Basic Information

Insect: Zaprionus lineosus
Gene Symbol: Trerf1
Assembly: GCA_035044505.1
Location: JAWNNX010000108.1:486426-495910[+]

Transcription Factor Domain

TF Family: MYB
Domain: Myb_DNA-binding domain
PFAM: PF00249
TF Group: Helix-turn-helix
Description: This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 1 6.6e-08 8.8e-05 22.7 0.1 3 45 1832 1874 1832 1875 0.94

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	1	6.6e-08	8.8e-05	22.7	0.1	3	45	1832	1874	1832	1875	0.94

Sequence Information

Coding Sequence: ATGGCTGCCATTAATTCGGTACCGAAAAGTATTCACCTACCACTGCGAAGTCTTAGCACAACGCGCGTTTTAATGTGCAGTGCTGCTGCAGGAACCGAGAATTCTGTGAATCTACAATTAAGACTGGACAATTCAGTCCTCGACTCCGTCGACTGCATAAAGGATAAGTTAATCACATCATCGGACGACTCAGCAAATGGTGtcgaagaaaataaaacatattcatcagcagcagaaaaaactACAACATTAGGAAACGCATATGTGACCTGCCTTTCCAATTCGGAAATGCTAGTAGATGTCGTAGACACTATACAGACCGTGTccttaaaaaataaacatagtGGTAAGATCACTAACGGAAACAGAAATAGCAGGGTTATCAGtaatagtaacagtaacagtaacagtaacagtaacagtaacagtaatagtAACAGTAACGGTAATAGTAACAGTAACGGCAACAGTAACACAAACACTAacagtaacggtaacggtacaAGTAACCATAACAGTAACGATAACAGTAATAGTAACACTGTCTCCAGCAGTGTTAGTAACAGTAATACTAACAGTAAAAGTAACACCAACAGTAACAATACCAGTAACAGTTCCACTAACAAAACCAGTAACATTaacggtaacaacaacagcagcagtaacaataacaatagcagtATCATTaacggtaacaacaacagcagcagtaacaataacaatagcagtAACATTAACGGTAACAGTAAatgttacagttacagtaacaataacactgACATTAACCGTGAAAGTAGCAGTTGCAGTACcggtaacagtaacagaaacatTAACAGCAAAAATGCTAATGAGTACAGAAAGTACAGCATTACTGCACCAACAATTCTGAACAGTAATAACGGAAATTCTAGTTCTGACGTAcaagtgaataatttaaaaaaagtaaccTTGACGCAACGCAGTGCCAGTAAAAGCAGCATCCAAACAATTACTACATCCACCAATACAGTCGTTGGCAGCATTAAGAccaattacattaaaaattgtcTTATACGCAGTAGTAGGTGTAGCAATACAGTCACCAATGTCACAACGTTGGCACAGATTATGAGCAatagcagcaccagcagctccACCAGTTTGCTTAgtcaacacaacaacaatagtaactgcagcaacagcagcagctccagcaacGCTTCGTCTGTGGGCAGCAGCATTAGCATCGGTAGCTCAAACAGCAACGACAGTAATAGCAACAGCAGTCATAGCTCAAACTTTCAAAACAACAGCTGTAATCCTCCTAGTATAGTTTCAGCCATAAAGGTAGAGTCAGCCAGAGCCTCTTTAAGTGGCAttgactttgttgctgttgaaaaTATTCCCAGAAAAAATCGCTCCAAGCTATCTTCACCAACACGTCACGGACCGCAGCAGTGTCAGatCTGTAGTAAAATCTTTGGAAATGCCTCTGCGCTAGCCAAGCACAAACTGACGCATAGTGACGAGAGAAAATACATTTGCCCGCTTTGCTCAAAGGCATTCAAGCGCCAAGATCACTTAAACGGACACATGATGACGCATCGCAACAAGAAGCCTTATGAGTGCAAAGCAGATGGTTGTGGAAAATCATATTGTGATGCACGCTCCTTGCGACGACACTCAGAAAATCACCATGGTGGCATGGTTATGCACAACAATATATTACATTCGCCGACAGCTAGTATTAAATGTAGTGGTGTCAATACCAATACGACTGCAGGTGCTCATACTAGTTCGCTAAGTCTTTCACCGGCCACAGCAAGCGGTGATGCCAGTTCACCTGATGGAGCCACGTGTATACGAACATACATATCTACAGGTAGTACTTTAGTAGATTCGGTCACTGGTATAGCCCTTTCTGCAGATCAAATAAAAGCTATGAATCTGCCAGTTAAGACGGGAGTCACATTGCTTTCACCTACCACCCCAACATCCTCACAATCATCGTTAACAACGTCTTCCTTATGCTCGTCAGCAGCGAGTGGCGGCAACACTTTTTCAACTGTTTCacaaaacattattttaagtaatggTGCTACTTTGGAAGGCGAAGGTCTTACGCGTGAGCAGCTTGATCTTATAAGCAAAATCATGCAACAAACTAAGCAAACTACTGCTCAAGTTACCGTCTCCTCACCAACCAGTGTAAGCtcctataaaattaatacCGAATCTTTACCAATGCAGGCCCGTCCACGTACTTGGAATATGCAATTGcTGAATAGTGCTAAAAATGTGACCGCCACTGTAGAGGATAGCAACGAGACTGTTCCATCGGCTTCATGCTCTTCTGATGAGGTGAGAAACGATGAGATAGCTCAACagattgttgctgctataaACCCTCAAATGCTCAATATTGTAAAGACTGATAAGCCGGTTGAGTGCAATCTCTGTCATCGTAAGTTCAAAAACATACCCGCTTTGAATGGACATATGCGCCTGCATGGGGGCTATTTCAAAAAAGATCCGGAAACTAAACGAAGCGAGAAGAAAGATTCAAATGGACCCCCTTTGCAAACCGCAAGTATTGGTGTTCGTGCACTTATTGAAGAGAAAATTATAAGTAAACGCAAGGACATTACCAAGGGTTCTTTTGTAGTACCTGCACCACCCATCTGTACGGTCAATGCCAATAGTAATAACAGCGTAAATCTGCGGCGCTCTATGAGTGACTTAGAAAATTTTCTATATCCGAAGGTCAGCTCCACTAATGTGGGTCAAACGCTGTGTAACAACACAACTACTACAGTGCTACCATCCGCAACTTCTATTAAAAATAGCAGTGGGATAAACATCCAACAAATCGGACTACCCCAAAGCATCGAGATATTTAGCGATGGGCAGAGGCAACCGAAAACGCTTAGTTTGGGTAGTGGCACAAATACCATAACCATAACAACGAATACTATACCTACCACATCTAATATGAGCGCCTTGGCGTCACTGAAGAGTGATAGTTGTATAGATGGTATTTCGTCAAACGTAGATGCCAAAGATTCCACATTAATAGAGCTCCTAAAACGTGGAACACGTATCGCAGTGACCTCTAAGAAGACCCAGCTACAAACTCCACTTAATACAAATTTGGTTTTAAGTAATGTTGGCGATTCAGACATAACAAACATTGGTAGCAGTTTACAAGGAAGCCGACAGATAatcacaaacaacaataatcgtACAATTATTATACCTTCAGATCTGCATGTTGTGACTACCAAAGGCAAGTTGATAACAAGTTGCCCCATTATGAATAATAacacaattacaaaatattccGCACCCATTACACCATTGCCTGAATGTCCACATACGCCTCTCACCATCGCACCGAGTCAAGAATGTCTTGACATCGTTGCTGAGACAGAAGCCGCTACTAGTAACGAAGGTGTCTACACTGTGACCTATACTAAAGATGCTGAAGTGTCTGATATTTTTGATGATACTGAGGTATATAATGTGTCAGACACGGAAATGCTGCTCCAAACGGTTGATACCATGGAGTTACTAAACGATGAAGACGATGAAGGTCATAAAAGCGAGCATTCCGAAAACTTTGCGCTTCTTAATGATGCAGGTGACAACGTAAATACACAATTTGTCAAATTGGAGCTGGAATCTGAGACTAGCAACTTTACTTCTAACGTCAATAACATGACACCACTGCCCACATTTCAGCATTTCCATTCCAAAGAGCTTATTATGCAGAGCAAGTCGCAAATTCACGCAATTACTAATATGCGTCCCAGTGGTACTTTAGATGTCTTAGCATCTCCAATGTTGTCACCGTTGGCGTATCCTACGCCGCCGTCCAGCCACGAAAATATGGCACAATCATCACCCTATATAGGAGATGCCGCTGCTCAGCTTGTGGACGCGGGTAATACGTTTTTTAGTGACAAGACGGATTTTTcgcaaatatattttaaaacggATGACGACAGTTCCTTAGAGCACCTTAATGAAGATGATAATGAAAAGATTGAAAAACTTAAGACGGTGTTAGAAAAAAGTTCTTTTGATCCGTCTATTAAAGTCgaggattttttaaataaaacagaagATGATGCTGTATGTGATTTACGAGAGTTTGCCGAAACTAATCTTTCATTTCTCGATGAAGATCAAGAGTTTCTTAATGATTCGCAAAATACGACATCACCTTTGTCCGAGTCCTTCTTCACCAACAATATTGGGTCTGCAGAGGAAGTGAAGCAAGTACTTCATGATGTGCTACCAGATGAAACTATGCAGATTAGCAACGAACAGCAGGGTGAAAGTATTATCGATTTGTACTATTTGCCAGGCCTAGGTCTACAATCACAAATGATGCCTAACTCAGATGATCCACTTCTATCCTCGTCACCACGTGAATTTGGTCAACAACGACAGTTTCTTCAGACTGAAACATCTATAAGTACTAATGCGCAGCCGTTAGAGCAAATACAATCAACTATGGTATTTTACGAACCACAACATCAGCAGTCCCCACAGTCAAACTCAACCCTGCAACTGCAAAATCAGTTGCTTTTAACGCAGGATCCTTATATACAGACGGGTTCaatacagcagcagcaaacccCAGAGATTGGGCTGCCACCCTTTACGTCAATGTCATGCCAAACACAATACGTCGACACAATGAATCAATCAATGGCGCTTCAGCCATTGAACACTATACTACATCCAATATTTTATGGAAGCAGTTGTATATCCAACGACAAACCAGAGTTGAACACCCTTTTGACTCCGAACGCTAGCCAGGCCAATGCTCTTGATACCAATCTGCTCATTAACTGCAACGATAgcagtagtaatagtagtaagCCTTTATTTACAACTGTACCTTTATCTTCATCAACCCCTAGTTATAGTGTATCTAATTTGCAACCGCTTTCTAATCAAACCAATTCCATACTTAAACGTCGCTTGCGTTCCAATGGAATTCAGGATGTATA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Protein Sequence: