Acol001613.1
Basic Information
- Insect
- Aphidius colemani
- Gene Symbol
- JARID2
- Assembly
- GCA_030523065.1
- Location
- JAPYYR010000241.1:40629-46847[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- ARID
- Domain
- ARID domain
- PFAM
- PF01388
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 5.7 1.6e+04 -3.7 0.2 57 82 165 188 156 189 0.66 2 2 1.9e-19 5.3e-16 58.7 0.0 8 89 1400 1479 1394 1479 0.87
Sequence Information
- Coding Sequence
- atggTACTTGGAAGAAatgataagagaaaaaaaaaagaaggtgaTTTGGTTGATCTCATGGATCCACTTTCTGAAGCTCCAAAAAGgGCTAAAGTACATGCACAAAGAAAATTTGCACAAGGTGCTGCAACTGTTTTTAATTCAGTTCAAACTGTTAtcaaggaaaaagaaaaaactaaaccATCAAAAGTCACAGAGTTGATAACAGATAAGCGTCCAAATACTGAAGATTTTTTGACTTTTCTTTGCTTTCGTGGAACATCAATATTACCACCAAGTTTAAATTTCTTTGGTATTGGaacaaagaaagaaaaaactgaagcaaaattattagcaaagaaaaaggtaaataatacTACAAATTCACAATCAACAATTTCAACGACATCAACAATACCAACAACAGCTCAATCAAAATCAGATATAAATCATAATACAGgatctaaaataaaaacaacagataccctgaaaaaaaaattatcaacaagtcaaaatgttggaaaaaatataaacaaatataaaacagcGACATCAACAGTAcaagcattgaaaaaaaaatataaagaacaACGTTTAGCTAAACAAAgaattgaaaagaaattaaaagtatCATGTGTTATGAAAACACgttcatcaacaacaccacGTGCAatcgttaataaaaatataacaaaaaacagtaataaattagcaaatatagttgataataaaaaacattgtttaCGTAGTAATAGTGTTGTTGATAAACGTAAAGTACCATTACcaaagaataaattatcaaaaaaagaaaagaaaaaagtaattgataatgataaaaacaatgaattatcagaattatcagattcatcattttcatctgAAGATAGTAATAAATCATCACTAagtattaaacaaaaaaataataaaacaaataataaaaaaaatattataacacgaagtaataataaaattgaacaaagAGTTACAAGATCAAGAAGTGATGTTACTGCACCAATTGTTAAACCAACACAAAGACCAtcaagaaaaacaaaagaagCAGCAGCTTCTTTATTGGaaataattagtaaaaaattaacgagTCCAGATATTGATAGTGATGACGATAATAGTTCATTAGATAGTTATTCAGAACTTTTAAGTGTACGTAAATCaactgataatgataataaatcgaAAACAAAAGCTAaattaatgaaagaaaaaaatttaaagactGAAGTtaataaagttgataaattaaaaagtaaaaaaacagtgacgaaaactaaaaaatcaataaagcCTCGAAAGTATGTTGAaagtgatgataatgatgacaacgaagaagatgaagatgacggtgatgaagaagaagaagacgaggatgaagaagataaaaacaaagatgatgatgatgatgatgaagatgatgaaagtaatgattcatcagcttcagaaaaagataataataaaaaatcaaaaccagttacaagaaaaaatagtaGTCAATCATCTAGCAATATTAAAGCAATATCAAGTGTTCGTAGTCTTCGCTCATCATCTAAAAATTTACCCaagcaacaacaaaaacaagaaACACCAATTAAATTACAgcgtgataataaaaaatctagtGAATTAAAACGTAAATCACcaaaattatcaacacaagATGATACAAAAAGtaaagataatattaaaaaattaataaaaaatattgtattagaaaaattagaagACTCTGATGACGAAccattgattaaattaaaaaaaagaattgaaatgattgataattttaaaagtgattcattacaagataataaagaaaagattacatttgataataaaaatgataatagtgaaacaataaaattatcagatgatgatgaagaatcaTTTCATGGTTTTAATAAGAaatcaatatcaaaattattaaatcaatgtaCAAGTAGCTCAATTGCAAATGAAGAATCATGtaaagttaataattcaatagaaaaaaatttaaatataaataaaacatgtgAAATATCAAAACTAGATACAACAAGTAATATTCCTTTACCAATagtgtcatcatcatcatcaccaaataTAAcagaaatagataaaaaatgtcCTCATACAGTACATGATACATCAACTGGAATAATTGATATACCACTATCAACATCACTCGGACGAAAAGAACGTGTTAATATGTCAACTGAGCAAATTGAAAAATGGCTTAATGAAAGTTCGATGGCTAAAGAAGAGAGTAAAGCTGAAATGGAAACAGTTACAAATTTTTCATACGAAGTTAtacctgaaaaaattaataaatcagaTATTAGtcatttatcaatatcaacaaGAATACAGCATTTAGTTAGACCCGTTAATGTTGCTATTGCTAAAATGGCTGAAAAacctttaattaataaaaatcaaatgaaatcaccatcatcaatatttagtACTGGTATTGCACTTGCAAAACCAATAAGTATACCAACAAatcgtaataaaataaatgctgatattaaagaaataattaaatgtagaaatgctaaaaataataatattaatattattcattcaaataataataataataataatagtaaagatacaacaattattaatgagGACAGTGATATTAGTTCAAGAAGATCAGATGGTAATGtgtcaattgattattattcacctgataaaaaaaatacatcaacaacaactacaacaacaacgacaccAACAGCAATACCAACACCACCAATAACAGCAGCAACGTCAACAACAGACAAAAAATCGATAAcacaattacaaaaaaaaactttcctACCAAAAGTCAAAGAACGTAAATCAGCAACACCAAGTGTTAATGCATTTTCACCTGAAAATGAAAGAAGTGTTTATGCATTTGAAAGTGATACTGAAACACCAGTTAATACACCATTTAGAAGAAAATTACGTGATTCGAAATCTGGGACATCATCTGACATTGCTGAGAGTGATGATGGTATTGTTAAAACACCAACAAAAATATCGgataaatatgatttattatcaacgacaaaatcaacaacaaaaagtaTTGCAACAACATGTAATgaagatgatttatttattgaaacacCAGGTACATCAACTGATACACCaatacaaacaaatattaaattaaaaaatacaaatgaacttgataatttatcaaatgctCAAGTATTACCAACGGGTAAACATCAAAATGTTTGGAATAGTTTAAATTGTAGTACATCAATTGCTGTACaagttaattttgatgaaCAAGGACAAAGTACAACAcaagataatgataataatcataatgatGACATTAATAATGGACAAAAATGTACTGAAATATCAACTCAAACCGAATGTACAGCTGTTGATAATGAAGACGATAATTCAtctcaagttttttatattccatTACAAGCTGTATCAAGAAATGGACCGAATACATGTGTTGCTGTTAAACTTGGTACTGAAGGACCAAATGGACCAAATCAACGTGTTTTATTACGTGCACAATTGGTTACAAAACCACCAGTTGCTGTTGCACGATGTCCACCAATTGGAACTGTTCAACCAACAACAAGAATACCAGCATCATTATTAACCGATTCAATAccttcaacatcatcatcaccatcaataATAGCAGCAGAAACAACAGGAGGCATAACAACAACCTCGACTTCATcgacaacaacaccaacaccactAACAAcaacatcgtcatcatcatcatcttcaattGTATTTCCAgttacaaaagaaaatgaaaaatcatcatcaactgatAGCaaggtaaatgaaaaaataacaaaatcattaaaaacatCACGTGAAAGAAAAGCATCAAGcgattcatcaacaacaaaattaagtagtaataaaaaaagtggtaaaaaaaagccatcatcagatataaaatttgatggaCAAACATTTCCAAGTATGGATGTAAATAAAGGTGAATCAGCACGTCTTGTTGATGCACCAACATTTCATCCATCTGAAAAAGATTTTCAAGATCCATTTGagtatattgataaaattcgtCCAATTGCTGAAAAATTTGGTATATGTCGTGTTGTACCACCATCGAATTTCAAACCCGATTGTAAAGTATCTGATGACATGCGTTTTACAGCATATAATCAATATGTACATCGTATGATGCATAGATGGGGTCCAAATGTTAAACAATTAAtggctattaaaaaaaatttagcaagTCAacgttttattgttaaaaaattacccTGGATTGGTGGAATGGAAGTTGATTTACCACATCTTTATGAGACAGTACAAAATCTTGGTGGTTTAGgtgaaataattgataaaaaaaaatggcaaaaaGTTGCTGATGGTATGAAAATTCCAAAATCAGCCCAAGATCGTGCAAGtaaacttgatgatatttattgtaGATATCTTTTGCCATTTGATACATTATCAAcaaaagaaaaggaaaaattatttgatgatgttgataaagAATGGAAAAAACGTGAAGCAAAAGCATTACGtagattaaataaatcatcatcagcatcatcttcttcatcttcgtCCTcatcagatgatgataatgataacgaTGACGAAGAGAGTGATGATAGTTCTGATGAATGTATTGTTAAAGGTAGAAATATGCCATTGAATGCATTTTATAGAATTGCTAGAAATACACAAAGAATGTGGTTTGGTGATAATCAACGTGGTAGTAGTAATAGTGAAATTGAAGGTGCATCAGCAGTTAAtgttgaaaatgatttttggAAACATGTTGTTGAACGTAAACGCCATGTTTGCGTACATGCTGCAAGTATTGACTCAAGTGGACGTGGTTTTGGCTTTTCAGTTGCTAAAAATAGTCCATTTGCACGTCATCCATGGAATCTCAAAGTATTGACAAATAATAGTGGTTCAATATTACGTGCACTTGGTCCATTAATGGGTGTTACAATACCAACATTACATGTTGGTATGTTATTTAGTGCATGTTGTTG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- Protein Sequence
- MVLGRNDKRKKKEGDLVDLMDPLSEAPKRAKVHAQRKFAQGAATVFNSVQTVIKEKEKTKPSKVTELITDKRPNTEDFLTFLCFRGTSILPPSLNFFGIGTKKEKTEAKLLAKKKVNNTTNSQSTISTTSTIPTTAQSKSDINHNTGSKIKTTDTLKKKLSTSQNVGKNINKYKTATSTVQALKKKYKEQRLAKQRIEKKLKVSCVMKTRSSTTPRAIVNKNITKNSNKLANIVDNKKHCLRSNSVVDKRKVPLPKNKLSKKEKKKVIDNDKNNELSELSDSSFSSEDSNKSSLSIKQKNNKTNNKKNIITRSNNKIEQRVTRSRSDVTAPIVKPTQRPSRKTKEAAASLLEIISKKLTSPDIDSDDDNSSLDSYSELLSVRKSTDNDNKSKTKAKLMKEKNLKTEVNKVDKLKSKKTVTKTKKSIKPRKYVESDDNDDNEEDEDDGDEEEEDEDEEDKNKDDDDDDEDDESNDSSASEKDNNKKSKPVTRKNSSQSSSNIKAISSVRSLRSSSKNLPKQQQKQETPIKLQRDNKKSSELKRKSPKLSTQDDTKSKDNIKKLIKNIVLEKLEDSDDEPLIKLKKRIEMIDNFKSDSLQDNKEKITFDNKNDNSETIKLSDDDEESFHGFNKKSISKLLNQCTSSSIANEESCKVNNSIEKNLNINKTCEISKLDTTSNIPLPIVSSSSSPNITEIDKKCPHTVHDTSTGIIDIPLSTSLGRKERVNMSTEQIEKWLNESSMAKEESKAEMETVTNFSYEVIPEKINKSDISHLSISTRIQHLVRPVNVAIAKMAEKPLINKNQMKSPSSIFSTGIALAKPISIPTNRNKINADIKEIIKCRNAKNNNINIIHSNNNNNNNSKDTTIINEDSDISSRRSDGNVSIDYYSPDKKNTSTTTTTTTTPTAIPTPPITAATSTTDKKSITQLQKKTFLPKVKERKSATPSVNAFSPENERSVYAFESDTETPVNTPFRRKLRDSKSGTSSDIAESDDGIVKTPTKISDKYDLLSTTKSTTKSIATTCNEDDLFIETPGTSTDTPIQTNIKLKNTNELDNLSNAQVLPTGKHQNVWNSLNCSTSIAVQVNFDEQGQSTTQDNDNNHNDDINNGQKCTEISTQTECTAVDNEDDNSSQVFYIPLQAVSRNGPNTCVAVKLGTEGPNGPNQRVLLRAQLVTKPPVAVARCPPIGTVQPTTRIPASLLTDSIPSTSSSPSIIAAETTGGITTTSTSSTTTPTPLTTTSSSSSSSIVFPVTKENEKSSSTDSKVNEKITKSLKTSRERKASSDSSTTKLSSNKKSGKKKPSSDIKFDGQTFPSMDVNKGESARLVDAPTFHPSEKDFQDPFEYIDKIRPIAEKFGICRVVPPSNFKPDCKVSDDMRFTAYNQYVHRMMHRWGPNVKQLMAIKKNLASQRFIVKKLPWIGGMEVDLPHLYETVQNLGGLGEIIDKKKWQKVADGMKIPKSAQDRASKLDDIYCRYLLPFDTLSTKEKEKLFDDVDKEWKKREAKALRRLNKSSSASSSSSSSSSDDDNDNDDEESDDSSDECIVKGRNMPLNAFYRIARNTQRMWFGDNQRGSSNSEIEGASAVNVENDFWKHVVERKRHVCVHAASIDSSGRGFGFSVAKNSPFARHPWNLKVLTNNSGSILRALGPLMGVTIPTLHVGMLFSACCWYRDPHGLPWIEYLHTGAKKIWYGIPNEHNDNFRIALSKMVPRYCKNKKIWLPSDTAMVPPETLVSNGVSLCQTVQEPGQFIIVFPKAFTSSICTGYVVSESVYFAQPTWLENAEQIFKDLQDSCEPSMFSFERLLFSIINDTRSNADVLKQILPTVTKIRERELNYRQQLDYYGLTSKEKLPLPDSGKKKKGQKVKDGQSEFECETCRMDLFVSHVCNSQDDSTYCLPHALQLISKKKQVLKHCTLKFSYSEEELDDLIHKLEDRIEAKLKKTNQNRQIK
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_00132433;
- 90% Identity
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- 80% Identity
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