Agif008384.1
Basic Information
- Insect
- Aphidius gifuensis
- Gene Symbol
- JARID2
- Assembly
- GCA_014905175.1
- Location
- CM026526.1:4293782-4300775[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- ARID
- Domain
- ARID domain
- PFAM
- PF01388
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 2.7 4.5e+03 -2.5 0.3 56 83 161 186 146 187 0.63 2 2 2.5e-19 4e-16 58.5 0.0 8 89 1431 1510 1425 1510 0.87
Sequence Information
- Coding Sequence
- atggtaCTTGGAAGAAAtgataagagaaaaaaaaaagaaggtgATTTGGTTGATCTCATGGATCCACTTTCTGAAGCTCCAAAAAGagCTAAAGTACATGCACAAAGAAAATTTGCACAAGGTGCTGCAACTGTTTTTAATTCAGTTCAAACTGTTAtcaaggaaaaagaaaaaactaaacCATCAAAAGTCACAGAATTGATAACAGACAAGCGTCCAAATACTGAAGATTTTTTGACTTTTCTATGTTTTCGTGgaACATCAATATTACCACCAAGTTTAAATTTCTTTGGTATtggaacaaaaaaagaaaaaattgaagcaaaattattagctaaaaaaaaagtaaataatacaaattcacaatcaacaatttcaacaacaacaacaacaacagctcAATCAAAGACAGATATAAATCATAATACAGgagctaaaataaaaacaacagataatttgaaaaaaaaattatcaacagctcaaaatgttggaaaaaatataaataaatataaaacaacaacatcaacagtacaagcattgaaaaaaaaatatcaagaacaACGTTTAGCTAAacaaagaattgaaaaaaaattaaaagtatcatGTGTTATGAAAACAcgttcatcaacaacatcacgtgcaattgttaataaaaatataacaaaaaataataataaattagcaaatataattgataataataaaaaacattgtttACGTAGTAATAGTGTTGTTGATAAACGTAAAACAACATTaccaaagaataataataataataataaattattaaaaaaagaaaagaaaaaaacaattgataatgataaaaataatgaattatctGAAGAATTATCagattcatcattttcatctgAAGATagtaataaatcatcatcaagtattaaacaaaaaaataataaaacaaataataaaaaaaatattataacacgaagtaataataaaattgaacaaagAAGAGTTACCAGATCAAGAAGTGATGTTACTGTACCAATTGTAAAACCAACACAAAGACCATcaagaaaaacaaaagaagCAGCAGCTTCGTTATTGGaaataattagtaaaaaattaacaagtccAGATATtgatagtgatgatgatgatgatgataataattcattagatAGTTATCCAGAACTTATAcgtaaaacaattgataatgataataaatctaaaataaaaggtaaattaaataaagaaaaaaatttaaagactgaaattaataaagttgataaattaaaaaataataaaacagtgacgaaaattaaaaaatcaataaaagttCGAAAGTATATTGAaagtgatgataatgatgaagatgatgatggtgatgaagatgaagaagaggAAGACGAGAATGAAGAAGATAgtaacaatgatgatgatgatgataaagatgaagatgatgaggACGATGATGATAGTAATGAATCATCAGCTTcagaaaaagataataataaaaaatcaaaaccaGTTACAAGAAAAAGTAGCAATCAATCATCTAGCAATGTTAAAGCAATATCAAGTGATCGTAGTCTTCGTTCATCATCTAGAAATTTAcccaaacaacaacaaaaacaagaaacaccaattaaattacaacgtgataataaaaaatctaatgaACTAAAACGAAAATCACCAAAATTATCAACACAAgatgatacaaaaaataaagataataataaaaaattaacaaaaaatattatcgtagaaaatttacaagattCTGATGATGAAccattgattaaattaaaaaaaagaattgaaatgattgataatattaaaaatgattcatcaaaagataataaagaaaaaattacatttgataataaaaaagatgatgaaataataaaattatcagatgatgatgaagaatcatttcatggttttaataaaaaaacaataacaaaattattaaatccatGTACAAGTAGCTCAATTGCAAATGAAGAaacatgtaaaataaaaaattcaatggagacattgataaacaaaattgaaaatataaatcatactgataattataaaaatttaaatacaaataaatcatgtgaaatatcaaatttagatacaacaacaaataatattattttaccaatggtatcatcatcatcaccaccgctactgccaccaccaccaaatACAACagaaatagataaaaaatgttCTCATACAGTACATGATACATCAACTGGAATAATTGATATACCATTATCAACATCACTTGGACGAAAAGAACGTGTTAATATGTCAActgaacaaattgaaaaatggcTTAATGAAAGTTCAATGGCTAAAGAAGAGAGTAAAGCTGAAATGGAAACAGttacaaatttttcatatgaagTTGAacctgaaaaaattaataaatcagaTATTAGtcatttatcaatatcaacaaGAATACAACATTTAGTTAGACCAGTTAATGTTGCTATTGCTAAAATGGCTGAAAAACctttaactaataaaaatcaaatgaaatcaccatcatcaatatttagtACTGGTATTGCACTTGCAAAACCAATAAATATACCAACAAAtcgtaataaaataaatgctgatattaaagaaataattaaatgtagaaatgctaaaaataataataacaataatattaatattaatcattcaaataataataaagatacaacaaatattaatgaGGATAGTGATATTAGTTCAAGAAGATCAGATGGTAATGtatcaattgattattattcaccagataaaaaaaatacatcaacaacaacaacatcaacaccaacagcaacaccaacaccaccaataacaacagcaacatcaacaacagataaaaaatcaacaacacaatcacaaaaaaaaacatttttaccaAAAGTTAAAGAACGTAAATCAGCAATACCAAGTGTTAATGCATTTTCACCAGAAAATGAAAGAAGTGTTTATGCATTTGAAAGTGATACTGAAACACCAGTTAATACACCATTTAGAAGAAAATTACGTGATTCAAAATCTGGTACATCATCTGATATTGCTGAGAGTGATGATGGTATTGTTAAAACACCAACAAAAATATCAgataaatatgatttattatcaacgacaaaatcaacaacaaaaagtaTTGCAACAACATGTAATGAAGATGATTCATTTATAGAAACACCAAGTACATCAACTGATACACCaatacaaacaaatataaaattaaaaaatacaaatgaatttgataatttatcaaattcacaAGTATTACCAATTGGTAAACATCAAAATGTATGGAATAGTTTAAATTGTAGTACATCAATTGCTGTACaagttaattttgatgaacaAGGACAAAGTACAACAcaagataatgataataatcataatgatgatattaataatggaCAAAAATGTACTGAAATATCAACACAAACAGAATGTACAGCTGTTGATAATGAAGATGATAATTCATcacaagttttttatattccatTACAAGCTGTATCAAGAAATGGACCAAATACATGTGTTGCTGTTAAACTTGGTACTGAAGGACCAAATGGACCAAATCAACGGGTTTTATTACGTGCACAATTAGTTACAAAACCACCAGTTGCTGTTGCAAGATGTCCACCAATTGGAACTGTTCAACCAACAACAAGAACACCAGCATCATTAGCAAATGATTCAATAccttcaacatcatcatcatcattaccagCAGAAACAGTAGGAGGTGTAACAACAGCTGCAactgcatcatcatcaacaacaacaccaacaccaccaacaacaacatcgtcatcatcatcatctccaATTGTATTACCAATTATAAAAGaaactgaaaaattatcatcaagtgaAAGTAATAGCAAggtattaataaatgaaaaaataacaaaatcattaaaagCATCACGTGAAAGAAAAGCATCAAGtgattcatcaacaacaaaattaagtagtaataaaaaaggtggtggtaaaaaaaagctatcatcagatataaaatttgatggaACAACATTTCCAAGTATGGATTTAAATAAAGGTGAATCAGCACGTCTTGTTGATGCACCAACATTTCATCCATCTGAAAAAGATTTTCAAGATCCATttgaatatattgataaaattcgTCCAATTGCTGAAAAATTTGGTATATGTCGTGTTGTACCACCATCAAATTTTAAACCAGATTGTAAAGTATCAGATGACATGCGTTTTACAGCATATAATCAATATGTACATCGTATGATGCATAGATGGGGTCCAAATGTTAAACAATTAAtggctattaaaaaaaatttagcaagtcaacattttattgttaaaaaattaccctGGATTGGTGGAATGGAAGTTGATTTACCACATCTTTATGAAACTGTACAAAATCTTGGTGGTTTAGgtgaaataattgataaaaaaaaatggcaaaaagTTGCTGATGGTATGAAAATTCCAAAATCAGCACAAGATCGTGCAAGTAaacttgatgatatttattgtAGATATCTTTTGCCATTTGATACATTATcagcaaaagaaaaagaaaaattatttgatgatgttgataaagaATGGAAAAAACGTGAAGCAAAAGCATTACGtagattaaataaatcatcatcatcatcagcatcatcttcatcatcttcatcagatgatgataatgataatgatgatgaagagaGTGATGATAGTGCTGATGAATGTATTGTTAAAGGTAGAAATATGCCATTAAATGCATTTTATAGAATTGCTAGAAATACACAAAGAATGTGGTTTGGTGATAATCAacgtggtggtggtggtagtggtaATGGTAGTGGTAGTGGAAATGGTAATGGTAATAGTGAAATTGAAGGTGCATCAGCAGTTAATgttgaaaatgatttttggAAACATGTTGTTGAACGTAAACGTCATGTTTGTGTACATGCTGCAAGTATTGATTCAAGTGGACGTGGTTTTGGTTTTTCAGTTGCTAAAAAAAGTCC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- Protein Sequence
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Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_00131080; iTF_00131752;
- 90% Identity
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- 80% Identity
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