MAAINSVPKSIHLPLRSLSTTRVLMCSAAAGTENSVNLQLRLDNSVLDSVDCIKDKLITSSDDSANGVEENKTYSSAAEKTTTLGNAYVTCLSNSEMLVDVVDTIQTVSLKNKHSGKITNGNRNSRVISNSNSNSNSNSNSNSNSNSNGNSNSNGNSNTNTNSNGNGTSNHNSNDNSNSNTVSSSVSNSNTNSKSNTNSNNTSNSSTNKTSNINGNNNSSSNNNNSSIINGNNNSSSNNNNSSNINGNSKCYSYSNNNTDINRESSSCSTGNSNRNINSKNANEYRKYSITAPTILNSNNGNSSSDVQVNNLKKVTLTQRSASKSSIQTITTSTNTVVGSIKTNYIKNCLIRSSRCSNTVTNVTTLAQIMSNSSTSSSTSLLSQHNNNSNCSNSSSSSNASSVGSSISIGSSNSNDSNSNSSHSSNFQNNSCNPPSIVSAIKVESARASLSGIDFVAVENIPRKNRSKLSSPTRHGPQQCQICSKIFGNASALAKHKLTHSDERKYICPLCSKAFKRQDHLNGHMMTHRNKKPYECKADGCGKSYCDARSLRRHSENHHGGMVMHNNILHSPTASIKCSGVNTNTTAGAHTSSLSLSPATASGDASSPDGATCIRTYISTGSTLVDSVTGIALSADQIKAMNLPVKTGVTLLSPTTPTSSQSSLTTSSLCSSAASGGNTFSTVSQNIILSNGATLEGEGLTREQLDLISKIMQQTKQTTAQVTVSSPTSVSSYKINTESLPMQARPRTWNMQLLNSAKNVTATVEDSNETVPSASCSSDEVRNDEIAQQIVAAINPQMLNIVKTDKPVECNLCHRKFKNIPALNGHMRLHGGYFKKDPETKRSEKKDSNGPPLQTASIGVRALIEEKIISKRKDITKGSFVVPAPPICTVNANSNNSVNLRRSMSDLENFLYPKVSSTNVGQTLCNNTTTTVLPSATSIKNSSGINIQQIGLPQSIEIFSDGQRQPKTLSLGSGTNTITITTNTIPTTSNMSALASLKSDSCIDGISSNVDAKDSTLIELLKRGTRIAVTSKKTQLQTPLNTNLVLSNVGDSDITNIGSSLQGSRQIITNNNNRTIIIPSDLHVVTTKGKLITSCPIMNNNTITKYSAPITPLPECPHTPLTIAPSQECLDIVAETEAATSNEGVYTVTYTKDAEVSDIFDDTEVYNVSDTEMLLQTVDTMELLNDEDDEGHKSEHSENFALLNDAGDNVNTQFVKLELESETSNFTSNVNNMTPLPTFQHFHSKELIMQSKSQIHAITNMRPSGTLDVLASPMLSPLAYPTPPSSHENMAQSSPYIGDAAAQLVDAGNTFFSDKTDFSQIYFKTDDDSSLEHLNEDDNEKIEKLKTVLEKSSFDPSIKVEDFLNKTEDDAVCDLREFAETNLSFLDEDQEFLNDSQNTTSPLSESFFTNNIGSAEEVKQVLHDVLPDETMQISNEQQGESIIDLYYLPGLGLQSQMMPNSDDPLLSSSPREFGQQRQFLQTETSISTNAQPLEQIQSTMVFYEPQHQQSPQSNSTLQLQNQLLLTQDPYIQTGSIQQQQTPEIGLPPFTSMSCQTQYVDTMNQSMALQPLNTILHPIFYGSSCISNDKPELNTLLTPNASQANALDTNLLINCNDSSSNSSKPLFTTVPLSSSTPSYSVSNLQPLSNQTNSILKRRLRSNGIQDVYKFSKFHSLSPHRSKLRKPSRTHYTPPPILNPDRKGTGLYINVRKKLAQKTFDNFEDDFGDPVGLVDFSDESKVNLGSAYQAQIPACNTLEDYNGNTNNADLMWDPNLQLDEKILMRYIDLSKSSAVPMGSHSEEVALQTLLEANGNSVAAVLTLLQTQSSAFQIKWSAYELEMFLRGLEKHGKDFGKIATELLTKTTGECVQMYYFWKKLCVDYKVSHLKMEPVIYSGSSTVEQKPYVCEIADCSASFSSKAALHGHVRIHAFGRNTSNSNGNNSNYSNNQHATAIIPNNTSHSSNHNNNSNSNSNINTYSACTSLTIANNNSSSNNSGNSNINQCKINVKTTTITHTNGNNMGLTSNKNANSCRSPNSTLTSSVTTSEALKDSCHSNCNSNSNSNVQSNTKVSNITKESEFPCKVCGKVFNKVKSRSAHMKTHRVQDTEQSSNLQSKQQAPAN

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity: iTF_01556337;
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