCCCCCGGCG-3') and may regulate expression of TNF, EGFR and PDGFA [1]. LRRFIP2 may function as activator of the canonical Wnt signalling pathway, in association with DVL3, upstream of CTNNB1/beta-catenin [2].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 6 0.00021 2.9 7.7 15.8 119 264 6 151 1 165 0.36 2 6 0.00032 4.4 7.1 14.8 114 259 64 202 54 212 0.36 3 6 0.0021 29 4.4 23.0 114 267 120 273 111 326 0.71 4 6 9.4e-05 1.3 8.9 19.1 113 265 231 383 208 401 0.53 5 6 0.00023 3.2 7.6 19.8 113 256 315 458 290 473 0.32 6 6 0.0011 15 5.4 23.4 114 266 365 489 330 534 0.30
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCCCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAATCTCCAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAATCTCCAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAATCTCCAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGCCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCTAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGACTCAAGTCCCAAGTCTCAAGTCTCACGTCCCAAGTCTCAACTCTCAAGTTTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCATGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAATCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGCCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAACTCCCAAGTCTCAAATCTCAAGTCTCAAGTCTCATGTCTCAAGTCTCAACTCTCAACTCTCAAGTCTCAAGTCTCAATTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGACTCAAGTCTCAAGACTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAAGTCTCAGGTCTTGGAGGCGTGTACTAGAGCCATGGTCGAGTCCAGGATGGGAAATACAACCGACAAGCTTTTCATTCAAAGAATGTTACTCGAGAAGAGCTTGGCTATAATCTGGAAATCCTCGCCAATTCCGATAACGACTACAGACACAGGATACAGACGTAATATACGAGGGAGACAGCATTATGGTGCAGAGCCTGAAGTCTGCATACCCTCCGATGTTCGGAAGCATTCAAAAACCTGCTCAAGCGATGAGAACATATAG
- Protein Sequence
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
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_00672610;
- 90% Identity
- iTF_00672610;
- 80% Identity
- iTF_00672610;