Basic Information

Gene Symbol
Kdm5
Assembly
GCA_949152465.1
Location
OX424441.1:26936946-26944304[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 3.8e-24 2.1e-20 74.0 0.0 2 89 124 207 123 207 0.94
2 2 2.7 1.5e+04 -2.5 0.0 25 62 1450 1487 1433 1501 0.65

Sequence Information

Coding Sequence
ATGACTTCCAAAGTAGAAAATTCTCCTAACAGTTTAAAGTCTTCAAATCAAAACTCTCTATTGAgtgattataaaataaatggtaAAATAGCACCTTTAAATGGATCAAAAAATCCTGCAGGATCTGTTAAatcggaaaattttgaatttgaaataccACCGGAAGCTCCCGTCTTCTATCCatctgaagaagaatttaaagaTCCCCTAGCCTACATCAATCAAATTAGGCCTGCTGCTGAAAGTACTGGAATATGCAAAATCAAACCACCTGccaaTTGGCAACCTCCATTTGCCGTCGATGTCGATAAACTTAGGTTCACTCCTAGAATCCAAAGGCTGAATGAATTGGAAGCTAAAACAAgagtcaaattaaattttttagatcaAATAGCAAAATTTTGGGAACTACAGGGATCCGCACTTCGGATCCCTATGGTAGAAaaaagagcattagatttaTACACTTTACATAGATTAGTCCAAAAAGaagGAGGTTCAGATGTCGTCTCCAAAGATAGAAAATGGTCGAAAATCGCCGGTTTTATGGGGTATCCACTTGGAAAAGGTATAGGAACCATTCTAAAAACGCATTACGAAAGACTACTATATCCATATGATGTATTCAAAAACGGAAAATCAGTCAGTATTAGTGTTGAAAACAGTCCTCCAGATAGTGATCGGGATTATAAACCACATGGAATAGTTGGACGCATGAATGTGAAACCACCCAACGATAAACATTTTAGACGATCAAAACGATACGAAGATGACCCGGATTCCAAGTCAGAAATTAAcacaaaagaTACGACACCTGTAAAATTAGAACCCATGGATGATGCCGAATCGGATCGAAATAAGGAACTGAAGCGATTGCAGTTTTACGGTGCTGGACCGAAAATGGCAGGCTATAACATTAAAAATGAAGgaaaaatgaaatcaaaaaaCAGTAATTGTGATGATCCGCTTGCAAAATATGTTTGCCAACATTGCTCACGTGGAGATGTCGAGGAATCCATGCTGTTATGTGATGGTTGTGATGATAGTTACCATACATTTTGCCTTATGCCACCTCTAACTGAAATTCCAAAAGGTGATTGGCGCTGTCCTAGTTGTGTAGCTGTTGAAGTATCAAAACCGACTGAAGCTTTTGGATTTGAACAAGCTCAACGTGAATATAGCTTACAACAGTTCGGTGAAATGGCTGATCAATTTAAATCGGACTACTTTAATTCGCCTGTACATttggTTAGAACTTGTGATGTAGAAAAGGAATTTTGGCGCATTGTGTCTTCCATTGATGAAGATGTTACAGTTGAATATGGAGCAGATTTGCACACCATGGATCACGGTTCTGGATTCCCGACATCCACGTCAATTAATCTGCTGCCAGGTGACATAGAATATGCAGATTCCCAGtggaatttaaataatttgccaGTCTTGGAAGGTTCCGTATTAGGATATATAAATGCAGACATTTCTGGAATGAAgGTGCCTTGGATGTATGTGGGGATGTGTTTCTCTACATTTTGTTGGCACAATGAAGATCATTGGAGTTATTCCATTAATTATCTTCATTGGGGTGAACCAAAAACATGGTATGGCGTACCTGGTACTAAAGCAATTGCTTTTGAAGAGACTATGAAATCAGCTGCTCCAGAATTATTTCATTCTCAGCCCGATTTATTGCATCAGTTAGTGACGATCATGAACCCAAATATATTAATGAGTGCTGGAGTTCCAGTATTCAGAACCGATCAAAATGCAGGAGAATTTGTGGTTACTTTTCCTCGAGCTTATCATGCTGGATTTAACCAagggTACAACTTTGCTGAAGCAGTAAATTTTGCTCCCGCCGATTGGCTAAAAATGGGTCGGGAGTGTATTCAACATTATTCGATTTTACGACGTTTTTGTGTTTTCTCGCACGACGAGTTGGTCTGTAAAATGGCTTTGGAACCCGAAAAATTGACTCCGTTAATAGCTGCATCCTTATACGAAGACATGCTCCAAATGGTCGACTCGGAAAAACGAATGCGTAAAAATCTTTTAGATTGGGGTGTCACTAATGCATTAAGGGAATCATTTGAACTTTACCCAGATGATGAACGACAGTGTGAAGTGTGTAAGACGACGTGCTTTCTGTCAGCCATCACCTGTTCTTGTAGTGGTAAAACTATTGTGTGTTTGCGGCATTTTACTAATCTATGTGAGTGTCCACCTAGTACCCACACATTGCGTTACCGTTACACTCTTGACGAATTACCAAAGATgttaaacaaattgaaaattaaagcaGAAGCGTTTGATTTGTGGTTAAGCAAGGTACGAGATTCTTTAGATCCATGCGTACCCTCTTCTTTAACTCTTAATGAGTTAAAAGGCCTTTTAGATGAagcagaagaaaaaatttttccgaAGAGTGATTTATTAGCAACTTTATCGAGCGCCATCGAGGATGCAGAAAAATGCGCAAGCGTTATACGTCAGCTCGATTCTACAATGGCACGCACACGTACTAGAAATTCTACCGATAGAAAATACCACTTAAATTTAGaagaacttaatttatttataggcGAAATTGAAAGCTTAGCTTGCATTTTGGAGGAGGCACAAATTGTAAGAGATTTGTTAGAAGACTCAAATAAATTTGAAGCCAATAGtgaaatatttatgaatatgcCATTATCCGATTGCAGTTGTGAACAAATTGAAAAGTGCTTGGAACATGGTGAAGCTATTTGTATTGAATTACCATCTTTAAATATAATGCGTGAACGTTTACGTCAAGTTAAATGGTTAGAGGATGTTAACGAAACGCGAGAAAAATCTGAACCATTAAGTAAAGACATAATAAATCGTTTTATTGAAAGTGGCGAGCTGCTAAACTCGGATGTACTAAttgaaaaagaattaaataatttacggACTTTATTATCGTGTGCCGACAATTGGGAGGTACGTgctcaggaaattttaaataaacctcaTCCAGAGTTGATAACAGAGATTGAATTGCTTCTTACAGAAGCTAAACAAATCAACGCTTACCTTCcaactgaaaaatttttaattgaaactgTAGATTGTGTTAAGCAGTGGTCAAAACAATTAGATGAAATTAATGCTGCAGAGTTTTACCCTTACATTAatgttgtagaaaatttaattcaaaaggGTCGTACTATTCCTCTGCCCATTCCACATGTCTCAGATCTCGAACAATACGTCATAGCTGGATATAACTGGAGAGATAAAACCAGTCGGATATTTTTACGTAAGAATTCTGTGTTAAATTTACTCGATGCTTTATCTCCACGCCATCCATTTTTGTTGAACAATGTTAAGGCTCGTCGAAAACTCTCCGAAGAAATTCAACCGTTTATGGTAACCAACGAAATGGAACCGGTGGACGTGGTAAACACATTTAAAGAAGCCGAAGAACGCGAATTAGAAGGAATACGACAGCTACGGAACATAAATTCAGCTAAAAGTTTTAACGTGGAAAGTGACAGCAAGTTTTGTGTTTGTCAACGAAATGCTTTTGGTGTGATGATGCGTTGTGAGTTATGTCAAGATTGGTTTCACTCGACATGTGTAACGTTGCCAAAAATTGCCAACATTAAAGTGAAGAGTAATTTTACTGCTACTTCGCTTAGGTTGGGGTTTAAAGATTCTAAATTTCTATGTCCAAGTTGTTTTCGTACAAAACGTCCTCGACttgaagttattttaagtttattggtATCCCTTCAGAAGTTGTCGGTTCGTATACCGGAAGGTGAGGCTTTACAGTGTTTGACCGAACGTGCAATGACGTGGCAAGATAGAGTAAAACAATTACTACAAACAACCGACATAGAAATTGCAATGTCCAAATTGTCACTcttaacacaaaaatattcAGAAGCAGCGGCTCGTCAAAAAACAGAGAAAATCATTAGTTCGGAGTTAAAAAAAGCTGCCAGTAATCCAGATTTGAAACAACACTTGCACGATATTGCTTCATGGAGTGGAATAACTCCAGACGTAGTTGATCCAACCATGGAAGTAGGCGAATGTACATCGACCGTCAGTTCATCTCAAGATGACACGATCGATGAGCATGCTTATTCTTTACATATTCCAAACATTGATTCTAGGGACTACATTTTGAAATTGCCGACTTCCACACAACAACTTTTGGAAGATATTTTATTAGAAGGCGATCTTTTAGAGGTATCACTTGATGAGACTTTACAGTTGTGGAAGCTTATCCAAGTATCTCGTGATCCTGAAAAGGAACCAGTTTTAATGGACTTCagtAGTCCCTCAAAAGTATCTTTGCTGAAAAAAACTCGTAAACGGAGATCAGAGGAAGTCGACGTCagaaaactaaaacaatttaaaaatgatggtattaaaaagttaacaaagcgcaaaactaaaaattttaaggatGTCACTCGGAAACAGCGGTCAGATGCAAACAATTCACGACGTAGTCAAGGACAAAGTAGTTCTGACGATGAAGTAGAAGAAAAGTGTGCTAGTGTTAATTGCCTTCAACCTTCCAGTGATGAAGTGGATTGGGTGCAGTGTGATGGTGGTTGTGAACAATGGTTTCATATGGCATGTGTTGGTTTATCTGCTCAAGAAATTAATGAAGATGAAGACTACATTTGTATGACATGTTCTCGTTCCAGTATTGCTTTTGAAAATCTCCAACGTTCTCCCGAAAGCCAATTATCCGATAACCCACAATCTCCAGATTCTACTCAGCCACTATCAATGCTTAAAGAAGTTTAG
Protein Sequence
MTSKVENSPNSLKSSNQNSLLSDYKINGKIAPLNGSKNPAGSVKSENFEFEIPPEAPVFYPSEEEFKDPLAYINQIRPAAESTGICKIKPPANWQPPFAVDVDKLRFTPRIQRLNELEAKTRVKLNFLDQIAKFWELQGSALRIPMVEKRALDLYTLHRLVQKEGGSDVVSKDRKWSKIAGFMGYPLGKGIGTILKTHYERLLYPYDVFKNGKSVSISVENSPPDSDRDYKPHGIVGRMNVKPPNDKHFRRSKRYEDDPDSKSEINTKDTTPVKLEPMDDAESDRNKELKRLQFYGAGPKMAGYNIKNEGKMKSKNSNCDDPLAKYVCQHCSRGDVEESMLLCDGCDDSYHTFCLMPPLTEIPKGDWRCPSCVAVEVSKPTEAFGFEQAQREYSLQQFGEMADQFKSDYFNSPVHLVRTCDVEKEFWRIVSSIDEDVTVEYGADLHTMDHGSGFPTSTSINLLPGDIEYADSQWNLNNLPVLEGSVLGYINADISGMKVPWMYVGMCFSTFCWHNEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGTKAIAFEETMKSAAPELFHSQPDLLHQLVTIMNPNILMSAGVPVFRTDQNAGEFVVTFPRAYHAGFNQGYNFAEAVNFAPADWLKMGRECIQHYSILRRFCVFSHDELVCKMALEPEKLTPLIAASLYEDMLQMVDSEKRMRKNLLDWGVTNALRESFELYPDDERQCEVCKTTCFLSAITCSCSGKTIVCLRHFTNLCECPPSTHTLRYRYTLDELPKMLNKLKIKAEAFDLWLSKVRDSLDPCVPSSLTLNELKGLLDEAEEKIFPKSDLLATLSSAIEDAEKCASVIRQLDSTMARTRTRNSTDRKYHLNLEELNLFIGEIESLACILEEAQIVRDLLEDSNKFEANSEIFMNMPLSDCSCEQIEKCLEHGEAICIELPSLNIMRERLRQVKWLEDVNETREKSEPLSKDIINRFIESGELLNSDVLIEKELNNLRTLLSCADNWEVRAQEILNKPHPELITEIELLLTEAKQINAYLPTEKFLIETVDCVKQWSKQLDEINAAEFYPYINVVENLIQKGRTIPLPIPHVSDLEQYVIAGYNWRDKTSRIFLRKNSVLNLLDALSPRHPFLLNNVKARRKLSEEIQPFMVTNEMEPVDVVNTFKEAEERELEGIRQLRNINSAKSFNVESDSKFCVCQRNAFGVMMRCELCQDWFHSTCVTLPKIANIKVKSNFTATSLRLGFKDSKFLCPSCFRTKRPRLEVILSLLVSLQKLSVRIPEGEALQCLTERAMTWQDRVKQLLQTTDIEIAMSKLSLLTQKYSEAAARQKTEKIISSELKKAASNPDLKQHLHDIASWSGITPDVVDPTMEVGECTSTVSSSQDDTIDEHAYSLHIPNIDSRDYILKLPTSTQQLLEDILLEGDLLEVSLDETLQLWKLIQVSRDPEKEPVLMDFSSPSKVSLLKKTRKRRSEEVDVRKLKQFKNDGIKKLTKRKTKNFKDVTRKQRSDANNSRRSQGQSSSDDEVEEKCASVNCLQPSSDEVDWVQCDGGCEQWFHMACVGLSAQEINEDEDYICMTCSRSSIAFENLQRSPESQLSDNPQSPDSTQPLSMLKEV

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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2