Basic Information

Insect: Diogma glabrata
Gene Symbol: T_3
Assembly: GCA_963693315.1
Location: OY856186.1:254582936-254595142[+]

Transcription Factor Domain

TF Family: HTH
Domain: HTH_psq domain
PFAM: PF05225
TF Group: Helix-turn-helix
Description: This DNA-binding motif is found in four copies in the pipsqueak protein of Drosophila melanogaster [1]. In pipsqueak this domain binds to GAGA sequence [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 1 2.2e-08 1.7e-05 26.9 0.1 3 43 711 751 709 753 0.86

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	1	2.2e-08	1.7e-05	26.9	0.1	3	43	711	751	709	753	0.86

Sequence Information

Coding Sequence: ATGAATAAACTAAAAAGTGGAAGTCAATGTGCAGTTGAGAGCTGCAAGTTATCAAGGCGAGAAAATGTTCGTTTATTTATGTTGCGAGAAAATCACGTGAAACGTGATCAATggattttaaattgtaatttgcaaaatctaactaaaaagcatatttatatatgtgaaaaacattttgaaaaaaaatatttcaacaaaaaggGATTAAACAAATATGCGATTCCAACACTGAAATTAACCGATTTTGAAAGTAACAAGGATTCTGATAATGTTGAAATGGTAACTGGTTTGTCAGTCGGACACCTTTCAGAAATTGCAGATAACTCGTGTATTTTAATTGATAGCGATGCTCTGATGCATGATAGCGGAAGACCATGTTTTCCTCCTTCGGTTAAATTAAACTCAAACCAATTAAAAACTTCCATTTATTCCGAATTAACCTTAGAGGAACTATCTGGCTTACCAGAAAACTTTACTGCTAATATTAATAGCGAGATTGAACCACCTCCATGTAACACATGTTTGCGAAATATTAAAAACGAGACTTACTATCgattaaaatattgtaaaatgttgaaaaatattcaATCTAAGGACAGACAAATATCAGAATTAAACCGAAAATGCAACAACTTTAGAAGAAAACTTAAACGACAGCATTTAAAATTGTCGGTATTTCAAAgatctaaaaataatattaacgACCAGATTGACCAATTGAACATAACCGAAAATGGTAAGAATTTCTGCAAAATGCTAACCGTTTTGATATTCGATGAAAAGCACATACGAAGTGATCTTGTATATAATACTTTCTCCGACCAAATTGATGGATTTGTTGATTATGGGCATAACAGAGAAGCTGCAATTGGAAAATTGGTTTGCTCTTTTATGATTAGAGGTGTATCATCAAATTGGAAATATGTTTTAAGCTATGTTGTTTCTGAAAATAGCATTTTTgctgataaattatttttgcttgttcaagaaaatttgaaaaagtgtTGTGAGTTGGGTATTAATATAAGAGCTGTGATTTGTGATCAAGGGCCAAATAAtagaaaatgtttcaatttgTTTGGTATAACCATTGAACGACCAGTGTTCATGTATAATGAAATCGAAATAGCAGCTTTATATGACGTACCACATTTAATAAAGTCAGTGagaaatactttaattaaatcAGACATATTATGTCCTGATGGATTGGTCAGCTGGAACATACTTATAGAATGGTATAACTTGGAAATAAACTCAATTACCAAATGTTGCCCAAAAATTTCAACCAAACATATTTATCCAAATAACTTTGAAAAAATGAGAGTTAAATTAGCTACACAAATTTTTAGCAGAAGCGTTGCGGCAGGCATTAAAGCTGCTGTTCAACTGAAAAGAATATCTGCCCGTTGTGAAGAAACAGCGATTTCAACAtataaatttatagaaaaaatagaTAAACTTTTCGACTGCCTAAACTCAAAAGCAAAGtatgataaaaatatgtttagaTGTGCCTTTATTACCGGTAAAGaagttgatcaatttttagaatatatgATACACTACATTACACAAGTTAAAATAGCAAATAAAACAACAGTATATTGTTTTAAAGGTTTAATCCAAAGCATTAAAGGAATTCAAACAGTTTCCAAACAGCTACTATCAGAAGATATTGGGATTGATTATATTCTAACTTCAAGGTTCAACCAGGATCcaattgaaaatttgtttgctcAAATAAGAACTGCAAATGGTAACAACCGAAACCCGTCAGTTCATGATTTTAATCACAACATTGCCAGGattataacaattaaaattctTACTCCTTTTTCTTCCATATCTAATTGTGAAAATGATACGGACGAATTAATTGCAGTCGAAACCATAACAACAGAGCAATCGAGTGAAGATGAAAACCTAATATCTACTAATACCAGCAATGATGATGAAATTGCCGATATATCTGAGAATTTCTTTAACCTGGATGTTCCATTACAGGAGACTTCTATGAGATATTTTGTAGGTTACGTAGCGTTTATTAATTTTGACATGCAACAAAGCCAACCATCATCATCTATCAAAAAGAAGCCTATAAAAATaactacaaacaaaaacagTGCAGAACGAATTAAAAAAGctttagaatttgttgcaaatGGAACAATGAGTGCATATAGAGCTTCGAAAATTTATGCTATACCGCAGCAAACATTAttggataaaattaaaaaaaagtacacTAAACAACTATCTGCAGGAGCTCCAACCGTTTTAAAACCCACCGAAGAAGAATTAATTGTGAAGTGGGTGCAACATCTAGCGGAAATAGGTTTTCCAATAACAAAAGTACAACTGATCCATTCAGTTacaaaattagttaaaaaacTAAACCGTCCAAACCACTTCAAAAATGGAATACCAGGCAGACATTGGTATGAAGGATTTTTAAAAAGGAACCCAATAATTAGGAGGAGAATTTCACAGAATCTGACTGCACCACGAGCCGTAGTTGATGAGCAACAAATTAAAGCTTGGTTTAAGAAAGTGCACacttttttagaaaacaaacaTCTATTGGAAATTCTCAAGGATCCATCTAGAATCTTCAATTGTGATGAATCAGCGTTTTCGTTGTGCCCAAAAGGTCAAGGTGTCCTTGTTACTAAAGGCACCAAAAATGTTTATAGCAGGTCCAACAACAATGAAAAGGAATGCTTGACTTTATCTCTTGGTGCTTCTGCTGATGGCGAGTTAATGCCACCCTTCGCTTTATTTCCGTACAAAAGAATTCCTCAAACTATACTTGTAAAGTATCCAAAAACTTGGGCAATAGGAAGATCGGATAGTGGGTGGATGACATGTGAAACTTTTTATGAATACATAACAAATGTTTTTCATccatttattttgaaaaaaaatgtaaagaaacCTATCATATTGTTTATGGATGGTCATTCTTCTCATTTATCTTTGCCATTAAGTGAGTTTTgcagagaaaataaaataattttaattgctttatTACCAAATGCTACCCACATCTTGCAACCAATGGATGTGGCTGTATTTCGGAGCATCAAAAATTCTTGGAAAAAAGAAGTTCAAAATTTTCGATTGGAAAACAATGGTAGTCGTTTAAAACGTGAAGATTTTGGCCCAATTCTTCAAGAATGTATCTCAACAACAATCAAGCCTGAAATAATTAAACATGGATTTCGCGCTTGTGGGTTGTATCCATTTGACGcaagtaaaattaattacaataagCTTTTAAAACCATGTTATCCAGCTTCAACATCTACCACTACGATATCGGTAACGGATGATCTAACTGAAAATACACAAATTTCACAATCAAAAGAGTTCATTAAACTGTTTGAACAGCGGCTACCCAGTGAAAAACTAAATGAATTTATGGTATGTACTGGAAAGTGGATAGGAGACGTAAAGGATGAAAATCTTTACTATTTTTGGAGAAAAACCAAAGGTTGTTTAGAAAAGACAACTAGGGGTACCGCAACTAATAAATCTTATGTAGATGATCCGACGTTAAACGGAAACATTTATTCAGACATTCCTACAAACACTATTGCTGACTGGTCTGAATTAAGCAGTAATATAGTAACGGAGCTTGATGCCCGAATGAATAGATTCCAAGCAAGTTCAACACCAAAATCTCAAAATATGTTACATAGAGAAACAAATGAATCCCCAATACAATATGCTAGTTTTAAAGAACACATTCAATCTCCTGCAGTTCAAAATATGATATCTACAATAGACTATGGGATGGATCTTGTTCTGAATAATGACAGCTACATCCGACAAAACGCAGAAAGAATAATAGATGATGAGATAATTTTACCAGAAGTGGTTAATACATCTGCAGCTGGAATGAATAACGAAACACAAATGGAAGAATTAGCCAACAAAATGCTATCATGA
Protein Sequence: MNKLKSGSQCAVESCKLSRRENVRLFMLRENHVKRDQWILNCNLQNLTKKHIYICEKHFEKKYFNKKGLNKYAIPTLKLTDFESNKDSDNVEMVTGLSVGHLSEIADNSCILIDSDALMHDSGRPCFPPSVKLNSNQLKTSIYSELTLEELSGLPENFTANINSEIEPPPCNTCLRNIKNETYYRLKYCKMLKNIQSKDRQISELNRKCNNFRRKLKRQHLKLSVFQRSKNNINDQIDQLNITENGKNFCKMLTVLIFDEKHIRSDLVYNTFSDQIDGFVDYGHNREAAIGKLVCSFMIRGVSSNWKYVLSYVVSENSIFADKLFLLVQENLKKCCELGINIRAVICDQGPNNRKCFNLFGITIERPVFMYNEIEIAALYDVPHLIKSVRNTLIKSDILCPDGLVSWNILIEWYNLEINSITKCCPKISTKHIYPNNFEKMRVKLATQIFSRSVAAGIKAAVQLKRISARCEETAISTYKFIEKIDKLFDCLNSKAKYDKNMFRCAFITGKEVDQFLEYMIHYITQVKIANKTTVYCFKGLIQSIKGIQTVSKQLLSEDIGIDYILTSRFNQDPIENLFAQIRTANGNNRNPSVHDFNHNIARIITIKILTPFSSISNCENDTDELIAVETITTEQSSEDENLISTNTSNDDEIADISENFFNLDVPLQETSMRYFVGYVAFINFDMQQSQPSSSIKKKPIKITTNKNSAERIKKALEFVANGTMSAYRASKIYAIPQQTLLDKIKKKYTKQLSAGAPTVLKPTEEELIVKWVQHLAEIGFPITKVQLIHSVTKLVKKLNRPNHFKNGIPGRHWYEGFLKRNPIIRRRISQNLTAPRAVVDEQQIKAWFKKVHTFLENKHLLEILKDPSRIFNCDESAFSLCPKGQGVLVTKGTKNVYSRSNNNEKECLTLSLGASADGELMPPFALFPYKRIPQTILVKYPKTWAIGRSDSGWMTCETFYEYITNVFHPFILKKNVKKPIILFMDGHSSHLSLPLSEFCRENKIILIALLPNATHILQPMDVAVFRSIKNSWKKEVQNFRLENNGSRLKREDFGPILQECISTTIKPEIIKHGFRACGLYPFDASKINYNKLLKPCYPASTSTTTISVTDDLTENTQISQSKEFIKLFEQRLPSEKLNEFMVCTGKWIGDVKDENLYYFWRKTKGCLEKTTRGTATNKSYVDDPTLNGNIYSDIPTNTIADWSELSSNIVTELDARMNRFQASSTPKSQNMLHRETNESPIQYASFKEHIQSPAVQNMISTIDYGMDLVLNNDSYIRQNAERIIDDEIILPEVVNTSAAGMNNETQMEELANKMLS

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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity: iTF_00455921;
90% Identity: iTF_00455926;
80% Identity: iTF_00456183;