Basic Information

Gene Symbol
Kdm5
Assembly
GCA_947369205.1
Location
OX376309.1:26959589-26967809[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 4.8e-24 2.1e-20 74.0 0.0 2 89 124 207 123 207 0.94
2 2 5.3 2.3e+04 -3.1 0.0 26 62 1451 1487 1433 1500 0.64

Sequence Information

Coding Sequence
ATGACTTCCAAAGTAGAAAATTCTCCTAACAGTTTAAAGTCTTCAAATCAAAACTCTCTATTGGGTGATTATAAAATAAATGGTAAAATAGCACCTTTAAATGGATCGAAAAATCCTGCAGGATCTGTTAAATCTGAAAATTTTGAGTTCGAAATACCACCCGAAGCTCCCGTCTTCTATCCATCCGAAGAAGAATTTAAAGATCCCCTAGCCTACATAAATCAAATTAGGCCTGCTGCCGAAAGTACTGGAATATGCAAAATCAAACCACCTGCCAATTGGCAACCTCCATTTGCCGTCGATGTCGATAAACTTAGGTTTACTCCTAGAATCCAAAGGCTGAATGAATTGGAAGCTAAAACAAGAGTCAAATTAAATTTTTTAGATCAAATAGCAAAATTTTGGGAACTACAGGGATCCGCACTTCGGATCCCGATGGTAGAAAAGAGAGCATTAGATTTATACACTTTACATAGATTAGTCCAAAAAGAAGGAGGTTCAGATGTCGTCTCGAAAGATAGAAAATGGTCGAAAATCGCCGGTTTTATGGGGTATCCACTTGGAAAAGGCATAGGAACCATTCTAAAAACGCATTACGAAAGACTACTATATCCATATGATGTATTCAAAAACGGAAAATCAGTCAGTATTAGTGTTGAAAACAGTCCACCAGATAGTGATCGGGATTATAAACCACATGGAATAGTTGGGCGCATGAATGTGAAACCACCTAACGATAAACATTTTAGACGGTCGAAACGATACGAAGATGACCCAGATTCCAAGTCGGAGATAAACACAAAAGATACAACACCTGTCAAATTAGAACCCATGGATGATGTCGAATCAGATCGAAATAAGGAACTGAAGCGATTACAGTTTTACGGTGCAGGACCAAAAATGGCAGGCTATAACATTAAAAACGAGGGAAAGATGAAATCTAAAAGCAGTAATTGTGATGATCCGCTTGCAAAGTATGTTTGCCAACATTGCTCACGTGGGGATGTTGAGGAATCCATGCTGTTATGTGATGGTTGTGATGACAGTTACCATACATTTTGCCTTATGCCACCTCTAACTGAAATTCCAAAAGGTGATTGGCGCTGCCCTAGTTGTGTAGCTGTGGAAGTATCAAAACCGACTGAAGCTTTTGGATTTGAACAAGCTCAACGTGAATACAGCTTACAACAGTTCGGTGAAATGGCTGATCAATTTAAATCGGACTATTTCAATTCGCCTGTACATTTGGTTAGAACTTGTGATGTAGAAAAGGAATTTTGGCGCATTGTGTCTTCCATTGATGAAGATGTTACAGTTGAATATGGAGCAGATTTACATACTATGGATCACGGTTCTGGATTCCCGACATCCACATCAATTAACCTGCTTCCAGGCGATATAGAATATGCAGATTCCCAGTGGAATTTAAATAATTTGCCAGTCCTCGAAGGTTCCGTATTAGGATATATAAATGCAGACATTTCTGGAATGAAGGTGCCTTGGATGTATGTGGGGATGTGTTTTTCTACATTTTGTTGGCACAATGAAGATCATTGGAGTTATTCCATTAATTACCTTCATTGGGGTGAACCAAAAACATGGTATGGCGTACCAGGTACCAAAGCAATTGCTTTTGAAGAGACTATGAAATCAGCTGCTCCAGAATTATTTCATTCTCAACCCGATTTATTGCATCAGTTAGTGACGATCATGAACCCGAATATATTAATGAGTGCTGGAGTTCCAGTATTCAGAACCGATCAAAATGCAGGAGAATTTGTGGTCACTTTTCCTCGAGCTTATCATGCCGGATTTAACCAAGGGTACAACTTTGCTGAAGCAGTAAATTTTGCTCCTGCCGATTGGCTAAAAATGGGTCGAGAGTGTATTCAACATTATTCGATTTTACGACGTTTTTGTGTTTTCTCTCATGACGAATTGGTCTGTAAAATGGCTTTAGAACCCGAAAAATTGACTCCGTTAATAGCTGCATCTTTATACGAAGACATGCTACAAATGGTCGACTCAGAAAAACGAATGCGTAAAAATCTTTTAGATTGGGGTGTCACTAACGCGTTAAGGGAATCATTTGAACTTTACCCAGATGACGAACGACAGTGTGAAGTGTGTAAGACGACGTGCTTTCTGTCAGCCATAACTTGTTCTTGTAGTGGTAAAACTATCGTATGTTTGCGGCATTTTACTAATCTATGTGAATGTCCGCCTAGTACTCACACGTTGCGTTACCGTTACACTCTTGACGAATTACCAAAGATGTTAAACAAATTGAAAATTAAAGCAGAAGCATTTGATTTGTGGTTAAGCAAGGTACGAGATTCTTTAGATCCCTGTGTACCCTCTTCTTTAACTCTTAATGAGTTAAAAGGTCTTTTAGATGAAGCAGAAGAAAAAAATTTTCCGAAAAGCGATTTATTAGCTACTTTATCGAGCGCCATCGAGGATGCAGAAAAATGTGCAAGTGTTATACGACAGCTCGATTCCACAATGGCACGCACACGTACTAGAAATTCTACTGATAGAAAATATCACTTAAACTTAGAAGAACTTAATTTATTTATAGGCGAAATTGAAAGCTTGGCTTGCATTTTGGAGGAGGCACAAATTGTAAGAGATTTGTTAGAAGATTCAAATAAATTTGAAGCCAATAGTGAAATATTTATGAATATGTCATTATCCGATTGCAGTTGTGCAGAAATTGAAAAGTGCTTGGAACACGGTGAAGCTATTTGTATTGAACTACCATCTTTAAATATAATGCGTGAACGTTTACGTCAAGTTAAATGGTTAGAGGATGTTAATGAAACACGAGAAAAATCCGAACCATTAAGTAAAGACATAATAAATCGTTTTATTGAAAGCGGCGAGCTGCTAAATTCGGATGTACTAATTGAAAAAGAATTAAGTAATTTGCGGACTTTATTATCATGTGCTGACAATTGGGAGGTACGTGCTCAGGAAATTTTAAATAAACCTCATCCAGAATTGATAACGGAGATTGAATTGCTGCTTGCAGAAGCTAAACAAATCAACGCTTACCTTCCAACTGAAAAATTTTTAATTGAAACTGTAGATTGTGTTAAGCAGTGGTCAAAACAATTGGATGAAATTAATGCTGCAGAGTTTTACCCTTACATTAATGTTGTAGAAAATTTAATTCAAAAGGGTCGTACTATTCCTCTGCCCATTCCACATGTCTCGGATCTCGAACAATACGTCATAGCTGGCTATAACTGGAGAGATAAAACTAGTCGAATATTTTTACGTAAGAATTCTGTCTTAAATTTACTCGATGCTTTATCTCCTCGTCATCCGCTTTCGTTAAATAATGCAAAGGCTCGTCGGAAACTCACAGAAGAAATGCAACCGTTTATGGTAACCAACGAAATGGAACCGGTTGATGTGGTAAACACATTTAAAGAAGCAGAAGAACGCGAATTAGAAGGAATACGACAGCTACGGAGCATAAATTCAGCTAAAAGTTTTAACGCGGAAAGTGATAGCAAGTTTTGTGTTTGTCAACGAAATGCGTTTGGTGTGATGATGCGTTGTGAGTTATGTCAAGATTGGTTCCACTCGACATGTGTAACGTTGCCAAAAATTGCTAACATTAAAGTGAAGAGTAATTTTACTGCTACTTCGCTTAGGTTGGGTTTTAAAGATTCTAAATTTCTATGTCCAAGTTGTTTTCGTACAAAACGTCCTCGACTTGAAGTTATTTTAAGTTTATTGGTATCCCTTCAGAAGTTATCGGTTCGTATACCAGAAGGTGAGGCTTTACAGTGTTTAACGGAGCGTGCAATGACGTGGCAAGATAGAGTAAAACAATTACTGCAAACAACCGATATAGAAATTGCAATGTCTAAATTGTCACTCTTAACACAAAAATATTCAGAAGCAGCTGCTCGTCAAAAAACAGAGAAAATCATCAGTTCAGAGTTAAAGAAAGCTGCTAGTAATCCAGATTTGAAACAACACTTGCACGATATTGCTTCGTGGAGTGGAATAACTCCAGATGTAGCTGATGCAACTATGGAAGTAGGCGAATGTACATCCACCGTCAGTTCATCTCAAGATGACACGATCGATGAACATGCTTATTCTTTACATATTCCGAACATTGATTCTAGAGATTACATTTTAAAATTGCCAACTTCGACACAACAACTTTTGGAAGATATTTTATTAGAAGGCGATCTTTTAGAAGTGTCACTTGATGAGACTTTACAGTTATGGAAGCTTATCCAAGTATCTCGGGATCCTGAAAAGGAACCAGTTTTAATGGACTTCAGTAGTCCCTCGAAAGTATCTTTGCTGAAAAAGACTCGTAAGCGGAGATCAGAGGAAGTGGACGTCAGAAAACTAAAACAATTTAAAAATGATGGTACTAAAAAGTTAACAAAGCGTAAAACTAAAAATTTTAAGGATGTAACTCGGAAGCAGCGGTCAGATGCAAACAATTCACGACGTAGTCAAGGACAAAGTAGTTCTGACGATGAAGTAGAAGAAAAGTGTGCTAGTGTTAATTGCCTTCAACCTTCCAGTGATGAGGTGGACtgggtgcagtgtgatggtggttgtgaacaatggtttcatatggcatgtgttggTTTATCTGCTCAAGAAATTAATGAAGATGAAGATTACATTTGTATGACATGCTCTCGTTCCAGTATTGCTTTTGAAAATCTCCAACGGTCTCCCGAAAGCCAATTATCCGATAACCCACAATCTCCAGATTCTACCCAGCCACTATCGATGCTTAAAGAAGTTTAG
Protein Sequence
MTSKVENSPNSLKSSNQNSLLGDYKINGKIAPLNGSKNPAGSVKSENFEFEIPPEAPVFYPSEEEFKDPLAYINQIRPAAESTGICKIKPPANWQPPFAVDVDKLRFTPRIQRLNELEAKTRVKLNFLDQIAKFWELQGSALRIPMVEKRALDLYTLHRLVQKEGGSDVVSKDRKWSKIAGFMGYPLGKGIGTILKTHYERLLYPYDVFKNGKSVSISVENSPPDSDRDYKPHGIVGRMNVKPPNDKHFRRSKRYEDDPDSKSEINTKDTTPVKLEPMDDVESDRNKELKRLQFYGAGPKMAGYNIKNEGKMKSKSSNCDDPLAKYVCQHCSRGDVEESMLLCDGCDDSYHTFCLMPPLTEIPKGDWRCPSCVAVEVSKPTEAFGFEQAQREYSLQQFGEMADQFKSDYFNSPVHLVRTCDVEKEFWRIVSSIDEDVTVEYGADLHTMDHGSGFPTSTSINLLPGDIEYADSQWNLNNLPVLEGSVLGYINADISGMKVPWMYVGMCFSTFCWHNEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGTKAIAFEETMKSAAPELFHSQPDLLHQLVTIMNPNILMSAGVPVFRTDQNAGEFVVTFPRAYHAGFNQGYNFAEAVNFAPADWLKMGRECIQHYSILRRFCVFSHDELVCKMALEPEKLTPLIAASLYEDMLQMVDSEKRMRKNLLDWGVTNALRESFELYPDDERQCEVCKTTCFLSAITCSCSGKTIVCLRHFTNLCECPPSTHTLRYRYTLDELPKMLNKLKIKAEAFDLWLSKVRDSLDPCVPSSLTLNELKGLLDEAEEKNFPKSDLLATLSSAIEDAEKCASVIRQLDSTMARTRTRNSTDRKYHLNLEELNLFIGEIESLACILEEAQIVRDLLEDSNKFEANSEIFMNMSLSDCSCAEIEKCLEHGEAICIELPSLNIMRERLRQVKWLEDVNETREKSEPLSKDIINRFIESGELLNSDVLIEKELSNLRTLLSCADNWEVRAQEILNKPHPELITEIELLLAEAKQINAYLPTEKFLIETVDCVKQWSKQLDEINAAEFYPYINVVENLIQKGRTIPLPIPHVSDLEQYVIAGYNWRDKTSRIFLRKNSVLNLLDALSPRHPLSLNNAKARRKLTEEMQPFMVTNEMEPVDVVNTFKEAEERELEGIRQLRSINSAKSFNAESDSKFCVCQRNAFGVMMRCELCQDWFHSTCVTLPKIANIKVKSNFTATSLRLGFKDSKFLCPSCFRTKRPRLEVILSLLVSLQKLSVRIPEGEALQCLTERAMTWQDRVKQLLQTTDIEIAMSKLSLLTQKYSEAAARQKTEKIISSELKKAASNPDLKQHLHDIASWSGITPDVADATMEVGECTSTVSSSQDDTIDEHAYSLHIPNIDSRDYILKLPTSTQQLLEDILLEGDLLEVSLDETLQLWKLIQVSRDPEKEPVLMDFSSPSKVSLLKKTRKRRSEEVDVRKLKQFKNDGTKKLTKRKTKNFKDVTRKQRSDANNSRRSQGQSSSDDEVEEKCASVNCLQPSSDEVDWVQCDGGCEQWFHMACVGLSAQEINEDEDYICMTCSRSSIAFENLQRSPESQLSDNPQSPDSTQPLSMLKEV

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_00267914;
90% Identity
iTF_00267914;
80% Identity
-