Basic Information

Gene Symbol
Kdm5a
Assembly
GCA_037414775.1
Location
JAZBGX010000036.1:14321-19933[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 4 5.6 1.2e+04 -3.5 0.0 4 24 55 76 53 86 0.79
2 4 7e-26 1.5e-22 79.5 0.0 2 89 108 192 107 192 0.95
3 4 1.3 2.7e+03 -1.5 0.0 4 57 1011 1063 1008 1081 0.69
4 4 0.064 1.3e+02 2.7 0.0 33 82 1229 1280 1226 1285 0.77

Sequence Information

Coding Sequence
ATGACATCAAAATTAGATAAACTGGCTAGTCCGGCCAAATCAAAAACAGGACCGTcaacaaaacaagaaacatATTGTTACAAAGAAGAGGCCTTTGAATTTGAACCACCACCAGAAGCACCTGTATTTTATCCAACTGAAGAAGAATTCAATGATCCATTagaatatattaataaaatacgtaAATTTGCTGAAGATTCTGgtatatgtaaaataaaacCACCACCAaattgGCAACCACCTTTTGCTGTTGACGTGGACAAATTGAGATTTACACCAAGAATTCAAAGACTTAATGAATTagaaGCTAAAACACgtgttaaattgaattttcttgatCAAATAGCCAAGTTTTGGGAATTACAAGGCTCTAcattgaaaattccaatggTTGAAAAACGTTGTATTGATCTCTATacattacataatattgttcATAATCTtggtGGTTTCGAACAAGTAACCAAAGACAGAAAATGGTCCAAAGTTGCTGTAAATATGGGATATTCACCTGGAAAAAGTAGTATAGGAACGATACTTAAGTCACATTATGAGCGATTAATATATCcatttgatttgtttaaattgGGTAAAACTTTGAATATAaaaatggCATCTCCTTCGACAAATGAAGAAATCGAAAAAACTGATAAAGATTATAAACCTCATGGTATTGTAGGAAGGATGCAAATAAAACCACCACCCGAGAAACATGCTCGACGCTCTAAAAGATTTGAAACtgaagtAAAATCAGAGGATGATATTAAACAAGAATGTATTGAGGATAATAAGGAATTGAAACGTCTTCAATTTTATGGCGCCGGACCAAAAATGACAATTAAAGAGAAACATGAAGATAAAAGAAGCAAGAATATTAATTACGAATTTGATCCgttggCGAAATATGTGTGTCATAATTGTAATCGTGGTGATTCCGAAGAATATATGTTATTGTGTGATGGTTGCGATGATAGTTATCATACATTCTGTTTAATGCCACCATTGAGTGAAATACCAAAAGGTGATTGGCGTTGTCCGAAATGTGTAGCCGAAGAAGTTTCAAAACCTGTGGAAGCTTTCGGTTTTGAACAAGCACAGAGGGAATATACATTACAACAATTCGGTGATATGGCTGATCAATTCAAGTCTGAATATTTCAACATGCCCGTTCATTTGGTACCAACAAGTGTTGTGGAAAAAGAATTTTGGCGTATTGtatcatcaattgatgaaGATGTAACTGTTGAATATGGAGCTGATCTTCATACAATGGATCATGGCTCCGGTTTTCCAACAAAAAcgtcattaaatttattacctGGCGATAAAGAATATGCTGATTCCGGatggaatttaaataatttaccagTATTAGAAAATTCTGTATTGGGCTATATTAATGCTGATATATCAGGTATGAAGGTGCCTTGGATGTATGTTGGTATGTGTTTTGCAACATTTTGTTGGCATAATGAAGATCATTGGagttattcaatcaattatttacattgGGGTGAAGCTAAAACCTGGTATGGTGTACCTGGTAAAATGGCTGAATCATTTGAAGAAACAATGAAATCAGCAGCACCTGAATTATTTCATTCACAACCAGATTTATTACATCAATTAGTAACAATAATGAATCcaaatattttgatgaaaGCTGGTGTACCTGTATATAGGACAGATCAGAATGCTGGCGAATTTGTTGTTACATTTCCACGTGCATATCATGCTGGTTTCAATCAAGGTTATAATTTTGCTGAGGCCGTTAATTTTGCACCAGCTGATTGGTTAAGAATGGGCCGTGAATGTATAttacattattcaaatttgagaaGATTTTGTGTATTCTCACATGATGAATTAGTTTGTAAAATGGCTCTTGATTCAGATAAACTTGGACTAACAATTGCTGCAGCTACTTATCAAGATATGTTACAAATGGTGGAAACGGAAAAACAACTTCGAAAAACTCTTTTAGATGcgggTGTATCAAATGCGGAACGTGAAGCATTTGAATTATTGCCAGATGATGAACGCCAATGCGATACTTGTAAAACAACATGCTTCCTTTCTGCAGTTACATGTAAATGTTCTCCAGATATATTAGTTTGTCTTCGTCATTATGCAAACCTTTGTAAATGTCATCCAGAAAATTATACATTACGTTATCGTTATACATTGGATGAATTACCTGTTATGCTAAAATCACTCAAATTAAAAGCAGAATCTTTCGATCAATGGGTAAATAAGGTTAAAGATGCTTTAGAtccgaaaaaaacaaaaatattaacattatcTGAATTGAAATCGCTACTTAATGAAGCAGATGGaaagaaatttccaaaatgtgAATTGTTACAAACACTAACCGATGCCGTTGAAGATGCTGAAAAATGTGCTAGAGTTATACAACaattagatttaaataaaataagaactAGAACAAGAAATGCATCCGatacaaaatataaactaaCATTGAAAGAGCTGTGTTTATTTAATGAAGAATTAGATAGTTTAGCTTGTGTACTTGAAGAATCCAAAAGTATTAAAGATTTACTTGAAGAAACTAAAAAATTTGAAGCTACAAGTAAATCATTACTTGATATGAAATTAAGTGAATGTTCTATATCTGATCTGGAAAATTGTATAAGTCAAGGTAATAACTTGTGTATAGAATTACCCAATTTACGTAGTATTAAAGTAAGATTACGACAAGCATTATGGCTAAATGAGATTTTATCGTATAAAAAACGTACTGAAGTACTTGGTCTAGAATCaataagaaatattattaaatccgGTAATATTTTACCACCAAATCCAGAGATTGAATCTGAATTGActgaattacaattattacttACAAAAAGTGAACAATGGGAGGAAAAAGTTAAAGATGTATTAAAAGATAAGAGTTGTGAAGTTATGATTGAggttgataaattattaaaagaagcAAGCCAAATAACATCATATCTACCATCagaagaatttttatttgatgctATGGATAAAGCTCGTGATTGGTTACGACAATTAGAAGAAATGAATTCAGCTGAATATTATCCATATTTTGATGATatgcaaattttaataaaaaaaggacATCAATTAGATTTACATTTGGTTGAAGTTACAAAATTAGAATCATATTTGGAATTTGCTAATAATTGGAAAGATAAAACAAGTCGTGCATTTCTAAGAAAAAATACACCTTATACTTTGATGGAAGCTCTCTCTCCAAGATTACAATTTGGCCCCacaaaaaattgtaagaaaaaGAATCAAGATGAGGAATGTGGTATATTCAATTTGACTAGCGATATGGATCCAGCAACTGTTGTTGCTTTATTCCGTGAAGCAGAACAAAAGGAAATGGAAATGATACAGAATTTACGAATGGCCAATTTGGAAAAGAGCTTAGATCCAAATGATAATGCTGTATTTTGTGTATgccaaaaaaatgtttatggTTTAATGATGCAATGTGAATTATGTAAAGATTGGTTTCATTCCGATTGCGTTCAATTACCAAAAGTTGCTTCATCTAAGTACAAAGGCAATTTTACAAGTGCTGCACTACATTTAAGTTTTAAAGATTGTAAATTTCTTTGTATAAATTGTTATAGAACTAGACGACCACGTTTAGATGcgattttattacttttaatGGCATTACAGAAGCTTTTTGTTCGTGTACCAGAAGGTGAAGCATTACAAAGTTTAACTGAACGAGCGATGAATTGGCAAGATCGTGCTAGACAATTAATGCAAATACCGGAATTGGAAGttgctaaaaataaattgaattcacTTACACAAAAATATACAGAAGCAGCTGCTAGACAACgaacagaaaaaattatatcaaatgaATTGAAACGAGCTTACAAAAATCCTGAATTACATCAAAGAGTACAAGAAATTGCACCATTCAGTGGTGTTAATCAAGACGAATccaaatgtaataataacgatatagCAGATGATTTAAAAGATTGTTCTACTGATGATAGAATGGGTGAACATgcttattcattgaatttgcCTAAATTTGATACTGGGGAATATCGTGTTCATCTTTCACCAGATATGAAAAAACATATTGAAGAACTTTTAATGGAAGGTGATTTATTAGAAGTATATCTGGATGAGACATTtcaattatggaaattattacaagCTTCTCGAGATCCAGAAAAAGAAtctattttgattgattttgatataaattcgaaaaatttaccGGTTAAACGTGGACGCAAAAGACGTTCCGATGATGGTGGTGATATTGTGAAAATTAAAACCAAagcaaataaaacaaatgaaattgaaagaaagaataaattatctaaaacaaaagaacaaagaaaaaaaggtAATAATGGACGACGGAAAGGACGTCGACGTCAATCAACTGGTTCAGAAgaagacgatgatgatgatgatgatgatgatgttgatgaaattTGTGCTGCATCTGGTTGTTTAAAACCATCAGGTGAAAATGTTGATTGGGTACAATGTGATGGTGGTTGCGATAAATGGTTTCATATGGCATGTGTTGGTTTATCAGCTCAAGATATTAATGAAGATGAAGATTATATTTGTATGACATGTTCTGAAAATACAACATATGAAGCATTTGATGATGATCAAGCCGAATATAAGTTATCGCCCATCAAAGGAGATGTTTCCACTTTACCCCTGCCTTCCACATCTAAAGACTCCGATTAG
Protein Sequence
MTSKLDKLASPAKSKTGPSTKQETYCYKEEAFEFEPPPEAPVFYPTEEEFNDPLEYINKIRKFAEDSGICKIKPPPNWQPPFAVDVDKLRFTPRIQRLNELEAKTRVKLNFLDQIAKFWELQGSTLKIPMVEKRCIDLYTLHNIVHNLGGFEQVTKDRKWSKVAVNMGYSPGKSSIGTILKSHYERLIYPFDLFKLGKTLNIKMASPSTNEEIEKTDKDYKPHGIVGRMQIKPPPEKHARRSKRFETEVKSEDDIKQECIEDNKELKRLQFYGAGPKMTIKEKHEDKRSKNINYEFDPLAKYVCHNCNRGDSEEYMLLCDGCDDSYHTFCLMPPLSEIPKGDWRCPKCVAEEVSKPVEAFGFEQAQREYTLQQFGDMADQFKSEYFNMPVHLVPTSVVEKEFWRIVSSIDEDVTVEYGADLHTMDHGSGFPTKTSLNLLPGDKEYADSGWNLNNLPVLENSVLGYINADISGMKVPWMYVGMCFATFCWHNEDHWSYSINYLHWGEAKTWYGVPGKMAESFEETMKSAAPELFHSQPDLLHQLVTIMNPNILMKAGVPVYRTDQNAGEFVVTFPRAYHAGFNQGYNFAEAVNFAPADWLRMGRECILHYSNLRRFCVFSHDELVCKMALDSDKLGLTIAAATYQDMLQMVETEKQLRKTLLDAGVSNAEREAFELLPDDERQCDTCKTTCFLSAVTCKCSPDILVCLRHYANLCKCHPENYTLRYRYTLDELPVMLKSLKLKAESFDQWVNKVKDALDPKKTKILTLSELKSLLNEADGKKFPKCELLQTLTDAVEDAEKCARVIQQLDLNKIRTRTRNASDTKYKLTLKELCLFNEELDSLACVLEESKSIKDLLEETKKFEATSKSLLDMKLSECSISDLENCISQGNNLCIELPNLRSIKVRLRQALWLNEILSYKKRTEVLGLESIRNIIKSGNILPPNPEIESELTELQLLLTKSEQWEEKVKDVLKDKSCEVMIEVDKLLKEASQITSYLPSEEFLFDAMDKARDWLRQLEEMNSAEYYPYFDDMQILIKKGHQLDLHLVEVTKLESYLEFANNWKDKTSRAFLRKNTPYTLMEALSPRLQFGPTKNCKKKNQDEECGIFNLTSDMDPATVVALFREAEQKEMEMIQNLRMANLEKSLDPNDNAVFCVCQKNVYGLMMQCELCKDWFHSDCVQLPKVASSKYKGNFTSAALHLSFKDCKFLCINCYRTRRPRLDAILLLLMALQKLFVRVPEGEALQSLTERAMNWQDRARQLMQIPELEVAKNKLNSLTQKYTEAAARQRTEKIISNELKRAYKNPELHQRVQEIAPFSGVNQDESKCNNNDIADDLKDCSTDDRMGEHAYSLNLPKFDTGEYRVHLSPDMKKHIEELLMEGDLLEVYLDETFQLWKLLQASRDPEKESILIDFDINSKNLPVKRGRKRRSDDGGDIVKIKTKANKTNEIERKNKLSKTKEQRKKGNNGRRKGRRRQSTGSEEDDDDDDDDDVDEICAASGCLKPSGENVDWVQCDGGCDKWFHMACVGLSAQDINEDEDYICMTCSENTTYEAFDDDQAEYKLSPIKGDVSTLPLPSTSKDSD

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_01480636;
90% Identity
iTF_01366120;
80% Identity
-