Basic Information

Insect: Elegia similella
Gene Symbol: PAXBP1
Assembly: GCA_947532085.1
Location: OX383927.1:6090395-6107690[-]

Transcription Factor Domain

TF Family: GCFC
Domain: GCFC domain
PFAM: PF07842
TF Group: Unclassified Structure
Description: This entry describes a domain found in a number of GC-rich sequence DNA-binding factor proteins and homologues [4, 5], as well as in a number of other proteins including Tuftelin-interacting protein 11 [1]. While the function of the domain is unknown, some of the proteins it is found in are reported to be involved in pre-mRNA splicing [1, 2]. This domain is also found in Sip1, a septin interacting protein [3].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 22 6.3e-06 0.1 13.0 0.0 3 42 62 101 60 108 0.91

2 22 9.1e-06 0.15 12.5 0.0 5 42 173 210 170 217 0.92

3 22 1.3e-05 0.21 12.0 0.0 5 42 282 319 279 324 0.93

4 22 1.4e-05 0.23 11.8 0.0 5 42 391 428 388 433 0.93

5 22 1.4e-05 0.23 11.8 0.0 5 42 500 537 497 542 0.93

6 22 1.4e-05 0.23 11.8 0.0 5 42 609 646 606 651 0.93

7 22 1.4e-05 0.23 11.8 0.0 5 42 718 755 715 760 0.93

8 22 1.4e-05 0.23 11.8 0.0 5 42 827 864 824 869 0.93

9 22 1.4e-05 0.23 11.8 0.0 5 42 936 973 933 978 0.93

10 22 1.4e-05 0.23 11.8 0.0 5 42 1045 1082 1042 1087 0.93

11 22 1.4e-05 0.23 11.8 0.0 5 42 1154 1191 1151 1196 0.93

12 22 1.4e-05 0.23 11.8 0.0 5 42 1263 1300 1260 1305 0.93

13 22 1.4e-05 0.23 11.8 0.0 5 42 1372 1409 1369 1414 0.93

14 22 1.4e-05 0.23 11.8 0.0 5 42 1481 1518 1478 1523 0.93

15 22 1.4e-05 0.23 11.8 0.0 5 42 1590 1627 1587 1632 0.93

16 22 1.4e-05 0.23 11.8 0.0 5 42 1699 1736 1696 1741 0.93

17 22 1.4e-05 0.23 11.8 0.0 5 42 1808 1845 1805 1850 0.93

18 22 1.4e-05 0.23 11.8 0.0 5 42 1917 1954 1914 1959 0.93

19 22 1.4e-05 0.23 11.8 0.0 5 42 2026 2063 2023 2068 0.93

20 22 1.4e-05 0.23 11.8 0.0 5 42 2135 2172 2132 2177 0.93

21 22 9.1e-06 0.15 12.5 0.0 5 42 2244 2281 2241 2288 0.92

22 22 2.3e-16 3.8e-12 47.2 0.1 5 190 2353 2517 2350 2528 0.80

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	22	6.3e-06	0.1	13.0	0.0	3	42	62	101	60	108	0.91
2	22	9.1e-06	0.15	12.5	0.0	5	42	173	210	170	217	0.92
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Sequence Information

Coding Sequence: 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