Basic Information

Gene Symbol
CSRNP3
Assembly
GCA_939192785.1
Location
CALNDV010000844.1:65261-69659[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
CSRNP_N
Domain
CSRNP_N domain
PFAM
PF16019
TF Group
Unclassified Structure
Description
This presumed domain is found at the N-terminus of cysteine/serine-rich nuclear proteins. These proteins act as transcriptional activators [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 4 0.21 3.7e+03 -2.5 3.3 76 105 44 73 23 120 0.49
2 4 1.1e-95 1.9e-91 305.8 8.0 1 217 420 620 420 621 0.92
3 4 0.11 2e+03 -1.6 1.8 70 106 1043 1078 1007 1112 0.66
4 4 1 1.7e+04 -6.9 9.3 63 97 1136 1170 1108 1223 0.40

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTTCAGACCTATAAAAAGCTTTATATCATATTTTCAAAAAAGTACCAATTGTGTAGGAATATTTGGTTCTACAACAAATACAACAAATAATGTTGATGAAGCTGAGAATATGGAGAATAAAAATATTTTAGATTCTTCAGAAAATAATAAAATTAATGAAAATGATAAATTAAATGAAGCTGTAGAAAATAATAAAAAAGAAGAATATGATGAAAAAGAAACATTATTAACATCAACAATATCATCATGTTATCCATTACAAAAAACAACACAATCACAACATGATCAAAATGAAAATGAAGTTTGTAAAGAAATAAGTAATAATCTTAATTCTACCATTCCTGAAGATTGTACGTCAATAAATAATGTAATTAATCCTTTACTCAATTGTTCTAGCCCAGCACCAAAAAATGTTGAATTAATAAATTTTCCAAGAACAGAATGTAGCAGTCCTATAAATGTAAATGTAACAAGTACAGAAGATTCAATTGAAATGACGAGTCCTATAAATGTAGATGTAACAAGTACAGAAGATTCAATTGAAATCATGAGTCCTAGTTGTAGTCCAATAAAAATAATATGTGATCTGACTGATAATAGCCCAACTAAAATTTATGTAAATGGAAATAAAAATTTTAAATGTTCAAAAGATATAAATAAAATAAATAATTCTGATGATGATTTATTATTAAAGACATTGGATAACGATGATGAAATTGTAGTTGATGAAGAAATTATTGTTATTTCAGACAATGAGAATAATTCAAATATTTTAGATTCTGGATCAGATCCTTTAGCATTGGATGATTGTCACTTTGAAGATAATTTAGATTTATTACAAAATCATTCATCATCGTCATCAATTAATGAAACTGATGGAATAATTTGTATTATAAATGTCGATAATATTAAAGAGACAAATAATATTGTGAGTAATGGATCAAAAAATACATCATTAACAAATTATAATGGATCATCAAAAAATTCAACTAATAATTTTGATATTTCAAATGATAAAGTTAAAGTAGGTAACGAAGAACAAGAATTAAGAAGTGATGGTTCAGATTCAGGTTTAGGATTAGAAACATCAACAAATTTACAAATTCCTACAACAAGTAATACTAATATAAATACTACAATAAATTTTATTTCTGAACCTCAAATTTCTTCTCATCTTCATGTCAGTACAATACCAAGAAAAAGTAATCTAAAACGAAGATTAAATGATGATCCAATAATTAGTTTAGCAGAGAAAAAAACAAAACGTTCAATTCATTTTAATGGTGTTAGTGTCTATTATTTTCCTCGAATGCAAGGTTTTGCTTGTGTACCATCACAGGGTGGCTGTACTTTAGGAATGGGTTCAAGACATGTAAACTATAAGACATTTTCGTTAACAGATTATGCTGCAGAACAAAGACGTGTTCATAAGCAACAAATGCAAGATATAAATCCAAGAAGTTCATCAAGTGATGAAACAGATAGTGATGAAGAAATTAGTGAAGCAAGTGGTTCTGATTTAGATGCAGATGGTAGTGGGTTCTTACAACCTGTACCAACTAGACAAAGAAGAGCACTCTTAAAAGCAGCAGGCATTCGAAAAATTGATCCAACAGAAAAAGATGAATGCCGTTCTATTCGTACATCAAGAGAATTTTGTGGATGCAGTTGCAGAGGTTATTGTGATCCTGATACATGTTCTTGTAGTCAAGCTGGAATTAAATGTCAGGTTGATAGACCAAGTTTTCCATGTGGATGTACTAGAGATGGCTGTGCCAATGTTGTAGGCAGAATTGAATTTAATCCTGGAAGAGTTCGAACACATTTTATACACACTATAATGCGTTTAGATATTGAAAATAAACAAAAGAGACGAGACGAAATTGATATATCGACGTCATTATCATCATCGTCATCAATAACAATGCCAATGCTTAATTATATGAATAATTGTGTATCAGATAATTTACCTATTACTGCCACCTTAAATTCATGCTCCAGCAGTAACAATAGTTTAAGTAATATTTGTAATTATAGTGTAAGTAATGCAAGCCATATTGGGGGAACACAACAATCATACCATTTACATAATCAAAATTTTATTAATACAACACTTTATTCGAACATGATGAATAATAGCAATAGCATTTCGGCAACATCATTTACACAAGATAATATATCTACTACACATCAACAGCAACAACATTTGATAGGTAATTCAACACATTCAATGGATTTATCGTATCCACTTCGTGATATCACAACAGAAAATCCAATGTGTAATAGTTTAATAATTGATTTTCCCACAAATAGTAACCAAATATTTCATAATGATGTTTATAGCAGTCAGTCTTATGGTAATCAATCGTATCACAACCAAAATCTAATAAATTCATCATCAAATAGTAATTATCATCTAATAGCAACTAATACAGCTAATACCTATTCAAATTATCAGCAAAATTATATTCCTTATATATCTCAAAATTGCACTAACGTAACATCTGTAATATCTTCAACACCAACAATAGAAATACATGATCTTGCAACACCTGATGATGATATTTCAAATAGTTACATAAACTTACATCCTCCAACAGCAAATTCATCTCGTTTAGATGCTATTAATGACCTTTTACATAATAATCGTAATACACCACCAACTGCTCCAATAGTATCATCATTATCACCAACACCTGCTGATTCATCAACAACTGCAATTCCAAATATTATTGATCCTCTTCCAATGAAACCAACAACAGTTTCAGCCCTTTCAGAAATTTGTAGTTTAGCACCTTCTGCACAAACTTCAACTTCAATTGTTGAAGGTACAGCAACAAAAGCATCATCTCCAGCATCTGTATCTGGAACATCTGGAAAATTATCATCATCATCAATTGTTGATTTAACAGAAGATTTAGAAGAAATTGAAAATATAACACCTAGAAATTCAGCAACAGTTTGTATGAATGAAGATTTCGAACAAATTATTGAATCATTAGAAATTTTTAAGAATATTGAAACATCAGAAATATCGGAAACAAAAAAAGTAACGGGAAATAATAATCAATTAACGTTAACAGCGACAGCAATATCAACAACAGTAAATTCTTCTGATGATACAGAAAAAAATAATCTTAAAAAATCAATAGCCTTAAATACAGTATCTTGTAATAATGAATCAATTGATGAAAAGAATGAAATAAAAGATTCTGAGATTGATGATGTTGAATTAATTGGAATTTCTTTAAATTTGAATGAAATAAATGATAATAAAAATAAAGATAATGATGAAATTGATAAAAATCAAGATATTATAAAAATCGATAATGAATTAGTCGAAAATAATATTGAAAAAAATTCAAAATGTACTAATGATACCTCAATGGAAAAAGATAATTTTAATGAAATCCAAAATAAAATAGAAGAAACACAAGAAAAAATAGATATAAGAAATGATGATAATGTTGAAGAAGAAGAAAATAAAAATGATAAAAATATTGAAAACTTATTAAATAATTTTGAAAATATCGAAACTTCAAATCAAAACACAAAAACAAAAATAACATATGAAGAGAAAAGTAAAACAATACTAGGATTGAAAAATGATGTTCCTGATTCTATAGATAATGAAATTGAAAAAAATAATGAAAATAATATCGATATAATAATTGATTCAAATAATTCAAATATAATAAATAATATTTCAAATGAAAATACGCAAGAAGAATTAAATAATACCGAATTAAATATAAAAACAATggattcatcattattatcatcatcatcatcattatcgaataatgtgtcagttaaaaataaatctttaaataaatcacaaacatcgtcatcatcaccatcatcagttgaaaatgatgaAAATTTAACAGATCTTATACAAAAGAGTATCGTTGAAACAGTTTCAGCGTAA
Protein Sequence
MFRPIKSFISYFQKSTNCVGIFGSTTNTTNNVDEAENMENKNILDSSENNKINENDKLNEAVENNKKEEYDEKETLLTSTISSCYPLQKTTQSQHDQNENEVCKEISNNLNSTIPEDCTSINNVINPLLNCSSPAPKNVELINFPRTECSSPINVNVTSTEDSIEMTSPINVDVTSTEDSIEIMSPSCSPIKIICDLTDNSPTKIYVNGNKNFKCSKDINKINNSDDDLLLKTLDNDDEIVVDEEIIVISDNENNSNILDSGSDPLALDDCHFEDNLDLLQNHSSSSSINETDGIICIINVDNIKETNNIVSNGSKNTSLTNYNGSSKNSTNNFDISNDKVKVGNEEQELRSDGSDSGLGLETSTNLQIPTTSNTNINTTINFISEPQISSHLHVSTIPRKSNLKRRLNDDPIISLAEKKTKRSIHFNGVSVYYFPRMQGFACVPSQGGCTLGMGSRHVNYKTFSLTDYAAEQRRVHKQQMQDINPRSSSSDETDSDEEISEASGSDLDADGSGFLQPVPTRQRRALLKAAGIRKIDPTEKDECRSIRTSREFCGCSCRGYCDPDTCSCSQAGIKCQVDRPSFPCGCTRDGCANVVGRIEFNPGRVRTHFIHTIMRLDIENKQKRRDEIDISTSLSSSSSITMPMLNYMNNCVSDNLPITATLNSCSSSNNSLSNICNYSVSNASHIGGTQQSYHLHNQNFINTTLYSNMMNNSNSISATSFTQDNISTTHQQQQHLIGNSTHSMDLSYPLRDITTENPMCNSLIIDFPTNSNQIFHNDVYSSQSYGNQSYHNQNLINSSSNSNYHLIATNTANTYSNYQQNYIPYISQNCTNVTSVISSTPTIEIHDLATPDDDISNSYINLHPPTANSSRLDAINDLLHNNRNTPPTAPIVSSLSPTPADSSTTAIPNIIDPLPMKPTTVSALSEICSLAPSAQTSTSIVEGTATKASSPASVSGTSGKLSSSSIVDLTEDLEEIENITPRNSATVCMNEDFEQIIESLEIFKNIETSEISETKKVTGNNNQLTLTATAISTTVNSSDDTEKNNLKKSIALNTVSCNNESIDEKNEIKDSEIDDVELIGISLNLNEINDNKNKDNDEIDKNQDIIKIDNELVENNIEKNSKCTNDTSMEKDNFNEIQNKIEETQEKIDIRNDDNVEEEENKNDKNIENLLNNFENIETSNQNTKTKITYEEKSKTILGLKNDVPDSIDNEIEKNNENNIDIIIDSNNSNIINNISNENTQEELNNTELNIKTMDSSLLSSSSSLSNNVSVKNKSLNKSQTSSSSPSSVENDENLTDLIQKSIVETVSA

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_00234788;
90% Identity
-
80% Identity
-