Dfeb006772.1
Basic Information
- Insect
- Dilophus febrilis
- Gene Symbol
- Rel_1
- Assembly
- GCA_958336335.1
- Location
- OY284469.1:24461197-24464890[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- RHD
- Domain
- RHD domain
- PFAM
- PF00554
- TF Group
- Beta-Scaffold Factors
- Description
- Proteins containing the Rel homology domain (RHD) are eukaryotic transcription factors. The RHD is composed of two structural domains. This is the N-terminal DNA-binding domain that is similar to that found in P53. The C-terminal domain has an immunoglobulin-like fold (See PF16179) that functions as a dimerisation domain [1-2].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 4.8e-47 2.8e-43 148.2 0.6 1 168 53 238 53 239 0.91 2 2 1.7 1e+04 -3.3 0.0 13 30 343 360 340 437 0.66
Sequence Information
- Coding Sequence
- atgtcaCCATTTTCTGATACAACAAGTGTatataatggtaataatacccCATCACAAAATATGTCACCCATATCGATGAATGGCAGTGAACAATCTtatcaatttcaaaatttaacaattgcaaataataACAGTGAAACGGCAAAGGGACCAAAATTGGAAATCGTTGAACAACCTGTTGAAAAATTTCGTTTTCGTTATAAATCGGAAATGCACGGTACTCATGGTTCGTTGACCGGAccaaaaatggaaaaaaataaaaaaacatttccaaCTGTTGAATTACGTAATTACAGTGGTGAAGCCATCATACGTTGTtcattatatcaaaataatccgtataagaaaattcaacaTTCACACAGTTTGGTTGTGAAAAAAGGCAGTGAAGATTTTCGTGATCCACATGATGTTTATGTATCACCAGTAAATGGTTATCTTGCTGTttttcaAGGTATGGGAATTATTCATACAGCTAAACGATTTATTGCCGAAGAacttcataaaaaattaattgaaaaacgTAAATTTGAAACAAATGAACCACAATTAACATTACTGGAAGAGACTAAAATAAAAAATCAAGCCGAACAAGAAGCAAAAACAATGAATTTAAATCAAgttgttttatgttttgaaGCCTTTACAAAATCATCATTTGATAATGCTTATGTACGTTTATGTGAACCGGTTTTTTCAACaccaattaataatatgaaaagtgCTTTAACTggtgaattaaaaataacaagaCTTAGTTCAGCTGTTAGCCGTGCCGATGGTGGTGATgatctatttttatttgttgaaaaagttggaaaaaaaaatattaaggTTAGATTTTATGAAGTTCAAGATGATGAGGAGGTATGGCAAGACTGGGGACGATTTTCCGAAGCTGATGTTCATCATCAATATGCAATTGCATTACGAACACCACCATATCGTGATGTGAACATTGAAActtataaagatgtttatattcaattgtatCGACCAAGTGATTCGGACATAAGTGAACCAGTTAAATTTCGTTATAAACCACGTCATGGTACAACGAATAGTCGTAAACGTCAACGACACAATTCCAATTTAAGTTCATCGGAATTACCAGTTTCTATTCATGaacaatttaatgataatccggttgctgctgctgctgttgccGTCGACAATGacaatcaattattaaaatcgAATTCTACTTTGATTGGCGAACAAACAACAACCATTGGTTATGatcaaaataattcatatcaacaacaacaacaacgaggttataataattcacaaaatattatgatgatgaataataaTGGGTATTCGGAACAAATAACAGATGATTTACGTTTAAATTCagatgatttaaaatataattcggATTTGTTTAAAGCTAAATCTGGTGATATGCACGAATTTActaatattttaattagtAATCCAGATGaaTTAATGAGATTATGTGGTTTAAATGATGATCATGATAATCGTAAATTAACAACCGATGGGATATCATCAGCGGCCGTTCAACAGCCAAGTTCAATGGCAACGGCAGGAATCAGTGTCGGTGATATgtttcatattaataatattcgtAAAATACTTGAAATCCATGACGATAAATCGATAAATGATTCCGATAAAAAAGCATcgataatttcatattttatacagGATAATTTAGAAAGtGTTCTTCATAcatgcatttataataataatgaacaaatatttaataaatatttaatggtaATTGAAAAATTCCAATTACAAAATGACATAttacaatttcaaaataaatttcaagaATGTTGTTTGCATACAGCATGTTTAATAAATCgtccaaaatatataaaatatttactatatgcTGGTGCTAATCCAAATATAACGGATAATCAAGGTGATACACCATTACATATTGCGGTGGCCGAAGGAAATTATGAATGTGTTGCAAATCTATTGGATGAATATCAAAATCAAGAATCAAAAAATCaaccaataataaatatactattaaCAAATGATGATGGGCTAACACCATTACATTTAGCTGTAAAACGTaataatttagatatatttaaattattaatcaaatCAATGATGATTGAACGGAATAATAATACATCATTAACCGATGTTATCGATcataaaaatggaaataatttattacacatAGCCATTGAACATCAATCCATTGAAATATGTAAATTTCTGTTAAGTAATAATAAGAATcaacataatttaaatgttatgcAAAAAAATGCATCTGGTTACAGTCCACTAGAATTATTAGAATGTTTATTGGACGATGAggatataacaataataaatcgacaagaattaaatcaaattaaaaataaattattaaattatggtAATGAAACgcataatgataataatagatcagaaaaattgaatgatacCAGAAATTCAACTAAATCACAATTGAATGAATTctatgatgaaaatgaaaataacaatgaatgtggtggtggtggtggtgcttCTGCTGGTGATAATAAATCTAATGATGATATTGCAACGAATAAAACTGATGCtgttaatcaaaataattcgTATGCCGATGACGATGAAGATAAAATAACATTGGATGGAAAATGTTTagaaaaattatgtaaaacatttaatcaatccaataaatggaaaatattggcagaaatattagattttaatagttttattgGTGTATGgtcaaaaaatgaaaatccatcaaaaatgttatttacatttttagaaATGCAGGGTGTTTCTTTATCACAATTGATTGATGCattcaatcatttaaattctATTGATGGATTAGATGCAATAAATGATATGGTGGCCAGACGATTAGAAGAAACAGattga
- Protein Sequence
- MSPFSDTTSVYNGNNTPSQNMSPISMNGSEQSYQFQNLTIANNNSETAKGPKLEIVEQPVEKFRFRYKSEMHGTHGSLTGPKMEKNKKTFPTVELRNYSGEAIIRCSLYQNNPYKKIQHSHSLVVKKGSEDFRDPHDVYVSPVNGYLAVFQGMGIIHTAKRFIAEELHKKLIEKRKFETNEPQLTLLEETKIKNQAEQEAKTMNLNQVVLCFEAFTKSSFDNAYVRLCEPVFSTPINNMKSALTGELKITRLSSAVSRADGGDDLFLFVEKVGKKNIKVRFYEVQDDEEVWQDWGRFSEADVHHQYAIALRTPPYRDVNIETYKDVYIQLYRPSDSDISEPVKFRYKPRHGTTNSRKRQRHNSNLSSSELPVSIHEQFNDNPVAAAAVAVDNDNQLLKSNSTLIGEQTTTIGYDQNNSYQQQQQRGYNNSQNIMMMNNNGYSEQITDDLRLNSDDLKYNSDLFKAKSGDMHEFTNILISNPDELMRLCGLNDDHDNRKLTTDGISSAAVQQPSSMATAGISVGDMFHINNIRKILEIHDDKSINDSDKKASIISYFIQDNLESVLHTCIYNNNEQIFNKYLMVIEKFQLQNDILQFQNKFQECCLHTACLINRPKYIKYLLYAGANPNITDNQGDTPLHIAVAEGNYECVANLLDEYQNQESKNQPIINILLTNDDGLTPLHLAVKRNNLDIFKLLIKSMMIERNNNTSLTDVIDHKNGNNLLHIAIEHQSIEICKFLLSNNKNQHNLNVMQKNASGYSPLELLECLLDDEDITIINRQELNQIKNKLLNYGNETHNDNNRSEKLNDTRNSTKSQLNEFYDENENNNECGGGGGASAGDNKSNDDIATNKTDAVNQNNSYADDDEDKITLDGKCLEKLCKTFNQSNKWKILAEILDFNSFIGVWSKNENPSKMLFTFLEMQGVSLSQLIDAFNHLNSIDGLDAINDMVARRLEETD
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
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- 90% Identity
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- 80% Identity
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