Basic Information

Insect: Empis livida
Gene Symbol: JARID2
Assembly: GCA_963932195.1
Location: OZ010647.1:53881714-53889328[+]

Transcription Factor Domain

TF Family: ARID
Domain: ARID domain
PFAM: PF01388
TF Group: Helix-turn-helix
Description: This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 1 8.7e-21 2.2e-17 63.4 0.0 8 89 1784 1863 1778 1863 0.90

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	1	8.7e-21	2.2e-17	63.4	0.0	8	89	1784	1863	1778	1863	0.90

Sequence Information

Coding Sequence: atggTGGTGTCAAAAGAAAAAGATGCAAAACGTAAAAGAAAAGAACCAATCATTGAATCACCAGAAATGCCGAAAAGaacCAAAGTGCAAGCGCAACGAAAATTCGCACAGGGACAACATGCTCCATCATCCTCATATTCATTTGCTGGTGGTAGTACTGCTTCAGGTGCATTAGCAGCAAGTACATCATCACAATCAATAGCGGGTGGTTCGGCGATACGTGAAAATCGAGAACCACCTCCAGAATTAATATCTAAAAGACCAAAACCTGAAGATTTTCTAacctttttatgttttcgcGGTACTCCAGTTCTGCCAACTAAACTAGATTTcctaaatcaaaataaaaatacaccaACTAAGAAAAATGATTCAACAAAGATAACAGATTCAGATGAAGtgcaaaagaaaaatgataGTCCTAAGACAAGAGCATCTACAAAtaggacaaaacaaaaacagtcAATTACACCTACAACAGCGACGGCAGTAGCAGTTACTACAACAGTttcaacaacagcaacaacaacaatttttagTTCTGATAAAAATGTTGCTAATATTAGTACAGAAAAAAATCTCGATTTAAAagacaataatataaaaattcaaaaaaaaaatgaaataattccATTTGCTGTTCGAAAGCGTGCTGAACAATCTGCTGAAGGTAACAAAACGgtgaaaaagaataaaaataaagggAAATCAATTACACCAGTTAAAGATAAAGAAGAAAATGGTCGAAGATCAACAAGAACGCGTGGTAAAACTAGTTTAGGATCTGATTTCAACGGTGATGCTGATAATActgaaattgataataataatgcgGAACAACAAGAtctaactaataaaatattaccacTAGCGGACGATATAGTTAATGAAGCcctacaaattgaaaatacgcCAAAAGATAAGCCATCAACAGTTAAAGGTAAACGAAAATCTGGTAttggacaaaaattaaatcaagaaATTGGTGTTGCTAGCGATGATGGTCATAAAAAAGAATTggagaaaattaattcaaatattcgATTAACTGAGCAACCGgcacttaataaaaaaattcccgGTAAACGAGGTCCTAAACcaaaagcaaataaaattgaaattgttccAGTTCCAGTGGTGGACACAGAAATTAAACAGGAGCTTGAACCAGTTGGTAGAATGACAAGGCAAAGAGCTTTTTTTGAACCAGTTAAAGTTCTACCAAAACCAGAAACATTCGACACAGAAGATACAAAAGTTTGTGATGAAATAAAAGaatgtgataaaaataatacattcaATGATAATGATCAAGTTGATTTCTCATCCGAAGATGAACAACCATTggcaaaaacaataaaattgacGTACGTAAAAAAATCACCGaagaaattaacaaaaaccTCTAGTAAAGATGAAACCCcaattagtaaaaaaacaaaaacatcatttattattgatgaaactgaacaaaaaaattctccAGAGATTGAAGCAGTACAATCAATATCAAAAGAGACAGGAAACAAATTATCaaagaaaaaatcaataaacaaAACTACTCCTAACCGagaaattaaaactgaaacaaaATTACCATCCCCAACTACAAAAATAACATCTAAACAAAGTACTACTAGTGCTGGTAAATTAGCTGTATCACAACAAGAAAAAGAACATGATTTCCAAATTGAAAATGCAAGTCGAAAATCTGatgtaagtttaaaattacaagaaaaacctaaaaaaaaaattacgaaaaaatcgaataaatttgacaaaaataaaaatgttgagtCAGAAGATGATTCATTTGGTAATGTAACAACAACTAAAATAacaccaaaaaagaaaactcgtAAAAAACAAGGAGCTGATGCAGATATATCACAACAATCTCAAACAGACGTTAGTGAAACAGATATTCGTACTGGTCGACCAACTAGAAAAACTAAAGAAGCTGCTACAATTTATATGGAGCTCATTGGACAGAAGTTAAATTTAGGTGATTTTGATGAAGATGATTTTTCAATGGATAGTTTTCCAGAGTTACCAAATGTTAAGGAAACACAAAAAATGGAAAcagaattaaagaaaaatgttggAAAACCAAAACCACCAcccatacaaaatataaaaattgataaagaaTCATCTAAAGAGGAAATTATTCCATTGATTACAGGTGATATTAGTGTGCGACAGCCTATTGCAGATGAATCAATCAACCAGGTATCACTTAAGATGGGTAAAAAACGCGGAccgaaaaagaaaatgaatataatacaTGATAGTAGTTCATCAAAAAAACTTTCCGCCAGCCAAAacaatgagaaaaaaaaatcaaaaaataaaaaattaaataaaaatcaacaaaataattttcttaacgAAGACTTTGATGTAGATAATAAGGAAACTAAacgaaaatttgaaaaaagttttagCGATTCCGATGATGAACCATTAGCaactaaattaacaaaaacaagtGAAAAAGATTTTGAATTATCGAAGAAATCagaatcaattaattttccaattcaaCAAACTGCGTTATCAAGTATTATCCCTTCCACCACAGGAACACCTGTAACTACTTGTGTAGTCACACAAACTATCACTAAACAATATgttgatatgaaattttcgCCTAGTCCGCAGACAACATCAACACCTAatcaaattgataataataaaatacaaaaaccaGAAGATcggcaattaaaattaataacaccACCAAATTTTGTACAAACAATAGCAAAATCACAAGTTAGAACACAACAAAATCCAAATATACCTTCAGGTCAATTAGTCCAACAACAACATTTGCATCATATACAAAAACCATCACAACAGCAACATCATACTCCTACAGCATTCGCACCACTTGAAAGTTATCCATCTCCAAAAATAAATCCAACATTTTTAACTCCAAAATTTGATAGAAATTTAGAGAGACGCTTACCTCCTAATACTTTAGATTCACCATTAAcagcacaaaaaaatttaagttttccaTCACCATCTGTGCAAGCATCAATAACAACACCACTtgctacaacaacaacaaccggTAAATTTCAAGAATCAACCACAAATACACCAAAATCAACATCACCAAGCAATAATTCCTCAGCAAATGCAATTGCGAATATTTTAGCAACGAATTTAATGCCAAGCAAAGAAGAATCtggtaaaatatttggtatagCTAGTGTTAGTTTAGCTCAAAGTTCTGGTCCAGATAATACAAAATGTACATTAGGTAAATGTGGTTCAATACACAAACCAGTTTTAGGTCCTGTTGTTCCAACAGAAACATATTTAGGTGAACAACAATTATCGAGTAAAGAACGTCGCAAAGCTAAAGTTAATATGACACATGAACAAATACAAAAGTGGCTAATTGAATGTTCATCTAATCCAGATGATATCCAAGATGATTTAGATGATGattttgatgatattttaaaaccaaCAACATTTGCACCAACACCACCACCGGTACCAATTAAAGACGATAAAGAATCAACGAGTACATCATCACGAACAACAAATAAACAAGACTTAGGTAAAGCTGAGAGTGCGTGGTCTGGTAAAGGACCATCTTTAAAAGCTACACCAGTTATTGCTAAAGAGGatattagtaaatttgaaGAATCGCCTGTACAggaattagtaattaaaaaagaagaacCTACCGTTTCTGGAACACAGCCAACAACTCAATCTATTCCAGCAACAACGGCAGCGATTGATACAACAACCGGCAAATTGCAACcgaatttaacaaaaaaagaaaagaaaaaagtagaacaagaaattaaattgaaagagaaaaaagaaattattgcaacatcaaagaaaaatcaacaaaacaaTGCTACCAAATTAACACGATCACCAGTTAAAGAATCACCCACCATTAAGTCACCAAAAGCAACAACTTCAGcagcaaatttaataaaaacgcAAAAGAAACAACAGCAATTAGCAACAGCCGaacagcaaaataaaaataaaaatgataatgcTGCGACAACATCATCATCGGCAGCTCAATCACTTAAAACACCACCAAAACGGCAACCAGTTTATAGTTCAAAAACAGTTGTTCCAGCTGCTGTGCCTGCTACAACAGCAGCCGAAATTAAAAGAACAATTCAAAAAATGAATACAATTGGTGGTGACATTGGTAATAGCTTTTCTGCCTTTTCACCTGACAATGAAAAAAGTGTTTATTCTTTCGATAAAGAAGAAGAAGATGTTTTACCATCTCCCCTATCAAAACCATTTAGACGTCAAAGTCGTCGTGAATCACATAATGACGATCAATCGTTAAGTGATTCAAAACCCTATaaacaagataaaaaaatggaaaataatagtATTTCATTGACGCTAAGTCCAGAGGATAATCGTAAGTTAGCTAAAATGAACTTTGATGCTAATACTACAACTACTGATACGAAGAAAATTgctaaaaaatcaacaaaatctacaaaaaattctGAAGATAAATCTACAACGaatgaatttgttttaaatgatTCAGAAGGGGAGACATTTTACATTCCATTACAAGGGGCTGCTGTTGGTGTTGCAGCGGGGGGTAAATCAGATCTTTTACAAGCTGTTGAAGTTAAAGTTAAAGTTGGTCGTGAAGGGCCGGATGGTCCAAACCAACGTGTTTGTGTTCAGGCTACATTAGTTACAAAATCACAAATTTCCGCAACAACAAATTCAACTACAACTACAGCTAATGCTGCTATCAATCCCAATATTGATACttcaaatgataaaaataaagaatcgTCTAATAGTGGTGCAATAACGACATCAACTTCAGCAAAAAATGTTCCAATTGGTACAGTACAACCAAgatttaaatcatataatgCTGTTGATCAGCAACAACAAAACAGTTCTTCTGTTACTAACGTCCCATTAACAAGAGTAAACTCAAACTCTTCATTATTTTCTGGATCGGGTAA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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

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