Basic Information

Gene Symbol
CSRNP3
Assembly
GCA_932526615.1
Location
CAKOBF010000233.1:2059193-2063462[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
CSRNP_N
Domain
CSRNP_N domain
PFAM
PF16019
TF Group
Unclassified Structure
Description
This presumed domain is found at the N-terminus of cysteine/serine-rich nuclear proteins. These proteins act as transcriptional activators [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 6 0.1 2.1e+03 -1.4 2.4 78 110 46 78 24 133 0.55
2 6 0.56 1.2e+04 -3.8 1.0 56 90 293 327 280 348 0.44
3 6 1.1e-95 2.2e-91 305.8 8.0 1 217 399 599 399 600 0.92
4 6 0.068 1.4e+03 -0.8 0.4 173 195 626 648 623 654 0.90
5 6 0.15 3.2e+03 -2.0 0.1 114 143 1018 1047 974 1071 0.71
6 6 0.44 9e+03 -3.5 9.3 61 110 1120 1169 1082 1229 0.59

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTTCAGACCTATAAAAAATTTTATATCATATTTTCAAAAGAGTACGAATGGTGCAGGAATACTTGGTTCTACACCAAATACAACAAATAATGTTAATGAAACCGAAAATATGGAGAATAAAAATATTTTAGATTCATCTGAAAATAATAAAATTAATGAAAATGATAAAATAAATGAAACTGTAGAAAATAATACAAGAGAAGAAGATGAAGAAGAAACAATATCATCATGTTCGCCATTACAAAAAACTATACAATCACAACATGATCAAAATGAAAATGAAGTTTGTAAAGAAATAAGTAATAATCTTACTTCTACCATTCCTGAAAATTGTACGTCAATAGATAATATAATTAATAATCCTTCTTTAATCAGTTGTTCTAGCCCAACATCAAAAAATGTTGAATTAATAAATTTTCCAAGAACAGAATGTAGCAGTCCTATAAATGTAGATGTAACAAGTACAGAATATTCAATTGAAATCACAAGTCCTAGTTGTAGTCCAATAAAAATAATATGTGATCCATTGACTGATAATAGTCCAACTAAAATTTATGTAAATGGAAATAAAAATTTTAAATGTTCAAAAGATCTAAATGAAATAAATAATTTGAATGATGATTTGTTATTAAAAACATTGGATAATGATGATGAAATAATAGTTGATGAAGAAATTATTGTTATTTCAGATAATGATAATAATTCAAATATTTTAGATTCTGGATCAGATCCTTTAGCATTGGATGATTGTCACATTGAAGATAATTTAGATTTATTACAAAATCATTCATCATCGTCATCAATTAATGAAACTGATGGAATAATTTGTATTATAAATGTCGATAATATTAAAGAGACAAATAATAGTGTGAATAATGAATCAAAAAATACATTATTAACAAATTATAATGAATCATCAAAAAATTCAACTAATAATTATGATATTTCAAATGATAAAGTTAAAGTTGGTAACGAAGAACAAGAATTAAGAAGTGATGGCTCAGATTCAGGTTTAGGATTAGAAACATCAACAAATTTACAAATTCCTACAACAAGTAATACTAATATAAATTCTACAATAAATTTTATTTCTGAACCTCAAATTTGTCATCTTCCTGTGAATATAATACCAAGAAAAAGTAATTTAAAACGAAGATTGAATGATGATCCAATAATTAGTTTAGCAGAGAAAAAAACAAAACGTTCAATTCATTTTAATGGTGTTAGTGTTTATTATTTTCCTCGAATGCAAGGTTTTGCTTGTGTACCATCACAGGGTGGCTGTACTTTAGGAATGGGTTCAAGGCATGTACACTATAAGACATTTTCGTTAACAGATTATGCTGCAGAACAAAGGCGTGTTCATAAGCAACAAATGCAAGATATAAATCCAAGAGGTTCATCAAGTGATGAAACAGATAGTGATGAAGAAATTAGTGAAGCAAGTGGTTCTGACTTAGATGCAGATGGAAGTGGATTTTTACAACCTGTACCAACTAGACAAAGAAGAGCACTCTTAAAAGCAGCAGGAATTCGAAAAATTGATCCAACAGAAAAAGATGAATGCCGTTCTATTCGTACATCAAGAGAATTTTGTGGATGCAGTTGCAGAGGTTATTGTGATCCTGATACATGTTCTTGTAGTCAAGCTGGAATTAAATGTCAGGTTGATAGACCAAGTTTTCCATGTGGATGTACTAGAGATGGCTGTGCCAATGTTGCAGGCAGAATTGAATTTAATCCTGGAAGAGTTCGAACACATTTTATACACACTATAATGCGTTTAGATATTGAACATAAACAAAAGAGACGAGATGAAATTGATATATCGACGTCATCAATAACAATGCCAATGCTTAATTATATGAATAGTTGTGTATCAGATAACAGTAATTTACCTATTACTGCCACTTTAAATTCATGCTCTAACAGTAACAATAGTTTAAGTAATATTTGTAATTATAGTGTAAGTAATGCAAGCCATATTGGAGGAACACAACAATCATACCATTTACATAATCAAAATTTTATTAATACAACACTTTATTCGAGCATGATGAACAATAATAGCATTTCGGCAACATCATTTTCACAAGATAATATATCTAGTACACATCAACAGCAACAAAATTTGATAGGTAACAATTGTATGCATATGAATTTAACGAATTCCACAAATTCAACACATTCAATAGATTTATCGTATCCACTACGTGATATTACAACAGAAAATTCAATGTGTAATAGTTTAATGATTGATTTTCCCACAAACAGTAACCAAATATTTCATCATGATGTTTATAGTAGTCAGTCTTATCTTAATCACAACCAAAATCTAATAAATTCACCATCAAATAGTAATTATCATCTAACAGCAACTAATACAGCTAATACCTATTCAAATTATCAGCAAAATTATATTCCTTATGTATCTCAAAATTGCACTAACGTAACATCTGTAATATCTTCAACACCAACAATTGAAATACACGATCTTGCAACACCCGATGATGATATTTCAAATAGTTACATAAACTTACATCCTCCAACAGCAAATTCATCTCGATTAGATGCTATTAATGATCTTTTACATAATAATCGTAATACACCACCAACTGCTCCAATAGTATCATCATTATCACCAACACCTGTTGATTCATCAACAACTACAATTCCAAATATTATTGATCCTCTTCCAATGAAACCAACAACAGTTTCAGCCCTTTCAGAAATTTGTAGTTTAGCACCTTCTGCACAAACTTCAACTTCAATTGCTGAAGGTACTTCAACTTCAGTTGTTGAAGGTACATCAACAAAAGCATCATCTCCAGTAATTTTATCTGGAACATCTACTGGAAAATTATCATCATCATCATCATCCAGAAAATTATCATCAACATCAGTTGTTGATTTAACAGAAGAGTTAGAAGAATTTGAAAATATAACACCTAGAATTTCAGAAACAGTTTGTATTAATGAAGATTTCGAACAAATTATTGAATCATTAGAAATTTTTAAAAACATTGAATCATCAGAAATATCAGAAACAAAAAAATTAATAGGAGATAATAATCAATTAATGTTAACAGCGACAACAGTAAATTCTTCTGAAGAAACGGAAAAAAATAATCTTGAAAAATCAACAGCCTTAAATACTGCAGTATCTTGTAATAATGAATTAATTGATGAAAAAAACAAAATAGAAGATTTTGTAGTTGATGATGTTGAATTAATTGGGATTTCTTCAAATTTGAATAAAACAAATGATAATAAAAATAAAGATAATGAAAAAATTGATAAAAATCAAGATATTATTGTACAAATCGATAATGAATCAATCGAAAATAAAATTGAAAAAAATCAAGAAAATAATTCAAAATGTACTAATGGTACATCAATGAAAAAAGATAATTTTAATGAAATCCAAAATGAAACAGAAGAAACACAAGAAAAACTAGATACAAAAAATGATGAAAATGTTGAAGAAGAAGAACATAAAAATGATAAAAATATTGAAAACTTATTAAATAATTGTGAAAATATCGAATCTTCAAATCAAAATACAAAAAGAAAAATATCATATGAAGAGAAAAGTAAAACAATATTAGGATTGAAAAATGATGTTCCTAATTCTATAGATAATGAAATTGAAAAAAATAATGAAAATAATATCGATGTAATTGTTGATTCAAATAATTTAAATATAATAAATAATATTTTAAATGAAAATACACAAGAAGAATTAAATATAAAatcaatggattcatcattattatcatcaccatcatcatcattatcaAAAAATGTGTCAATTGCAAATGAATCTTTGAATAAATCACAAACACCGTCATCATCAGTTGAAAATGATGAAAATTTAACAGATATTATACAAAAGAGTATCGTTGAAACAGTTTTAGCGTAA
Protein Sequence
MFRPIKNFISYFQKSTNGAGILGSTPNTTNNVNETENMENKNILDSSENNKINENDKINETVENNTREEDEEETISSCSPLQKTIQSQHDQNENEVCKEISNNLTSTIPENCTSIDNIINNPSLISCSSPTSKNVELINFPRTECSSPINVDVTSTEYSIEITSPSCSPIKIICDPLTDNSPTKIYVNGNKNFKCSKDLNEINNLNDDLLLKTLDNDDEIIVDEEIIVISDNDNNSNILDSGSDPLALDDCHIEDNLDLLQNHSSSSSINETDGIICIINVDNIKETNNSVNNESKNTLLTNYNESSKNSTNNYDISNDKVKVGNEEQELRSDGSDSGLGLETSTNLQIPTTSNTNINSTINFISEPQICHLPVNIIPRKSNLKRRLNDDPIISLAEKKTKRSIHFNGVSVYYFPRMQGFACVPSQGGCTLGMGSRHVHYKTFSLTDYAAEQRRVHKQQMQDINPRGSSSDETDSDEEISEASGSDLDADGSGFLQPVPTRQRRALLKAAGIRKIDPTEKDECRSIRTSREFCGCSCRGYCDPDTCSCSQAGIKCQVDRPSFPCGCTRDGCANVAGRIEFNPGRVRTHFIHTIMRLDIEHKQKRRDEIDISTSSITMPMLNYMNSCVSDNSNLPITATLNSCSNSNNSLSNICNYSVSNASHIGGTQQSYHLHNQNFINTTLYSSMMNNNSISATSFSQDNISSTHQQQQNLIGNNCMHMNLTNSTNSTHSIDLSYPLRDITTENSMCNSLMIDFPTNSNQIFHHDVYSSQSYLNHNQNLINSPSNSNYHLTATNTANTYSNYQQNYIPYVSQNCTNVTSVISSTPTIEIHDLATPDDDISNSYINLHPPTANSSRLDAINDLLHNNRNTPPTAPIVSSLSPTPVDSSTTTIPNIIDPLPMKPTTVSALSEICSLAPSAQTSTSIAEGTSTSVVEGTSTKASSPVILSGTSTGKLSSSSSSRKLSSTSVVDLTEELEEFENITPRISETVCINEDFEQIIESLEIFKNIESSEISETKKLIGDNNQLMLTATTVNSSEETEKNNLEKSTALNTAVSCNNELIDEKNKIEDFVVDDVELIGISSNLNKTNDNKNKDNEKIDKNQDIIVQIDNESIENKIEKNQENNSKCTNGTSMKKDNFNEIQNETEETQEKLDTKNDENVEEEEHKNDKNIENLLNNCENIESSNQNTKRKISYEEKSKTILGLKNDVPNSIDNEIEKNNENNIDVIVDSNNLNIINNILNENTQEELNIKSMDSSLLSSPSSSLSKNVSIANESLNKSQTPSSSVENDENLTDIIQKSIVETVLA

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_00233896;
90% Identity
-
80% Identity
-