Eliv003625.1
Basic Information
- Insect
- Empis livida
- Gene Symbol
- Rel
- Assembly
- GCA_963932195.1
- Location
- OZ010645.1:49978429-49994455[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- RHD
- Domain
- RHD domain
- PFAM
- PF00554
- TF Group
- Beta-Scaffold Factors
- Description
- Proteins containing the Rel homology domain (RHD) are eukaryotic transcription factors. The RHD is composed of two structural domains. This is the N-terminal DNA-binding domain that is similar to that found in P53. The C-terminal domain has an immunoglobulin-like fold (See PF16179) that functions as a dimerisation domain [1-2].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 4 3.5e-47 1.2e-43 149.2 0.6 1 168 75 258 75 259 0.95 2 4 0.00054 1.8 8.7 0.0 1 73 853 924 853 957 0.73 3 4 0.00036 1.2 9.2 0.0 27 76 1160 1214 1153 1235 0.69 4 4 2.2e-05 0.075 13.2 0.0 123 167 1232 1275 1214 1277 0.85
Sequence Information
- Coding Sequence
- atgatttcaacAATTTATGATTTGGATACTCAAACTAGTCATTATTATGACAGTGGCTATTCTGGAACTTCATCGCCAGGTTCTACTTCATCTAGTTCTTGTATGATGGGTTCACCATCTTCACAGACAAGCGATTCagcttataataataattttcaaaatcttatATTATCCGATGATAATGATCAACAAACAGACGAATTCACAAATAGTAAttgttatttagaaataaCTGAACAACCGGTAGATAAATTTCGTTTTCGTTATAAATCTGAAATGCATGGTACACATGGTTCGTTAATGggtataaataattgtaaaacaCGTAAAACACATCCAACAGTTGAATTAAGAGGATATAATGGCAAAGCATTAATACGTTGTAGTTTATACCAATTTGATACTATAAATCCATTACCACATTCACATCAATTAGTTGTACGACAAAATGATGATGACAAATCAGATCCTCATGAATTGGAAGTAAATCCAGATAGGGGTTATCGTGCattatttatTGGAATGGGTATTATACATACGGCTAAGAAATTTATAGCCGAAGCTctatatgaaaaaaagaaaaagattaGAGAATTTGAATTACGTCGACAATGTACTGTGAAAGAAATTAgtcaattaaaaattgattCAGAAAAACAAGCTAAAAGTATGAATTTAAATCAAGTAACATTATGTTTTGAAGCTTACAAAGTACATGATAATGGATCTTTAGAACAACTCTGTAAACCAGTATTTTCAAAACCTATAAATAACATGAAAAGTGCATTAACTggtgaattgaaaatttctcgTCTAAGTGCATGTGTGAGCAGTGCATCAGGTGgtgatgatttatttttactggTTGAAAAAGTTGGAAAaaaaaatataaaagtaaaatttttcgaaGTAAATGATGAAGATGAATCTATATGGGAGGATTGGGGAATATTTACTGAAGCCGATGTTCATCATCAATATGCAATAGCATTGAGAACACCGCCTTatcaaaataaagatattgaTAAACATgTAGATGTTTTTATACAGCTTTTCCGTCCTAGTGATGGTGATCAAAGTGAACCGGtaccatttaaatataaaccaCGTGATTTTGTGTCGTCTCGAAAACGTGCTAGAACCTGTTCATCAAGTTTAGGTTCAATGGAATTACCAGAatcaattgttaaaaattttagagaTGATAATTCCGGAACAACAATAAGTGCAGAATATAACAAAGAagatttaatatcaaatttatgtaatgatCAACAATTTTCagaacatattaaaaaaaattctgatgaaCTAATGAAAATACTAGATCCATCGGTATTTGATGTACAATTAGATTATGATCCACATCTACAAATAGATGGTGTATCTTCTAATAACAgagaaaaactatataaatctgatttaaaaattacttcaaaaatAAACACTATATTAAGGTCCGTTGATAAAACTCCTAATAGTATTAGAGACGCTATCAAATTGATATTAAGGATTTTTAATGAAGCAAATACAAATGGCAACGAtattCTACACAATATTATTCAAAGTAATGAGATTGGAGAAgctatgaaattattaaaaattattgataaattacaaatttatgatgttctacaattacaaaataaatatggtGATACATGTTTACATGTAGCATGTACATATGACCGACCTGCATATATAAaaccattaattaatttggGTATTGATCCAAATGTTCAAAATGCTCAAGGAAACACCGCATTACATATTGCTGTTAGAGAATCAATGGCTATGTGcgttacaaaaattttagaaaaacagaattatacaaaattaagtaaatcattaaatattgatttagcGAATGATAATGGTTTAACACCATTACATTTAGctgttatgaaaaaaaatctagatatggtaaaaaatttaatggaaaatggGAATGCATCAGTGAAAATTTCCATATCAAAAGATGGCAATAATGTTTTACATTTAGCTGTTAAGGAGaataatgATGGAATTGTACGATATTTACTCAGTAATACAtcagttaaaattaatcaacCAAATACATCTGGTTTTACACCATTATCTTTAGCACAATCGATGGGAAAAGATGcgataaaaattgttaaaatattattagaaaaaggTGCCACCAATAATActgatcataaatttaaagttgaattaaaaaaattaaaaaattcccAAGATGATAGTAATTCAGCAGATGATAGTAACTCAGATAGTGATGatgaaaaatctttaagaATTGACGAATCGCATATTACTGAAgaaaaaatggatttaaattatacagaaatagattattttgatgatattgcattaaaaaaattaatagaaatattaaaaattaatcaaaaatggataaaattggcaaagattttaaatttagatgattatttatatttatggaaaTCGCCAGAAACTATGTTAAGACATATTAATAAGtataaTATAAAGATGCAGCAAGTTATAGATGCATTAAACCAATGTAAAGAATATGCTGCAATTGAATattgtGAACTCAAGATAATTGTTGaacctaaaaattattttcgttttcgTACAATCGATGATTTAAACCATGGTACATTACCAGGATGTGATAATAAACCTGTAATAACTGTTAAATTAGAAGGATTTAACGAAGAACGAAACGATGTAGTAATATTGTGTACAATTTATCAACCAGATGGAGGTTATCAAATGTATCCACATCCAAATGTTTTGGTTAAATCTGAATCTGATGGACGAAAAGgcaagaaaaagaaaaacgttTATATATATGATCCAATAAAATCAGAATTAAATGAAGATTTTACAGCTGGGATGAAAACAGATGGAAAAAGTGCAACTATTCAATTTAGTGATGAGgcaacaacatcaacatcaGAAACtagtaaaatatctaattttgatAAAGAGTTATTGGAAGAATTAAAAAGggaaaaCATTCTACATATGTTAATTGAAGATGATAAAGGAGATAAACTAAATCATTTACTTAGCgtaattaaaacatataaacttgaaaatatattacaactTCAAAATGTTTATGATGATACCGCTTTACATGTTGCATGTTATTTTAACAGACAAgaatatgttgaaaaattattgaaattaggTATTGATCCAAATATACAAAACCATGACGGCAACACAGCTTTACATATTGCGGtagataaaaaacatataaattgtattaacaAGATGTTAGatccaaaaaataatgaaaactttaatattgatttgatAAATGATAAAGGAAATACAGCACTTTATTTAGCTGTTTTTTTACAAGAATACGAAATAGCTAAGACATTAATAGAAAAAGGAAATGCTTCAgctgaaattgaaaatccaacaaatggtaataatattttacatttagcAATAATGCAGTTAAATCcatcaaataaagaaaaaactgaAGATTTACATGGTACATTATCAGGACATGATAGTAAAACTGCAATAACTGTGCAATTAGAAGGTTTTAAAGGAGAACGAAACGATGTAATAGTATTATGTACAATTTATCAACCAGATGGAATCTACCCACATCCAAATCTTTTGGTTAAATTTGCAGGAAAAAAAGGAGAGAAAAATACAACAAAGATATTTGACCCAATAAAAtcagaattaaaaaaagattttacaGCCAcgtatttgaatAAATACAACAATATTGATATGAATGATATTCAATTATGTTTTGAAGCATTtgtaaaaattggtaaaaattttcaaacaattgGCAGtccaatattttcaacaaacaTCAGCAACTTTAGTACAGCATCGaaaaaaaatcttGACTCTTTTATCTGGCATTGTGACCAATCTGAAGGGAAGCCAGATGGCGGTGAAGAGTTCATTATTTTATGTGAATACAaatcaagtattaaaaaaaaagatattaaagttagattttttgaaaacaaatctGATGGTACGGTTTGGGAAGCATATGCTAAAATTCAAACTCGTTCTTTTTGTACTCATTCTTTATTGATTAAAACTCCCGCATATGAAGATGTTAAAATTGACGAAGATGTAAGTATTGATGAAGAtgtaaaaaGACGAGAAAAAGTTAAAACTCTTGATGGCTTACTGGAGGGTTTTACTATCAAAGATTTTGCAAATGACAGGATGAAAACTGATGGAAAAAATGTAACTATTCAATTTAGTGATGAGGCAACAACACCAACATCAGAAACtagtaaaatatctaattttgatAAAGAGTTATTGGAAGAATTAAAAAGggaaaaCATTCTACATATGTTAATTGAAGATGATAAAGGAGATAAACTAAATCATTTACTTAGCgtaattaaaacatataaacttgaaaatatattacaactTCAAAATGTTTATGATGATACCGCTTTACATGTTGCATGTTATTTCAACAGAGAAgaatatgttgaaaaattattaaaattaggTATTGATCCAAATATACAAAACCATGAAGGCAACACAGCTTTACATATTGCTGtagataaaaaacatataaattgtattaacaAGATGTTAGATCCAGAAAATACTGAAAACTTGAACATTGATTTGATAAATCATAAGGGAAATACAGCACTTTATTTAGCTGTTCTTCTACAAGAATACGAAATAGCTAAGACATTAATAGAAAAAGGAAATGCTTCGgctgaaattgaaaatccaacaaatggtaataatattttacatttagcAATAATGCAGTTAAATCcatcaaataaagaaaaaactgaAGATTTAGTAAGTTTTTTACTCGAAAATACTTATATTGACGTAGACGATGAAAATTTGTATGTCAATAATTCAACACCTTTAGCACTAGCATTAGAAATTGGAGCTGAtgcagaaaatattattaatttactactgaaataa
- Protein Sequence
- MISTIYDLDTQTSHYYDSGYSGTSSPGSTSSSSCMMGSPSSQTSDSAYNNNFQNLILSDDNDQQTDEFTNSNCYLEITEQPVDKFRFRYKSEMHGTHGSLMGINNCKTRKTHPTVELRGYNGKALIRCSLYQFDTINPLPHSHQLVVRQNDDDKSDPHELEVNPDRGYRALFIGMGIIHTAKKFIAEALYEKKKKIREFELRRQCTVKEISQLKIDSEKQAKSMNLNQVTLCFEAYKVHDNGSLEQLCKPVFSKPINNMKSALTGELKISRLSACVSSASGGDDLFLLVEKVGKKNIKVKFFEVNDEDESIWEDWGIFTEADVHHQYAIALRTPPYQNKDIDKHVDVFIQLFRPSDGDQSEPVPFKYKPRDFVSSRKRARTCSSSLGSMELPESIVKNFRDDNSGTTISAEYNKEDLISNLCNDQQFSEHIKKNSDELMKILDPSVFDVQLDYDPHLQIDGVSSNNREKLYKSDLKITSKINTILRSVDKTPNSIRDAIKLILRIFNEANTNGNDILHNIIQSNEIGEAMKLLKIIDKLQIYDVLQLQNKYGDTCLHVACTYDRPAYIKPLINLGIDPNVQNAQGNTALHIAVRESMAMCVTKILEKQNYTKLSKSLNIDLANDNGLTPLHLAVMKKNLDMVKNLMENGNASVKISISKDGNNVLHLAVKENNDGIVRYLLSNTSVKINQPNTSGFTPLSLAQSMGKDAIKIVKILLEKGATNNTDHKFKVELKKLKNSQDDSNSADDSNSDSDDEKSLRIDESHITEEKMDLNYTEIDYFDDIALKKLIEILKINQKWIKLAKILNLDDYLYLWKSPETMLRHINKYNIKMQQVIDALNQCKEYAAIEYCELKIIVEPKNYFRFRTIDDLNHGTLPGCDNKPVITVKLEGFNEERNDVVILCTIYQPDGGYQMYPHPNVLVKSESDGRKGKKKKNVYIYDPIKSELNEDFTAGMKTDGKSATIQFSDEATTSTSETSKISNFDKELLEELKRENILHMLIEDDKGDKLNHLLSVIKTYKLENILQLQNVYDDTALHVACYFNRQEYVEKLLKLGIDPNIQNHDGNTALHIAVDKKHINCINKMLDPKNNENFNIDLINDKGNTALYLAVFLQEYEIAKTLIEKGNASAEIENPTNGNNILHLAIMQLNPSNKEKTEDLHGTLSGHDSKTAITVQLEGFKGERNDVIVLCTIYQPDGIYPHPNLLVKFAGKKGEKNTTKIFDPIKSELKKDFTATYLNKYNNIDMNDIQLCFEAFVKIGKNFQTIGSPIFSTNISNFSTASKKNLDSFIWHCDQSEGKPDGGEEFIILCEYKSSIKKKDIKVRFFENKSDGTVWEAYAKIQTRSFCTHSLLIKTPAYEDVKIDEDVSIDEDVKRREKVKTLDGLLEGFTIKDFANDRMKTDGKNVTIQFSDEATTPTSETSKISNFDKELLEELKRENILHMLIEDDKGDKLNHLLSVIKTYKLENILQLQNVYDDTALHVACYFNREEYVEKLLKLGIDPNIQNHEGNTALHIAVDKKHINCINKMLDPENTENLNIDLINHKGNTALYLAVLLQEYEIAKTLIEKGNASAEIENPTNGNNILHLAIMQLNPSNKEKTEDLVSFLLENTYIDVDDENLYVNNSTPLALALEIGADAENIINLLLK
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
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- 90% Identity
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- 80% Identity
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