Eliv000368.1
Basic Information
- Insect
- Empis livida
- Gene Symbol
- foxp1b
- Assembly
- GCA_963932195.1
- Location
- CAWVQG010000033.1:56822-102673[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- Fork_head
- Domain
- Fork_head domain
- PFAM
- PF00250
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- The fork head domain is a conserved DNA-binding domain (also known as a winged helix) of about 100 amino-acid residues. Drosophila melanogaster fork head protein is a transcription factor that promotes terminal rather than segmental development, contains neither homeodomains nor zinc-fingers characteristic of other transcription factors [1]. Instead, it contains a distinct type of DNA-binding region, containing around 100 amino acids, which has since been identified in a number of transcription factors (including D. melanogaster FD1-5, mammalian HNF-3, human HTLF, Saccharomyces cerevisiae HCM1, etc.). This is referred to as the fork head domain but is also known as a 'winged helix' [1, 2, 3]. The fork head domain binds B-DNA as a monomer [2], but shows no similarity to previously identified DNA-binding motifs. Although the domain is found in several different transcription factors, a common function is their involvement in early developmental decisions of cell fates during embryogenesis [3].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 3 1.4 1.3e+03 -0.3 0.4 19 51 70 102 65 126 0.85 2 3 6.3e-29 5.8e-26 90.6 0.3 2 81 1025 1098 1024 1105 0.94 3 3 0.52 4.7e+02 1.1 0.1 44 63 1802 1821 1777 1834 0.74
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGAAACGTCCATATTTACATATtgagcaacaacaacaacaacaactttTATACcaacaatataaatatcaacaaTTGGATTATGATTATCATCAAAATTatcaattaacaaaattacaacaaCATAAAGAAGAATtctatcatcatcatcagcagcagcaacagcaacaacagcagcagcattatcatcatcatcatcatcaatatcaacataataaattattttatgataatatacaattatcatatgaaaaaaattatccatattatttagatttaacaacaaaacaatTGGAATTAAGTGTACAACAGATACAAGAAcgtttacaattaaatttattacaacaaGCTCATAtcataaaacaacaaaaaactgaattaacaatatcaaaatctatattaaataaattatcatcatcatcatcatcatcatcatcatcatcatcatcaacaacaacaacaacaacaaaaacaaaaacaacatcTGCATCTGAATCATCAGCATCTGAATCATCaatattaacaacaacaagaacaacaacaactacaacattaattaataataataataataataataataataataataataaattagaaaaagaaaatttatttattaatgaaaatcaaaaatatttttatgtaaataataaaaaacatgaaaaatttattaaaaaacaaaaagaattatataatcaaattgaaaataattcatcatatttattagaatttaataataatactaataataataataataataataataataataataataataaaattaaagaagaaattaaagaaaataatgatgattataataatataaataatgtagaagaattatataataataataataataataataataataataataataataataataataataatagtaatgatgataataataatttattaaatttaaataaaataaatattaaaattgaaaaaaatataaatgatgatgatgatttaattaataataatgatttaaatttcataaataatgaattaaataataataataataataataataataataatattataaataataaaaatttaaaaataaaaacaaaattaaatttatcaacaatGCAACTGCAACATCAATTAAGTGTACAACAACAGGAATTATTACAACAATTACAATTGGTACAACGTCAATATTTAATGCATCAAGGTATTGcattacaacaacaacaacaacaacaacagcaacagcagcaacaacaacaacaacaacagcaacaacaacaacattatcatcatcatcatcatcaacaacaacaccaGCAATCAATGAATTCACAATcagGTTTTATAAAACCACTTCAATTAGATTTTCAATCACAAATACACCGTGTAATGTCACCATTACATCATATGGCCGCAGCAGCAGTTGCATCACAACAGaatcaccatcatcatcataatcatcatcatcatcaaaattATCAGCAGCagcaccaacaacaacaacagcaacagcaacaacaacaacatcatcatcatcatcataatacTTATCATAATCAACAGACACAACAATTACAGGATACAACTAATCATCCAACATcgttatcatcatcatcatcgtcatcATCACCACCATCACCAaaaccaccaccaccaccaccaccatcacagcaacagcagcagcaacaacaacaacaacagcaacaacaattACCACAACAaacattatcatcatcatcatcatcatcatcaccaccACAATCACCAATATCAATAGTTACATCACagaaatgtaaaatttctaataataataataatataattgaagaTGATGAccatgatgatgatgatgatgatgatgataatgacgatgatgataatgatgatgataatgatgatgatcctttaattattaataataataatcataaatttcaaaatagtactagtaataattttaaaaataataatagtagtgataaaaataatgaaaatacaaatcaaaataatgataataataataataataataataataataataaaaataataatgataataatgataatagtaataacaataataatactaatagtaaaattataaaaactgatATTGATACAAATGATATTACATTTAAtgatgaattaataaataataataataataataataataatagtagaTCATCATCAgtaacaacaaatttaattgaaattaatggtGGCGCTAGTATAGTATCTAcatcacaacaacaacaaatttatgaTGATAATTCAAAtgataaatgtaataataatgataataataattgtaaatcaacaaataataattataatgataaaataaatataattaataatgaaaatgattatttattaacaaatcaAATAGATGGCGGTAATAGTAGTCATATTACTGCTATTGGTGGTAGTGGTGCTGTTGGTGGTATTACAATTGGTGGTAATAATGGTATTATTGGTAATACAACAATAACAGATACAATGAGTATAAATAGTGGTAGTCATTTAGATGATTATCCAATATCAAAtcaatttgataaatattatcatcCATTATATGCACATGGTATGTGTAGATGGCCGGGCTGTGAATTAATATTAGATGATGTATCCACATTTGTCAAacatTTAAATACAGAACATAGTTTAGATGATCGTTCAACAGCTCAGGCTCGTGTTCAAATGCAAGTTGTATCACAATTAGaaattcatttacaaaaaGAACGTGATCGTTTACAAGCAATGATgcatcatttatatttaacaaaacaattttcatcatcagagaaaaatgattataaggAAAATGATATACCATATATACCATGCCCGCcgaatttaacaaatttaacaaataatccAAATATGCCTGTATCAATTCGTTcaccaattttaaataatcaaaacatATCATCAATTAGAAAACGTATTAGTGATAAGACACCATTATCATTAGCTGgtggtCTACCATATATGTTAGAACGTGCTGGTTTAGATGTACAACAAGaaatacaAAGAAATcgtgaattttataaaaatgctgATGTTCGACCACCATTTACATATGCATCATTAATTAGACAatCTATAATTGAATCACCAGATAaacaattaacattaaatgaaATCTACAATTGGtttcaaaatacattttgttattttcgaCGTAATGCAGCTACTTGGAAgaatGCTGTACGTCATAATTTATCACTACACAAATGTTTCATGAGAGTTGAAAATGTTAAGGGTGCTGTTTGGACAGTAGATGaagttgaattttataaaagacgTCCACAAAGATCAACAGCAGCAGCTGCACTTTCAATATCTGGTAGTCCAACATTTGGATATGAAGATGATTTTGGTTCATTTTGGATGGTCGATGATAATGAATTTGTTAAAAGACGACATTTATCACGTGGTAGACCAAGAAAATATGAACCATCATCATCACCAAATTCACAAATATGTAATAGTCAACAAAGTACAGGTAGTAATAATGGTTGTGGTGgcaataataatagtaataataataataataataataacagtGGTGGTAACAATAATAGTggaacaaataataataatagtagtaGTGGAGGAGGAGGAGGAGTTGGAGGAGGAGGAGGAAATAATGGTGGtagtagtaataataataataatggtggtggaaattgtattaatggtagtggtggtggtggtaatgGTGGTGGTGTTGGTTCTAATAATATTGACGGTAGTAATAATGGTGGATTTGTATCATGCAACTTTCAATCACaGCCAACAAATGCCTTACTAATTGTTGAACCCACCTCATTATCTGATGGTATATTATTAGTTTCAAATTCTGAACAAGATATTATTAGTAATACCGGTACTAAATTaactagtaataataataataataataatttgagaaatagtaatggtaataataatattggatTAATTGGTAATGGAGGTGGAACTGGTAGTAGTAACAGTAATACTAATGGACATTATCTAgataaattagataatttggAAAGAAGTCTTGCTGCtgtattaattaaagttgCATATGGTACAACATCAACTACAAAACGTAGTATACCAGATAATAGTTATATACCAAGTTTAACAACAATAGCAACACCACCTTTAACAACATTaagatattccGAAAAATCACCacatcaacaacaaataaatttacatcatCGAAATTACGAATTAGATTTGGAAAGAGATCATGCACTGCCAACATCAGCACCAAATGCTGATATATTAAAAAGCAACAGTAATCCAACATATCCAAATCCAAATCGTCATCATAATCATGATCGTGATAGACATAGACATACATTAAATTCAACACCAGCACCTTCAAttcataatttacttaaaaaaggCCAACCAACTATACCAATGTATCCTGGTGATATTCCATCATATTCACCACCAGCTCGAGCATTTTTTACACCACCTCTACCACCTGAATATCAAAATCCTTTTGCTGATAAACCAACCCTACGTGGTACTAATAATGATGGtggtataattaataataatcctGGTAGTGTTAATGGTGGTGGAAATGGTGCTACTACAAGTAATGGTGGTAGTGTAAATGGAAATGGTGTTGTTAATCCATCATATATTAATCGTAGACCAATACCACCGCCTAGTTTAATGCCTGGTCATGAAAGAATACCTTATAGACCACCAGAATTAGGTAATCAAAATATTGGCGGTACTGGTAGTGAAATAATTGGATTACGTGGTGTTACAGTTGGTAATGGTGTATCTTTAGGCAATAGTGCATCTGGTCCTAGTGGTAATTATAGtggacaacaacaacaacaacagcaacaacgtAAAAAAGCATTAAATACGCCATCACAAAAAgctacaaataaaattgatcaaTATAAtgatggattaataaataataataataatagtttaacAAATGATTCTGGTAATactgatttaaa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- Protein Sequence
- MKRPYLHIEQQQQQQLLYQQYKYQQLDYDYHQNYQLTKLQQHKEEFYHHHQQQQQQQQQQHYHHHHHQYQHNKLFYDNIQLSYEKNYPYYLDLTTKQLELSVQQIQERLQLNLLQQAHIIKQQKTELTISKSILNKLSSSSSSSSSSSSSTTTTTTKTKTTSASESSASESSILTTTRTTTTTTLINNNNNNNNNNNNKLEKENLFINENQKYFYVNNKKHEKFIKKQKELYNQIENNSSYLLEFNNNTNNNNNNNNNNNNNKIKEEIKENNDDYNNINNVEELYNNNNNNNNNNNNNNNNNNSNDDNNNLLNLNKINIKIEKNINDDDDLINNNDLNFINNELNNNNNNNNNNNIINNKNLKIKTKLNLSTMQLQHQLSVQQQELLQQLQLVQRQYLMHQGIALQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHYHHHHHQQQHQQSMNSQSGFIKPLQLDFQSQIHRVMSPLHHMAAAAVASQQNHHHHHNHHHHQNYQQQHQQQQQQQQQQQHHHHHHNTYHNQQTQQLQDTTNHPTSLSSSSSSSSPPSPKPPPPPPPSQQQQQQQQQQQQQQLPQQTLSSSSSSSSPPQSPISIVTSQKCKISNNNNNIIEDDDHDDDDDDDDNDDDDNDDDNDDDPLIINNNNHKFQNSTSNNFKNNNSSDKNNENTNQNNDNNNNNNNNNNKNNNDNNDNSNNNNNTNSKIIKTDIDTNDITFNDELINNNNNNNNNSRSSSVTTNLIEINGGASIVSTSQQQQIYDDNSNDKCNNNDNNNCKSTNNNYNDKINIINNENDYLLTNQIDGGNSSHITAIGGSGAVGGITIGGNNGIIGNTTITDTMSINSGSHLDDYPISNQFDKYYHPLYAHGMCRWPGCELILDDVSTFVKHLNTEHSLDDRSTAQARVQMQVVSQLEIHLQKERDRLQAMMHHLYLTKQFSSSEKNDYKENDIPYIPCPPNLTNLTNNPNMPVSIRSPILNNQNISSIRKRISDKTPLSLAGGLPYMLERAGLDVQQEIQRNREFYKNADVRPPFTYASLIRQSIIESPDKQLTLNEIYNWFQNTFCYFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFMRVENVKGAVWTVDEVEFYKRRPQRSTAAAALSISGSPTFGYEDDFGSFWMVDDNEFVKRRHLSRGRPRKYEPSSSPNSQICNSQQSTGSNNGCGGNNNSNNNNNNNNSGGNNNSGTNNNNSSSGGGGGVGGGGGNNGGSSNNNNNGGGNCINGSGGGGNGGGVGSNNIDGSNNGGFVSCNFQSQPTNALLIVEPTSLSDGILLVSNSEQDIISNTGTKLTSNNNNNNNLRNSNGNNNIGLIGNGGGTGSSNSNTNGHYLDKLDNLERSLAAVLIKVAYGTTSTTKRSIPDNSYIPSLTTIATPPLTTLRYSEKSPHQQQINLHHRNYELDLERDHALPTSAPNADILKSNSNPTYPNPNRHHNHDRDRHRHTLNSTPAPSIHNLLKKGQPTIPMYPGDIPSYSPPARAFFTPPLPPEYQNPFADKPTLRGTNNDGGIINNNPGSVNGGGNGATTSNGGSVNGNGVVNPSYINRRPIPPPSLMPGHERIPYRPPELGNQNIGGTGSEIIGLRGVTVGNGVSLGNSASGPSGNYSGQQQQQQQQRKKALNTPSQKATNKIDQYNDGLINNNNNSLTNDSGNTDLNNMKNNGRVHIPNISRILSGSNGKKEDIPDILLQQVTNRPDLIGNNNNNNNKYLNINQNKFIENSKSLSTINNHDIIIDDITLKQQSSEEDNNNNNDENFDDLYNIQKNHNHDEPKTQLTIKMSIKSTENPLNINNNIYSTQIIHNLSSDKNFVTSSSLGPLSTSNTGNIINGHESIATAAASLPNNNNNNNNNKEIINNGKNNIGNGISSSSSTISSSSSSSSSSTTTTLTTTWDIAWNIHIYLSVILFTILELLLNLPSIFLTITFSILIIFLLIRSLNHKNNRYSSLIRPLTVVVGSSVHVGLCITLHYVENYTTNNLYNHYYYQQQQHQQQFIQLQLQQQQFLQQHQQLLNNQNHHTTTLQQQQQQQQQQQQILYRSINGINNDGIISTNINNNNNNNNINNNNLIINNIGRNSLPIQTQQPPRVLSLICQIIYIFVCLSLGLLYLYIYRLLKRVLRSKSQNYIHGYQNLSYAIHITIATSLLFILLAALQIFGAISIPTTRTLNINGILEIDWLQWGYQFSLRLIEISIIWLIGWVAGLKTGGGGGGNNNGNIIGNNGSNNGLSNNINNTNNILQRDKSNCNNDNRNISGFALFPCTSSSSQENFETDYPAICNANTNLHTYTKRTGKPIYDDNFTLNSIQNNTNIIQSSNGQQQQRILSNNNDFHQLQNNTDYVRTYTDTNSIRSDQHRHHLQIQNQQHHHQHSSKLDNEFNVDDDDDDDGDNDDDNNINNDGVGAGIIDNDDTIDHYENPNFELRCSKLNYHYQQQEQNQIDNCYSEPLNQHGYDFQNFERPHFQDRSNSRSSGGGGGNNSIDIEYHYNNNNHHHNNSTLNKHKHSTKLDRSNYDNTERRSSNSTHSCTSGRSGAATTNINNGINSIESVRYPIYNSFERRNNGVRKSGTLNNIGGIVHGRNGSSSSSSSVSNQQHNQHHHHHHHHRPSGVQTLSSGHRNSSGTGIINTTSIRNGILNSQNGIIGSNSSSSSKGGGGGGGGSSSSNGFYRNGNSTIAFQQQQQHMLPSDDEVILIGNSSASEKTNLLTNHCNSDGTTTINCGHNIGITSSISGGNLTNITAGSGGGGGGGGVGGSSSGIGSVALVSGGGSASSSGESANSGSMLVAEHGFVRFRALDDINNAQGVGIHNASIRTTGRNKEKRYTNNT
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
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- 90% Identity
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- 80% Identity
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