Basic Information

Gene Symbol
-
Assembly
GCA_963971155.1
Location
CAXAQU010000270.1:51452-84182[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
BTB
Domain
zf-C2H2|ZBTB
PFAM
PF00651
TF Group
Zinc-Coordinating Group
Description
The BTB (for BR-C, ttk and bab) [6] or POZ (for Pox virus and Zinc finger) [1] domain is present near the N-terminus of a fraction of zinc finger (Pfam:PF00096) proteins and in proteins that contain the Pfam:PF01344 motif such as Kelch and a family of pox virus proteins. The BTB/POZ domain mediates homomeric dimerisation and in some instances heteromeric dimerisation [1]. The structure of the dimerised PLZF BTB/POZ domain has been solved and consists of a tightly intertwined homodimer. The central scaffolding of the protein is made up of a cluster of alpha-helices flanked by short beta-sheets at both the top and bottom of the molecule [2]. POZ domains from several zinc finger proteins have been shown to mediate transcriptional repression and to interact with components of histone deacetylase co-repressor complexes including N-CoR and SMRT [5, 3, 4]. The POZ or BTB domain is also known as BR-C/Ttk or ZiN.
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 8 5.7e-13 2.2e-10 41.5 0.1 6 104 57 156 52 161 0.88
2 8 3.9e-13 1.5e-10 42.1 0.1 6 104 562 661 557 666 0.88
3 8 3.9e-13 1.5e-10 42.1 0.1 6 104 1067 1166 1062 1171 0.88
4 8 5.9e-13 2.2e-10 41.5 0.1 6 104 1572 1671 1567 1676 0.88
5 8 7.7e-12 2.9e-09 37.9 0.1 6 104 2077 2176 2072 2181 0.88
6 8 7.7e-12 2.9e-09 37.9 0.1 6 104 2582 2681 2577 2686 0.88
7 8 4.2e-13 1.6e-10 42.0 0.1 6 104 3087 3186 3082 3191 0.88
8 8 8.2e-10 3.1e-07 31.4 0.1 4 87 3567 3651 3564 3652 0.86

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGAATTTTCTAAGTATGAGTTAAAACGTGGAATCAAAAGAATTTGTAATAACTCAGAATACTCGTCTTACAAAGAAAAAGGTTCTGGTATCAACGAAGCTACTATTGCGAAAACTGCGCCTAAGACGAATATTGAGCATTCAAGcattaaatatttcaaaacTCAAGAATGTGGAGAATTTTACGGTTATGAATTAAAAACGGAAGATGGTACCAGTTTTACAGTACACAAATGGGTTCTTTCTACGTTAAGTCCATTGCTAGTCAGTTACCGCAATGAGGAAGTACAATTGTTTGAACGAATTTCTGATACATTTTTGGTACGTCAAATATCTTCTAGTGATCTGAAGAAAATCATTGAGTATATGTACACTGAAGAGACGGATATCTCATCAAATACAGCGAAGGAAATTACTGACATGGCGTTATTCTTGAATATATACACTTTGGTAGAAAAAGGATGTCGCGTGCTTGGTAAAATTGTTAATGAGAATAACTGTTTGGAATGGCTGAAGTATTCAGAGACATGTTTGCACTATGGCGAAAAACTGACGAAGAAATGCTTGAAATTGATTTGTACAAAATTCAACGACTTCGTCAATTTACCAGATTTTATTGAATTGTCTCCAAGTACAATAAAACTGTTGGTTGAACAAGAGAGAATAACGTATACAGAAGAAGATTTGTACCTGGCAGTTAAAAAGTGGATAACATTTGATATGGAATTTCGGAAGGAAACCGCAAAAGATTTGCTGAATGCAATTGAATTTGCACGTTTTACGTCGGAATTTACTAAACTACATATCTTTGATAATCATTTGTTATTCGGCGTAGAGgaatataaagaaaaattgatCGAATTATTCTACAACAACTTGACGCAGACAACTCGGGCGGCAAAAGACCAAAGTCTATATGCAATAATCGATAATACTATATCTTCAGTTTATCAAGGTAACGGATCTTTCAAGTGTTTGACCAAGATTGACAACAGCCGCCGTTTCTTTGGTGTTACTCCACTcgataaaaagaaaattctaatTGGTGGTGGATGGAAAGGCAGTAACATTGTAAATGCTTGCAGCTATTTTTCgatagaagaaaaaaaatggGAAGAATTCTCACCAATGAACCGGGCCATGTGTCCAAAGTTAGTTACATTAGGTGACAACATATATGCTTTCGaaacaaataacaaaaggATTGATGttcttaatatatataaacCAGTATGGTTCACAGGAAGAAGTCAAATTGTTGTTCCTGCAAAATACAGATTTAACTTGTGTCACTCcaataattgtatttattatgttACCAGAACACATGTTCAGCGTGTTGATTCAAGAGAATTAAATTGTGACGTTCTATTTTCTGGTGATGTCAAGGCAAATATACAATCATCAGAAATTAATGGACATTTTATGCATGGATTCACTTACGACGATATTAGAACTTTTGATTTTCGTAACAGAAAGTGGTTTGAAACTATATTACCATATACAATGAAACTTGATTACGAACCTATGACTTGCATTTTTGATAATagtattcatatattttcCAAATACGGTGGTCAATTACAAACTTATGATTTATCAAATTTGTCATTTCCTACTATTGCGAAAACTACGCCTAAGACGAATATTGAGCATTCAAGcattaaatatttcaaaacTCAAGAATGTGGAGAATTTTACGGTTATGAATTAAAAACGGAAGATGGTACCAGTTTTACAGTACACAAATGGGTTCTTTCTACGTTAAGTCCATTGCTAGTCAGTTACCGCAATGAGGAAGTACAATTGTTTGAACGAATTTCTAATACATTTTTGGTACGTCAAATATCTTCTAGTGATCTGAAGAAAATCATTGAGTATATGTACACTGAAGAGACGGATATCTCATCAAATACAGCGAAGGAAATTACTGACATGGCCTTATTCTTGAATATATACACTTTGATAGAAAAAGGATGTCGCGTGCTTGgtaaaattgttaataaaaataactgTTTGGAATGGCTGAAGTATTCAGAGACATGTTTGCACTATGGCGAAAAACTGACGAAGAAATGCTTGAAATTGATTTGTACAAAATTCAACGACTTCGTCAATTTACCAGATTTTATTGAATTGTCTCCAAGTACAATAAAACTGTTGGTTGAACAAGAGAGAATAACGTATACAGAAGAAGATTTGTACCTGGCAGTTAAAAAGTGTATAACATTTGATATGGAATTTCGGAAGGAAACCGCAAAAGATTTGCTGAATGCAATTGAATTTGCACGTTTTACGTCGGAATTTACTAAACTACATATCTTTGATAATCATTTGTTATTCGGCGTAGAGgaatataaagaaaaattgatCGAATTATTCTACAACAACTTGACGCAGACAACTCGGGCGGCAAAAGACCAAAGTCTATATGCAATAATCGATAATACTATATCTTCAGTTTATCAAGGTAACGGATCTTTCAAGTGTTTGACCAAGATTGACAACAGCCGCCGTTTCTTTGGTGTTACTCCACTcgataaaaagaaaattctaatTGGTGGTGGATGGAAAGGCAGTAACATTGTAAATGCTTGCAGCTATTTTTCgatagaagaaaaaaaatggGAAGAATTCTCACCAATGAACCGGGCCATGTGTCCAAAGTTAGTTACATTAGGTGACAACATATATGCTTTCGaaacaaataacaaaaggATTGATGttcttaatatatataaacCAGTATGGTTCACAGGAAGAAGTCAAATTGTTGTTCCTGCAAAATACAGATTTAACTTGTGTCACTCcaataattgtatttattatgttACCAGAACACATGTTCAGCGTGTTGATTCAAGAGAATTAAATTGTGACGTTCTATTTTCTGGTGATGTCAAGGCAAATATACAATCATCAGAAATTAATGGACATTTTATGCATGGATTCACTTACGACGATATTAGAACTTTTGATTTTCGTAACAGAAAGTGGTTTGAAACTGTATTACCATATACAATGAAACTTGATTACGAACCTATGACTTGCATTTTTGATAATAGAATTCATATATTTTCCAAATACGGTGGTCAATTACAAACTTATGATTTATCAAATTTGTCATTTCCTACTATTGCGAAAACTACGCCTAAGACGAATATTGAGCATTCAAGcattaaatatttcaaaacTCAAGAATGTGGAGAATTTTACGGTTATGAATTAAAAACGGAAGATGGTACCAGTTTTACAGTACACAAATGGGTTCTTTCTACGTTAAGTCCATTGCTAGTCAGTTACCGCAATGAGGAAGTACAATTGTTTGAACGAATTTCTAATACATTTTTGGTACGTCAAATATCTTCTAGTGATCTGAAGAAAATCATTGAGTATATGTACACTGAAGAGACGGATATCTCATCAAATACAGCGAAGGAAATTACTGACATGGCCTTATTCTTGAATATATACACTTTGATAGAAAAAGGATGTCGCGTGCTTGgtaaaattgttaataaaaataactgTTTGGAATGGCTGAAGTATTCAGAGACATGTTTGCACTATGGCGAAAAACTGACGAAGAAATGCTTGAAATTGATTTGTACAAAATTCAACGACTTCGTCAATTTACCAGATTTTATTGAATTGTCTCCAAGTACAATAAAACTGTTGGTTGAACAAGAGAGAATAACGTATACAGAAGAAGATTTGTACCTGGCAGTTAAAAAGTGGATAACATTTGATATGGAATTTCGGAAGGAAACCGCAAAAGATTTGCTGAATGCAATTGAATTTGCACGTTTTACGTCGGAATTTACTAAACTATATATCTTTGATAATCATTTGTTATTCGGCGTAGAGgaatataaagaaaaattgatCGAATTATTCTACAACAACTTGACGCAGACAACTCGGGCGGCAAAAGACCAAAGTCTATATGCAATAATCGATAATACTATATCTTCAGTTTATCAAGGTAACGGATCTTTCAAGTGTTTGACCAAGATTGACAACAGCCGCCGTTTCTTTGGTGTTACTCCACTcgataaaaagaaaattctaatTGGTGGTGGATGGAAAGGCAGTAACATTGTAAATGCTTGCAGCTATTTTTCgatagaagaaaaaaaatggGAAGAATTCTCACCAATGAACCGGGCCATGTGTCCAAAGTTAGTTACATTAGGTGACAACATATATGCTTTCGaaacaaataacaaaaggATTGATGttcttaatatatataaacCAGTATGGTTCACAGGAAGAAGTCAAATTGTTGTTCCTGCAAAATACAGATTTAACTTGTGTCACTCcaataattgtatttattatgttACCAGAACACATGTTCAGCGTGTTGATTCAAGAGAATTAAATTGTGACGTTCTATTTTCTGGTGATGTCAAGGCAAATATACAATCATCAGAAATTAATGGACATTTTATGCATGGATTCACTTACGACGATATTAGAACTTTTGATTTTCGTAACAGAAAGTGGTTTGAAACTATATTACCATATACAATGAAACTTGATTACGAACCTATGACTTGCATTTTTGATAATAGAATTCATATATTTTCCAAATACGGTGGTCAATTACAAACTTATGATTTATCAAATTTGTCATTTCCTACTATTGCGAAAACTACGCCTAAGACGAATATTGAGCATTCAAgcattaaatatatcaaaacTCAAGAATGTGGAGAATTTTACGGTTATGAATTAAAAACAGAAGATGGTACCAGTTTTACAGTACACAAATGGGTTCTTTCTACGTTAAGTCCATTGCTAGTCAGTTACCGCAATGAGGAAGTACAATTGTTTGAACGAATTTCTGATACATTTTTGGTACGTCAAATATCTTCTAGTGATCTAAAGAAAATCATTGAGTATATGTACACTGAAGAGACGGATATCTCATCAAATACAGCAAAGGAAATTACTGACATGGCGTTATTCTTGAATATATACACTTTGGTAGA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Protein Sequence
MEFSKYELKRGIKRICNNSEYSSYKEKGSGINEATIAKTAPKTNIEHSSIKYFKTQECGEFYGYELKTEDGTSFTVHKWVLSTLSPLLVSYRNEEVQLFERISDTFLVRQISSSDLKKIIEYMYTEETDISSNTAKEITDMALFLNIYTLVEKGCRVLGKIVNENNCLEWLKYSETCLHYGEKLTKKCLKLICTKFNDFVNLPDFIELSPSTIKLLVEQERITYTEEDLYLAVKKWITFDMEFRKETAKDLLNAIEFARFTSEFTKLHIFDNHLLFGVEEYKEKLIELFYNNLTQTTRAAKDQSLYAIIDNTISSVYQGNGSFKCLTKIDNSRRFFGVTPLDKKKILIGGGWKGSNIVNACSYFSIEEKKWEEFSPMNRAMCPKLVTLGDNIYAFETNNKRIDVLNIYKPVWFTGRSQIVVPAKYRFNLCHSNNCIYYVTRTHVQRVDSRELNCDVLFSGDVKANIQSSEINGHFMHGFTYDDIRTFDFRNRKWFETILPYTMKLDYEPMTCIFDNSIHIFSKYGGQLQTYDLSNLSFPTIAKTTPKTNIEHSSIKYFKTQECGEFYGYELKTEDGTSFTVHKWVLSTLSPLLVSYRNEEVQLFERISNTFLVRQISSSDLKKIIEYMYTEETDISSNTAKEITDMALFLNIYTLIEKGCRVLGKIVNKNNCLEWLKYSETCLHYGEKLTKKCLKLICTKFNDFVNLPDFIELSPSTIKLLVEQERITYTEEDLYLAVKKCITFDMEFRKETAKDLLNAIEFARFTSEFTKLHIFDNHLLFGVEEYKEKLIELFYNNLTQTTRAAKDQSLYAIIDNTISSVYQGNGSFKCLTKIDNSRRFFGVTPLDKKKILIGGGWKGSNIVNACSYFSIEEKKWEEFSPMNRAMCPKLVTLGDNIYAFETNNKRIDVLNIYKPVWFTGRSQIVVPAKYRFNLCHSNNCIYYVTRTHVQRVDSRELNCDVLFSGDVKANIQSSEINGHFMHGFTYDDIRTFDFRNRKWFETVLPYTMKLDYEPMTCIFDNRIHIFSKYGGQLQTYDLSNLSFPTIAKTTPKTNIEHSSIKYFKTQECGEFYGYELKTEDGTSFTVHKWVLSTLSPLLVSYRNEEVQLFERISNTFLVRQISSSDLKKIIEYMYTEETDISSNTAKEITDMALFLNIYTLIEKGCRVLGKIVNKNNCLEWLKYSETCLHYGEKLTKKCLKLICTKFNDFVNLPDFIELSPSTIKLLVEQERITYTEEDLYLAVKKWITFDMEFRKETAKDLLNAIEFARFTSEFTKLYIFDNHLLFGVEEYKEKLIELFYNNLTQTTRAAKDQSLYAIIDNTISSVYQGNGSFKCLTKIDNSRRFFGVTPLDKKKILIGGGWKGSNIVNACSYFSIEEKKWEEFSPMNRAMCPKLVTLGDNIYAFETNNKRIDVLNIYKPVWFTGRSQIVVPAKYRFNLCHSNNCIYYVTRTHVQRVDSRELNCDVLFSGDVKANIQSSEINGHFMHGFTYDDIRTFDFRNRKWFETILPYTMKLDYEPMTCIFDNRIHIFSKYGGQLQTYDLSNLSFPTIAKTTPKTNIEHSSIKYIKTQECGEFYGYELKTEDGTSFTVHKWVLSTLSPLLVSYRNEEVQLFERISDTFLVRQISSSDLKKIIEYMYTEETDISSNTAKEITDMALFLNIYTLVEKGCRVLGKIVNENNCLEWLKYSETCLHYGEKLTKKCLKLICTKFNDFVNLPDFIELSPSTIKLLVEQERITYTEEDLYLAVKKWITFDMEFRKETAKDLLNAIEFARFTSEFTKLHIFDNHLLFGVEEYKEKLIELFYNNLTQTTRAAKDQSLYAIIDNTISSVYQGNGSFKCLTKIDNSRRFFGVTPLDKKKILIGGGWKGSNIVNACSNFSIEEKKWEEFSPMNRAMCPKLVTLGDNIYAFETNNKRIDVLNIYKPVWFTGRSQIVVPAKYRFNLSHSNNCIYYVTRTHVQRVDSRELNCDVLFSGDVKANIQSSEINGHFMHGFTYDDIRTFDFRNRKWFETILPYTMKLDYEPMTCIFDNSIHIFSKYGGQLQTYDLSNLSFPTIAKTTPKTNIEHSSIKYFKTQECGEFYGYELKTEDGTSFTVHKWVLSTLSPLLVSYRNEEVQLFERISNTFLVRQISSSDLKKTIEYMYTEETDISSNTAKEITDMALFLNIYTLVEKGCRVLGKIVNENNCLEWLKYSETCLHYGEKLTKKCLKLICTKFNDFVNLPDFIELSPSTIKLLVEQERITYTEEDLYLAVKKWITFDMEFRKETAKDLLNAIEFARFTSEFTKLHIFDNHLLFGVEEYKEKLIELFYNNLTQTTRAAKDQSLYAIIDNTISSVYQGNGSFKCLTKIDNSRRFFGVTPLDKKKILIGGGWKSSNIVNACSYFSIEEKKWEEFSPMNRAMCPKLVTLGDNIYAFETNYKRIDVLNIYKPVWFTGRSQIVVPAKYRFNLCHFNNCIYYVTRTHVQRVDSRELNCDVLFSGDVKANIQSSEINGHFMHGFTYDDIRTFDFRNRKWFETVLPYTMKLDYEPMTCIFDNRIHIFSKYGGQLQTYDLSNLSFPTIAKTTPKTNIEHSSIKYFKTQECGEFYGYELKTEDGTSFTVHKWVLSTLSPLLVSYRNEEVQLFERISNTFLVRQISSSDLKKTIEYMYTEETDISSNTAKEITDMALFLNIYTLVEKGCRVLGKIVNENNCLEWLKYSETCLHYGEKLTKKCLKLICTKFNDFVNLPDFIELSPSTIKLLVEQERITYTEEDLYLAVKKWITFDMEFRKETAKDLLNAIEFARFTSEFTKLHIFDNHLLFGVEEYKEKLIELFYNNLTQTTRAAKDQSLYAIIDNTISSVYQGNGSFKCLTKIDNSRRFFGVTPLDKKKILIGGGWKSSNIVNACSYFSIEEKKWEEFSPMNRAMCPKLVTLGDNIYAFETNYKRIDVLNIYKPVWFTGRSQIVVPAKYRFNLCHFNNCIYYVTRTHVQRVDSRELNCDVLFSGDVKANIQSSEINGHFMHGFTYDDIRTFDFRNRKWFETVLPYTMKLDYEPMTCIFDNRIHIFSKYGGQLQTYDLSNLSFPTIAKTTPKTNIEHSSIKYFKTQECGEFYGYELKTEDGTSFTVHKWVLSTLSPLLVSYRNEEVQLFERISNTFLVRQISSSDLKKIIEYMYTEETDISSNTAKEITDMALFLNIYTLVEKGCRVLGKIVNENNCLEWLKYSETCLHYGEKLTKKCLKLICTKFNDFVNLPDFIELSPSTIKLLVEQERITYTEEDLYLAVKKWITFDMEFRKETAKDLLNAIEFARFTSEFTKLYIFDNHLLFGVEEYKEKLIELFYNNLTQTTRAAKDQSLYAIIDNTISSVYQGNGSFKCLTKIDNSRRFFGVTPLDKKKILIGGGWKGSNIVNACSYFSIEEKKWEEFSPMNRAMCPKLVTLGDNIYAFETNNKRIDVLNIYKPVWFTGRSQIVVPAKYRFNLCHSNNCIYYVTRTHVQRVDSRELNCDVLFSGDVKANIQSSEINGHFMHGFTYDDIRTFDFRNRKWFETVLPYTMKLDYEPMTCIFDNRIHIFSKYGGQLQTYDLSNLSFQCGEFYGYELKTEDGTSFTVHKWVLSTLSPLLVSYRNQEVQLFERISDTFLVRQISSSDLKKIIEYMYTEETDISSNTVLCLLQ

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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

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90% Identity
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