Basic Information

Gene Symbol
T_4
Assembly
GCA_963693315.1
Location
OY856188.1:127869826-127883916[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
HTH
Domain
HTH_psq domain
PFAM
PF05225
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This DNA-binding motif is found in four copies in the pipsqueak protein of Drosophila melanogaster [1]. In pipsqueak this domain binds to GAGA sequence [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 2.2e-08 1.8e-05 26.8 0.1 3 43 711 751 709 753 0.86

Sequence Information

Coding Sequence
ATGAATAAACTAAAAAGTGGAAGTCAATGTGCAGTTGAGAGCTGCAAGTTATCAAGGCGAGAAAATGTTCGTTTATTTATGTTGCGAGAAAATCACGTGAAACGTGATCAATggattttaaattgtaatttgcaaaatctaactaaaaagcatatttatatatgtgaaaaacattttgaaaaaaaatatttcaacaaaaaggGATTAAACAAATATGCGATTCCAACACTGAAATTAACCGATTTTGAAAGTAACAAGGATTCTGATAATGTTGAAATGGTAACTGGTTTGTCAGTCGGACACCTTTCAGAAATTGCAGATAACTCGTGTATTTTAATTGATAGCGATGCTCTGATGCATGATAGCGGAAGACCATGTTTTCCTCCTTCGGTTAAATTAAACTCAAACCAATTAAAAACTTCCATTTATTCCGAATTAACCTTAGAGGAACTATCTGGCTTACCAGAAAACTTTACTGCTAATATTAATAGCGAGATTGAACCACCTCCATGTAACACATGTTTGCGAAATATTAAAAACGAGACTTACTATCgattaaaatattgtaaaatgttgaaaaatattcaATCTAAGGACAGACAAATATCAGAATTAAACCGAAAATGCAACAACTTTAGAAGAAAACTTAAACGACAGCATTTAAAATTGTCGGTATTTCAAAgatctaaaaataatattaacgACCAGATTGACCAATTGAACATAACCGAAAATGGTAAGAATTTCTGCAAAATGCTAGCCGTTTTGATATTCGATGAAAAGCACATACGAAGTGATCTTGTATATAATACTTTCTCCGACCAAATTGATGGATTTGTTGATTATGGGCATAACAGAGAAGCTGCAATTGGAAAATTGGTTTGCTCTTTTATGATTAGAGGTGTATCATCAAATTGGAAATATGTTTTAAGCTATGTTGTTTCTGAAAATAGCATTTTTgctgataaattatttttgcttgttcaagaaaatttgaaaaagtgtTGTGAGTTGGGTATTAATATAAGAGCTGTGATTTGTGATCAAGGGCCAAATAAtagaaaatgtttcaatttgTTTGGTATAACCATTGAACGACCAGTGTTCATGTATAATGAAATCGAAATAGCAGCTTTATATGACGTACCACATTTAATAAAGTCAGTGagaaatactttaattaaatcAGACATATTATGTCCTGATGGATTGGTCAGCTGGAACATACTTATAGAATGGTATAACTTGGAAATAAACTCAATTACCAAATGTTGCCCAAAAATTTCAACCAAACATATTTATCCAAATAACTTTGAAAAAATGAGAGTTAAATTAGCTACACAAATTTTTAGCAGAAGCGTTGCGGCAGGCATTAAAGCTGCTGTTCAACTGAAAAGAATATCTGCCCGTTGTGAAGAAACAGCGATTTCAACAtataaatttatagaaaaaatagaTAAACTTTTCGACTGCCTAAACTCAAAAGCAAAGtatgataaaaatatgtttagaTGTGCCTTTATTACCGGTAAAGaagttgatcaatttttagaatatatgATACACTACATTACACAAGTTAAAATAGCAAATAAAACAACAGTATATTGTTTTAAAGGTTTAATCCAAAGCATTAAAGGAATTCAAACAGTTTCCAAACAGCTACTATCAGAAGATATTGGGATTGATTATATTCTAACTTCAAGGTTCAACCAGGATCcaattgaaaatttgtttgctcAAATAAGAACTGCAAATGGTAACAACCGAAACCCGTCAGTTCATGATTTTAATCACAACATTGCCAGGattataacaattaaaattctTACTCCTTTTTCTTCCATATCTAATTGTGAAAATGATACGGACGAATTAATTGCAGTCGAAACCATAACAACAGAGCAATCGAGTGAAGATGAAAACCTAATATCTACTAATACCAGCAATGATGATGAAATTGCCGATATATCTGAGAATTTCTTTAACCTGGATGTTCCATTACAGGAGACTTCTATGAGATATTTTGTAGGTTACGTAGCGTTTATTAATTTTGACATGCAACAAAGCCAACCATCATCATCTATCAAAAAGAAGCCTATAAAAATaactacaaacaaaaacagTGCAGAACGAATTAAAAAAGctttagaatttgttgcaaatGGAACAATGAGTGCATATAGAGCTTCGAAAATTTATGCTATACCGCAGCAAACATTAttggataaaattaaaaaaaagtacacTAAACAACTATCTGCAGGAGCTCCAACCGTTTTAAAACCCACCGAAGAAGAATTAATTGTGAAGTGGGTGCAACATCTAGCGGAAATAGGTTTTCCAATAACAAAAGTACAACTGATCCATTCAGTTacaaaattagttaaaaaacTAAACCGTCCAAACCACTTCAAAAATGGAATACCAGGCAGACATTGGTATGAAGGATTTTTAAAAAGGAACCCAATAATTAGGAGGAGAATTTCACAGAATCTGACTGCACCACGAGCCGTAGTTGATGAGCAACAAATTAAAGCTTGGTTTAAGAAAGTGCACacttttttagaaaacaaacaTCTATTGGAAATTCTCAAGGATCCATCTAGAATCTTCAATTGTGATGAATCAGCGTTTTCGTTGTGCCCAAAAGGTCAAGGTGTCCTTGTTACTAAAGGCACCAAAAATGTTTATAGCAGGTCCAACAACAATGAAAAGGAATGCTTGACTTTATCTCTTGGTGCTTCTGCTGATGGCGAGTTAATGCCACCCTTCGCTTTATTTCCGTACAAAAGAATTCCTCAAACTATACTTGTAAAGTATCCAAAAACTTGGGCAATAGGAAGATCGGATAGTGGGTGGATGACATGTGAAACTTTTTATGAATACATAACAAATGTTTTTCATccatttattttgaaaaaaaatgtaaagaaacCTATCATATTGTTTATGGATGGTCATTCTTCTCATTTATCTTTGCCATTAAGTGAGTTTTgcagagaaaataaaataattttaattgctttatTACCAAATGCTACCCACATCTTGCAACCAATGGATGTGGCTGTATTTCGGAGCATCAAAAATTCTTGGAAAAAAGAAGTTCAAAATTTTCGATTGGAAAACAATGGTAGTCGTTTAAAACGTGAAGATTTTGGCCCAATTCTTCAAGAATGTATCTCAACAACAATCAAGCCTGAAATAATTAAACATGGATTTCGCGCTTGTGGGTTGTATCCATTTGACGcaagtaaaattaattacaataagCTTTTAAAACCATGTTATCCAGCTTCAACATCTACCACTACGATATCGGTAACGGATGATCTAACTGAAAATACACAAATTTCACAATCAAAAGAGTTCATTAAACTGTTTGAACAGCGGCTACCCAGTGAAAAACTAAATGAATTTATGGTATGTACTGGAAAGTGGATAGGAGACGTAAAGGATGAAAATCTTTACTATTTTTGGAGAAAAACCAAAGGTTGTTTAGAAAAGACAACTAGGGGTACCGCAACTAATAAATCTTATGTAGATGATCCGACGTTAAACGGAAACATTTATTCAGACATTCCTACAAACACTATTGCTGACTGGTCTGAATTAAGCAGTAATATAGTAACGGAGCTTGATGCCCGAATGAATAGATTCCAAGCAAGTTCAACACCAAAATCTCAAAATATGTTACATAGAGAAACAAATGAATCCCCAATACAATATGCTAGTTTTAAAGAACACATTCAATCTCCTGCAGTTCAAAATATGATATCTACAATAGACTATGGGATGGATCTTGTTCTGAATAATGACAGCTACATCCGACAAAACGCAGAAAGAATAATAGATGATGAGATAATTTTACCAGAAGTGGTTAATACATCTGCAGCTGGAATGAATAACGAAACACAAATGGAAGAATTAGCCAACAAAATGAATACTGCAGCCAATTTTAAAGAAGAAAGGCATGAAACAATTAGAAGGGCAACAGGTCATCTTCGTAGACGAAGCAGAAAATGTTTAGAAGTCAATGGCGGTACTTTTGAACATTTATTAAAAGAAGGCTATGATTAG
Protein Sequence
MNKLKSGSQCAVESCKLSRRENVRLFMLRENHVKRDQWILNCNLQNLTKKHIYICEKHFEKKYFNKKGLNKYAIPTLKLTDFESNKDSDNVEMVTGLSVGHLSEIADNSCILIDSDALMHDSGRPCFPPSVKLNSNQLKTSIYSELTLEELSGLPENFTANINSEIEPPPCNTCLRNIKNETYYRLKYCKMLKNIQSKDRQISELNRKCNNFRRKLKRQHLKLSVFQRSKNNINDQIDQLNITENGKNFCKMLAVLIFDEKHIRSDLVYNTFSDQIDGFVDYGHNREAAIGKLVCSFMIRGVSSNWKYVLSYVVSENSIFADKLFLLVQENLKKCCELGINIRAVICDQGPNNRKCFNLFGITIERPVFMYNEIEIAALYDVPHLIKSVRNTLIKSDILCPDGLVSWNILIEWYNLEINSITKCCPKISTKHIYPNNFEKMRVKLATQIFSRSVAAGIKAAVQLKRISARCEETAISTYKFIEKIDKLFDCLNSKAKYDKNMFRCAFITGKEVDQFLEYMIHYITQVKIANKTTVYCFKGLIQSIKGIQTVSKQLLSEDIGIDYILTSRFNQDPIENLFAQIRTANGNNRNPSVHDFNHNIARIITIKILTPFSSISNCENDTDELIAVETITTEQSSEDENLISTNTSNDDEIADISENFFNLDVPLQETSMRYFVGYVAFINFDMQQSQPSSSIKKKPIKITTNKNSAERIKKALEFVANGTMSAYRASKIYAIPQQTLLDKIKKKYTKQLSAGAPTVLKPTEEELIVKWVQHLAEIGFPITKVQLIHSVTKLVKKLNRPNHFKNGIPGRHWYEGFLKRNPIIRRRISQNLTAPRAVVDEQQIKAWFKKVHTFLENKHLLEILKDPSRIFNCDESAFSLCPKGQGVLVTKGTKNVYSRSNNNEKECLTLSLGASADGELMPPFALFPYKRIPQTILVKYPKTWAIGRSDSGWMTCETFYEYITNVFHPFILKKNVKKPIILFMDGHSSHLSLPLSEFCRENKIILIALLPNATHILQPMDVAVFRSIKNSWKKEVQNFRLENNGSRLKREDFGPILQECISTTIKPEIIKHGFRACGLYPFDASKINYNKLLKPCYPASTSTTTISVTDDLTENTQISQSKEFIKLFEQRLPSEKLNEFMVCTGKWIGDVKDENLYYFWRKTKGCLEKTTRGTATNKSYVDDPTLNGNIYSDIPTNTIADWSELSSNIVTELDARMNRFQASSTPKSQNMLHRETNESPIQYASFKEHIQSPAVQNMISTIDYGMDLVLNNDSYIRQNAERIIDDEIILPEVVNTSAAGMNNETQMEELANKMNTAANFKEERHETIRRATGHLRRRSRKCLEVNGGTFEHLLKEGYD

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100% Identity
iTF_00455921;
80% Identity
iTF_00456184;