Basic Information

Insect: Zonitis immaculata
Gene Symbol: JARID2
Assembly: GCA_037414775.1
Location: JAZBGX010000983.1:11472-18116[-]

Transcription Factor Domain

TF Family: ARID
Domain: ARID domain
PFAM: PF01388
TF Group: Helix-turn-helix
Description: This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 1 6.7e-23 1.4e-19 70.0 0.0 6 89 1367 1448 1363 1448 0.93

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	1	6.7e-23	1.4e-19	70.0	0.0	6	89	1367	1448	1363	1448	0.93

Sequence Information

Coding Sequence: ATGTTAATAAATCGGTGTGAAATGAAAAGAAAACGTAGAGATTGTGCATCACCtctaattgatgataatccGAAAAGgACAAAGGTACATGCACAACGGAAATTTGCACAAGGCTCCAATGTTAATAGTCCTGTAATAACACCAGttagagaaattgaaaaacaagaaGTCGACGTAATGCCGGAACCGgttgaattattaccaataaaacGTCCAAATACAGAAGATTTCCTAACATTTTTATGTTTCCGTGGTACACCGATTCTACCAccgaatttgaattttttcaatacagCTTCAATTGTCGATACAAATGGTCAAGTACATGAAATTAAAAGTGAATCACCCAAAAATGGTCCAATCGATACATCGGCAATTGCTAAAGCTTCCGGTTCATCTGAACGACCATTTATTGCATTTGGTGTACGTAAACGAGCCGATCCTATAGTTATTAGTAAACAAATGGATAAAAAACGACGACATGCTTTAGCTTTACAAGCGCTAAGACGGAAATATCAAGAACAAAGAATGGCGAAAATTCGAGCTGTTACTATAAGTAAATTATCAGAAACTAAAACTAATAAGACATTAGTACGTTCGAATTCTGTATCGAAAAATGAGACAGTTTTAAAGAAAACTACTGCAAATACAACTAATCCAATACATAAATCGAATAAAGTTAGTGTTGTTTCGACGAAACATGTAAAAGTAACAACACAAACTGTTAAAAGCACTTTAAGAACACAAATCAAACCGAAAATGTGTTTGAGAAGTTTCCGTGGACGATTCATACAAAGGGAATtgcaatttagaaataatatgaaaaagaaaacacTTCCAATCAAACGAATTGAGAAAAATGATGAAGAAAGTGGTAGTGGAACAATATCCGAGTATTCGTCAACTGAAGATGAAGAACGTtcaattaatacaacaaaagAAACTAAATTGAATCCGAAAGTTGTTCTGTCTAAAGTTAAAGTTGCTAAAAAATCAGCACCAGGACCGAAAAAACCAGCCGAAATTAAttttaggATAACGcgttctaataaatttataagtaataaaatgaaatcaaGACGacaacaaatgaaacaattgattctaacaacaccaacaaataTTGTTAAACCACGAACTTTACGTTCGCATacattaaagaaaattgatggaaattttacaTCACCtaaaaaacagaaattgatGCAATTACGCAAACAGAAAGAATTTGAACGTACACGATcggaaataacaacaatgacaacgaaaaaagagacaaatgaattacaaaaaaagaaTATGAAAACGTCAATCAATGTCAAAAAagacaataaagaaaatacgGAGAATATTAGAAAAGAAGCAATCAAATCTGTTGAAAGTGCGAAAAAactgattaataaaattagcGAGACTAGTAAGAAACGAATAACATCACCAACTCCATCGACTTGTTCAGctgtaacaaataataaaaataaatcaacgaaaaatacaagaaaaagtGATTTGAAGATTGTCGAACCATTAAAACGGAAAGAACAAGAACGTATACGATTTGAATTGAGAAGAATACCACATGTAACAGCTGAAACGGAATTGGAATTGCAAAAGGAACAAAAAACCAAATCGCCACCTGTTATAGTCGATAAAAGACCAATGAaaactgaaattaataataaaagaaattcagAAATCGAAATTCGAACATCACAACGACCTagtagaaaaacaaaagaagcaGCAgctatttatatggaaattttaagTCATAAATTAGTTAATGATagtaaaattgatgatgatgataatatatcGATTGATAGTTTTCCTGAATTACCGAATGTTAAGAAAACTGAACAAAGAGAGAATGAATTGAAAGCTAAAGCTAAATCGCATAATGATGGTGATAAGAAAAGtttgattgaaacaaaaaatcttCGATCGTCGGATAGAAAACGGGGTAATCCAATCAAAAAGAATCAACTAGATGATGATAGaagtgaaaaaattaaaatagatgaTGTGAAAATTTGTGATCGAAAAACTCGTTCTAGTGGTCCACTAGAAAAAACTAAAGATAtcgaattgaaaaatgaaacaaatgaaattatagaaacgagaaaaattacaaataaaattgaaaataaacgaaaaatcgaatcaaacattgataattcaacgaaaataactaaacaacaaaaatctgaaattaaaGATGATGATtcttcgaaaataataatgaaacgtGATGAAATTCCTCGTAGACAAACGCGAAATTCTTCACAAAATATCCACGATAGTAGTGATAATGATTCAGATGAATCGTATCGAGTTGATATTCGTATACCAAAAAAACGTTTAATAACACGCAATAAATTACTTAAATCATATAAAAGTGATAGTGATGATATAATTGATAACGAAGAAGGTACTGATAATTCATCGATTTCTGATATTAAAAAAGTTTTACGATTAAAAACGAAAACTTATAAAGAAATTAGTTCGAGTGAATCAGATCAATCAACAACATCGGATGTTAATATAAAACCGACAAgatcaataacaacaacgacaacaacaaaaaataaacgtttCACAAAAACACGTAGCCAACGTAAAAGTGAACCGAGTTTTAGTGATTCAGATGAAGAACcattatcgaaattaacacaaaataaaattaacgaaatcaataataaaaatgataatgttAGTGTTGATAAAAAACAAGAGATTGTCGATGATAAAATAGAGAATGTACGTGAAATAAAGCCGAAACGTGAATGTGCAAAACGTCCACAAAATTATTTACCAATGTTTTCATCATCTGAAGAAGAAGATTTCTTTTTTGGTTatgaattaatgaaacaagaagaaaaaccaagaaaaattaaagataataataattgtggtcATGCACCGACAACATCGGATATTGGTCGACGTTTTGGTAAAGGTAAAGTTAATATGTCGAATGAACAAATTGAGAAATGGTTGAAAGAATCAGCGATGGCTGGTAGtttgaaaaatgataatgatgaaatgttgaaattcaatgaaaaaataCCAACAGAAACAtcattaaattcaaatgatagtattgatattgaaaaattgaaaacatcattattattatcatctgatattgatgataaagttgatattgattgtaataaaaaagaaacagcATCAACAACAAGTAGTATAAAtgagaaattggaaaataataaaaataatttattgaaaccgAATTTAGATCGGAAATTGATATTTCGTAAAGATAAATTATCGACAATACCGAATATTAATGCATTCTCAGCTGATAATGAAAGTAGTGTTTATGCTTTTGAAGAGAATGAagatttaatgaaaatgaaaacacCATTTAGACGGCCATCTAGACGTCCATCTAGTACTGCTACATCACGATCAGAAGATGAATCGTCGAAAGTTGAcgattccaataaaattgCACAATTTCGAATACCGTCATCGATAAAACAACaagattctaataaaattaaaaatgagaTTTGTGATGAGGATACAACAATATTcgaacaaaatttacaatcagACAATGATAATTCGAATCAATTGAAACCATCTATTTCgactgtaataaaaaataataataataataataatactagaaCAGAAATGATACCACCACAGGCAGTTGtaccaaaaaaattaccaatatcAAAGATAGATGatgattttaaatataaaataccaaGTTCGCCTAGTGCCAGTTCATCATCTAGTgccaaattatataaaaaacaaggcataaaaacaaaattacgtACAACAAATGATATACAACCGATAACAGTTaatgaatttccaataaattcaaatctagCACAATTAATATTAGCACCAACATATTATCCGAGTGAAAAAGAATTTCAAGATcctattgaatttattgaaaaaatccgTCCAAAAGCCGAACAATTTGGTATATGTCGTATTGTACCGCCGAATACATTCAAACCAGAATGTAAAGTTACTGATGATATGAGATTTACAGCTTATAATCAATATGTACATAAAATGTTGTATCGTTGGGGGCCGAATTTTAAAGAATTAATggctattaaaaaatatttatcgacACAAAATATCAGTTTAACACACCCACCATggattggCGGTATGGAAGTAGATTTGCCACGTTTATATCAAACTGTACAATCTTTAGGTGGTTTAAAGGAGGTAATTGAAAAGAAGAAATGGCCTAAAGTTTCTGATGCAATGAAAATACCAAAATCAGCACAAGATCGTGTAACAAAACTTGAcgatatttattgtaaatatcttTTACCTTACGATACATTATCAccagcTGAACgtgagaaattatttgatgaagTTGAAACTGATTGGGCGAAACGTgaatcaaaatcattattaaaattacaacagaatttagatgatgataatgatgatagtgatACAGAATCGGATAATGAAGCTGAAGAATGTATTGTTAAAGGTCGTGGTATGGCTTTAAATGCATTTTATCGTATTGCTCGTAATACAATGAGTATGTGGTTTAAAACAACAGAACCACCAGTTGATgaagTTGAACaggaattttggaaaaatgttacattaaaacaaaatcatattTGTGTACATTCCGGATCGATTGATTCTGGTAATTGGGGATATGGTTTTGCTGTATCGAAAAATAGTCCATTTGCACGACATGCTTGGAATTTGAAagttttaacaaataatagtgGATCAGTTTTAAGATCATTAGGACCTATTATGGGTGTGACAGTGCCAACTTTACACGTTGGTATGGTATTTAGTTCATGTTGTTGGTATCGTGATCCACATAGTCTACCATGGATTGAATATTTACATACAGGTGGTAATAAAATATGGTATGGTATACCAGATTCGGCAAGTGAATCATTTCAtaatgtattaaaaaaattagtacCAAATTATTGTCGTAATAAAACATTATGGTTACC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Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity: iTF_01366124;
90% Identity: -
80% Identity: -